PLoS ONE: Systematisk Identifikation af Core transkriptionsfaktorer Mediating dysreguleret Links Bridging inflammatoriske tarmsygdomme og kolorektal cancer

Abstrakte

Akkumulere beviser en stram sammenhæng mellem betændelse og kræft. Men omfattende identifikation af centrale transkriptionsfaktorer (dvs. kerne TF’er) medierer de dysregulerede links forbliver udfordrende, hovedsageligt på grund af en mangel på prøver, der effektivt kan afspejle forbindelserne mellem betændelse og tumorigenese. Her konstruerede vi en række TF-medieret regulerende net fra en stor samling af ekspression profilering af normale colon væv, inflammatoriske tarmsygdomme (IBDS) og kolorektal cancer (CRC), som indeholder 1201 prøver i alt, og derefter foreslået en net- tilgang til at karakterisere potentielle forbindelser brodannende inflammation og cancer. Til dette formål har vi beregnet signifikant dysregulerede relationer mellem inflammation og deres tilknyttede kræftnetværk, og derefter 24 core TF’er med deres dysreguleret gener blev identificeret. Kollektivt, vores tilgang giver os ret vigtigt indblik i inflammation-associerede tumorigenese i kolorektal cancer, som også kunne anvendes til at identificere funktionelt dysregulerede relationer medierer sammenhængen mellem andre forskellige sygdomsområder fænotyper

Henvisning:. Xiao Y, Fan H, Zhang Y, Xing W, Ping Y, Zhao H, et al. (2013) systematisk identifikation af Core transkriptionsfaktorer Mediating dysreguleret Links Bridging inflammatoriske tarmsygdomme og endetarmskræft. PLoS ONE 8 (12): e83495. doi: 10,1371 /journal.pone.0083495

Redaktør: Paolo Provero, universitetet i Torino, Italien

Modtaget: Juli 9, 2013; Accepteret: November 4, 2013; Udgivet: 26 december, 2013