PLoS ONE: The Genetic Variant på kromosom 10p14 er forbundet med risiko for kolorektal cancer: Resultater fra en case-kontrol undersøgelse og en Meta-Analysis

Abstrakt

Baggrund

En fælles enkelt nukleotid polymorfi (SNP), rs10795668, placeret på 10p14, blev første gang identificeret at være signifikant associeret med risiko for colorectal cancer (CRC) af en genom-dækkende forening undersøgelse (GWAS) i 2008; Men en anden GWAS og følgende replikation undersøgelser givet modstridende resultater.

Metoder

Vi gennemførte en case-kontrol undersøgelse af 470 tilfælde og 475 kontroller i en kinesisk befolkning og derefter udførte en meta-analyse, integrere den aktuelle undersøgelse og 9 publikationer for at evaluere associationen mellem rs10795668 og CRC risiko. Heterogenitet blandt undersøgelser og publikationsbias blev vurderet af

χ

2

-baseret Q statistik test og Egger test, hhv.

Resultater

I case-kontrol undersøgelse, signifikant sammenhæng mellem SNP og CRC risiko blev observeret, med pr-A-allel OR på 0,71 (95% CI: 0,54-0,94,

P

= 0,017). Følgende metaanalyse yderligere bekræftet signifikant sammenhæng med pr-A-allel OR på 0,91 (95% CI: 0,89 til 0,93,

P

heterogenitet

0,05) i europæiske befolkning og 0,86 ( 95% CI: 0,78-0,96,

P

heterogenitet 0,05) i asiatiske befolkning. Desuden følsomhedsanalyser og publikationsbias vurdering indikerede robust stabilitet og pålidelighed af resultaterne.

Konklusioner

Resultater fra vores case-kontrol undersøgelse og fulgt meta-analyse bekræftede signifikant sammenhæng af rs10795668 med CRC risiko

Henvisning:. Qin Q, Liu L, Zhong R, Zou L, Yin J, Zhu B, et al. (2013) The Genetic Variant på kromosom 10p14 er forbundet med risiko for kolorektal cancer: Resultater fra en case-kontrol undersøgelse og en meta-analyse. PLoS ONE 8 (5): e64310. doi: 10,1371 /journal.pone.0064310

Redaktør: Struan Frederick Airth Grant, Børnehospitalet i Philadelphia, USA

Modtaget: Januar 25, 2013; Accepteret: April 10, 2013; Udgivet: May 22, 2013 |

Copyright: © 2013 Qin et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Dette arbejde blev støttet af National Natural Science Foundation of China (NSFC-81.172.752, og NSFC-81.222.038) og Talent introduktion plan for Huazhong Universitet for Videnskab og Teknologi (Li Liu). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:. Xiao-Ping Miao er en PLoS ONE Editorial Board medlem. Dette ændrer ikke forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikker om datadeling og materialer.

Introduktion

Kolorektal cancer (CRC) er den tredje mest almindeligt kræft hos mænd og den anden i hundyr, med over 1,2 millioner nye tilfælde og 608,700 dødsfald i 2008 på verdensplan [1]. I de udviklede lande, i henhold til tilsyns- Epidemiologi og End Results database, CRC er den anden hyppigste årsag til kræft dødsfald i de udviklede lande, med levetid risiko skønnes at være 5-6% [2]. I udviklingslandene, som Kina, har forekomsten af ​​CRC vokset hurtigt i de seneste årtier, især i byområder [3]. Shanghai, som udviklede by i Kina, oplevede en årlig stigning på 4,2% i kolorektal cancer incidens, som var endnu højere end det globale niveau (2%) [4].

CRC er provokeret af samspillet mellem genetiske og miljømæssige faktorer. Blandt alle årsager til CRC, arvede genetiske faktorer tegner sig for ca. 35% af sygdommen ætiologi [5]. Men høj penetrans mutationer, såsom dem i

APC

,

Smad4

MMR

gener, der er ansvarlige for mindre end 5% af tilfældene i patogenesen af ​​CRC [6]. Mildt eller moderat penetrerende alleler kunne forklare omkring 8,3% af ætiologi i tilfælde med familiær sammenlægning [7], [8]. Det forventes, at den resterende del af arvet modtagelighed sandsynligvis forklares ved lavrisiko-varianter [6].

Genom-dækkende associationsstudier (GWAS), som gjorde det muligt at genotype af hundredtusindvis af enkelt nukleotidpolymorfier (SNP’er), som tag bindingsuligevægt (LD) blokke i genomet, med succes har identificeret hidtil ukendt modtagelighed loci for CRC [9] – [19]. Blandt disse loci blev SNP, rs10795668, placeret på 10p14, først identificeret af Tomlinson, IP et al. at være signifikant associeret med CRC risiko i et 4-fase GWAS med 18831 tilfælde og 18540 kontroller i europæerne [18]. Men en anden GWAS rapporteret af Peters, U. et al. fundet nogen rolle i denne variant i CRC modtagelighed af en test sæt af 2906 tilfælde og 3416 kontroller og 10 replikation sæt af 8161 tilfælde og 9101 kontroller i europæerne [17]. I replikation undersøgelser, hvoraf nogle billede statistisk dokumentation af denne SNP for CRC risiko [20] – [22], men meget mere undladt at replikere denne association [6], [23] – [28]. Desuden rs10795668 udstillet en befolkning forskel blandt de europæiske, japanske og African American befolkninger [23]. Da allele frekvens og LD mønstre på tværs af forskellige befolkningsgrupper er forskellige, denne variant skal blive gentaget til at afklare sin rolle i CRC udvikling. Replikation studier af sammenhængen mellem rs10795668 polymorfi og CRC er blevet udført i det nordlige, sydlige og Hong Kong kinesisk [20], [22], [25]. Heri, udførte vi en replikering undersøgelse omfattende 470 tilfælde og 475 kontroller i Central kinesisk. Desuden blev en meta-analyse kombinerer den aktuelle undersøgelse og tidligere offentliggjorte undersøgelser om rs10795668 yderligere udført for at afklare forholdet mellem denne SNP og CRC risiko.

Materialer og metoder

Etik erklæring

undersøgelsen blev godkendt af den institutionelle gennemgang bestyrelse Tongji Medical College of Huazhong Universitet for Videnskab og Teknologi. Og alle deltagere forudsat skriftligt informeret samtykke til at deltage i denne undersøgelse.

Undersøgelse befolkninger

Undersøgelsen bestod af 470 CRC sager med nydiagnosticeret CRC og 475 kræft-fri kontrol. Patienterne blev konsekutivt rekrutteret mellem den 1. januar, 2007 og November 31, 2009 på ottende Hospital i Wuhan, centrale Kina, som er et hospital med speciale i kolorektale sygdomme og absorbere størstedelen af ​​kolorektal patienter i Wuhan og nærliggende områder. Controls var kræft-fri individer, der bor i Wuhan by og de omkringliggende områder, der blev udvalgt fra en pulje af raske frivillige besøger sundhed check-up center på det samme hospital i samme periode af rekrutteringen af ​​CRC patienter. Inklusionskriterierne for patienter inkluderet histopatologisk bekræftet CRC, uden forudgående kemoterapi eller strålebehandling og ingen begrænsning i forhold til køn, alder eller sygdom scenen. Sager med patologi rapport udpeget familiær adenomatøs polypose, inflammatorisk tarmsygdom, kolorektal adenom, Lynch-syndrom, intestinal tuberkulose og schistosomiasis var ikke støtteberettigede. Kriterierne for kontrol udvælgelse inkluderet kræft-fri individer og frekvens afstemt sager efter køn og alder (± 5 år). Alle emner var ubeslægtede etniske han-kinesere. Demografiske og livsstil information, og medicinske data blev indsamlet af uddannede interviewere via direkte interview ved hjælp af standardiserede spørgeskemaer. Kliniske data blev der indvindes fra hospitalets medicinske journaler. 5-ml perifert veneblod blev trukket fra hver deltager.

Genotypning

Genomisk DNA blev ekstraheret fra perifert blod prøve ved hjælp af RelaxGene Blood System DP319-02 (Tiangen, Beijing, Kina) i henhold til producentens anvisninger. Den rs10795668 SNP blev genotypebestemmes ved hjælp af Sequenom MassARRAY platform (Sequenom San Diego, CA, USA). Genotyper blev kaldt hjælp MassARRAY Typer 4.0 software [29], [30]. For at sikre kvalitetskontrol, blev udvalgt 5% duplikerede prøver tilfældigt at vurdere reproducerbarhed, med en konkordans på 100%.

Statistisk analyse

Hardy-Weinberg ligevægt (HWE) er blevet underkastet en goodness-of-fit

χ

2

test til at sammenligne de observerede genotypefrekvenser til de forventede genotypefrekvenser i kontrol. Pearsons

χ

2

test blev anvendt til at sammenligne forskellene i fordelingen af ​​kategoriske variable (køn, rygning status, brug af alkohol og familie historie af kræft) og Studerendes

t

-test WAS anvendes til kontinuerte variable [alder og legemsvægt index (BMI)]. For SNP med mindre allel frekvens (MAF) på 0,35, blev styrken i vores stikprøvestørrelse beregnet til at være 0,72 for at detektere en OR på 0,7 i case-kontrol undersøgelse.

For de vigtigste effekt af rs10795668, ubetinget logistisk regression blev udført for at beregne odds ratio (OR) og deres tilsvarende 95% konfidensintervaller (CIS), korrigeret for potentielle konfoundere (alder, køn, rygning status, alkoholrelaterede og BMI). Yderste periferi og 95% CIs som de målinger af effekt størrelse blev beregnet for genotyper AG versus GG og AA versus GG. For at undgå den antagelse af genetiske modeller, blev også analyseret dominante, recessive og additive modeller. To-faktor gen-miljø interaktion analyser blev evalueret ved hjælp af likelihood kvotientkriteriet sammenligner indlejrede modeller med kun vigtigste effekter og modeller med de vigtigste virkninger plus relevant interaktion sigt. Der miljømæssige faktorer, såsom rygning status, brug af alkohol og BMI, indgik i interaktion modeller. Ifølge WHO Expert Høring konklusion, BMI cut-off point for overvægt for kinesisk blev sat til at være 24 kg /m

2 [31]. Bonferroni-metoden blev anvendt til multipel korrektion sammenligning. Alle statistiske analyser blev udført ved hjælp af SPSS software 12,0 (SPSS, Inc., Chicago, III) og alle

P

værdier var tosidede testet med et betydeligt niveau på 0,05.

Meta-analyse af rs10795668 i samarbejde med CRC risiko

for yderligere at undersøge sammenhængen mellem rs10795668 og CRC risiko blev en meta-analyse gennemført i overensstemmelse med retningslinjerne i den foretrukne Reporting Produkter til systematiske reviews og meta-analyser (PRISMA) erklæring (https://www.prisma-statement.org) (Checkliste S1).

En systematisk litteratursøgning blev udført i PubMed /MEDLINE og ISI Web of Science uden sprog begrænsning op til slutningen af ​​november, 2012. søgestrategi var baseret på kombinationer af udtrykkene “rs10795668 eller 10p14” og “kolorektal cancer eller kolorektal neoplasme”. For at udvide dækningen af ​​vores søgninger, vi yderligere udførte søgninger i kinesisk Biomedical database (CBM) baseret på den samme strategi [32]. Desuden blev henvisninger i hentede artikler scannet. Anmeldelser, kommentarer og breve blev også kontrolleret for yderligere undersøgelser. Søgning blev udført i to eksemplarer af to uafhængige korrekturlæsere (Qin Qin og Li Liu)

Der blev inkluderet, hvis de mødte alle de følgende kriterier:. (1) original undersøgelse; (2) vurdering af sammenhængen mellem rs10795668 og CRC risiko; (3) case-kontrol eller kohortestudie design; (4) giver odds ratio (OR) med tilsvarende tillid 95% interval (95% CI) eller tilstrækkelige data til at beregne dem; (5) undersøgelser af mennesker; (6) de genotyper af rs10795668 i kontroller er i HWE. Vi forlod undersøgelser hos forsøgspersoner med Lynch-syndrom. Case rapporter, kommentarer, anmeldelser og ledere blev også udelukket. Hvis undersøgelserne havde overlappende emner, kun blev undersøgelsen med den største befolkning endelig inkluderet. Hvis mere end en geografisk eller etnisk befolkning blev inkluderet i en rapport, blev hver population behandles særskilt. Alle data blev udtrukket uafhængigt af to korrekturlæsere (Qin Qin og Li Liu) og enhver uenighed blev bedømmes af en tredje forfatter (Rong Zhong)

Følgende oplysninger blev udvundet fra hver undersøgelse:. Første forfatters navn, udgivelsesår , undersøgelse land, etnicitet af studiepopulation, studiedesign, studie type, genotype metode, antal sager og kontroller, kontrol kilde, MAF. HWE i kontroller skønnedes igen i meta-analyse fra goodness-of-fit

χ

2

test (

P

0,01) [33] – [35]. Pooled frekvens af A allel af rs10795668 i forskellige etniske grupper blev estimeret ved hjælp af den inverse varians metode beskrevet af Thakkinstian A et al. [36]. Statistisk heterogenitet på tværs af studierne indgår i metaanalysen blev vurderet ved Cochran s

Q

-statistic og betragtet som signifikant på

P

0,05 [37].

I

2

statistik blev derefter brugt til at estimere heterogenitet kvantitativt (

I

2

= 0-25%, ingen heterogenitet;

jeg

2

= 25-50%, moderat heterogenitet;

I

2

= 50-75%, stor heterogenitet;

I

2

= 75-100%, ekstrem heterogenitet ) [38]. Den faste effekter model, ved inverse varians metode blev anvendt til at beregne den poolede estimat når heterogenitet var ubetydelig; ellers blev den tilfældige effekter model, ved DerSimonian og Laird anvendte metode [39]. Følsomhedsanalyse blev udført for at vurdere indflydelsen af ​​hver undersøgelse om samlet skøn ved sekventiel fjernelse af hver undersøgelse [40]. Offentliggørelse skævhed blev estimeret ved tragt plot og Eegger test [41], [42]. Alle statistiske analyser blev udført i STATA statistisk software (version11.0, Stata Corporation, College Station, Texas) og alle

P

værdier var tosidede testet med en betydelig grad på 0,05

Resultater

Resultat af case-kontrol undersøgelse

Population egenskaber.

Kendetegnene for forsøgspersonerne blev beskrevet i tabel 1. Der var ingen signifikante forskelle i fordelingen af alder, køn og alkohol brug mellem cases og kontroller. Gennemsnitsalderen [± standardafvigelse (SD)] var 58,1 (± 11,6) år for sager og 58,4 (± 13,1) år for kontrol (

P

= 0,652). Flere rygere blev observeret i tilfælde end i kontrollerne (

P

0,001). Derudover BMI i sager, var betydeligt højere end i kontrollerne (

P

= 0,023).

Association analyse.

De genotype data rs10795668 til sager og kontroller blev vist i tabel 2. genotype distribution i kontrol overholdt Hardy-Weinberg ligevægt (

P

= 0,433). blev observeret signifikant forskel i genotype fordeling mellem cases og kontroller (

χ

2

= 9,89,

P

= 0,007). I den ubetingede logistisk regression model, individer med AA genotypen viste en signifikant reduceret CRC risiko sammenlignet med dem bærer GG-genotypen (OR = 0,51, 95% CI: 0,28-0,94). I allel model, en allel luftfartsselskaber viste også signifikant nedsat risiko sammenlignet med dem med G allel luftfartsselskaber (OR = 0,70, 95% CI: 0.52-0.93). Derudover faldt betydeligt risikoen for CRC blev også fundet i additiv model, med per-A-allel OR på 0,71 (95% CI: 0,54-0,94). Ligeledes signifikant sammenhæng mellem denne polymorfi og nedsat CRC risiko blev fundet i dominant model (OR = 0,65, 95% CI: 0,44-0,96). Mens ingen signifikante associationer blev fundet for AG versus GG og recessive model.

To faktor-gen-miljø interaktion analyser.

At udforske de potentielle interaktioner mellem rs10795668 og rygning status, alkohol bruge og BMI, vi udførte to-faktor-gen-miljø interaktion analyser af ubetinget Logistisk regression. Resultaterne blev vist i tabel 3. Ingen signifikant interaktion blev fundet i overensstemmelse med

P Drømmeholdet værdi af interaktionen sigt (

P

≥0.017). Blandt personer med BMI≥24 kg /m

2, bærer med AA og AG genotyper viste signifikant nedsat risiko for CRC sammenlignet med dem med GG genotype, med en OR på 0,45 (95% CI: 0,22-0,91). Dog blev foreningen ikke findes blandt personer med BMI. . 24 kg /m

2

Resultater af Meta-analyse

Karakteristik af inkluderede studier

som vist i figur 1, blev 31 potentielt relevante artikler identificeret og screenet, hvoraf, 17 artikler mødte inklusionskriterierne. Men efter yderligere undersøgelse, vi ekskluderet 4 undersøgelser [26] – [28], [43] for at medtage patienter med Lynch-syndrom, og en anden 4 undersøgelser [44] – [47] for indeholder overlappende deltagere med de inkluderede studier. Endelig kombinerer den aktuelle undersøgelse, i alt 10 publikationer [6], [17], [18], [20] – [25] med 14 date sæt bestående 39341 tilfælde og 41566 kontroller indgik i meta-analyse (Tabel 4). Af disse blev 7 studier gennemført i europæere, fem i asiater og 2 i afroamerikanere. Genotyper af rs10795668 i kontrol var i overensstemmelse med Hardy-Weinberg ligevægt for alle inkluderede studier (

P

0,01)..

Frekvens af A allel i kontrolpopulationer

Ingen signifikant heterogenitet blev observeret i europæiske og afrikanske amerikanske grupper (

P

heterogenitet

= 0,236 og 0,462 henholdsvis). Den samlede frekvens ved hjælp af den faste tilfældige effekter model var 0,327 (95% CI: 0,322-0,333) i europæiske kontroller og 0,063 (95% CI: 0,051 til 0,075) i African American kontroller. Der var betydelig heterogenitet blandt de asiatiske studier (

P

heterogenitet

0,001), og den poolede frekvens var 0,385 (95% CI: 0,352-0,419) under tilfældige effekter model. Disse samlede frekvenser svarede til dem rapporteret i dbSNP database over 0,353, 0,390 og 0,065 for europæere, asiater og afroamerikanere, hhv. På grund af den anden frekvens fordeling af SNP rs10795668 tværs af forskellige befolkningsgrupper, blev startet metaanalysen i hver etnisk gruppe for sig.

Metaanalysen af ​​rs10795668 i forbindelse med CRC.

Som vist i tabel 5, kun i asiatiske gruppe omfattende dokumentation af heterogenitet blev påvist (

P

heterogenitet

= 0,031,

i

2 = 62,3%), derfor yderste periferi i Asien gruppe blev samlet under tilfældige effekter model, og yderste periferi i europæiske og afrikanske amerikanske gruppe blev begge samlet under faste effekter model. Signifikant sammenhæng mellem varianten og CRC risiko blev fundet både i europæiske og asiatiske grupper, med yderste periferi af 0,91 (95% CI: 0,89-0,93) (figur 2) og 0,86 (95% CI: 0,78-0,96) (Figur 3), henholdsvis. Mens der i African American gruppe, viste variant borderline omvendt sammenhæng med CRC risiko (OR = 1,24, 95% CI: 0,99-1,56) (Figur 4) Vejviser

i de europæiske datasæt, yderligere analyse uden indledende undersøgelse [18] blev udført, for at undgå bias. Efter at udelukke den oprindelige undersøgelsens prøver, sammenhængen mellem varianten og CRC risiko var stadig signifikant, med OR på 0,94 (95% CI: 0,90-0,98,

P

heterogenitet

= 0,242) (figur S1) .

følsomhedsanalyser.

for at vurdere indflydelsen af ​​hver enkelt undersøgelse om poolede tilsætningsstof OR, følsomhedsanalyser blev udført ved at fjerne studiet sekventielt enkelte. Som vist i figur S2, de puljede yderste periferi var ens før og efter sletning af hver undersøgelse, der angiver robust stabilitet af de nuværende resultater.

Offentliggørelse bias.

Tragt plot og Egger test var anvendes til at vurdere publikationsbias. Som afspejlet i figur S3, formen af ​​tragten plot syntes symmetrisk. Og Egger test ikke afsløre nogen publikationsbias (tabel 5).

Diskussion

SNP rs10795668 placeret på 10p14 blev først afsløret at være forbundet med CRC risiko ved en flertrins GWA undersøgelse, men inkonsistente resultater er blevet rapporteret ved at følge studier. Nærværende case-kontrol undersøgelse fundet en signifikant sammenhæng mellem rs10795668 polymorfi og CRC risiko i kinesiske befolkning. Herefter fremkommer følgende meta-analyse foreslog også, at SNP signifikant var forbundet med CRC risiko. Denne meta-analyse var den første til at integrere offentliggjorte GWA studier og replikation undersøgelser for at klarlægge effekten af ​​rs10795668 variant på CRC risiko.

SNP rs10795668 kort til en 82-kb LD blok (8,73-8,81 Mb) inden 10p14 [18]. Tomlinson IP et al. undersøgte tre yderligere SNP’er i dette LD blok (rs706771, rs7898455 og rs827405) og fandt ingen beviser for mere end én sygdom locus i regionen [18]. Ligesom de fleste af risiko varianter identificeret af GWAS, rs10795668 bosat udenfor de kodende regioner af gener. De nærmeste forudsagte gener er

BC031880

, ligger 0,4 Mb proksimalt for rs10795668, og

LOC389936

, ligger 0,7 Mb distalt. Skønt der er fundet variant rs10795668 at være forbundet med CRC risiko, er lidt om funktionen af ​​SNP. For at undersøge eventuelle regulerende funktioner på ekspressionen af ​​nabolandet gener, Loo LW gennemførte cis-udtryk kvantitativ egenskab loci analyser og fundet en signifikant sammenhæng mellem den lave kolorektal cancer risiko allel (A) for rs10795668 på 10p14 og øget ekspression af

ATP5C1

[48].

ATP5C1

koder for gamma-underenheden af ​​den katalytiske kerne (F1) af mitokondrie ATP syntase, enzymkomplekset ansvarlig for ATP-syntese, vides at spille en central rolle i cellulær respiration. En fælles begivenhed i tumorceller er det metaboliske skift fra respiration (i mitochondrierne) til glycolyse (i cytosolen), der ofte omtales som “Warburg-effekten” [49]. Flere mekanismer kan indlede denne omskifter, hvoraf den ene er et fald i ekspressionen af ​​beta-underenheden af ​​ATP syntase (F1) (

ATP5B

), der fører til afbrydelse af den katalytiske funktion af ATP syntase kompleks, en begivenhed, der tidligere er blevet observeret i flere cancertyper [50], [51]. Den øgede udtryk for

ATP5C1

forbundet med A-allelen på rs10795668 ville være i overensstemmelse med at opretholde aktiviteterne i ATP-syntase og cellulære respiration og potentielt hæmme tumor progression for tyktarmskræft. Men

ATP5C1

, ligger at10p15.1, er ikke det nærmeste tilstødende gen. Nogle undersøgelser [52], [53] tyder på, at de GWAS risiko varianter ikke fortrinsvis kan regulere gener, der er nærmest. De transkriptionelle reguleringsmekanismer påvirket af allel status kan involvere komplekse kromatin bekræftelse stater og funktion i et væv specifik kontekst. Desuden fleste varianter identificeret af GWAS indebærer sandsynligheden for at være i sammenkædning med de “rigtige” kausale varianter [54], så det er muligt, at polymorfi er i koblingsuligevægt med “rigtige” kausal loci. Hvad mere er, at forstå den biologiske funktion af disse loci, der fokuserer på ikke-kodende varianter, måske er den største udfordring i “post-GWAS ‘æra [55].

metaanalysen Resultaterne viste signifikant sammenhæng mellem varianten rs10795668 og CRC risiko både i europæiske og asiatiske befolkning, men i afroamerikanere foreningen var borderline signifikant og i den modsatte retning. Det puljede En allel frekvens på tværs forskellige etniske befolkning varieres. Desuden blev det bemærket, at Kupfer SS et al. fandt også, at der var genetisk heterogenitet i CRC foreninger amerikanere af afrikansk versus europæisk afstamning [24]. Den følsomhedsanalyser og publikationsbias vurdering angav de aktuelle resultater fra denne meta-analyse var pålidelige.

Nogle begrænsninger i case-kontrol undersøgelse og metaanalysen skal løses. For det første stikprøve størrelsen af ​​vores case-kontrol undersøgelse var relativt lille, hvilket resulterer i den relativt utilstrækkelige statistiske styrke. For det andet, i metaanalysen, at antallet af offentliggjorte undersøgelser var fortsat utilstrækkelig for analyserne i asiatiske og afrikanske amerikanske gruppe, der kunne maskere eller overdriver den mulige sande foreningen. For det tredje, selv om signifikant sammenhæng mellem rs10795668 og CRC er blevet bekræftet i denne undersøgelse, er ikke blevet gjort de funktionelle eksperimenter, så uanset om denne variant beskytter fortsat usikker.

Som konklusion, vores case-kontrol undersøgelse i en kinesisk befolkning og meta-analyse bekræftet, at varianten rs10795668 var signifikant forbundet med CRC risiko. Yderligere bør gennemføres funktionel kontrol for at bekræfte resultaterne, som kan hjælpe optrævle de underliggende mekanismer af denne variant i CRC udvikling og progression.

Støtte oplysninger

figur S1.

skov plot af sammenslutning af rs10795668 med kolorektal cancer for europæisk gruppe uden den oprindelige undersøgelse. (TIF)

doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s001

(TIF)

Figur S2.

Følsomhedsanalyser for europæisk gruppe. (TIF)

doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s002

(TIF)

Figur S3.

Tragt plot for offentliggørelse bias for europæisk gruppe. (TIF)

doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s003

(TIF)

Tjekliste S1.

PRISMA 2009 tjekliste

doi:. 10,1371 /journal.pone.0064310.s004

(DOC)