PLoS ONE: Rem: En integreret ressource for Profilering High-Throughput Cancer Genomisk data fra stressrespons Studies

Abstrakt

Den stigende ledighed og modenhed mikromatrice teknologi har ført til en eksplosion af kræft profilering undersøgelser til at identificere cancer biomarkører og forudsige behandlingsrespons. Afsløring komplekse relationer, dog stadig den mest udfordrende opgave, da det kræver udarbejdelse og effektiv forespørge data fra forskellige kilder. Her beskriver vi stress respons Array Profiler (Strap), en open source, webbaseret ressource for opbevaring, profilering, visualisering, og deling af kræft genomiske data. Strap huse multi-cancer microarray data med stor vægt på strålebehandling studier, og tager en systembiologi tilgang til integration, sammenligning, og cross-validering af flere kræft profilering undersøgelser. Databasen er en omfattende platform for sammenlignende analyse af genekspression data. Til effektiv brug af arrays, vi leverer brugervenlige og interaktiv visualisering værktøjer, der kan vise data og forespørgslen resultater. Strap er webbaseret, platform-uafhængige, og frit tilgængelig på https://strap.nci.nih.gov/

Henvisning:. Johnson S, Issac B, Zhao S, Bisht M, Celiku O, Tofilon P, et al. (2012) Rem: En integreret ressource for Profilering High-Throughput Cancer Genomisk data fra stressrespons Studies. PLoS ONE 7 (12): e51693. doi: 10,1