PLoS ONE: Oligonucleotid Microarray Identificerer Gener differentielt udtrykte under tumorigenese af DMBA-induceret kræft i bugspytkirtlen i rotter

abstrakt

Den ekstremt dystre prognose af pancreascancer (PC) henføres, i det mindste delvis, at mangel på en tidlig diagnose. Derfor identificere differentielt udtrykte gener i multiple trin med tumorigenese af PC er af stor interesse. I den foreliggende undersøgelse blev en 7,12-dimethylbenzanthraene (DMBA) -induceret pc-model etableret i Sprague-Dawley rotter. Genekspressionsprofilen blev screenet under anvendelse af et oligonukleotid mikroarray, efterfulgt af real-time kvantitativ polymerasekædereaktion (QRT-PCR) og immunhistokemisk farvning validering. I alt 661 differentielt udtrykte gener blev identificeret i trin af bugspytkirtlen carcinogenese. Ifølge GO klassificering blev disse gener involveret i flere molekylære veje. Ved hjælp af to-vejs hierarkisk klyngedannelse analyse, normale pancreas, akut og kronisk pancreatitis, Panin, tidlig og fremskreden bugspytkirtelkræft blev fuldstændig diskrimineret. Endvidere 11 opreguleret og 142 nedreguleret gener (prober) blev fundet af Mann-Kendall trend Monotone test, hvilket indikerer homologe gener af rotter og mennesker. Den QRT-PCR og immunohistokemi analyse af CXCR7 og UBe2c, to af de identificerede gener, bekræftede microarray resultater. I humane PC cellelinjer, knockdown af CXCR7 resulterede i nedsat migration og invasion. Kollektivt, identificeret vores data flere lovende markører og terapeutiske mål for PC baseret på en omfattende screening og systemisk validering

Henvisning:. Guo JC, Li J, Yang YC, Zhou L, Zhang TP, Zhao YP (2013) Oligonucleotid Microarray Identificerer Gener differentielt udtrykte under tumorigenese af DMBA-induceret kræft i bugspytkirtlen i rotter. PLoS ONE 8 (12): e82910. doi: 10,1371 /journal.pone.0082910

Redaktør: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, USA

Modtaget: August 2, 2013; Accepteret: 29 oktober 2013; Udgivet: 23 december, 2013