PLoS ONE: Prostata Cancer Risk ændres ikke af TP53AIP1 Kimcellelinje Mutationer i en tysk sag-Control Series

Abstrakt

Prostatakræft modtagelighed har tidligere været forbundet med beskærer germlinie varianter i genet

TP53AIP1

(tumor protein p53 reguleres apoptoseinducerende protein 1). For to tilsyneladende tilbagevendende mutationer (p.Q22fs og p.S32X) en bemærkelsesværdige OR på 5,1 blev rapporteret for risiko prostatakræft. Da disse resultater ikke er blevet valideret hidtil, vi genotype p.Q22fs og p.S32X i to tyske serie med i alt 1.207 prostatakræft tilfælde og 1.495 kontroller. De trunkering varianter blev ikke signifikant associeret med prostatacancer i ingen af ​​de to kohorter, eller i den kombinerede analyse [odds ratio (OR) = 1,16; 95% konfidensinterval (CI 95%) = 0,62-2,15; p = 0,66]. Carriers viste ingen signifikante forskelle i familiens historie prostatakræft, alder ved diagnose, Gleason score eller PSA på diagnosetidspunktet sammenlignet med ikke-carrier sager prostatacancer. Den store stikprøve af den kombinerede kohorte afviser en højrisiko-effekt større end 2,2 og indikerer en begrænset rolle

TP53AIP1

i prostatakræft disposition

Henvisning:. Luedeke M, Coinac I, Linnert CM, Bogdanova N, Rinckleb AE, Schrader M, et al. (2012) Prostata Cancer Risk ændres ikke af

TP53AIP1

Kimcellelinje Mutationer i en tysk sag-Control Series. PLoS ONE 7 (3): e34128. doi: 10,1371 /journal.pone.0034128

Redaktør: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare, Italien

Modtaget: Januar 18, 2012; Accepteret: 22 februar 2012; Udgivet: 23 Mar 2012

Copyright: © 2012 Luedeke et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Prostata Cancer Genetics Project i Ulm er blevet understøttet af en National Cancer Institute underentreprise titlen “prostatakræft Følsomhed: The ICPCG undersøgelsen” – tilskud # CA089600 – https://cancer.gov/. AM er blevet støttet af den Hannelore Munke fællesskab, en intern forskning fællesskab af Hannover Medical School. De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Prostatacancer (PRCA) er den hyppigste tumor og den tredje hyppigste årsag til kræft dødsfald hos mænd i den vestlige industrialiserede verden [1]. I ætiologien af ​​PRCA antages at være involveret [2] en betydelig grad af arvelighed. Til dato har mere end 30 moderat risiko-associerede single nukleotidpolymorfismer blevet identificeret i genom brede associationsstudier, som forklarer en mindre brøkdel af arvelighed [3]. I modsætning hertil risiko gener høje som kunne være ansvarlig for størstedelen af ​​den observerede familiær klyngedannelse er stadig ukendt.

Der er stigende tegn på, at gener involveret i DNA-skade responset spiller en prædisponerende rolle for PRCA [4]. Dette omfatter DNA reparation processer samt relaterede mekanismer som apoptotiske veje. TP53AIP1 (tumor protein p53 reguleres apoptoseinducerende protein 1) en central rolle i tumorsuppressor p53 afhængig apoptotisk signalering. TP53AIP1 er lokaliseret i mitokondriemembranen og medierer apoptose gennem cytokrom

c

frigivelse [5]. Udtrykket af

er TP53AIP1

udløses ved alvorlige skader ved fosforylering af p53 på Ser46 [6].

TP53AIP1

viste sig at være muteret i PRCA væv i en nylig undersøgelse [7]. De to identificerede beskærer mutationer p.Q22fs og p.S32X viste sig at være tilbagevendende kim-line varianter og var stærkt forbundet med PRCA risiko (OR 5,1), hvilket tyder på

TP53AIP1

som et lovende modtagelighed gen. I nærværende undersøgelse har vi vurderet risikoen virkning af disse to

TP53AIP1

mutationer i to uafhængige tyske PRCA kohorter.

Resultater

Begge trunkering varianter blev observeret i vores kohorter. Mens rammeskift allel p.Q22fs var til stede i 1,8% tilfælde og 1,6% kontrol, nonsens mutation p.S32X syntes at være forholdsvis sjældne (0,1% luftfartsselskaber i begge tilfælde og kontroller). Samlet set blev der p.Q22fs og p.S32X ikke forbundet med prostatakræft risiko, hverken i den kombinerede serie af Ulm og Hannover, og heller ikke i hver enkelt prøve (Tabel 1). blev ikke observeret nogen beviser mod homogenitet blandt Ulm og Hannover-serien (p = 0,39). Ophobning i familiære tilfælde prostatakræft kunne indikere en høj risiko effekt medieret af varianterne. Denne hypotese blev testet i Ulm serien, som indeholdt en samling af PRCA tilfælde med positiv familiens historie. Men ingen berigelse af mutationerne blev observeret i familiære tilfælde (6 af 377 (1,6%)) sammenlignet med sporadiske tilfælde (7 af 325 (2,1%)). Endelig blev kliniske undergrupper af sager defineres for at belyse tendenser i retning af aggressive tumor former. De mutationsbærere viste ingen signifikant forskel fra ikke-bærere i sværhedsgraden af ​​prostatakræft, som bestemt af alder for debut, Gleason score, eller tidligere behandling PSA-niveau (tabel 2).

Diskussion

TP53AIP1

er blevet foreslået som en PRCA modtagelighed gen, da to tilbagevendende germlinie mutationer (p.Q22fs og p.S32X) blev fundet betydeligt overrepræsenteret blandt PRCA patienter inden for en tidligere case-control undersøgelse [7]. Med henblik på bekræftelse, har vi genotypet p.Q22fs og p.S32X i ca. 1.200 sager prostatakræft og 1.500 kontroller, men vi undlod at kopiere en sammenslutning af disse varianter med PRCA risiko.

De forskelle mellem nuværende og den første undersøgelse kunne forklares ved flere faktorer, herunder variable etnisk baggrund, forskellige stikprøvestørrelser og kriterier divergerende inklusion. Befolknings–specifikke forskelle er blevet indlysende i tilfældet med p.S32X, da denne variant har vist sig sjældent i tyske probander, og kunne således ikke vurderes for sygdom foreningen. Den tydeligste forskel mellem undersøgelsesprøverne er frekvensen af ​​variant p.Q22fs, der udkom meget lavere i kontrolgruppen af ​​Wang og kolleger sammenlignet med vores kontroller (0,3% versus 1,6%). Bemærkelsesværdigt, Wang et al. har rekrutteret sund, alder matchede kontroller, som kunne være mere kraftfuld at opdage foreninger med risiko prostatakræft, på trods af deres 4,5-fold mindre stikprøve. I modsætning hertil kan de ikke-valgte styringer til vores sammenligninger indeholder fejlklassificeres prostata kræfttilfælde på befolkningens prævalens, så sande sygdom effekter synes lidt underspillet. Men magt skøn tyder, at tabet af magt ved at vælge befolkning styrer i stedet for “super kontrol” ville være lille til en sygdom med en incidensrate omkring 10%, og at dette tab kan effektivt kompenseres for ved beskedne stigninger i prøvestørrelse [ ,,,0],8]. Det faktum, at vi observeret næsten lige bærefrekvenser i begge tilfælde og kontroller stærkt taler imod en sammenslutning af p.Q22fs med PRCA. Baseret på de stikprøvestørrelser indskrevet her, et resulterende interval på tillid udelukker enhver risiko effekt større end 2,2 for p.Q22fs og p.S32X.

I undergruppe analyser vi har overvejet disponerende roller

TP53AIP1

mutationer især for familiær og for aggressiv PRCA. Ingen opsummering af p.Q22fs og p.S32X blev observeret i familiære tilfælde afvise hypotesen om en høj penetrans af disse mutationer. Endelig, manglen på genotype /fænotype korrelation med hensyn til kliniske parametre taler imod modtagelighed for mere alvorlige former for PRCA for mutationen luftfartsselskaber.

Bortset fra beskærer mutationer undersøgt i den foreliggende undersøgelse, en missense substitution (s. A7V) i

TP53AIP1

har tidligere været undersøgt i Hannover serien. Tilsvarende p.A7V varianten også havde vist en øget frekvens i tilfælde prostatakræft [9]. Vi konkluderer, at der er lidt støtte på nuværende tidspunkt at betragte

TP53AIP1

som prostatakræft modtagelighed gen.

Materialer og metoder

probander

To serier af cases og kontroller blev samlet til denne undersøgelse, ansat ved universiteterne i Ulm og Hannover, Tyskland. Alle probander var af kaukasisk oprindelse. Undersøgelsen blev godkendt af Institution Review Board of Ulm (Ethikkommission der Universität Ulm – stemme nummer 87/97) og Institution Review Board of Hannover (Ethikkommission der Medizinischen Hochschule Hannover – stemme nummer 3894/05). Skriftligt informeret samtykke, i henhold til de Institution anmeldelse Boards, blev opnået.

Fra prostatakræft Genetics Project of Ulm et samlet antal af 377 familiær og 325 sporadiske tilfælde blev inkluderet. Rekrutteringen arrangement med disse patienter er beskrevet andetsteds [10]. Den mediane alder ved diagnose var 63 år (spændvidde 40-84 år), og de fleste blev behandlet ved radikal prostatektomi. For foreningen tester 995 population kontrol fra Ulm blev brugt.

Hannover prostatakræft undersøgelse (HaPCS) består af et hospital-baserede serier af 505 uselekterede patienter med PRCA, som blev behandlet med brachyterapi mellem oktober 2000 og september 2007 kl Hannover Medical School [9]. Alle patienter havde biopsi-verificeret adenokarcinom i prostata. Indikation for permanent brachyterapi blev klinisk lokaliseret lav risiko tidligt PRCA (cT2a eller mindre med en PSA serumniveau 10 ng /ml og en Gleason score 7). Den mediane alder ved diagnose var 67 år (spændvidde 42-82 år). Til sammenligning blev 504 genomiske DNA-prøver indsamlet fra voksne mandlige bloddonorer på Hannover Medical School mellem 2006 og 2007.

Genotypning

Genomisk DNA, udvundet fra perifere blod-lymfocytter, tjente som skabelon til genotypning . Den Ulm kohorten blev indtastet for p.Q22fs med den høje opløsning smeltning (HRM) metode. Kort fortalt: PCR blev udført med AmpliTaq Gold Mastermix (Applied Biosystems, Foster City, USA). Efter PCR-amplifikation 1.0 pi EVA-Green (Biotium, Hayward, USA) blev tilsat til hver prøve, og dissociationskurven blev målt på en 96-brønds 7900HT Hurtig Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA). HRM data blev analyseret med High Resolution Melt software v1.1 (Applied Biosystems, Foster City, USA). Den S32X varianten blev indtastet ved hjælp af Custom SNP genotypebestemmelsesassay (Applied Biosystems, Foster City, USA) sammen med TaqMan Genotypebestemmelse Mastermix (Applied Biosystems, Foster City, USA) i et totalt volumen på 5 pi på en 384-brønds 7900HT Hurtig Real- Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA). For positive kontroller brugte vi plasmider svarende til de beskærer allel p.Q22fs eller p.S32X henholdsvis, og den normale allel. Normale allel og mutant-plasmider blev blandet 1:01 med henblik på at efterligne heterozygote genotyper. Genotypebestemmelse af Hannover-serien blev udført med begrænsninger polymorfisme analyser ved hjælp af

Bgl

jeg for p.Q22fs og

BFA

jeg for p.S32X, efter PCR-amplifikation. Primer og probesekvenser samt PCR-betingelser vil blive givet efter anmodning. Prøver, der blev identificeret til at bære de p.Q22fs eller p.S32X variant fra nogen af ​​de udnyttede screeningsmetoder blev verificeret ved Sanger sekventering.

statistiske analyser

Foreninger mellem genotyper og sygdomsstatus blev vurderet med SAS 9.2 (SAS, Cary, USA). Odds ratio og præcis 95% konfidensintervaller er givet sammen med p-værdier ved Fishers eksakte test. For den kombinerede analyser ensartethed odds ratioer hvor kontrolleret af Breslow-dages test og den kombinerede odds ratio blev beregnet med Mantel-Haenszel test. Den uparrede t-test blev anvendt til sammenligning af kliniske parametre i mutationsbærere og ikke-bærere og blev beregnet med StatView 5,01 (SAS, Cary, USA).

Tak

Manuel Luedeke er deltager i den internationale Graduate School i molekylær medicin Ulm.