PLoS ONE: Expression Ændringer i Stroma af prostatakræft Forudsige Efterfølgende Relapse

Der er behov

abstrakt

Biomarkører at løse overbehandling, der opstår for de fleste prostatacancerpatienter, der ikke ville dø af sygdommen, men modtager radikal behandling. En mulig hindring for biomarkør opdagelse kan være polyklonale /multifokal karakter prostatatumorer samt celletype heterogenitet mellem patientprøver. Tumor-tilstødende stroma (tumor mikromiljø) er mindre påvirket af genetisk ændring og derfor kan give mere ensartede biomarkører som reaktion på tumor aggressivitet. Til dette formål har vi sammenlignet Affymetrix genekspression profiler i stroma nær tumor og identificeret et sæt af 115 probe sæt for hvilke ekspressionsniveauerne var signifikant korreleret med time-to-tilbagefald. Vi sammenlignede også patienter, der kemisk tilbagefald kort efter prostatektomi ( 1 år), og patienter, der ikke fik tilbagefald i de første fire år efter prostatektomi. Vi identificerede 131 differentielt udtrykte microarray probe sæt mellem disse to kategorier. 19 probe sæt (15 gener overlappede mellem de to gen lister med

s

0,0001). Vi udviklede en PAM-baserede klassificeringen af ​​træning på prøver indeholdende stroma nær tumor: 9 hurtige prøver tilbagefald patient og 9 indolente patientprøver. Vi derefter testet klassificeringen på 47 forskellige prøver, som indeholder 90% eller mere stroma. Klassifikatoren forudsagde risikoen status hos patienter med en gennemsnitlig nøjagtighed på 87%. Dette er den første generelle tumormikromiljøet-baserede prognostisk klassifikator. Disse resultater indikerer, at prostatakræft mikromiljø udviser reproducerbare ændringer er nyttige til at forudsige resultater for patienter

Henvisning:. Jia Z, Rahmatpanah FB, Chen X, Lernhardt W, Wang Y, Xia X-Q, et al. (2012) Expression Ændringer i Stroma af prostatakræft Forudsige Efterfølgende Relapse. PLoS ONE 7 (8): e41371. doi: 10,1371 /journal.pone.0041371

Redaktør: Chad Creighton, Baylor College of Medicine, USA

Modtaget: Maj 11, 2012; Accepteret: 20 Juni 2012; Udgivet: August 1, 2012