PLoS ONE: Identifikation af Enriched af Driver Gene Ændringer i undergrupper af ikke-småcellet lungekræft Patienter Baseret på histologi og Rygning

Der er behov for

Abstrakt

Baggrund

Passende patient selektion for målrettede behandlinger, der er effektive hos patienter med specifikke genetiske ændringer. Vi havde til formål at definere undergrupper af patienter med kandidat driver gener hos patienter med ikke-småcellet lungekræft.

Metoder

Patienter med primær lungekræft, som gennemgik kliniske genetiske tests på Guangdong General Hospital blev indrulleret . Driver-gener blev påvist ved sekventering, høj opløsning smelte analyse, qPCR, eller flere PCR og RACE metoder.

Resultater

524 patienter blev inkluderet i denne undersøgelse, og forskellene i driveren genændringer blandt undergrupper blev analyseret på grundlag af histologi og rygning status. I en undergruppe af ikke-rygere med adenocarcinom, EGFR var den hyppigst ændret gen, med en mutation på 49,8%, efterfulgt af EML4-ALK (9,3%), PTEN (9,1%), PIK3CA (5,2%), c- Met (4,8%), KRAS (4,5%), STK11 (2,7%), og BRAF (1,9%). De tre hyppigst ændrede gener i en undergruppe af rygere med adenocarcinom var EGFR (22,0%), STK11 (19,0%), og KRAS (12,0%). Vi fandt kun EGFR (8,0%), c-Met (2,8%), og PIK3CA (2,6%) ændringer i ikke-ryger med pladecellecarcinom (SCC) undergruppe. PTEN (16,1%), STK11 (8,3%), og PIK3CA (7,2%) var de tre hyppigst beriget gener i rygere med SCC. DDR2 og FGFR2 kun præsenteres i rygere med SCC (4,4% og 2,2%, henholdsvis). Blandt disse fire undergrupper, forskellene i EGFR, KRAS, og PTEN mutationer var statistisk signifikante.

Konklusion

De forskellige funktioner i driver gen ændringer i forskellige undergrupper baseret på histologi og rygning status var nyttigt definere patienter for fremtidige kliniske forsøg, der er målrettet disse gener. Denne undersøgelse viser også, at vi kan overveje patienter med sjældne ændringer af driver gener som havende sjældne eller sjældne sygdomme, som skal forvaltes med særlige molekylært målrettede behandlinger

Henvisning:. En SJ, Chen ZH, Su J, Zhang XC , Zhong WZ, Yang JJ, et al. (2012) Identifikation af Enriched af Driver Gene Ændringer i undergrupper af ikke-småcellet lungekræft Patienter Baseret på histologi og Rygning. PLoS ONE 7 (6): e40109. doi: 10,1371 /journal.pone.0040109

Redaktør: Ming Du, Medical College of Wisconsin, USA

Modtaget: 11. december 2011; Accepteret: 1 Jun 2012; Udgivet: 29 juni, 2012