Abstrakt
Baggrund
Både genetiske polymorfier og miljømæssige risikofaktorer spiller en vigtig rolle i udviklingen af de menneskelige kroniske sygdomme, herunder lungekræft. Dette er den første case-kontrol undersøgelse af interaktionen mellem polymorfier i pre-miRNA gener og madolie røg eksponering på risikoen for lungekræft.
Metoder
Et hospital-baseret case-kontrol undersøgelse af 258 tilfælde og 310 kontroller blev gennemført. Seks polymorfier i miRNA blev bestemt ved Taqman metode allel diskrimination. De gen-miljø interaktioner blev vurderet på både additiv og multiplikativ skala. De statistiske analyser blev udført for det meste med SPSS.
Resultater
Kombinationen af de risikofaktorer genotyper af fem miRNA SNP’er (miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, MIR-608 rs4919510, miR- 27a rs895819 og miR-423 rs6505162) med risikofaktor (madolie røg eksponering) har bidraget til en markant højere risiko for lungekræft, og de tilsvarende yderste periferi (95% konfidensintervaller) var 1,91 (1,04-3,52), 1,94 (1,16-3,25 ), 2,06 (1,22-3,49), 1,76 (1,03-2,98) og 2,13 (1,29-3,51). De personer med både risiko- genotyper af miRNA SNP’er og eksponering for risikofaktor (madlavning oliedampe) var i en højere risiko for lungekræft end personer med kun én af de to risikofaktorer (periferi var 1,91, 1,05 og 1,41 for miR-146a rs2910164 , regioners var 1,94, 1,23 og 1,34 for miR-196a2 rs11614913, regioners var 2,06, 1,41 og 1,68 for miR-608 rs4919510, regioners var 1,76, 0,82 og 1,07 for miR-27a rs895819, og regioners var 2,13, 1,15 og 1,02 for miR -423 rs6505162, henholdsvis). Alle foranstaltningerne i biologisk interaktion viser, at der ikke var faktisk biologiske vekselvirkninger mellem de seks SNPs af miRNA og udsættelse for madlavning oliedampe på et tilsætningsstof skala. Logistiske modeller foreslået, at gen-miljø interaktioner ikke var statistisk signifikante på en multiplikativ skala.
Konklusioner
Samspillet mellem miRNA SNP’er og madolie røg eksponering foreslået af yderste periferi af forskellig kombination var ikke statistisk signifikant
Henvisning:. Yin Z, Cui Z, Guan P, Li X, Wu W, Ren Y, et al. (2015) Samspil mellem polymorfier i Pre-miRNA Gener og madolie Røg Eksponering på risikoen for lungekræft i kinesisk ikke-ryger kvindelige befolkning. PLoS ONE 10 (6): e0128572. doi: 10,1371 /journal.pone.0128572
Academic Redaktør: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, JAPAN
Modtaget 31. oktober, 2014, Accepteret: April 28, 2015; Udgivet: 17 juni 2015
Copyright: © 2015 Yin et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres
Data Tilgængelighed: Alle relevante data er inden for papir og dens støtte Information filer
Finansiering:. Denne undersøgelse blev støttet af National Natural Science Foundation of China (nr 81.102.194). ZY modtaget finansiering. De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser
Baggrund
i Kina har lungekræft blevet den hyppigste årsag til kræft-dødsfald for både mænd og kvinder [1]. Forekomsten og dødeligheden af lungekræft i kinesiske bybefolkningen har nået nummer et blandt maligne tumorer [2]. Rygning er den vigtigste risikofaktor for lungekræft; imidlertid anslås det, at 15% mænd og 53% kvinder af lungecancerpatienter er rygere [3], hvilket antyder, at andre risikofaktorer også er blevet impliceret i ætiologien af lungekræft. Cigaretrygning kan ikke helt forklare de epidemiologiske karakteristika lungekræft i kinesiske kvinder, så det er virkelig væsentligt at udforske andre vigtige risikofaktorer for lungekræft i kinesiske røgfri hunner for at styre effekten af cigaretrøg.
Udsættelse for miljømæssige risikofaktorer spiller en vigtig rolle i udviklingen af lungekræft, men i det samme miljø folk er forskellige i deres følsomhed over for kræft. Nogle af disse forskelle tilskrives det koncept, at genetiske modtagelighed modificerer virkningerne af miljømæssige eksponeringer [4].
Molekylære epidemiologiske undersøgelser viste, at der var hundredvis af gener involveret i lunge carcinogenese [5]. I de senere år ny dokumentation understøtter en ekstraordinær rolle for microRNA (miRNA) i patogenesen af human lungekræft. MiRNA er klasser af ikke-kodende RNA’er, cirka 20 nukleotider i længde, der anses for at regulere ekspression ved binding til cis-regulerende regioner af 3′-UTR regioner af målgener [6]. MiRNA er blevet impliceret i vigtige biologiske processer, herunder udvikling, differentiering, apoptose, proliferation og udvikling af de fleste sygdomme, herunder cancer [7]. Undersøgelsen viste, at over 50% af miRNA gener lokaliserer i kræftrelaterede genomiske regioner eller i skrøbelige steder, hvilket antyder, at miRNA kan spille vigtige roller i udviklingen af kræft [8]. Enkelt nukleotid polymorfier (SNP) i frøet region eller forstadiet stem-loop af miRNA er rapporteret at væsentlig indflydelse på produktion eller forarbejdning af miRNA [9-10]. Disse linjer af beviser tyder på, at miRNA SNPs kan påvirke ekspressionen eller funktionen af deres vært miRNA. Nu konkluderer forskerne, at SNP eller mutationer i miRNA sekvens kan ændre udtryk, modning og /eller target udvalg af miRNA, og dermed bidrage til at ændre kræftrisiko. I de sidste par år, har foreningen mellem miRNA SNP’er og risikoen for kræft bliver varmt emne i kræft ætiologi forskning.
Der er undersøgelser om sammenhængen mellem miRNA SNP’er og lungekræft risici. For eksempel, Tian et al. fandt, at rs11614913 SNP i miR-196a2 var forbundet med modtagelighed for lungekræft, men ingen signifikante effekter blev observeret på foreningen for de andre tre SNPs (rs2910164, rs2292832 og rs3746444) placeret på pre-miRNA regioner i miR -146a, miR-149, miR-196a2, og miR-499 [11]. Den nylige undersøgelse in Korean foreslog, at rs2910164C G i præ-MIR-146a kan bidrage til genetisk modtagelighed for lungekræft [12]. En meta-analyse viste, at lungekræft risiko var forbundet med SNP rs11614913 men ikke med SNP rs3746444 [13].
Vi har undersøgt effekten af de fælles SNPs i udvalgte seks miRNA på modtagelighed for lungekræft hos ikke -smoking hunner (miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-30c-1 rs928508, miR-608 rs4919510, miR-27a rs895819, og miR-423 rs6505162) og fundet den signifikant associeret miRNA SNP’er (der er indgivet manuskriptet ). Men blandt mennesker, der bærer samme genotype af SNP’er, nogle af dem udvikler kræft og andre ikke. I det samme miljø, mennesker er forskellige i deres følsomhed over for kræft. Nogle af disse forskelle kan skyldes ændring af genetiske faktorer på effekten af miljømæssige risikofaktorer. Udforskning gen-miljø interaktion, som kombinerer den genetiske modtagelighed og miljømæssige eksponeringer sammen, kan være den gode måde at forstå ætiologien af kræft. Samspillet af miRNA SNP’er og miljømæssige risikofaktorer på lungekræft modtagelighed er ikke blevet rapporteret hidtil.
Madlavning olie røg eksponering foreslås at være en risikofaktor for lungekræft i tidligere undersøgelser. Vores tidligere rapporter viste, at husholdningernes eksponering for madolie røg var forbundet med risiko for røgfri kvindelige lungekræft [14-18]. En undersøgelse i en høj forekomst befolkning i det nordøstlige Indien fandt, at interaktionen af XRCC1Gln /Gln genotype med eksponering for eksponering af madolie dampe var signifikant forbundet med øget risiko for lungekræft [19]. Der er nogle vurderinger på de risikofaktorer for lungekræft indgået den signifikant sammenhæng mellem madolie røg eksponering og risiko for lungekræft [20-21].
I den tidligere generelle interaktion analyser, logistisk regression har været almindeligt. Men i logistisk eller Cox regressionsmodellen, regressionskoefficienten af produktet sigt anslår interaktion på en multiplikativ skala, mens statistisk signifikans indikerer afgang fra multiplikativitet. Rothman hævder, at når biologisk interaktion undersøges, er vi nødt til at fokusere på interaktion som afvigelse fra additivitet snarere end afgang fra multiplikativitet [22]. I dette papir, beregner vi begge additivet interaktion og den multiplikative interaktion. Resultaterne kan bruges som reference ved epidemiologer at vurdere den biologiske samspil mellem faktorer.
Så vidt vi ved, er dette den første og omfattende case-kontrol undersøgelse for lungekræft til at vurdere samspillet mellem SNPs i præ- miRNA og udsættelse for risikofaktor miljøet i udviklingen af lungekræft. I denne undersøgelse, beskriver vi en case-kontrol undersøgelse for lungekræft i ikke-ryger kvindelige befolkning i Shenyang, nordøst Kina for at studere samspillet mellem miRNA SNP’er og madolie røg eksponering.
Materialer og metoder
Etik Statement
undersøgelsen blev godkendt af Institutional Review Board of China Medical University, Shenyang, Kina. Alle patienter forudsat skriftligt informeret samtykke.
Undersøgelse fag og dataindsamling
Dette er en løbende molekylær epidemiologisk undersøgelse af lungekræft i Shenyang City, som ligger i det nordøstlige Kina. Hvert emne blev interviewet til at indsamle demografiske data og miljømæssige faktorer, samt 5 ml veneblod at opdage SNP. Miljømæssige faktorer omfatter passiv rygning, madolie røg eksponering, røg eksponering brændstof, familie historie af kræft, erhvervsmæssig eksponering og kosten vane, der blev opnået for hvert enkelt tilfælde og kontrol af uddannede interviewere. Individuelt med i alt 100 cigaretter i hans levetid blev defineret som en ryger, ellers blev han betragtet som en ikke-ryger.
I dette hospital-baseret case-kontrol undersøgelse, forsøgspersoner omfattede 258 sager og 310 matchede kontrol for alder og køn, efter hinanden blev indrulleret i studiet i løbet af juli 2006 og december 2012. Inddragelsen af sagen gruppe: (1) nydiagnosticerede lungekræftpatienter, (2) histologisk bekræftet lungekræft af erfarne patologer, (3) aldrig modtager kemoterapi eller strålebehandling, (4) ikkeryger kvindelige patienter, (5) evne til behandling ved en 1,5 time interview, (6) med de fuldstændige oplysninger om miljømæssig eksponering. Udelukkelseskriterierne omfattede tidligere kræft eller spredt kræft fra en anden tumor. I samme periode, kontrollerne bestod af raske mennesker besøger andre end tilfælde eller andre kræftpatienter blev rekrutteret fra medicinske undersøgelse centre i det samme hospital, undtagen med neoplasme og luftvejssygdomme. Controls var alle ikke-ryger hunner og frekvens matchet til tilfælde af alder (± 5 år). Deltagerne var ubeslægtede etniske Han kinesiske kvinder.
I vores tidligere offentliggjorte papirer, blev madolie røg eksponering fundet at være signifikant associeret med risiko for lungekræft i ikke-ryger kvinder [14-18], så i foreliggende undersøgelse vi analysere interaktionen mellem SNP’er og madolie røg eksponering. For madolie røg eksponering, blev deltagerne spurgt om hyppigheden af madlavning og typer af olier. Forsøgspersonerne blev også spurgt “Hvor ofte gjorde luften i dit køkken bliver fyldt med fedtet” røg “under tilberedningen?” For hvert af disse spørgsmål, var der fire mulige svar, der spænder fra “aldrig”, “sjældent”, “nogle gange”, at “ofte”. Eksponering for madolie røg blev kategoriseret som en indikator variabel lig 1, hvis deltagerne rapporterede ofte eller nogle gange, og lig med 0 ellers.
SNP genotypning
Genomisk DNA-prøver blev isoleret ved anvendelse af Phenol-chloroform Metode. Genotypebestemmelse af SNPs blev udført på en Applied Biosystems 7500 FAST Real-Time PCR System (Foster City, CA, USA) ved hjælp af Taqman allel diskrimination (Applied Biosystems, Foster City, CA) med en kommercielt tilgængelig primer-probe sæt (assay ID C_15946974_10 for rs2910164, C_31185852_10 for rs11614913, C_1766455_10 for rs928508, C_2826025_10 for rs4919510, C_3056952_20 for rs895819 og C___11613678_10 for rs6505162). kvalitetskontrol inkluderet at passende negative kontroller blev indbefattet i hver kørsel, og 10% af patienterne blev tilfældigt udvalgt til at blive genotype to gange af forskellige personer, og resultaterne viste sig at være samstemmende for alle de maskerede dublerede sæt.
Statistisk analyse
Ubetinget logistisk regressionsanalyse blev udført for at beregne odds ratioer (OR) og deres konfidensintervaller 95% (CI) for evaluering af sammenhængen mellem kombination eller et samspil mellem SNP’er og miljøfaktorer med lungekræft eller lungeadenokarcinom risici. Genet-miljø interaktion blev vurderet ved crossover analyse (additiv interaktion) og logistiske regressionsmodeller (multiplikativ interaktion). I disse analyser blev kombinationer af beskyttende genotyper af hver SNP og fravær af madolie røg eksponering betragtes som referencegruppe. Vi bruger regressionskoefficienter og kovarians matrix af logistiske model i SPSS-software, og derefter indføre et Excel-regneark oprettet af Tomas Andersson til at beregne indeks for interaktion på et tilsætningsstof omfang og de tilsvarende konfidensintervaller [23]. Tre mål for biologisk interaktion: den relative overrisiko skyldes interaktion (Reri), den kan tilskrives forhold på grund af interaktion (AP), og synergi indeks (S); såvel som deres 95% CIs blev beregnet på grundlag af de tre risikogrupper skøn relative og den tilsvarende kovariansmatricen fra en logistisk regressionsmodel. De fleste af de statistiske analyser blev udført ved hjælp af SPSS 20,0 software, bortset fra foranstaltninger af additive interaktioner som specificeret ovenfor. Alle tests var to-sidet og statistisk signifikans blev defineret som P. 0,05
Resultater
Der er 258 tilfælde og 310 kontroller i den nuværende analyser. Alle individer er ikkeryger hunner. Af de lungekræfttilfælde 258, 194 (75,19%) patienter var adenocarcinom, 34 (13,18%) var pladecellekræft celler karcinom og 30 (11,63%) var andre typer.
Analyser af virkningerne på miljøet faktorer foreslog, at der var en signifikant sammenhæng mellem risiko lungekræft med madolie røg eksponering (OR = 1,52, 95% CI = 1,06-2,17, P = 0,023), men ikke med andre miljømæssige risikofaktorer (data ikke vist). I vores tidligere undersøgelser og de nuværende analyser, CG eller GG genotype rs2910164, TT genotype rs11614913, AG eller GG genotype rs928508, GG genotype rs4919510, TC eller CC genotype af rs895819, CA eller AA genotype rs6505162 blev foreslået at være beskyttende genotype (s), så de kombinationer af disse genotyper og ikke-eksponering for madolie røg blev defineret som referencegrupper i samspillet analyser.
tabel 1 viste omfattende kombination af seks SNPs i miRNA og madolie røg eksponering på modtagelighed for lungekræft og lunge adenocarcinom i kinesisk kvindelige befolkning ikke-ryger. De emner, der bærer miR-196a2 rs11614913 TC genotype og eksponering for madolie røg havde en 2,08 gange risiko for lungekræft sammenlignet med kombinationen af TT genotype og ikke-udsættelse for madolie røg (95% CI = 1,18-3,65). Personer med MIR-608 rs4919510 GC genotype og eksponering for madolie røg havde en 2,33 gange så stor risiko for kræft sammenlignet med kombinationen af GG genotype og ikke-eksponering for madolie røg (95% CI = 1,29-4,23). Kombinationen af MIR-423 rs6505162 CC genotype og madolie røg eksponering var signifikant associeret med risiko lungekræft sammenlignet med kombinationen af AA genotype og ikke-eksponering for madolie røg (OR = 3,14, 95% CI = 1,02-9,62). De tilsvarende resultater blev viste i lunge adenocarcinom. Selv i andre SNPs, resultaterne ikke var signifikant, kunne det foreslået, at kombinationer af risikofaktorer genotyper og madolie røg eksponering kan være forbundet med den øgede risiko for lungekræft. Desuden blev kombinationen af SNPs i miRNA og madolie eksponering på modtagelighed for lungekræft og lunge adenocarcinom under andre sammenligninger præsenteres i S1 tabel.
Tabel 2 viste crossover analyserer resultater om samspillet mellem SNPs i miRNA og madolie røg eksponering på lungekræft modtagelighed i kinesisk røgfri kvindelige befolkning. For miR-146a rs2910164 polymorfi, de individer med CC-genotypen (risiko genotype) og udsættelse for madlavning oliedampe (risikofaktor) var mere tilbøjelige til at udvikle lungekræft sammenligne dem med CG /GG genotype og ikke-udsættelse for madolie røg ( OR = 1,91, 95% CI = 1,04-3,52, P = 0,037). De tilsvarende statistisk signifikante resultater blev også fundet i miR-196a2 rs11614913, MIR-608 rs4919510, miR-27a rs895819 og MIR-423 rs6505162 polymorfier, der var en kombination af de risikofaktorer genotyper af disse miRNA SNPs med risikofaktor madolie røg eksponering bidraget til en markant højere risiko for lungekræft, og de tilsvarende yderste periferi (95% CIS) var 1,94 (1,16-3,25), 2,06 (1,22-3,49), 1,76 (1,03-2,98) og 2,13 (1,29-3,51). I tabel 2, kunne det konstateres, at folk både transporterer risiko genotyper af miRNA SNPs og udsættelse for risikofaktor (madlavning oliedampe) var i en højere risiko for lungekræft end personer med kun én af de to risikofaktorer (periferi var 1,91, 1.05 og 1.41 for miR-146a rs2910164, regioners var 1,94, 1,23 og 1,34 for miR-196a2 rs11614913, regioners var 2,06, 1,41 og 1,68 for miR-608 rs4919510, regioners var 1,76, 0,82 og 1,07 for miR-27a rs895819, og yderste periferi var 2,13, 1,15 og 1,02 for miR-423 rs6505162, henholdsvis), som foreslået, at der kan være interaktion mellem disse SNPs og madolie røg eksponering, så vi nærmere interaktionen på en additiv skala og en multiplikativ skala ved kvantitativ og statistisk signifikant analyser.
Fordi adenocarcinom er den hyppigste undertype af lungekræft, med en højere incidens hos kvinder, vi analyserede samspillet mellem ovenstående SNPs i miRNA og madolie røg eksponering på lunge adenocarcinom modtagelighed i kinesisk ikke -smoking kvindelige befolkning (tabel 3). For miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-608 rs4919510, miR-27a rs895819 og MIR-423 rs6505162 polymorfier, de risikofaktorer genotyperne kombinerer med risikofaktoren (madolie røg eksponering) var signifikant forbundet med lunge adenocarcinom risici, og de tilsvarende yderste periferi (95% cis) var 2,13 (1,12-4,04), 2,18 (1,25-3,81), 2,18 (1,24-3,83), 2,19 (1,24-3,88) og 2,06 (1,20-3,55). Kombinationen af to risikofaktorer medvirket til en højere risiko for lunge adenocarcinom end dem med kun én af dem (periferi var 2,13, 1,07 og 1,37 for miR-146a rs2910164, regioners var 2,18, 1,31 og 1,20 for miR-196a2 rs11614913, yderste periferi var 2,18, 1,04 og 1,13 for miR-608 rs4919510, regioners var 2,19, 1,04 og 1,13 for miR-27a rs895819, og regioners var 2,06, 1,13 og 1,13 for miR-423 rs6505162 henholdsvis). Desuden viste støtte Information S2 Tabel samspillet mellem SNPs i miRNA og madlavning eksponering olie på lungekræft og lungeadenokarcinom modtagelighed under andre sammenligninger.
Tabel 4 viste de kvantitative og statistisk signifikante analyser resultater om foranstaltninger af biologisk samspil mellem SNPs i miRNA og madlavning eksponering olie på lungekræft og adenocarcinom i kinesisk røgfri kvindelige befolkning. Der er tre foranstaltninger for interaktion og deres konfidensintervaller. Hvis der ikke er biologisk interaktion, Reri og AP er lig med 0 og S er lig med 1. Alle målinger af biologisk vekselvirkning indikerer, at der ikke var faktisk biologiske vekselvirkninger mellem de seks SNPs af miRNA og udsættelse for madlavning oliedampe på et tilsætningsstof skala. Logistiske modeller foreslået, at genet-miljø interaktioner ikke var statistisk signifikant på en multiplikativ skala (data ikke vist). Ud fra resultaterne af vores analyser, kan der ikke være nogen statistisk signifikant vekselvirkning mellem seks miRNA SNP’er og madolie røg eksponering i lungekræft eller lungeadenokarcinom blandt ikkeryger kvinder i Kina.
Diskussion
i de seneste år, den ætiologiske undersøgelse af lungekræft stadig populær over hele verden, men resultaterne er inkonsekvent. Det er velkendt, at udover tobaksrygning, andre påvirkningsfaktorer for lungekræft er ikke endelige. Cigaretrygning kan ikke helt forklare de epidemiologiske karakteristika lungekræft i kinesiske kvinder, der ryger sjældent, men har lungekræft relativt ofte. Utvivlsomt røgfrie hunner er de ideelle emner at undersøge ukendte, men vigtige miljømæssige og genetiske faktorer af lungekræft. Vores forskergruppe har stået på studiet af risikofaktorer og genetisk modtagelighed for lungekræft i kinesiske befolkning. I tidligere undersøgelser, vi rapporterede sammenhængen mellem madolie røg eksponering og lungekræft risici. For nylig vi analysere miRNA SNP’er og lungekræft risici. I betragtning af den vigtige rolle, som gen-miljø interaktion i udvikling af lungekræft, i nærværende undersøgelse, vi evaluerede samspillet mellem seks funktionelle polymorfier af seks miRNA og lungekræft risici i en kinesisk røgfri kvindelige befolkning.
Så vidt vi ved, er dette den første undersøgelse omfattende udforske samspillet mellem miRNA SNP’er og risikofaktoren miljømæssige både additiv omfang og multiplikativ skala fra kvalitative og kvantitative analyser. De kvalitative resultater efter cross-over analyser foreslået, at der kan være samspil mellem seks miRNA SNP’er og madolie røg eksponering i udviklingen af lungekræft eller lungeadenokarcinom blandt kinesiske røgfri kvindelige befolkning. Men yderligere kvantitative analyser på både, tilsætningsstof omfang og multiplikativ skala viste, at ingen statistisk signifikant interaktion mellem miRNA SNP’er og madolie røg eksponering blev fundet i lungekræft eller lungeadenokarcinom blandt ikkeryger kvinder i Kina.
I den foreliggende undersøgelse , personer med udsættelse for madolie røg havde en 1,52 gange øget risiko for at udvikle lungekræft, som var samstemmende med vores tidligere rapporter [14-18]. Der er undersøgelser, der viser, at madolie røg kondensater kan fremkalde DNA skader og indflydelse DNA cross-links i en vis koncentration [24-25]. Tung et al fandt, at udsættelse for madolie røg kunne hæmme cellevækst og inducerer oxidativt stress i lungeepitelceller [26]. Der er andre undersøgelser tyder de vigtige roller madolie røg eksponering i lungekræft risiko blandt ikkeryger kvinder [27-29]. Over beviser understøtter de vigtige roller madolie røg eksponering i udvikling lungekræft.
Der er etableret en stærk forbindelse mellem ændrede miRNA, enten struktur ændringer eller udtryk for moden miRNA, og kræftrisiko, åbner op for en ny vej af undersøgelse for molekylære mekanismer i kræft udvikling [30]. Selv om deres biologiske funktioner stort set uklart, er der undersøgelser, der viser, at miRNA kan fungere som onkogener og /eller tumorsuppressorgener [30-34]. SNP’er eller mutationer af miRNA kan påvirke deres ejendom gennem at ændre miRNA-ekspression og /eller modning, og dermed kan bidrage til kræft risiko [9,35]. Forskere prognose, at miRNA kan blive ideelle kandidater til kræft disposition faktor, fordi deres lille variation kan påvirke tusindvis af target mRNA og resultere i forskellige funktionelle konsekvenser. Men den rolle genetiske varianter i miRNA i kræft modtagelighed er for det meste ukendt.
De fleste af de ætiologiske studier af kræft ikke analysere gen-miljø interaktion, hvilket anses for vigtigere i ætiologien af kræft, eller kun analyseret den multiplikative interaktion ved at tilføje interaktionen i logistisk regression. En redaktionel har udtalt, at statistisk interaktion er helt forskellig fra biologisk interaktion, kan førstnævnte afspejle enten afvigelse fra additivitet eller multiplikativitet afhængig af den valgte statistiske model og graden af biologisk samspil mellem risikofaktorer måles som afvigelse fra additivitet og ikke som afvigelse fra multiplikativitet [36]. Den logistiske regressionsmodel er nok den mest anvendte statistiske model i epidemiologisk analyse til dag, men logistisk regression er i sagens natur multiplikativ, så det er meget brugt til kun at analysere multiplikativ interaktion. Således er en signifikant interaktion term i en sådan model indebærer en multiplikativ relation mellem sygdommen og tilstedeværelsen af en interaktion sigt indebærer afgang fra multiplikativitet, snarere end fra additivitet. Derfor interaktionen i logistisk model har ingen direkte mulighed for at oplyse, hvorvidt biologisk interaktion er til stede. På den anden side kan den biologiske interaktion stadig undersøges ud fra resultaterne af en logistisk regressionsmodel, men det kræver, at modellen er defineret på en særlig måde, og at analysen udføres tilstrækkeligt. Andersson et al. beskrive, hvordan en logistisk regressionsmodel kan defineres for at producere output, der er nødvendig til vurdering af biologisk interaktion [23].
I nærværende undersøgelse, interaktion analyseresultater om at sammenligne yderste periferi af forskellig gen-miljø kombination af cross-over analyser viste, at i fem miRNA SNPs kombinationen af de risikofaktorer genotyper med risikofaktor (madolie røg eksponering) har bidraget til en markant højere risiko for lungekræft, hvilket tyder på at der kan være gen-miljø interaktion. yderligere statistiske analyser for additiv interaktion og multiplikativ interaktion viste imidlertid, at interaktioner mellem miRNA SNP’er og madolie røg eksponering ikke var signifikant, enten fra multiplikativitet hjælp interaktion løbetid logistisk regression eller fra additivitet af Andersson et al. metode. Den mulige årsag er, at prøvens størrelse af denne undersøgelse er for lille til at opnå de statistisk signifikante resultater. Så der er behov for større population af lungekræft for at verificere den konklusion i fremtiden. Fordi det er bare en statistisk vurdering, yderligere undersøgelser vedrørende deres biologiske gyldighed er påkrævet.
Denne undersøgelse er den første undersøgelse for at evaluere gen-miljø interaktion mellem miRNA SNP’er og miljømæssige risikofaktorer i udviklingen af lungekræft på både multiplikative og additive skala. Selv om resultaterne var statistisk signifikante, at idéen og metoden omfattende vurdering interaktion mellem to faktorer er værdifulde og har vejledende betydning for fremtidige lignende undersøgelser. De vigtigste begrænsninger undersøgelse var den lille stikprøvestørrelse og fravær af andre faktorer, herunder potentielle forstyrrende faktorer i analyserne. Derfor er de fremtidige studier med større stikprøve population af lungekræft, overvejer flere påvirkningsfaktorer og om deres biologiske gyldighed kræves for at bekræfte konklusionen.
Sammenfattende denne undersøgelse først rapporteret interaktionen af enkelt nukleotid polymorfier i miRNA og risikofaktoren miljøet i udviklingen af lungekræft, med angivelse var der ingen statistisk signifikant interaktion. Vores undersøgelse ville have en vis positiv betydning i forståelsen af lungekræft patogenese og i fremtiden analyse af interaktion.
Konklusioner
Samspillet mellem miRNA SNP’er og madolie røg eksponering foreslået af yderste periferi af anden kombination var ikke statistisk signifikante.
Støtte Information
S1 Table. . Kombination af SNPs i miRNA og madolie eksponering på modtagelighed for lungekræft og lunge adenocarcinom i kinesisk røgfri kvindelige befolkning under andre sammenligninger
doi: 10,1371 /journal.pone.0128572.s001
(DOC)
S2 Table. Samspil mellem SNPs i miRNA og madolie eksponering på lungekræft modtagelighed i kinesisk røgfri kvindelige befolkning under andre sammenligninger
doi:. 10,1371 /journal.pone.0128572.s002
(DOC)
Tak
Vi er taknemmelige for patienter for deres deltagelse. Vi vil gerne takke alle medarbejdere på sygehusene i vores undersøgelse. Denne undersøgelse blev støttet af National Natural Science Foundation of China (nr 81.102.194).
Leave a Reply
Du skal være logget ind for at skrive en kommentar.