PLoS ONE: Identifikation af PBX1 målgener i kræftceller ved Global Kortlægning af PBX1 Binding steder

Abstrakt

PBX1 er en fortælling homeodomæne transskription faktor involveret i organogenese og tumorigenese. Selv om det er blevet vist, at ovarie-, bryst- og melanom cancerceller afhænger PBX1 for cellevækst og overlevelse, den molekylære mekanisme for, hvordan PBX1 fremmer tumorigenese fortsat uklar. Her har vi anvendt en integreret tilgang ved overlappende PBX1 chip-chip mål med PBX1-regulerede transkriptom i æggestokkene kræftceller til at identificere gener, hvis transskription var direkte reguleret af PBX1. Vi yderligere bestemt, hvis PBX1 målgener identificeret i æggestokkene cancerceller blev co-overudtrykt med PBX1 i carcinom væv. Ved at analysere TCGA genekspression microarray datasæt fra æggestokkene serøse carcinomer, fandt vi co-opregulering af PBX1 og et betydeligt antal af sine direkte målgener. Blandt PBX1 målgener blev et homeodomæne protein MEOX1 hvis DNA bindende motiv blev beriget i PBX1-immunoprecipicated DNA-sekvenser udvalgt til funktionel analyse. Vi viste, at MEOX1 protein interagerer med PBX1 protein og hæmning af MEOX1 giver en tilsvarende væksthæmmende fænotype som PBX1 undertrykkelse. Desuden ektopisk udtrykte MEOX1 funktionelt reddet PBX1-trukket effekt, hvilket tyder MEOX1 medierer den cellulære vækst signal PBX1. Disse resultater viser, at MEOX1 er en kritisk målgen og cofaktor af PBX1 i ovariecancere

Henvisning:. Thiaville MM, Stoeck A, Chen L, Wu R-C, Magnani L, Oidtman J, et al. (2012) Identifikation af PBX1 målgener i cancerceller ved Global Kortlægning af PBX1 Binding steder. PLoS ONE 7 (5): e36054. doi: 10,1371 /journal.pone.0036054

Redaktør: Jindan Yu, Northwestern University, USA

Modtaget: 9. december 2011; Accepteret: 26 mar 2012; Udgivet: Maj 2, 2012