PLoS ONE: dissekere epigenetisk inaktivering Kompleksitet i Mouse Lung Cancer Suppressor Gene Cadm1

Abstrakt

Sygdom-orienterede funktionel analyse af epigenetiske faktorer og deres reguleringsmekanismer i afvigende lyddæmpning er en forudsætning for bedre diagnostik og terapi. Men de præcise mekanismer er stadig uklart og kompleks, der involverer samspillet mellem flere effektorer, herunder nukleosom positionering, DNA methylering, histon varianter og histon modifikationer. Vi undersøgte epigenetisk inaktivering kompleksitet i tumorsuppressorgen

Cadm1

i muse lungekræft progenitorcellelinjer, udviser promotor hypermethylering forbundet med transkriptionel repression, men hovedsagelig ikke reagerer på demethyleringsmiddel lægemiddelbehandlinger. Efter at forudsige nucleosomstørrelse positioner og transskription faktor bindingssteder langs

Cadm1

promotor, vi udført single-molekyle kortlægning med DNA methyltransferase

M.Sss

I, som afslørede på stille initiativtagere høj nukleosom belægning og okklusion af transkriptionsfaktor-bindingssites. Desuden

M.Sss

I kort over initiativtagere varieres inden og mellem de forskellige lungekræft-cellelinjer. Chromatin analyse med micrococcal nuklease oplyste også variationer i nukleosom positionering for at få konsekvenser i bindingen af ​​transkriptionsfaktorer tæt nucleosomstørrelse grænser. Kromatin immunofældning viste, at histon varianter (H2A.Z og H3.3), og modsatrettede histon modifikation mærker (H3K4me3 og H3K27me3) alle colocalized i de samme nucleosomstørrelse positioner, der minder om epigenetisk plasticitet i embryonale stamceller. Helt, epigenetisk inaktivering kompleksitet i promotorregionen af ​​

Cadm1

er ikke kun defineret ved DNA hypermethylering, men høj nukleosom belægning, ændret nukleosom positionering, og “bivalente” histon modifikationer, bidrog sandsynligvis også i den transkriptionelle repression af dette gen i lungen kræftceller. Vores resultater vil bidrage til at definere terapeutisk intervention strategier via epigenetiske lægemidler i lungekræft

Henvisning:. Reamon-Buettner SM, Borlak J (2012) dissekere epigenetisk inaktivering Kompleksitet i Mouse Lung Cancer Suppressor Gene

Cadm1

. PLoS ONE 7 (6): e38531. doi: 10,1371 /journal.pone.0038531

Redaktør: Javier S. Castresana, Navarra Universitet, Spanien

Modtaget: September 22, 2011; Accepteret: 7 maj 2012; Udgivet: Juni 6, 2012