PLoS ONE: Tab af heterozygositet og eksemplarnummer Ændringer i Flow-Sorteret Storskrald Cervical Cancer

Abstrakt

Behandling valg for livmoderhalskræft er primært baseret på klinisk FIGO scenen og postoperativ evaluering af prognostiske parametre, herunder tumor diameter, parametrial og lymfeknudeinvolvering, vaso-invasion, infiltration dybde, og histologisk type. Formålet med denne undersøgelse var at evaluere genomiske ændringer i voluminøse cervikale tumorer og deres relation til kliniske parametre, ved hjælp af enkelt-nukleotid polymorfisme (SNP) -analyse.

flow-sorterede tumorceller og patient-matchede normale celler blev ekstraheret fra 81 voluminøse cervikale tumorer. DNA-indeks (DI) måling og hele genomet SNP-analyse blev udført. Data blev analyseret for at opdage kopi nummer ændringer (CNA) og allel balance tilstand: afbalanceret, ubalanceret eller ren LOH, og deres relation til kliniske parametre

DI varierede fra 0,92 til 2,56.. Pure LOH blev fundet i ≥40% af prøverne på kromosom-arme 3p, 4p, 6p, 6Q, og 11q, KN gevinster i 20% på 1q, 3q, 5p, 8Q og 20Q, og tab på 2q, 3p , 4p, 11q, og 13q. Over 40% viste gevinst ved 3. kvartal. De eneste signifikante forskelle blev fundet mellem histologiske typer (skællede, adeno og adenosquamøst) i mindre allel intensitet ratio (LAIR) (p = 0,035) og i CNA analyse (p = 0,011). Flere tab blev fundet på kromosom-arm 2q (FDR = 0,004) i pladecellekræft tumorer og flere gevinster på 7 p, 7q, og 9 p i adenosquamøst tumorer (FDR = 0,006, FDR = 0,004, og FDR = 0,029).

Hele genom analyse af storskrald livmoderhalskræft viser omfattende ændringer i allel balance og CN. De overordnede genetiske ændringer og CNA om specifikke kromosom-arme afveg mellem histologiske typer. Ingen relation blev fundet med de kliniske parametre, der i øjeblikket diktere behandling valg

Henvisning:. Van den Tillaart SAHM, Corver WE, Ruano Neto D, ter Haar NT, Goeman JJ, Trimbos JBMZ, et al. (2013) Tab af heterozygositet og eksemplarnummer Ændringer i Flow-Sorteret Storskrald livmoderhalskræft. PLoS ONE 8 (7): e67414. doi: 10,1371 /journal.pone.0067414

Redaktør: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, Japan

Modtaget: November 21, 2012; Accepteret: 20 maj 2013; Udgivet: 9 jul 2013

Copyright: © 2013 van den Tillaart et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. D. Ruano Neto modtaget støtte fra tildelingen 93518025 i den nederlandske Genomisk Initiative (NGI). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Prognostiske faktorer for livmoderhalskræft

livmoderhalskræft er en af ​​de hyppigste gynækologiske kræftformer i hele verden. Efter den kirurgiske behandling af cervikale tumorer, prognostiske faktorer for overlevelse omfatte de kliniske parametre FIGO stadium, tumor diameter, tumor i parametria, tumor positive bækken lymfeknuder, vaso-invasion, og infiltration dybde. Histologisk type er også relateret til prognose og evalueres både præ- og postoperativt [1] – [4]. Selvom parametre kan delvis bestemmes præoperativt ved klinisk undersøgelse, billeddiagnostik, eller den patologiske vurdering af biopsi prøver, er de fleste parametre kun endeligt fastlagt efter den postoperative patologisk undersøgelse af kirurgiske prøver. Tilstedeværelse eller fravær af disse faktorer er af prognostisk relevans og bruges derfor til at vælge både den primære behandling, og til at beslutte, om adjuverende kemoterapi og /eller strålebehandling er nødvendige.

Kirurgisk behandling anses for at være den optimale primær behandling for lille diameter cervikale tumorer ( 4 cm, FIGO stadie 1B2). Lokalt udvidede tumorer (FIGO 2b eller højere) primært behandles med kemo-strålebehandling. Der er dog ingen global aftale om den optimale primære behandling for pladskrævende livmoderhalskræft (diameter 4 cm, FIGO ≥1b2-2b), selv om strålebehandling eller kirurgi er muligheder [5] – [13]. For nylig, vores gruppe rapporterede en mulig yderligere prognostisk faktor for voluminøse cervikale tumorer. Patienter med tøndeformede (sideværts forlængelse ≥1.5 × craniocaudal forlængelse) voluminøse tumorer viste en værre sygdomsfri og samlet overlevelse efter kirurgisk behandling, når der sammenlignes med eksofytiske (alle andre) tumorer. Primær kirurgisk behandling, snarere end strålebehandling eller kemo-strålebehandling, er blevet foreslået som den optimale behandling til patienter med eksofytiske voluminøse tumorer [14].

Evnen til at vælge mere homogene undergrupper af patienter med cervikal tumorer kan hjælpe med udvælgelse af den mest egnede behandling mod individuelle patienter. Identifikation af patienter med specifikke genetiske mønstre kan være en måde at opnå dette mål. Genetiske ændringer kan vurderes objektivt, præ-operativt, i tumor biopsier, potentielt give en mere præcis forudsigelse af scenen og klinisk adfærd end den fysiske undersøgelse af patienten. Endvidere kunne genetisk profilering give oplysninger om de gener eller veje, der er ansvarlige for tumorvækst og metastase.

Genetisk profilering

progression af normale celler til kræft er ledsaget af ændringer i DNA, og genetiske profiler der er etableret for flere typer af kræft. Disse profiler er stort set blevet bestemt ved anvendelse arrayCGH, og har derfor været begrænset til at kopiere nummer ændringer. I denne undersøgelse anvendte vi enkelt-nukleotid polymorfisme (SNP) arrays for at bestemme den genetiske profil flow-sorterede tumor populationer. Denne fremgangsmåde har den fordel også at bestemme allel-specifikke ændringer, udover kopital ændringer (CNA), i ren tumorceller. For at omfatte tab af heterozygositet (LOH) i analysen, udviklede vi den mindre allel intensitet ratio (LAIR) tilgang, som gør det muligt at vurdere diskrete allelspecifikke kopi numre (KN) for alle genomiske steder [15]. Denne metode giver klassificeringen af ​​den diskrete samlede KN som både summen af ​​to alleler og som balancen tilstand, som derefter kan inddeles i 3 klasser:. Afbalanceret, ubalance, og LOH

Den statistiske analyse af forskelle i genetiske profiler mellem grupper af tumorer har vist sig at være vanskelig. Arten af ​​de genetiske ændringer i tumorer forårsager stærke korrelationer mellem målinger fra tilstødende prober, korrelationer, der ikke håndteres korrekt i almindeligt anvendte statistiske test. I denne undersøgelse introducerer vi en statistisk metode, der bygger på den globale test [16], som udfører korrektion multipel testning korrekt i tilstedeværelse af stærkt korrelerede værdier. En anden fordel ved den globale test er, at den kan teste den hypotese, at grupper af prøverne er den samme på et helt genom niveau, og kan zoome ind på kromosom arme, når en forskel mellem grupperne er fundet.

Formålet med undersøgelse

formålet med denne undersøgelse var at identificere genetiske ændringer i forbindelse med en eller flere prognostiske faktorer i livmoderhalskræft kræftpatienter. Vores tilgang var at bruge SNP-array analyse på flow-sorteres FFPE tumorvæv fra voluminøse livmoderhalskræft.

Så vidt vi ved, er dette den første stor skala, hele genomet SNP-array undersøgelse af denne fase af cervikale tumorer, og nogen offentliggørelse har endnu beskrevet et genomisk profil af cervikale tumorer baseret på SNP array analyse af ren tumorvæv. Derudover er det første hele genomet SNP-array undersøgelse af en stor gruppe af voluminøse cervikale tumorer i forhold til genetiske ændringer i balance tilstand og CN, og deres forhold til ugunstige prognostiske faktorer.

Materialer og metoder

prøver

væv fra 107 cervikale carcinomer, samt parret normal (ikke-berørt) endometrie og /eller lymfeknude væv, blev opnået fra FFPE vævsbank af Patologisk Institut, Leiden University Medical center (LUMC). Prøver blev håndteret i overensstemmelse med de medicinske etiske retningslinier, der er beskrevet i kodeksen Korrekt sekundær anvendelse af humant væv etableret af det hollandske Federation of Medical Sciences (www.federa.org). Vores undersøgelse gruppe bestod af patienter, der bor i Holland og i Surinam. Alle patienter, der præsenteres med pladskrævende livmoderhalskræft FIGO stadie ≥1b2-2b og modtaget primær kirurgisk behandling på LUMC fra januar 1984 og november 2000 blev inkluderet i studiegruppen. Et stort antal kliniske parametre er blevet karakteriseret i disse patienter, men til dette studie vi vælger at undersøge syv kliniske parametre vides at være af prognostisk værdi: tumordiameter, histologisk type, parametrial engagement, bækken lymfeknude-status, vaso-invasion, infiltration dybde, og vækstmønster. Vækstmønster blev defineret som tøndeformet hvis sideværts forlængelse af tumoren var ≥1.5 × den craniocaudal udvidelse af tumoren; ellers tumoren blev klassificeret som eksofytiske. Histologisk typebestemmelse (skæl-, adeno, adenosquamøst, eller blandede tumorer) var baseret på histokemisk farvning med H LOH – segmenter med kun én allel til stede, og en LAIR værdi nær 0; ubalancerede segmenter – med anden KN for de to alleler og en LAIR værdi mellem 0 og 1.

Dataene forbehandles for at opnå kvalitet kontrolleres og normaliserede værdier for intensitet og LAIR. Sammen med DNA-indeks disse fortolkes på en diskret og kategorisk skala. Den integrerede plot viser normaliserede intensitet som prikker i det øverste panel, og LAIR i det nederste panel som bindestreger. Proceduren for segmentering har inddelt denne region i to segmenter. Den venstre segment har kopital 1 med LOH. Den allele tilstand er A. Den højre segment har kopital 2 med balance. Den allele tilstand er AB.

Statistisk analyse

De breakpoints mellem segmenterne er forskellige i hver prøve. De breakpoints af hver prøve blev anvendt på alle prøver. Dette gør prøverne sammenlignelig efter segmentering Den globale test blev anvendt til at påvise forskelle i genetiske ændringer mellem grupper af patienter på hele genomet og i kromosomale arme [16]. Vi testede forskelle både i løbende og diskret CN. Den kontinuerlige CN er et relativt mål; gennemsnit prøven er 1 uanset DI. Discrete CN er et absolut mål, der repræsenterer antallet af kopier i et genomisk segment i hver celle i en tumor. Den kontinuerlige CN er den konventionelle måde at se på CN; Vi ville undersøge her, om det er nyttigt at se på absolut CN. LAIR som en kontinuerlig måling af allel balance og balance tilstand som en diskret foranstaltning blev også testet. Kontinuerlig KN gevinster og tab blev defineret som afviger mere end 15% fra gennemsnittet prøven. Den globale test tillader brug af konfoundere. Etniske gruppe blev anvendt som en confounder for alle prøver, idet det genetiske make up kunne påvirke forekomsten af ​​kromosomale forandringer. DI blev brugt som en ekstra confounder i analysen af ​​kontinuerlige CN, fordi DI har et forhold til gevinster og tab. Bestemmelsen af ​​diskrete KN allerede tager DI i betragtning, og derfor bruger DI som confounder ville gøre denne analyse tilbage til et relativt mål i stedet for en absolut (se figur S2 i File S1). Etnicitet blev defineret ved gruppering genotyperne sammen med HapMap af prøver med kendt etnisk oprindelse. Testene blev yderligere lokaliseret ved udførelse af den globale test på alle kromosomale arme individuelt. Forskelle mellem grupper blev accepteret som signifikant, når den falske opdagelse sats (FDR) var lavere end 0,05 [28]

Alle vores SNP-data findes i Gene Expression Omnibus:.. Serie GSE29143

Resultater

Kliniske data

Fra 107 livmoderhalsen carcinoma patienter inkluderet i studiet, var tilstrækkeligt DNA-materiale opnået for 82 matchede tumor /normal par efter flow sortering. En prøve blev fjernet efter hybridisering på grund af lav kvalitet data. Tabel 1 viser opsummeret kliniske oplysninger om de 81 patienter, analyserede, mens tabel S1 i File S1 viser data for de enkelte patienter. Som 96,3% af tumorerne viste sig at have en tumor diameter større end 40 mm, blev denne parameter ikke undersøges nærmere.

Principal Components Analysis (PCA) blev udført ved hjælp af de 4 oprindelige HapMap befolkninger som henvisning paneler sammen med genotyper opnået fra patienternes normale væv. Tre store genetiske klynger kunne skelnes i de fire HapMap befolkninger, med de japanske og kinesiske HapMap befolkninger klyngedannelse sammen. Styret af denne gruppering, vi klassificeret patienterne i 3 etniske grupper: Europæisk (EUR, n = 45) for patienter, der klynge sammen med CEU HapMap befolkning, afrikansk (AFR, n = 25), klynge sammen med Yri, og asiatiske ( ASI, n = 11), klynge sammen med CHB og JPT populationer. For mere detaljeret information, se Figur S1 i File S1.

Prøver

De fleste af de 81 matchede tumor prøver (89%) kunne parres med normal /ikke-påvirkede væv. Som normalt væv ikke var tilgængelige i 9 tilfælde blev tumor-DNA i stedet parret med DNA fra normale stromaceller hidrørende fra strømmen sortering procedure [23]. Cellesortering detekteret tilstedeværelsen af ​​mere end én tumor cellepopulation i 8 tilfælde. For disse tilfælde blev den mest udbredte DNA-population udvalgt til at undergå SNP array analyse. DNA-indeks (DI) af flow-sorterede prøver varierede fra 0,92 til 2,56. Figur 2 viser DI tæthed plot af patientgruppen.

Der er en bimodal fordeling af DNA-indekset med toppe omkring 1, og tæt på 2.

Samlet genetiske mønster

balance stat.

Når man ser på de balance statslige mønstre genereret af analysen af ​​SNP array-data, kan det konstateres, at LOH er til stede i næsten alle kromosomale regioner (figur 3). Den 28. ud af 40 kromosom arme, mere end 10% af patienterne viste LOH. LOH var særlig hyppigt på kromosom arme 3p, 4p, 6p, 6Q, og 11q, hvor det blev observeret i mere end 40% af alle patienter. Udover LOH alle kromosomale regioner viser tilstedeværelsen af ​​ubalancer i mindst 10% af prøverne (figur 3). Mønsteret af ubalance er noget komplementær til mønster af LOH

Udover højden af ​​grafen, Farverne angiver frekvensen af ​​LOH.; sort: 10%, grøn: 20%, blå: 0%, rød: 40%. Den afbalancerede gruppe ikke plottet; Det er et supplement til disse 2 grupper.

Kopiér nummer ændringer.

CNA hjælp af kontinuerlige KN kan ses i hele genomet (figur 4). Mere end 20% af de patienter, viser gevinster på 1q, 3q, 5p, 8Q og 20Q og tab på kromosomer 2q, 3P, 4p, 11q og 13q. Gevinst ved 3q blev fundet i . 40% af alle prøver

Avance er afbildet oven på ideogrammer, mens tab afbildet nedenfor. Farverne angiver frekvens inden datasættet; sort: 10%, grøn: 20%, blå: 30%, rød: 40%. Gevinster og tab blev identificeret, når den kontinuerlige KN afveg mere end 15% fra gennemsnittet prøven.

Forholdet mellem kliniske parametre og genetiske ændringer

Balance tilstand.

tabel 2A viser resultaterne af hele genomet analyse af LAIR og resten tilstand. Når de 22 autosomer og X-kromosomet blev analyseret sammen, kun histologisk type, viste statistisk signifikante forskelle i LAIR værdi (p = 0,035). Ingen forskelle mellem de forskellige kliniske parametre blev observeret i balance tilstand (p = 0,050). Fokus på kromosom armene individuelt viste, at forskellen mellem histologiske grupper ikke kunne tilskrives et bestemt kromosom arm.

Kopier nummer ændringer.

Tabel 2B viser resultatet af hele genom analyse for ændringer i KN. Kontinuerlig KN-værdier viste statistisk signifikante forskelle kun for histologiske typer (p = 0,011). Testen for diskrete CN var ikke statistisk signifikant (p = 0,363). Når DI tilsættes som confounder til analysen af ​​diskrete KN forskellen mellem histologiske typer er signifikant (p = 0,019), De diskrete KN profiler af patienter med og uden lymfeknudemetastaser var signifikant forskellige (p = 0,032), og her test til kontinuerlig CN var ikke signifikant (p = 0,614). Inklusionen af ​​DI som en confounder i testen for diskrete KN viser nu ingen forskel længere (p = 0,637). Se også figur S3 i File S1. Til kontinuerlig CN testene viser sammenlignelige resultater med eller uden optagelse af DI som confounding (data ikke vist). Vi derefter zoomet ind på de enkelte kromosom arme, når man analyserer de kliniske parametre, som viste en forskel. Pladecellekræft tumorer viste større tab på 2q (FDR = 0,004), mens adenosquamøst tumorer viste sig at have flere gevinster på 7 p, 7q, og 9p (FDR = 0,006, FDR = 0,004, og FDR = 0,029 henholdsvis). For diskrete CN, kunne forskellene mellem grupper med og uden lymfekirtelinvolvering ikke tilskrives nogen af ​​kromosomarmene i særdeleshed. Figur 5 viser forskellene i kontinuerlig CN for histologisk type på de forskellige kromosom armene.

Avance er afbildet oven på ideogrammer, mens tab afbildet nedenfor. Rød: planocellulære tumorer, grøn: adenokarcinom + blandet type, blå: adenosquamøst tumorer. Adenocarcinom og blandet type blev kombineret på grund af de lave antal prøver i disse grupper.

Diskussion

Brug SNP array analyse, har vi vist omfattende genom-dækkende LOH og CN ændringer i pladskrævende livmoderhalskræft. Så vidt vi ved, har ingen tidligere studier anvendt genom-dækkende genetisk profilering til sådan en lang række omfangsrige livmoderhalskræft (FIGO stadie 1b2-2b).

Analysen af ​​forholdet mellem genetiske ændringer og den prognostiske faktorer histologiske type, infiltration dybde, lymfeknude-status, udvidelse til parametria, vaso-invasion, og vækstmønster afslørede en statistisk signifikant forskel i analysen af ​​den diskrete CN mellem grupper med og uden lymfeknuder, og et forhold mellem histologisk type og ændringer i LAIR og kontinuerlig CN. Selvom den diskrete KN ikke viste forskelle mellem de forskellige histologiske typer, observerede vi, at når DNA-indekset blev anvendt som en confounder i analysen af ​​signifikant forskel mellem de histologiske grupper blev genoprettet (p-værdi går fra 0,363 til 0,019). Dette betyder, at de diskrete KN værdier indeholder omfattende information til at skelne grupperne, men at relative ændringer i DNA i forhold til den gennemsnitlige DNA-indholdet i en celle er vigtigere for forskellen mellem histologiske grupper end den absolutte allel tæller.

for at præcisere de genetiske ændringer, der bidrager til forskellene i kliniske parametre, vi analyserede kromosom arme individuelt. I analysen af ​​kontinuerte KN ændringer, viste histologiske gruppe pladecarcinomer en statistisk signifikant stigning i tab på 2q, mens adenosquamøst carcinomer viste flere gevinster på 7 p, 7q, og 9p. De statistiske forskelle i disse 4 områder er sammenlignelige, men den numeriske forskel er mest udtalt for kromosom 2q, hvor omkring 10% af de adenosquamøst carcinomer viser tab, men over 40% af de pladecarcinomer viser tab. Trods hele genomet forskel i diskret CN mellem patienter med og uden lymfeknude involvering, kunne vi ikke linke denne forskel til en specifik kromosomal arm. Således kan denne forskel ikke bruges til at udtrække en klinisk parameter

CNA blev fundet i tidligere undersøgelser ved hjælp af klassisk matrix-CGH, ​​som undersøger kun kontinuerte KN ændringer (se tabel S2 i File S1) [29] -. [ ,,,0],39]. Som det kan ses i tabellen, de gevinster, som vi fandt var tidligere rapporteret:

Avance ved 1q blev også fundet i 8 af de 11 omfattede undersøgelser, på 3. kvartal hyppigt i alle undersøgelserne, på 5p i fem af de 11 studier, på 8Q i 3 af de andre undersøgelser, og 20Q i seks forsøg. Tabene på 2q blev rapporteret i fem af de 11 andre undersøgelser på 3p i 8 af 11, på 4p i seks på 11q i seks, og 13q i otte af de andre studier. Alle vores resultater blev tidligere fundet af Rao et al., Og alle undtagen én af Lando et al., Selv om også fundet yderligere ændringer på andre steder i disse undersøgelser. Dette kan forklares ved optagelse af tumorer med en højere FIGO stadium i disse undersøgelser.

Nogle af undersøgelserne også undersøgt relationen mellem kliniske parametre og genetiske ændringer i livmoderhalskræft (se tabel S2 i File S1) [ ,,,0],29], [30], [33], [34], [36]. Rao et al. fundet nogen forskelle mellem planocellulære og adeno tumorer iscenesætte 1b-4b. Dette kan skyldes det lille antal adenokarcinomer inkluderet (5 adenocarcinomer og 72 pladecarcinomer) [34]. Der var ingen adenosquamøst tumorer i denne gruppe. I en analyse af fase 1b-3b cervikale tumorer, Visnen et al. rapporteret signifikant flere gevinster i 9 planocellulære tumorer i forhold til 7 adenocarcinomer. Højere gevinster blev overvejende fundet på 3q [36], selv om den metode, der anvendes til at definere den histologiske type, ikke blev beskrevet. Placeringerne af forskellene i genetiske ændringer mellem planocellulære og adenosquamøst karcinomer i vores undersøgelse ikke er sammenfaldende med resultaterne på visnen et al., Men der var ingen adenosquamøst tumorer i denne gruppe.

Forskellen i de samlede resultater mellem vores og tidligere studier kan forklares med forskelle i FIGO stadie, stikprøvestørrelse og farvning teknikker til at diskriminere histologiske type. Gruppen af ​​tumorer, som vi brugte ikke tidligere analyseret i litteraturen, og, bortset fra lymfeknuder blev de kliniske parametre, som vi analyserede studeret før i kun 2 af de andre 11 studier (Rao et al., Og Visnen et al. ). Fortynding, der skyldes brug af tumorvæv i stedet for rene tumorceller kan også forklare forskelle i resultater.

prognostiske relevans af histologiske type er stadig genstand for debat, og er i øjeblikket ikke anvendes til primær eller adjuverende behandling valg [ ,,,0],1] – [4], [40] – [42]. De modstridende resultater af disse undersøgelser af virkningen af ​​histologiske type på tumor adfærd og patientoverlevelse kan også skyldes forskelle i klassificeringen af ​​tumorer, hvor ingen specifik farvning (PAS og Alcian Blue) blev anvendt. Fremtidige undersøgelser om genomiske forandringer rådes til at tage de forskellige genetiske profiler af histologiske typer i betragtning.

Regionerne med de mest fremtrædende forskelle indeholder mange gener. Formålet med denne undersøgelse var at finde yderligere præ-operative parametre, som kunne anvendes til behandling valg, uden at vide det kausative gen. Dette emne fortjener yderligere undersøgelse.

SNP-array anvendt i denne undersøgelse bestod af 6000 SNP-markører fordelt jævnt over genomet, og array blev optimeret til at have en højere mindre-allel frekvens i den kaukasiske (europæiske) befolkning . Som følge heraf er det gennemsnitlige antal af informative prober var højere for de kaukasiske patienter (2139 informative SNP’er) end for asiatiske (1712) patienter i Afrika (1796) og. Dette kan resultere i en undervurdering af de genetiske ændringer, der finder sted i livmoderhalskræft i disse populationer. Selv om det ville have været interessant at sammenligne genetiske forandringer og forholdet til kliniske parametre ved etnisk baggrund, undergrupperne er for små til at tillade dette.

Vores resultater viste genetiske ændringer i relation til histologisk type, en klinisk parameter i øjeblikket ikke anvendes til behandling valg. Vores analyse viste ingen relation af genetiske ændringer i kliniske parametre, som kunne anvendes til at forudsige ugunstige postoperative prognostiske karakteristika eller vælg undergrupper af patienter. Det lader til, at der på nuværende tidspunkt er den bedste vurdering af prognostiske faktorer stadig kommer fra præ-, intra- og postoperative resultater af den gynækologiske onkolog og patolog. Da forskelle i DNA-ændringer mellem tumorer i forskellige histologiske typer kan have en indvirkning på tumor adfærd, behandling respons og overlevelse, bør fremtidig forskning omfatte større patientgrupper, og bruge farvning teknikker, der pålideligt kan skelne histologiske type.

Støtte Information

File S1.

Figur S1, Klassifikation af patientens etnicitet i forhold til HapMap befolkninger.