PLoS ONE: En Multiplex Assay til måling RNA udskrifter af prostatakræft i urin

Abstrakt

prostata-specifikt antigen (PSA) test serum har en høj falsk positiv rate. Som en enkelt markering, PSA giver begrænset diagnostisk information. En multi-markør test kan påvise ikke kun tumorer, men også de potentielt dødelige dem giver en udækket behandlingsbehov. Brug af nanoString NCounter genekspressionssystem, blev en 20-gen multiplex test udviklet baseret på digital gen optælling af RNA-transkripter i urinen som et middel til at påvise prostatacancer. I denne test er udtømt urin centrifugeres for at pelletere celler og det oprensede RNA amplificeres til hybridisering til forudvalgte probesets. Forstærkning af test cellelinje-RNA viste sig ikke at indføre væsentlig bias, og optællingerne matchede godt med gen overflod niveauer målt ved mikromatrice. Til dataanalyse blev de enkelte tællinger sammenlignet med β2 mikroglobulin, et housekeeping-gen. Urinprøver af 5 præ-operative sager og 2 ikke-cancer blev analyseret. Patologi oplysninger blev derefter hentet. Signaler for et flertal af generne var lave for ikke-cancer og en lav Gleason scorer, og 6/6 kendte prostatakræft markører var positive i de tilfælde. Et tilfælde af Gleason 4 + 5 viste, i kontrast, stærke signaler for alle cancer-associerede markører, herunder CD24. En ikke-cancer viste også signaler for alle 6 kræft markører, og denne mand kan harbor en udiagnosticeret kræft. Denne multiplex test analyse et naturligt affaldsprodukt kan potentielt anvendes til screening, detektion tidlig kræft og patient lagdeling. Diagnostisk information er opnået fra RNA-signaturer, der er forbundet med celletyper af prostata tumorer

Henvisning:. Quek SI, Ho ME, Loprieno MA, Ellis WJ, Elliott N, Liu AY (2012) En Multiplex Assay til Mål RNA Afskrifter af prostatakræft i urin. PLoS ONE 7 (9): e45656. doi: 10,1371 /journal.pone.0045656

Redaktør: Anthony WI. Lo, Den kinesiske University of Hong Kong, Hongkong

Modtaget: June 12, 2012; Accepteret: August 21, 2012; Udgivet: September 20, 2012