PLoS ONE: Mirna Gener Udgør nye mål for mikrosatelitter Ustabilitet i kolorektal cancer

Abstrakt

fejlparringsreparation-mangel kolorektal kræft (CRC) display udbredt ustabilitet på DNA mikrosatellit sekvenser (MSI). Selvom MSI er blevet rapporteret at almindeligt forekomme ved kodning gentagelser, hvilket fører til ændringer i funktionen af ​​en række gener, der koder cancer-beslægtede proteiner, er intet kendt om den formodede virkningen af ​​denne proces på ikke-kodende microRNA. I miRBase V15 identificerede vi meget få humane microRNA gener med mono- eller di-nucleotid repeats (

n

= 27). En mutationsanalyse af disse sekvenser i en stor serie af MSI CRC cellelinjer og primære tumorer understregede ustabilitet i 15 af de 24 microRNA gener held studeret på variable frekvenser i området fra 2,5% til 100%. Efter en maksimal sandsynlighed statistisk metode, blev microRNA gener adskilt i to grupper, der varierede betydeligt i deres mutationsfrekvenser og deres tendens til at repræsentere mutationer, som måske eller måske ikke er under selektive pres under MSI tumoral progression. Den første gruppe omfattede 21 gener, der viste ingen eller få mutationer i CRC. Den anden gruppe indeholdt tre gener, dvs.

HSA-mir-1273c

,

HSA-mir-1303

HSA-mir-567

, med hyppige (≥80 %) og undertiden bi-allele mutationer i MSI tumorer. For den eneste udtrykkes i colon væv,

HSA-mir-1303

blev fundet nogen direkte forbindelse mellem tilstedeværelsen eller ikke af mono- eller bi-allele ændringer og niveauerne af modent miR udtryk i MSI-cellelinjer som bestemt ved sekventering og kvantitativ PCR hhv. Samlet set vores resultater dokumenterer, at DNA-gentagelser indeholdt i humane miRNA gener er relativt sjældne og bevaret fra mutationer grundet MSI i MMR-mangel kræftceller. Funktionelle studier er nu forpligtet til at konkludere, om muterede miRNA, og især MIR-1303, kan have en rolle i MSI tumorigenese

Henvisning:. El-Murr N, Abidi Z, Wanherdrick K, Svrcek M, Gaub MP , Fléjou JF, et al. (2012)

miRNA

Gener Udgør nye mål for mikrosatelitter Ustabilitet i kolorektal cancer. PLoS ONE 7 (2): e31862. doi: 10,1371 /journal.pone.0031862

Redaktør: Hoguen Kim, Yonsei University College of Medicine, Republikken Korea

Modtaget: November 18, 2011; Accepteret: 13 januar 2012; Udgivet: 14 februar, 2012