PLoS ONE: medfødte immunforsvar og Non-Hodgkins lymfom (NHL) gener i en indlejret Case-Control Study for mavekræft Risk

Abstrakt

Målsætning

Genetiske varianter regulerer værtens immunsystem kan bidrage til modtagelighed for udviklingen af ​​mavekræft. Der vides kun lidt om den rolle, den medfødte immunity- og non-Hodgkins lymfom (NHL) -relaterede gener for gastrisk kræftrisiko. Denne nested case-control undersøgelse blev udført for at identificere kandidatgener for mavekræft risiko for fremtidige undersøgelser.

Metoder

I Discovery fase 3,072 SNPs i 203 medfødt immunity- og 264 NHL-relaterede gener ved hjælp af oplyse GoldenGateTM OPA Panel blev analyseret i 42 matchede case-kontrol sæt udvalgt fra koreanske Multi-center Cancer Kohorte (KMCC). Seks betydelige SNPs i fire medfødte immunitet (

DEFA6, DEFB1, JAK3

og

ACAA1

) og 11 SNPs i ni NHL-relaterede gener (

INSL3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, CHUK, CD79B

og

CLDN9

) med en permuteret

s

-værdi 0,01 blev re-genotypebestemmes i Replication fase blandt 386 tilfælde og 348 kontroller. Odds ratio (OR) for gastrisk kræftrisiko blev anslået justering for alder, rygning status, og

H. pylori

CagA sero-positivitet. Sammenfattet yderste periferi i den samlede studiepopulation (428 tilfælde og 390 kontroller) er præsenteret ved hjælp pooled- og metaanalyser

Resultater

Fire SNPs havde nogen heterogenitet på tværs af de faser:. I meta- analyse,

DEFA6

rs13275170 og

DEFB1

rs2738169 havde både en 1,3 gange øget odds ratio (OR) for mavekræft (95% kreditinstitutters = 1,1-1,6, og 1,1-1,5, henholdsvis) .

INSL3

rs10421916 og rs11088680 havde både en 0,8-fold nedsat eller for mavekræft. (95% kreditinstitutters = 0,7-0,97 og 0,7-0,9, henholdsvis)

Konklusioner

Vores resultater tyder på, at visse varianter i den medfødte immunitet og NHL-relaterede gener påvirker mavens kræftrisiko, måske ved at modulere infektion-betændelse-immunitet mekanismer, der mangler at blive defineret

Henvisning:. Park SK, Yang JJ , Oh S, Cho LY, Ma SH, Shin A, et al. (2012) medfødte immunforsvar og Non-Hodgkins lymfom (NHL) gener i en indlejret Case-Control Study for mavekræft Risk. PLoS ONE 7 (9): e45274. doi: 10,1371 /journal.pone.0045274

Redaktør: Georgina L. Hold, University of Aberdeen, England

Modtaget: May 10, 2012; Accepteret: 14. august 2012; Udgivet: 21 september, 2012