PLoS ONE: Non-Random Integration af HPV Genome i livmoderhalskræft

Abstrakt

HPV DNA integration i værtsgenomet er en egenskab, men ikke en eksklusiv trin under cervikal carcinogenese. Det er stadig et spørgsmål om forhandling om viral integration bidrager til omstillingsprocessen ud sikre konstitutiv ekspression af de virale onkogener. Der er stigende evidens for en ikke-tilfældig fordeling af integration loci og direkte inddragelse af cellulære kræftrelaterede gener. I denne undersøgelse rettet vi dette emne ved at udvide eksisterende datasæt med yderligere 47 HPV16 og HPV18 positiv livmoderhalskræft. Vi leverer understøttende dokumentation for tidligere definerede integration hotspots og har afsløret en anden klynge af integration sites inden for cytogenetiske band 3q28. Desuden i nærheden af ​​disse hotspots talrige microRNA (miRNA) er placeret og kan være påvirket af den integrerede HPV-DNA. Ved udarbejdelsen vores data og offentliggjorte rapporter 9 gener kunne identificeres som blev ramt af HPV integration mindst to gange i uafhængige tumorer. I nogle tumorer var endda identiske med hensyn til det virale donor og cellulære -acceptorsteder anvendes den virale-cellulære fusionstranskripter. Men den nøjagtige integrationssteder, kan variere, da ingen af ​​integrationssteder analyserede hidtil har vist mere end et par nukleotider af homologi mellem virale og host-sekvenser. Derfor kan DNA-rekombination involverer store strækninger af homologi på integrationsstedet udelukkes. Det er imidlertid interessant, at ved sekvensalignment flere regioner i HPV 16 genomet viste sig at have meget homologe strækninger af op til 50 nukleotider til de førnævnte gener og integrationen hotspots. En fælles region af homologier med cellulære sekvenser er mellem det virale gen E5 og L2 (nukleotider positionerne 4100 til 4240). Vi spekulere, at dette og andre områder af homologi er involveret i integrationsprocessen. Vores observationer tyder på, at målrettet forstyrrelser, muligvis også af kritiske cellulære gener ved HPV integration er fortsat et spørgsmål, der skal helt løst

Henvisning:. Schmitz M, Driesch C, Jansen L, Runnebaum IB, Durst M (2012) ikke-vilkårlig integration af HPV-genomet i livmoderhalskræft. PLoS ONE 7 (6): e39632. doi: 10,1371 /journal.pone.0039632

Redaktør: Alejandro H. Corvalan, Pontificia Universidad Catolica de Chile, Faculty of Medicine, Chile

Modtaget: April 3, 2012; Accepteret: 24 maj 2012; Udgivet: 27 juni, 2012