PLoS ONE: Kvantitativ Vurdering af indflydelse TP63 Gene polymorfier og lungekræft Risiko: Beviser Baseret på 93.751 Subjects

Abstrakt

Baggrund

Flere genom-dækkende forening undersøgelser af lungekræft (LC ) har rapporteret lignende fund af en ny modtagelighed locus, 3q28. Efter at en række undersøgelser rapporteret, at rs10937405, og rs4488809 polymorfi i kromosom 3q28 er blevet impliceret i LC risiko. Imidlertid har undersøgelserne givet modstridende resultater.

Metoder

PubMed, ISI Web of Science, EMBASE og kineserne National videninfrastruktur databaser blev systematisk søgt at identificere relevante studier. Data blev indvindes uafhængigt af to anmeldere. En meta-analyse blev udført for at undersøge sammenhængen mellem rs10937405, rs4488809 polymorfi ved 3q28 og modtagelighed for LC. Odds ratio (OR) og 95% konfidensintervaller (95% CIS) blev beregnet. Heterogenitet og publikationsbias blev også testet.

Resultater

I alt 9 undersøgelser, herunder 35,961 LC tilfælde og 57,790 kontroller var involveret i denne meta-analyse. En samlet random-effects per-allel ELLER of1.19 (95% CI: 1,14-1,25; P 10

-5) og 1,19 (95% CI: 1,13-1,25; P 10

-5) blev fundet for rs10937405 og rs4488809 polymorfi hhv. Lignende resultater blev også observeret ved anvendelse af dominant eller recessiv genetisk model. Efter stratificeret efter etnicitet, blev der signifikante sammenhænge findes blandt East asiater (per-allel OR = 1,22, 95% CI: 1,17-1,27; P 10

-5); mens ingen signifikante associationer blev fundet blandt kaukasiere for rs10937405. I undergruppen analyse af prøvens størrelse, var signifikant øget risiko fundet for disse polymorfier i alle genetiske modeller. Når analyseret efter histologisk type, virkningerne af rs10937405, og rs4488809 ved 3q28 om risikoen for lungekræft var signifikante meste for lunge adenocarcinom.

Konklusioner

Vores resultater viste, at rs10937405-G allelen og rs4488809-G-allelen kan være risikofaktorer-overdragelse faktorer for udvikling af lungekræft, især for østasiatiske befolkninger

Henvisning:. Zhang L, Wang XF, Ma YS, Xia Q, Zhang F, Fu D, et al. (2014) Kvantitativ Evaluering af indflydelse TP63 Gene polymorfier og lungekræft Risiko: Beviser Baseret på 93,751 Emner. PLoS ONE 9 (1): e87004. doi: 10,1371 /journal.pone.0087004

Redaktør: John Souglakos, University Hospital of Heraklion og Laboratoriet for Tumor Cell Biology, School of Medicine, University of Crete, Grækenland

Modtaget: Oktober 2, 2013; Accepteret: 16. december 2013; Udgivet: 23 januar 2014

Copyright: © 2014 Zhang et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. National Natural Science Foundation of China (81201535, 81302065), Knowledge Innovation Program for Shanghai Institutes for Biologisk Institut, Chinese Academy of Sciences (2012KIP203) og Shanghai Natural Science Foundation (12ZR1436000). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Lungekræft (LC) er den mest almindelige malignitet og den førende årsag til kræft død på verdensplan, med en anslået fem-års overlevelse på 15% [1]. De forskellige histologiske former for LC er typisk opdelt i småcellet lungecancer (SCLC) og ikke-småcellet lungekræft (NSCLC), der omfatter adenocarcinom og skællede tumorer. Hver af LC typer har forskellige klinisk-patologiske karakteristika reflekterende af forskelle i carcinogenese [2]. Trods megen undersøgelse, årsagerne er endnu ikke fuldt forstået. Epidemiologiske undersøgelser tyder på, at udsættelse for tobak-associeret kræftfremkaldende stoffer er klart impliceret i sin ætiologi [3]. Men det er også blevet rapporteret, at kun 20% af rygere udvikler LC, hvilket tyder på, at genetiske variationer og andre miljømæssige faktorer også spiller en vigtig rolle i fastsættelsen af ​​individuelle forskelle i LC modtagelighed [4], [5].

For nylig blev spektakulære forhånd lavet identificere modtagelige gener involveret i LC gennem genom-dækkende forening strategi (GWAS). Genomiske regioner på kromosomer 15q25.1 (CHRNA5, CHRNA3 og CHRNA4) [6] – [8], 5p15.33 (tert-CLPTM1L) [9], [10] og 6p21.33 (BAT3-MSH5) [9] har blevet identificeret til at være associeret med modtagelighed for LC ved GWAS i populationer af europæisk afstamning. Men undersøgelser også vist tilstedeværelsen af ​​genetisk heterogenitet i LC modtagelighed mellem populationer af europæisk afstamning og asiater [6] – [8]. En nylig GWAS på lunge adenocarcinom risiko i de japanske og koreanske befolkninger identificeret en ny locus, 3q28 (TP63) [11]. Efterfølgende blev en signifikant, men svagere sammenslutning af 3q28 variationer med lunge adenocarcinom risiko valideret i europæerne [12]. Til dato har mange undersøgelser case-kontrol er udført for at undersøge den rolle, TP63 på 3q28 polymorfi i genetisk modtagelighed for LC mellem forskellige befolkningsgrupper. Genetiske associationsstudier kan være problematisk at reproducere på grund af utilstrækkelig magt, afprøvning flere hypotese, befolkning lagdeling, kilde til kontrol, publikationsbias, og fænotypisk heterogenitet. Derfor har vi gennemført en omfattende meta-analyse på alle støtteberettigede undersøgelser for at vurdere den samlede LC risiko for 3q28 polymorfi samt at kvantificere mellem-studiet heterogenitet og potentiel bias.

Materialer og Metoder

Litteratur Søg Strategi

Genetiske associationsstudier offentliggjort inden udgangen af ​​oktober 2013 LC og polymorfier inden kromosom 3q28 blev identificeret via en søgning på PubMed, Web of Science, EMBASE, og CNKI (kinesisk Nationalt Videnscenter Infrastructure) uden sproglige begrænsninger. Søg sigt kombinationer var nøgleord i forbindelse med kromosom 3q28 (f.eks “3q28”, “rs10937405”, “rs4488809”, “tp63”) i kombination med ord relateret til LC (fx lungekræft “eller” lungekræft “eller” ondartet lunge neoplasme). Desuden blev studier identificeret ved en manuel søgning af reference- lister over anmeldelser og hentede undersøgelser. Alle undersøgelser blev omhyggeligt vurderet til at identificere duplikerede data. Kriterier der anvendes til at bestemme duplikerede data inkluderet studietid, hospital, information behandling og de kriterier yderligere integration.

Støtteberettigede Studies og Data Extraction

For at inkludere relevante undersøgelser på dette metaanalyse til følgende kriterier blev anvendt: (1) case-kontrol eller kohortestudier, (2) at vurdere sammenhængen mellem 3q28 polymorfier og LC risiko, (3) identifikation af LC tilfælde blev bekræftet histologisk eller patologisk, og (4) at give tilstrækkelige data til at beregne odds ratio (OR) med dens 95 konfidensinterval (CI) og P-værdi. De vigtigste årsager til udelukkelse af studier var (1) overlappende data, (2) case-only studier, (3) familie-baserede studier og oversigtsartikler. Hvis mere end én artikel ved hjælp af samme data blev offentliggjort, blev kun undersøgelsen med den største datasæt inkluderet i metaanalysen.

To efterforskere udvundet oplysninger fra alle støtteberettigede publikationer uafhængigt i henhold til de inklusionskriterier er anført ovenfor. For modstridende evaluering blev der indgået en aftale efter diskussion blandt alle forfattere. For hver undersøgelse blev følgende karakteristika indsamlet: første forfatterens navn, udgivelsesår, etnicitet, identifikation af kræfttilfælde, histologisk type, alder, køn, rygning status (aldrig rygere eller nogensinde rygere), kilde til kontrolgrupperne (befolkning-baseret kontroller og hospitals-baserede kontroller), matchende faktorer, Hardy-Weinberg ligevægt (HWE) status blandt kontroller, antal tilfælde og kontroller, genotype frekvens og genotypebestemmelsesmetoder. For undersøgelser, herunder emner af forskellige etniske grupper, blev ekstraheret data separat og kategoriseres som East asiater og kaukasere.

kvalitetsvurdering

For associationsstudier med inkonsistente resultater på samme polymorfier, bør den metodiske kvalitet vurderes af passende kriterier for at begrænse risikoen for at indføre skævhed i meta-analyser eller systematiske reviews. En procedure kaldes “udvidet kvalitet score”, er udviklet til at vurdere kvaliteten af ​​associationsstudier. Proceduren scores hver papir kategorisere det som at have “høj”, “median” eller “dårlig” kvalitet. Detaljeret procedure af kvalitetsvurderingen er tidligere beskrevet [13].

statistiske metoder

Afvigelse fra HWE for kontroller blev undersøgt ved χ

2 tests. OR med 95% CIs blev anvendt til at vurdere styrken af ​​sammenhængen mellem de 3q28 polymorfier (rs10937405 og rs4488809) og LC risiko. Den per-allel ELLER risikoen allelen blev estimeret. Derefter anslås vi risikoen for disse polymorfier på LC under dominante og recessive genetiske modeller. Random-effekter og fast-effekt summariske mål blev beregnet som omvendt-varians-vægtet gennemsnit af log odds ratio. Resultaterne af resumé tilfældige-effekter blev rapporteret i teksten, fordi den tager højde for variationen mellem undersøgelser. Heterogenitet på tværs enkelte studier blev beregnet ved anvendelse af Cochran χ

2 baseret Q test og jeg

2 test efterfulgt af datterselskab analyser eller af tilfældige-effects regressionsmodeller med begrænset maksimal sandsynlighed estimering [14], [15]. Generelt, jeg

2 værdier 25% svarer til ingen eller ringe heterogenitet, værdier 25-50% svarer til moderat heterogenitet, og værdier 50% svarer til en stærk heterogenitet mellem studier. Kilder til heterogenitet blev undersøgt af stratificerede meta-analyser baseret på etnicitet og stikprøvestørrelse (nr sager ≥ 1000 eller 1000). Etniske gruppe blev defineret som østasiater (dvs. kinesisk, japansk og koreansk), og kaukasiere (dvs. folk af europæisk oprindelse). Desuden blev etnicitet, prøve størrelse, alder, køn og genotype metode analyseres som kovariater i meta-regression. Betydningen af ​​den poolede OR blev bestemt ved Z-test. Offentliggørelse skævhed blev vurderet med Egger test og Begg test [16], [17]. Følsomhed analyse blev udført ved at fjerne hver enkelt undersøgelse på skift fra den totale og re-analysere resten. Analysen blev udført ved hjælp af Stata software version 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX). Alle P-værdier var for to-sidet analyse og værdier P. 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant

Resultater

Karakteristik af Studies

På baggrund af vores søgestrategi, den primære screening producerede 97 potentielt relevante artikler. 88 artikler blev udelukket, fordi de klart ikke opfyldte inklusionskriterierne eller overlappende referencer. I alt 9 støtteberettigede undersøgelser [11], [12], [18] – [24] blev inkluderet i metaanalysen involverer 35,961 LC tilfælde og 57,790 kontroller. Udvælgelsesprocessen litteratur var viste i figur S1. Blandt dem blev 23 datasæt identificeret for rs10937405 polymorfi, herunder i alt 31,109 tilfælde og 51,999 kontroller, og for de rs4488809 polymorfi 18 datasæt blev identificeret på i alt 19,790 tilfælde og 26,264 kontroller. Genotypen fordelinger i styringer til alle undersøgelser var i overensstemmelse med HWE. Severn undersøgelser fik høj kvalitet, og to undersøgelser blev givet median kvalitet. Nej ‘dårlig kvalitet’ undersøgelse blev fundet. Karakteristik af undersøgelser, der indgår i den aktuelle metaanalyse er præsenteret i tabel 1.

Foreningen af ​​rs10937405 Polymorfi med lungekræft

Samlet set var der tegn på en sammenhæng mellem øget risiko for LC og rs10937405 polymorfi i forskellige genetiske modeller, når alle de støtteberettigede studier blev samlet ind i den meta-analyse. Brug random effekt model, resuméet pr-allel eller den rs10937405 G variant til LC var 1,19 [95% CI: 1,14-1,25, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-5; Figur 1], med tilsvarende resultater under dominante og recessive genetiske modeller af 1,27 [95% CI: 1,15-1,40, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-4] og 1,25 [95% CI: 1,19-1,33, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-4] hhv. Efter justering for multiple test vha Bonferroni korrektion, alle væsentlige foreninger for rs10937405 under forskellige genetiske modeller tilbage. Betydelig heterogenitet var til stede blandt de 23 datasæt (P 0,05). I meta-regressionsanalyse, alder (P = 0,26), køn (P = 0,11), stikprøvestørrelse (P = 0,06), og genotype metode (P = 0,78), ikke signifikant forklaret sådan heterogenitet. Derimod etnicitet (P = 0,001) var signifikant korreleret med størrelsen af ​​den genetiske effekt.

Når undersøgelser blev stratificeret for etnicitet, blev der betydelige risici findes blandt østasiater i alle genetiske model [G allelen : OR = 1,22, 95% CI: 1,17-1,27; dominerende model: OR = 1,26, 95% CI: 1,13-1,38; recessiv model: OR = 1,28, 95% CI: 1,17-1,36]. Der blev imidlertid ikke signifikante resultater påvist i de kaukasiske befolkning [G allel: OR = 1,07, 95% CI: 1,00-1,16; dominerende model: OR = 1,08, 95% CI: 0,99-1,21; recessiv model: OR = 1,10, 95% CI: 1,00-1,21]. Datterselskab analyser af stikprøvestørrelsen gav en per-allel OR for små studier af 1,27 [95% CI: 1.17-1.37, P (Z) 10

-5], og for store studier af 1,16 [95% CI: 1,10 -1,22, P (Z) 10

-5; . Tabel 2]

I undergruppe analyser af histologiske typer af LC, fandt vi, at rs10937405 polymorfi var signifikant associeret med lunge adenocarcinom [G allel: OR = 1,26, 95% CI: 1,21-1,30, P (Z) 10

-5] og pladecellekræft [G allel: OR = 1,14, 95% CI: 1,06-1,22, P (Z) 10

-4], mens ingen signifikant sammenslutninger blev påvist for småcellet carcinom (tabel 3). Vi undersøgte forholdet mellem polymorfismen og kendte miljømæssige tobak engagementer. Effekten af ​​tobaksrøg var ens for aldrig rygere med pr-allel OR på 1,27 (95% CI: 1.21-1.33), i forhold til nogensinde rygere (OR = 1,26, 95% CI: 1,18-1,34). Desuden har vi stratificeret de inkluderede studier efter køn. Tilsvarende statistisk signifikante resultater blev også observeret i både mandlige og kvindelige (tabel 3).

Foreningen af ​​rs4488809 Polymorfi med lungekræft

For LC risikoen og rs4488809 polymorfi, vores meta -analyse gav en samlet OR på 1,19 (95% CI: 1,13-1,25, P 10

-5, figur 2) med statistisk signifikant mellem-studie heterogenitet (P 10

-5). Markant øget LC risici blev også fundet ved hjælp dominerende [OR = 1,24, 95% CI: 1,11-1,38, P (Z) 10

-5; P (Q) 10

-4] og recessive model [OR = 1,25, 95% CI: 1,14-1,37, P (Z) 10

-5; P (Q) = 0,01]. Eftersom alle inkluderede studier vedrørende rs4488809 polymorfi blev udført i østasiatiske befolkninger, vi så foretaget undergruppe analyse af prøvens størrelse. I den stratificerede analyse af prøvens størrelse, blev der betydelige risici findes blandt større studier i alle genetiske modeller (G allel: OR = 1,24, 95% CI: 1,20-1,28, P 10

-5; dominerende model: OR = 1,39 , 95% CI: 1,31-1,48, P 10

-5; recessiv model: OR = 1,30, 95% CI: 1,22-1,37, P 10

-5) uden signifikant mellem-studie heterogenitet (P 10

-5] imidlertid blev detekteret væsentlige foreninger for planocellulært karcinom eller småcellet carcinom (tabel 3). Foreninger af polymorfi med LC risiko blev observeret både i nogensinde rygere og aldrig rygere, og både mandlige og kvindelige (tabel 3).

I meta-regression, stikprøvestørrelse (P = 0,02) forklarede en stor del af heterogenitet, mens sex distribution (P = 0,29), gennemsnitsalder (P = 0,14), og genotype metode (P = 0,31) forklarede lidt heterogenitet.

Følsomhed Analyser og publikationsbias

En enkelt undersøgelsen omfattede i meta-analyse blev slettet hver gang for at afspejle indflydelsen af ​​individuelle data-sæt til de poolede yderste periferi, og de tilsvarende puljede yderste periferi ikke kvalitativt ændret (figur S2 og S3). Formen af ​​tragten parceller var symmetrisk for disse polymorfier (Figur S4 og S5). De statistiske resultater stadig ikke vise små studiegrupper effekter i disse undersøgelser rs4488809 (Egger test, P = 0,30) og rs10937405 (Egger test, P = 0,06).

Diskussion

GWAS har ført til identifikationen af ​​adskillige nye genetiske varianter associeret med risiko lungekræft. De fleste af disse lungekræft GWAS og replikation undersøgelser er blevet gennemført i de europæiske befolkninger [6] – [10] og i mindre grad i østasiater [11], [18], [19]. Der er imidlertid betydelige forskelle i allelfrekvenser og forekomsten af ​​lungekræft blandt forskellige populationer. Det er derfor vigtigt, at kvantitativt vurdere virkningerne af GWAS-identificerede markører i forskellige etniske befolkningsgrupper og udforske potentielle heterogenitet af offentliggjorte data. Meta-analyse er et middel til at øge den effektive stikprøvestørrelse under undersøgelse ved at samle data fra de enkelte forbindelsesundersøgelser og dermed styrke den statistiske effekt af analysen til vurdering af genetiske virkninger [25]. Dette er den første omfattende meta-analyse, som omfatter i alt 35,961 tilfælde og 57,790 kontroller fra 9 case-control studier, undersøge sammenslutning af to almindeligt studerede polymorfier af 3q28 (rs10937405, og rs4488809) med risiko lungekræft. Vores resultater viste, at rs10937405-G-allelen, og rs4488809-G allelen er en risikofaktor for at udvikle lungekræft.

I den stratificerede analyse af etnicitet, blev signifikante associationer fundet i østasiater for rs10937405 polymorfi i alle genetiske modeller ; mens ingen foreninger blev fundet i kaukasiere, hvilket tyder på en mulig rolle af etniske forskelle i genetiske baggrunde og det miljø, de boede i [26]. Faktisk fordelingen af ​​risikoen G allelen varierer udstrakt mellem forskellige racer, med en prævalens på -70% blandt østasiater [19] – [22], og ~55% blandt kaukasere [12], [23]. Således ikke at identificere nogen signifikant sammenhæng i den hvide befolkning kan skyldes væsentligt lavere statistisk styrke forårsaget af den relativt lavere forekomst af G allel af rs10937405. Derfor er yderligere undersøgelser berettiget til yderligere at validere etnisk forskel i effekten af ​​denne polymorfi på risiko lungekræft. Endvidere kan studiedesign eller lille stikprøvestørrelse eller nogle miljømæssige faktorer påvirke resultaterne. Det er muligt, at variation i dette locus har beskedne virkninger på lungekræft, men miljømæssige faktorer kan dominere i udviklingen af ​​lungecancer og maskere virkningerne af denne variation. Specifikke miljømæssige faktorer som livsstil og rygning, der allerede er blevet godt undersøgt i de seneste årtier [1]. Desuden forskellige populationer har normalt forskellige bindingsuligevægt mønstre. En polymorfisme kan være i tæt forbindelse med en anden nærliggende kausal variant i en etnisk befolkning, men ikke i en anden. Disse polymorfier kan være i tæt forbindelse med forskellige nærliggende kausale varianter i forskellige populationer. Som for rs4488809 kun undersøgelser blandt østasiater var tilgængelige i øjeblikket, yderligere undersøgelser, herunder et bredere spektrum af emner for at undersøge den rolle, denne variant i forskellige etniske befolkningsgrupper vil være behov for at bekræfte vores resultater.

Når analyseret efter til histologisk type, virkningerne af rs10937405 og rs4488809 på 3q28 om risikoen for lungekræft var signifikante for det meste for adenocarcinom. Imidlertid adenocarcinom udgør ca. 50% af alle histologiske typer lungecancer [11]. Årsagen til den observerede tumorspecifikke forskel i risikoen knyttet til disse polymorfier er ukendt. Dog kan forskellige kræftfremkaldende processer være involveret i tilblivelsen af ​​forskellige tumortyper på grund af tilstedeværelsen af ​​funktionelt forskellige 3q28 polymorfier. Derfor bør fremtidige undersøgelser bruge homogene kræftpatienter. Når stratificeret ved at ryge adfærd og køn, disse SNPs tendens til at have lignende eller for kvinder og mænd, aldrig rygere og nogensinde rygere.

Selv om det vil være en udfordring at identificere den præcise mekanisme, hvorved 3q28 variation påvirker lungekræft udvikling akkumulering af DNA-skade og manglende reaktion på genotoksisk stress er anerkendt for at bidrage til lunge carcinogenese. TP63 (også kendt som P63) er et medlem af tumor suppressor p53-familien, som er afgørende for cellulær differentiering og reagere på cellulært stress [27]. Eksponering af celler til DNA-beskadigelse fører til induktion af TP63 og begge isoformer har evnen til at transaktivere TP53 målgener, dermed påvirker cellulær respons på DNA-skade [28], [29]. TP63 udtrykkes hovedsageligt i to isoformer, TA og N-terminal-trunkeret (An) former, og dets biologiske rolle synes at være mere kompleks end for en klassisk tumor suppressor [30]. TAp63 isoformer forekommer meget transkriptionelt potent og er afgørende for at opretholde voksne epidermale stamceller [31], celleproliferation, differentiering og overlevelse upon NF-KB-aktivering [32]. TP63 overudtrykt og amplificeret kan øge invasivitet og aggressivitet af celler i normale eller hyperplastiske epitelceller [33], [34]. Ophobning af DNA-skader og manglende reaktion på genotoksisk stress bidrager til en tidligere trin i carcinogenese. Fordi mulig kandidat SNPs er placeret i intron 1 af TP63, som koder TAp63 isoformer, disse resultater antyder, at en eller flere af disse SNP’er kan have en funktionel rolle i reguleringen af ​​TP63 genekspression. Salg

styrker af dette undersøgelsen omfatter den meget store stikprøve størrelse, ingen afvigelse fra HWE, og den høje kvalitet af de kvalificerede undersøgelser. Dog skal vores aktuelle undersøgelse tolkes med flere tekniske begrænsninger i tankerne. For det første, at langt størstedelen af ​​hvide emner i undersøgelsen er af østasiatisk afstamning, og statistisk styrke til analyser i andre etniske grupper er begrænset. Fordi prøvens størrelse var relativt mindre for kaukasiske studier er hovedkonklusionerne fra dette manuskript baseret på analyser blandt hvide østasiatiske befolkninger. Fremtidige undersøgelser, herunder større antal kaukasisk eller afrikanske er nødvendige for at klarlægge sammenhængen i resultaterne på tværs af etniske grupper. For det andet blev vores resultater baseret på ukorrigerede skøn, mens bør gennemføres en mere præcis analyse, hvis individuelle data var til rådighed, som giver mulighed for justering af andre kovariater, herunder alder, familie historie, miljømæssige faktorer og livsstil. For det tredje blev undergruppe metaanalyser overvejer associationer mellem de to polymorfier og rygevaner, køn, samt mellem forskellige histologiske typer af lungekræft udført på grundlag af en brøkdel af alle de mulige data, der skal samles, så selektionsbias kan har fundet sted, og vores resultater kan overoppustede. Ikke desto mindre er det samlede antal emner i denne del af analysen omfatter den største stikprøve hidtil.

På trods af disse begrænsninger, vores meta-analyse viste, at rs10937405, og rs4488809 polymorfi ved 3q28 kunne være risiko-overdragelsen faktor for udvikling af lungekræft, især for østasiatiske befolkninger. Større undersøgelser af forskellige etniske befolkningsgrupper, især med detaljerede individuelle oplysninger, der er nødvendige for at bekræfte vores resultater. Da det er usandsynligt, at genetisk variation alene vil forklare lungekræft byrde, der er behov for yderligere forskning for at identificere miljømæssige eksponeringer og gen-miljø interaktioner i disse populationer. Desuden vil de funktionelle genetiske varianter og mekanismer der ligger til grund denne forening kræver yderligere undersøgelser.

Støtte Information

figur S1.

Study udvælgelsesproces

doi:. 10,1371 /journal.pone.0087004.s001

(TIF)

Figur S2.

Resultat af følsomhedsanalyser for 3q28-rs10937405 polymorfi og LC risiko

doi:. 10,1371 /journal.pone.0087004.s002

(TIF)

Figur S3.

Resultat af følsomhedsanalyser for 3q28

–

rs4488809 polymorfi og LC risiko

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s003

(TIF)

Figur S4..

Begg s tragt plot af 3q28-rs10937405 polymorfi og risikoen for lungekræft

doi:. 10,1371 /journal.pone.0087004.s004

(TIF)

Figur S5.

Begg s tragt plot af 3q28

–

rs4488809 polymorfi og lungekræft

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s005

(TIF)

Tjekliste S1..

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s006

(DOC)