PLoS ONE: 3′-UTR polymorfier i miRNA Maskiner Genes drosha, DICER1, RAN, og XPO5 er forbundet med kolorektal cancer risiko i et koreansk Population

Abstrakt

MikroRNA’er spiller en vigtig rolle i kræft initiering og udvikling. Formålet med denne undersøgelse var at undersøge, om polymorfismer i miRNA maskiner gener er forbundet med udviklingen af ​​colorectal cancer (CRC).

RAN

rs14035 CT heterozygoter og T allel luftfartsselskaber (CT + TT) genotyper havde lavere risiko for CRC, mens

DICER1

rs3742330,

drosha

rs10719, og

XPO5

rs11077 polymorfier var ikke associeret med CRC i den fulde undersøgelse prøven. Konkret mandlig

RAN

rs14035 CT heterozygoter og

XPO5

rs11077 AA genotypen (CT /AA) bærere oplevede reduceret CRC modtagelighed (både colon og rektal). Undergruppe analyse viste, at den kombinerede

RAN

rs14035 CT + TT genotypen var forbundet med endetarmskræft, men ikke tyktarmskræft. Desuden blev

DICER1

rs3742330 AG genotype forbundet med en signifikant øget risiko for tyktarmskræft. Stratificeret analyse afslørede

RAN

rs14035 kombineret CT + TT genotypen var forbundet med nedsat CRC risiko hos mandlige patienter uden diabetes mellitus (DM) og hos patienter med endetarmskræft. Desuden fandt vi

RAN

rs14035 CC genotype var relateret til en nedsat risiko for CRC med hensyn til tumorstørrelse og metabolisme af homocystein og folat. Desuden patienter diagnosticeret med hypertension eller DM, som har foretaget den

drosha

rs10719 CC genotype viste øget CRC risiko, mens

XPO5

rs11077 AC + CC genotype ført til øget CRC risiko hos patienter med hypertension kun . Vores resultater viser, variationer i

RAN

rs14035,

DICER1

rs3742330,

XPO5

rs11077, og

drosha

rs10719 af koreanske patienter signifikant associeret med deres risiko af CRC

Henvisning:. Cho SH, Ko JJ, Kim JO, Jeon YJ, Yoo JK, Oh J, et al. (2015) 3′-UTR polymorfier i miRNA Maskiner Gener

drosha

,

DICER1

,

RAN

, og

XPO5

er forbundet med kolorektal cancer Risiko i en koreansk Befolkning. PLoS ONE 10 (7): e0131125. doi: 10,1371 /journal.pone.0131125

Redaktør: Jian-Jun Zhao, Dana-Farber Cancer Institute, UNITED STATES

Modtaget: Marts 3, 2015; Accepteret: 27. maj 2015; Udgivet: Juli 6, 2015

Copyright: © 2015 Cho et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Data Tilgængelighed: Alle relevante data er inden for papir og dens Støtte Information filer

Finansiering:. Grundforskningsfond Korea Tilskud finansieret af den koreanske regering (NRF-2012R1A1A2007033 2009 til 0.093.821), Republikken Korea (www.nrf.re. kr /). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Kolorektal cancer (CRC) er den tredje mest almindelige kræftform hos mænd (746.000 tilfælde om året, 10,0% af de samlede kræfttilfælde) og den anden mest almindelig hos kvinder (614,000 tilfælde om året, 9,2% af den samlede kræft tilfælde) på verdensplan [1]. Den geografiske forekomst af CRC varierer, men mønstre er ens hos mænd og kvinder. Næsten 55% af CRC tilfælde forekommer i mere udviklede regioner [2], selv om de kan opstå sporadisk.

Flere iboende faktorer [fx alder, køn, diabetes mellitus (DM), fedme, og inflammatorisk tarmsygdom] og eksterne faktorer (fx rygning, utilstrækkelig fiber indtagelse, højt forbrug af alkohol, rødt kød forbrug, og en fedtrig kost) er forbundet med øget CRC risiko [3-5]. Således er CRC modtagelighed påvirket af både genetiske og miljømæssige elementer. Adskillige rapporter har vist, at microRNA (miRNA) modulere genekspression ved at målrette mRNA for deregulering eller translationel undertrykkelse [6, 7]. Disse molekyler udøver deres biologiske funktioner ved at binde til 3′-utranslaterede region (UTR) af mål-messenger-RNA (mRNA), hvorved undertrykke dets ekspression. En enkelt miRNA kan regulere flere mål og dermed fungere som en mester kontrol af genekspression. Forrige bioinformatik analyser tyder på, at op til 30% af humane gener kan reguleres af miRNA, selvom om miRNA udgør kun 1-3% af det humane genom [8]. Derfor miRNA synes at spille en central rolle i både fysiologiske og patologiske mekanismer [9]. Ekspression af miRNA er forbundet med forskellige cancere, og miRNA-gener antages at fungere som både tumorsuppressorer og onkogener [10-12].

MicroRNA maskiner proteiner, såsom drosha, RAS-beslægtede kerneprotein (RAN) , DICER1 og exportin 5 (XPO5), skal behandle miRNA, før de kan fungere. Efter transkription, drosha og dets cofaktor, DGCR8, proces primære miRNA i precursor-miRNA (pre-miRNA) ved at fjerne 5′-cap, 3′-poly (A) hale, og sekvenser, som flankerer hårnålestruktur. Pre-miRNA derefter eksporteres fra kernen til cytoplasmaet af XPO5 og RAN

–

GTP. I cytoplasmaet, er precursor-miRNA viderebehandles af DICER1, en endoribonuclease, til frembringelse af en kort dobbeltstrenget RNA-fragment (ca. 20-25 nukleotider lang), der består af det modne miRNA og dens komplementære streng [13]. På grund af asymmetrisk termostabilitet, er det modne miRNA streng fortrinsvis inkorporeret i RNA-induceret nedregulering kompleks, der er målrettet endogent mRNA for silencing [14].

Nylige undersøgelser tyder 35% af alle CRC tilfælde kan tilskrives arvelige genetiske faktorer [15]. Arvet risiko skyldes sandsynligvis single nucleotide (SNP’er) og andre genetiske abnormiteter inden kodning og ikke-kodende DNA. Fordi miRNA spiller en vigtig rolle i cancer, herunder CRC initiering og udvikling, kan SNPs i miRNA maskiner gener forstyrre miRNA struktur, bindingssteder, eller forarbejdning, derved ændre en persons modtagelighed for CRC ved at påvirke miRNA funktionalitet [16]. For eksempel kan nedsat miRNA forarbejdning fremme cellulær transformation og tumorigenese [17]. Desuden har talrige undersøgelser vist en sammenhæng mellem koncentrationen eller funktion miRNA pathway komponenter og en patients prognose i hud, lunge, bryst, og æggestokkene kræfttilfælde [18-21]. Andre undersøgelser har fastslået, at miRNA udtryk spiller en funktionel rolle i initiering og progression af CRC [22,23].

Men til dato, få studier har undersøgt den mulige sammenhæng mellem specifikke SNPs i miRNA maskiner gener og risiko for CRC [24-26]. Således undersøgte vi, om polymorfier i

DICER1

(rs3742330),

drosha

(rs10719),

RAN

(rs14035), og

XPO5

(rs11077 ) var forbundet med CRC forekomst i et koreansk befolkning.

Materialer og metoder

studiepopulation

Mellem juni 2005 og januar 2009 808 blodprøver blev indsamlet fra studiegruppen bestående af 408 CRC patienter og 400 tilfældigt udvalgte ikke-CRC (kontrol) fag, efter en sundhedsmæssig screening på CHA Bundang Medical center (Seongnam, Sydkorea). CRC-gruppen omfattede 167 konsekutive patienter med endetarmskræft og 241 konsekutive patienter med tyktarmskræft. Patologiske mellemstationer frekvenser efter helbredende tumorresektion var som følger: tumor node metastase (TNM) fase I, n = 43 (10,5%); trin II, n = 173 (42,4%); fase III, n = 153 (37,5%); og trin IV, n = 39 (9,6%). Patienter med højt baseline blodtryk (≥ systolisk 140 mmHg eller diastolisk 90 mmHg) på mere end én lejlighed eller med en historie af antihypertensiv medicin blev klassificeret som havende hypertension (HTN). Patienter med højt fastende plasmaglukose (≥ 126 mg /dl), som tog et oralt hypoglykæmisk middel, eller som havde en historie af insulinbehandling blev klassificeret som havende DM. Alle forsøgspersoner var etniske koreanere og forudsat skriftligt informeret samtykke til undersøgelsen deltagelse. Undersøgelsen protokol Den blev godkendt af Institutional Review Board of CHA Bundang Medical Center.

Analyse af miRNA biogenese gen polymorfier

Genomisk DNA blev ekstraheret fra blodprøver perifere indsamlet med en antikoagulant ved hjælp af en G- DEX blod udvinding kit (intron Bioteknologi, Seongnam, Sydkorea). Nukleotidændringer blev bestemt via en polymerasekædereaktion (PCR) -Indskrænkning polymorfisme (RFLP) -analyse. Restriktionsenzymfordøjelse blev udført ved hjælp af følgende enzymer (New England Biolabs, Ipswich, MA):

NLA

III (

drosha

, rs10719),

Ban

I (

DICER1

, rs3742330),

Bsl

I (

RAN

, rs14035), og

Bsm

I (

XPO5

, rs11077) . Fordøjelsen blev udført ved 37 ° C i 16 timer. Salg

genotyper bestemt ved RFLP-analyse blev bekræftet af to uafhængige forskere og ved sekventering 10% af prøverne. For

RAN

rs14035 i kontrolgruppen og

XPO5

rs11077 i CRC patienter blev genotyper verificeret tre gange for at udelukke eventuelle fejl tilskrives overtrædelse af Hardy-Weinberg ligevægt (HWE).

Statistisk analyse

for at sammenligne baseline karakteristika mellem cases og kontroller, vi brugte Chi-squared test til at analysere kategoriske data (køn, HTN, og DM) og t-test for at analysere løbende data. Allelhyppigheder blev beregnet til at identificere afvigelser fra HWE. Justerede odds ratio (AOR) og 95% konfidensintervaller (CI) blev anvendt til at undersøge sammenhængen mellem

DICER1

,

drosha

,

RAN

,

XPO5

polymorfier og CRC forekomst med GraphPad Prism 4.0 (La Jolla, CA, USA) og MedCalc udgave 12.1.4 (Panmun Uddannelse, Seoul, Korea). Gene samspil mellem SNP loci blev analyseret ved hjælp multifaktorproduktiviteten dimensionalitet reduktion (MDR) med MDR version 2.0 (www.epistasis.org) [27-29]. Vi bestemt de bedste multilocus kombinationer baseret på MDR identifikation af de væsentligste modeller ved hjælp maksimeret cross-validering værdier. HAPSTAT version 3.0 (www.bios.unc.edu/~lin/hapstat/) blev anvendt til at estimere haplotypefrekvenser for polymorfier bestemt ved MDR-analyse at have stærke synergistiske virkninger [30]. Den falske-positive opdagelse sats (FDR) korrektion blev anvendt til at justere flere sammenligning tests.

Resultater

Undersøgelse underlagt egenskaber

De 408 CRC tilfælde omfattede 170 mænd og 238 kvinder med en samlet gennemsnitsalder var 61,55 ± 12,26 år (middelværdi ± SD; tabel 1). Blandt de sager, 241 (59,1%) havde tyktarmskræft og 167 (40,9%) havde endetarmskræft. Ingen statistisk blev identificeret signifikante forskelle i alder eller køn mellem CRC sager og kontroller (

P

= 0,772 og 0,847 henholdsvis). Men både HTN (60,5%,

P

= 0,004) og DM (34,1%,

P

0,0001). Var væsentligt mere udbredt blandt CRC sager end i kontrollerne

genotypefrekvenser

Genotype og allelfrekvenserne for de fire miRNA maskiner gener i CRC sager og kontroller er vist i tabel 2. Genotype distributioner i begge grupper viste ingen afvigelse fra HWE.

RAN

rs14035 CT heterozygote havde signifikant nedsat CRC risiko i forhold til vildtype homozygoter (AOR = 0,698; 95% CI, 0,511-0,952;

P

= 0,023). Tilsvarende blev den kombinerede CT + TT genotype forbundet med nedsat CRC risiko (AOR = 0,690; 95% CI, 0,510 til 0,934;

P

= 0,016). Men hverken forening forblev statistisk signifikant efter kontrol for multiple sammenligninger ved hjælp af FDR korrektion. Ingen sammenhæng mellem CRC risiko og andre polymorfier blev fundet. Desuden observerede vi ingen signifikant sammenhæng mellem genotypefrekvenser for de fire miRNA maskiner gener og CRC patient overlevelse (tabel A i S1 File).

I en undergruppe analyse målrettet kræft type, den kombinerede

RAN

rs14035 CT + TT genotypen var forbundet med nedsat risiko for endetarmskræft (AOR = 0,640; 95% CI, 0,430-0,954;

P

= 0,028), men ikke tyktarmskræft (tabel 3) . Omvendt

DICER1

rs3742330 AG heterozygoter havde en signifikant øget risiko for colon, men ikke endetarmskræft (AOR = 1,506; 95% CI, 1,020-2,223;

P

= 0,040). Men forholdet var ikke signifikant efter FDR korrektion, hvilket antyder en svag association (tabel 3). Kombination analyser (tabel 4 Tabel B i S1 File) viste, at

RAN

rs14035 CT heterozygoter og

XPO5

rs11077 AA luftfartsselskaber oplevede nedsat følsomhed af CRC (AOR = 0,610; 95% CI, 0,434-0,859;

P

= 0,005) (tabel 4). Desuden blev de samme genotyper forbundet med nedsat følsomhed af begge typer kræft i mandlige (AOR = 0,283; 95% CI, 0,139-0,573;

P

= 0,001, AOR = 0,497; 95% CI, 0,254-0,973

P

= 0,041; tabel 5 tabel C i S1 File), men ikke kvindelige patienter (tabel D i S1 fil). Selvom

drosha

rs10719 CC genotype luftfartsselskaber og

RAN

rs14035 CC heterozygote viste nedsat risiko for endetarmskræft (tabel E i S1 File), vi observeret nogen signifikant sammenhæng mellem genotypefrekvenser for fire miRNA maskiner gener og patient overlevelse eller TNM klassifikation fase af deres ondartede CRC tumorer (tabel F i S1 File og tabel G i S1 File). Vejviser

Stratificerede analyser indikerede

RAN

rs14035 kombineret CT + TT genotypen var forbundet med nedsat CRC risiko hos mandlige patienter (AOR = 0,493; 95% CI, 0.308-0.791;

P

= 0,003), patienter uden DM (AOR = 0,618; 95% CI, 0,438-0,874;

P

= 0,006), og patienter med endetarmskræft (AOR = 0,640; 95% CI, 0,43 til 0,954;

P

= 0,028; tabel 6) . Desuden bestemmes vi

drosha

rs10719 CC genotype var forbundet med øget risiko for tyktarmskræft hos personer på 62 år eller ældre (AOR = 3,148; 95% CI, 1.276-7.766; P = 0,013) og emner yngre end 62 år (AOR = 2,940; 95% CI, 1,169-7,399; P = 0,022; tabel 6). Desuden

RAN

rs14035 CC genotype var forbundet med nedsat risiko for CRC hos forsøgspersoner med 5-cm tumorer (AOR = 0,654; 95% CI, 0,437-0,978;

P

= 0,039), homocystein lavere end 12,97 pmol /l (AOR = 0,637; 95% CI, 0,453-0,896;

P

= 0,01), og folat niveauer højere end 3,72 ng /ml (AOR = 0,630; 95% CI, 0,447-0,888;

P

= 0,008) (tabel 7). Vi fandt også

drosha

rs10719 CC genotype var forbundet med øget CRC risiko hos personer med 5-cm tumorer (AOR = 2,159; 95% CI, 1.057-4.413;

P

= 0,035)

Interaktion modeller foreslået af MDR, baseret på et kors. Validering værdi på 10, blev vurderet ved anvendelse haplotype-baseret analyse. Der blev imidlertid ikke associationer mellem de fire miRNA maskiner polymorfier og CRC konstateret risiko (tabel H i ​​S1 File og tabel I i S1 File).

Genetisk sammenslutning af miRNA maskiner gener og kombinerede gen-patient karakteristika

Vi undersøgte potentialet genetiske sammenhæng mellem HTN eller DM og gen /patientkarakteristika at belyse den genetiske ætiologi CRC udvikling, fordi metaboliske syndrom risikofaktorer, herunder HTN og DM, er meget relevant i forekomsten af ​​CRC. Vi bestemmes

drosha

rs10719 CC genotype var forbundet øget risiko for tyktarmskræft hos personer 62 år eller ældre (AOR = 3,875; 95% CI, 1,432 til 10,490) og patienter med HTN (AOR, 3,292; 95% CI, 1,362-7,958), DM (AOR = 6,764; 95% CI, 1,424 til 32,126) (tabel 8). Interessant kombinationen af ​​DM og

drosha

rs10719 CC genotype steg CRC risiko 6,764-fold (figur 1). Vi observerede også en sammenhæng mellem

XPO5

rs11077 kombineret AC + CC genotype og øget CRC risiko hos patienter med HTN (AOR, 3,126; 95% CI, 1,739-5,619) eller BMI af 25 kg /m

2 (AOR = 11,765; 95% CI, 1,011-3,079) (tabel 8)

Y-aksen repræsenterer fold ændringer mellem

drosha

genotype TT + TC. og

drosha

genotype CC. Hver række repræsenterer de patienter med eller uden DM. Hver søjle repræsenterer

drosha

genotype TT + TC og

drosha

genotype CC.

Diskussion

Tidligere undersøgelser har vist, at flere kræftformer er forbundet med ændringer i miRNA maskiner gener, såsom

drosha

,

DICER1

,

XPO5

, og

AGO2

[31-33 ]. Selvom modifikationer af disse gener kan påvirke initiering og progression af cancer markant, er rollen af ​​genetisk variation i miRNA maskiner gener under CRC udvikling ikke fuldt klarlagt. Så vidt vi ved, er dette den første rapport for at vurdere sammenhængen mellem

RAN

polymorfier og CRC; vi fandt

RAN

rs14035 CT heterozygoter og T allel luftfartsselskaber (CT + TT genotyper) havde en lavere CRC risiko end personer med andre genotyper.

Desuden i en undergruppe analyse målrettet kræft type, vi bestemmes den kombinerede

RAN

rs14035 CT + TT genotypen var forbundet med nedsat endetarmskræft risiko. RAN koder for et lille G-protein vigtig for translokationen af ​​RNA og proteiner gennem kerneporen komplekset [34]. Når RAN-GTP er opbrugt som følge af RAN guanin nukleotid udveksling faktor hæmning, pre-miRNA eksport er stærkt reduceret, indikerer miRNA transport formidles af en RAN-GTP-bindende eksport receptor [35]. Derfor er det muligt, at

RAN

mutationer spiller en væsentlig rolle i patologi-relaterede ændringer miRNA transport og udtryk. RAN-proteinet er også en velkendt nedstrøms modulator af PI3K-signalvejen, som medierer cancercelleinvasion og metastase [36]. Desuden CRC væv udviser signifikant højere niveauer af

RAN

udtryk end normale kolorektale epitelceller, der er blevet positivt forbundet med dybde invasion, lymfeknudemetastaser, fjernmetastaser, tumor differentiering og tumor-node-metastaser fase [37]. Derfor rs14035 polymorfi i

RAN

‘s 3’-UTR kan påvirke dens funktion som en downstream modulator af CRC udvikling.

Faggad et al. [38] rapporterede, at reduceret

DICER1

udtryk kan bidrage til tumor progression i CRC. I overensstemmelse med denne rapport, Dewi et al. [39] fastslået, at

DICER1

deficiente CRC væv har et reduceret antal alkalisk phosphatase-positive omprogrammerede celler i forhold til vildtype celler. Men viste ingen signifikant forskel i ekspressionsniveauerne af lange 3′-UTR

DICER1

mRNA mellem CRC tumorer og normale væv [40], en anden rapport. Således virkningerne af op- og nedregulering af

DICER1

udtryk på CRC modtagelighed er uklare. Vores undergruppe analyse, som er målrettet specifikke kræfttype, afslørede, at

DICER1

rs3742330 AG heterozygoter viste en signifikant øget risiko for tyktarmskræft. Tilsvarende har en associering mellem denne polymorfi, beliggende i genets 3′-UTR, og T-celle lymfom overlevelse også rapporteret, måske fordi dets 3′-UTR er vigtig for mRNA-transkript stabilitet [41]. Desuden en anden SNP placeret i

DICER1

‘s 3’-UTR (rs1057035) kan bidrage til oral kræftrisiko ved at påvirke miRNA binding til

DICER1

[42]. Selv om

DICER1

rs3742330 AG-genotypen var forbundet med en signifikant øget risiko for tyktarmskræft i vores data, observerede vi ingen signifikant sammenhæng mellem genotypefrekvenser for

DICER1

rs3742330 og CRC patient overlevelse.

DICER1

rs3742330 blev rapporteret at være forbundet med øget overlevelse i T-celle lymfom [41]. Disse forskellige resultater forskellige forskellige cancere tyder på, at de unormale ekspressionsmønstre for miRNA pathwaygener kan være forbundet med vævsspecifikke effekter. SNP’en er placeret i 3′-UTR, en region, der er vigtig for

DICER1

mRNA-stabilitet, polyadenylering, translation effektivitet, og lokalisering. Den 3′-UTR indeholder bindingssteder for microRNA. Mange undersøgelser har rapporteret de regulatoriske roller miRNA i genetiske netværk bag forskellige cellulære veje, hvilket indikerer, at onkogene miRNA kan være involveret i de genetiske netværk regulerer funktionelle vej dereguleret i forskellige kræftceller [7,43].

DICER1

rs3742330 er blevet identificeret som den målområdet af to miRNA-miR-3622a-5p [44] og miR-5582-5p [45]. Men reguleringen af ​​disse miRNA af

DICER1

rs3742330 i CRC og T-celle lymfom er ikke blevet eksperimentelt valideret. Ekspressionsniveauerne af

DICER1

har globale virkninger på biogenese af miRNA. For eksempel et mønster af nedregulering af

DICER1

er forbundet med dårlig prognose i hud, lunge, bryst og ovariecancer, blandt andre kræftformer [46]. Men analysen af ​​prostatakræft og CRC viser, overekspression af

DICER1

andre miRNA biogenese gener i metastatiske læsioner [47]. Mucoepidermoid kræftformer opstår i halsen eller øvre esophagus udstille både over- og under-udtryk for

DICER1

sammenlignet med normale væv fra halsen og spiserøret [48]. Den miRNA-SNP af rs3742330 af

DICER1

er blevet identificeret for sin forening med resultatet kræft i CRC, T-celle lymfom, orale præmaligne læsioner og renalcellecarcinom [49-51,42] .Den AA allel af rs3742330 placeret i

DICER1

gen udviste en signifikant øget risiko for CRC. Men i T-celle lymfom, Patienter bærer GG genotypen havde en signifikant øget samlet overlevelse (OS) i forhold til dem, der udfører GA og AA genotyper. I orale præmaligne læsioner, patienter bærer GA og AA genotyper havde en signifikant øget risiko for OPL, og der var ingen signifikant sammenhæng mellem de genotypefrekvenser for

DICER1

rs3742330 og renalcellecarcinom. Disse undersøgelser, sammen med vores undersøgelse, tyder genetiske polymorfier i kræft kan spille en anden rolle i reguleringen af ​​miRNA maskiner gener, herunder

DICER1

, og derfor påvirke prognosen for kræft.

I miRNA behandlingssystemet, den XPO5 /RAN-GTP-komplekset medierer den nukleare transport af præ-miRNA.

XPO5

mutanter udviser reduceret miRNA behandling niveauer og målrette hæmning, mens restaureret XPO5 fungerer som en tumor suppressor, der vender svækket eksport af præ-miRNA i tyktarmskræft [52]. Tidligere undersøgelser har rapporteret associationer mellem

XPO5

rs11077 SNP (placeret i genets 3’UTR) og kræft i spiserøret, ikke-småcellet lungekræft, og myelomatose [53,54]. Desuden associationer mellem polymorfier i

XPO5

og

Der er rapporteret AGO1

gener og renalcellecarcinom risiko [55]. Især

XPO5

rs11077 var forbundet med øget risiko for renalcellecarcinom i en recessiv model [55]. Til støtte for disse tidligere rapporter, fandt vi, at

RAN

rs14035 CT heterozygoter og

XPO5

rs11077 AA genotype luftfartsselskaber oplevet nedsat følsomhed over for CRC, et link, der var særlig tydelig i mandlige patienter. Kønsforskelle er blevet dokumenteret hos patienter diagnosticeret med CRC. En højere CRC alder justeret incidens blandt mænd end blandt kvinder har varet over de seneste 30 år, men den underliggende årsag er fortsat uklart [56]. I vores undersøgelse,

RAN

rs14035 CT /

XPO5

rs11077 AA og

RAN

rs14035 CT /

drosha

rs10719 AA genotyper var forbundet med nedsat følsomhed over for CRC hos mænd. Desuden

RAN

rs14035 CT heterozygoter og

drosha

rs10719 AA genotype luftfartsselskaber reduceret følsomhed over for CRC undertype. Polymorfier inden for 3′-UTR’er af miRNA maskiner gener kan være ansvarlig for lokalt ændrede mRNA sekundære strukturer. For eksempel kan 3′-UTR polymorfier resultere i forskellige sekundære mRNA strukturer og distinkte allel-afhængige forskelle i mRNA-stabilitet [57]. Ligeledes har flere rapporter foreslået, at SNPs uden for miRNA bindingssted resultat i ændret miRNA binding på grund af allel-afhængige ændringer i sekundær mRNA struktur [58]. Desuden kan ændringer i sekundær struktur interferere med RNA-bindende proteiner, som kan føre til ændret mRNA-stabilitet [59]. Således SNPs placeret i 3′-UTR’er af

RAN

,

DICER1

XPO5

kan påvirke mRNA-stabilitet og efterfølgende udtryk. Men resultaterne fra denne undersøgelse kræver validering af en anden CRC case-kontrol undersøgelse og ved laboratorie-baserede ekspressionsfremgangsmåder.

De seneste tal viser, at dele af metabolisk syndrom (MetS), herunder aldring, HTN, og DM, kan også være forbundet med risikoen for at udvikle CRC [60,61]. Forholdet mellem de enkelte komponenter i MetS og CRC risiko er blevet analyseret af flere undersøgelser [62,63]. Men en inkonsekvent forbindelse mellem MetS og dens komponenter på CRC dødelighed blev observeret i en anden undersøgelse [64]. Diabetes mellitus type 2 er forbundet med en 20% -60% øget risiko for CRC [65], som insulinresistens kan fremme carcinogenese direkte ved stimulering colon cellevækst [66]. Vores data viser, at

RAN

rs14035 CT + TT genotypen kan resultere i lavere CRC risiko hos patienter uden DM, men ikke hos patienter med DM. en nylig meta-analyse viste imidlertid, at DM var en uafhængig, øget risikofaktor for CRC i både mænd og kvinder, selv efter kontrol for rygning, fedme og motion af patienterne [65]. Vi fandt imidlertid den

RAN

rs14035 CT + TT genotypen var forbundet med en lavere CRC risiko hos mandlige patienter, og hos alle patienter med endetarmskræft. Skønt talrige undersøgelser har vist, at tumorstørrelse er uden prognostisk betydning i CRC [67,68], viste vores data, at

drosha

rs10719 CC blev forbundet med en øget CRC risiko med hensyn til tumorstørrelse ( 5 cm) og alder (≥62 år). Vi fandt også, at

DICER1

rs3742330 og

XPO5

rs11077 genotyper var ikke forbundet med risiko for alder, køn, hypertension, DM, tumor site, tumorstørrelse, lymfeknude invasion, HTN og folat, hvilket tyder på, at disse SNPs ikke kunne modulere modtagelighed for CRC i den koreanske befolkning.

Flere undersøgelser har rapporteret sammenhængen mellem homocystein og kræft udvikling. For eksempel blev kohortestudier fundet forhøjede homocystein korreleret med øget adenom recidiv [69,70]. Ligeledes bemærkede vi, at

drosha

rs10719 og

RAN

rs14035 CC genotyper var forbundet med CRC med hensyn til forsøgspersonernes tumor størrelser. Vi fandt også, at

RAN

rs14035 CC genotype var forbundet med nedsat risiko for CRC hos patienter med 12.97 pmol /l homocystein. Men så vidt vi ved, er blevet fundet, ingen andre signifikante sammenhænge mellem homocystein og risikoen for CRC [71].

Folat giver 1-carbon-enheder for DNA-syntese og methylering, og neoplasi resultater fra afbrydelsen i begge disse processer. Ændringer DNA methylering forekommer på en genomic- og gen-specifikke niveau i kolorektale neoplasi [72], og nogle undersøgelser har vist, at lav plasma folat-koncentrationer var forbundet med reduceret CRC risiko, og at plasma folat-koncentrationer var positivt relateret til CRC risiko [73 , 74]. Men vores data viser, at den

RAN

rs14035 CC genotype var forbundet med nedsat risiko for CRC hos forsøgspersoner med 3,72 ng /ml folat.

Vi undersøgte også samspillet mellem genetiske faktorer og patientkarakteristika med hensyn til CRC forekomst. For eksempel har vi bestemt den

drosha

rs10719 CC genotype var forbundet med øget CRC risiko hos patienter med HTN og DM, mens

XPO5

rs11077 AC + CC genotype korreleret til øget CRC risiko hos patienter med HTN. Nylige undersøgelser har observeret øget risiko for CRC forbundet med HTN [60,62], og tilstedeværelsen af ​​HTN, fedme og hyperglykæmi [75]. Men en undersøgelse af finske mandlige rygere ikke støtte disse foreninger [76]. Desuden viste vores data, at CC genotype rs10719 placeret i

drosha

gen havde en øget CRC risiko hos patienter med alder (≥62 år) sammenlignet med dem, der bærer TT og CC genotyper. En ophobning af data viser MetS, med sine systemiske og hormonelle virkninger, kan påvirke patientens modtagelighed for karcinom og prognosen for patienter diagnosticeret med forskellige kræftformer [77,78]. Vores undersøgelse giver nye oplysninger om sammenhængen mellem CRC og MetS i forbindelse med polymorfier i miRNA maskiner gener. Men der vil være behov, yderligere undersøgelser af andre miRNA maskiner gener at afklare sammenhængen mellem disse polymorfier og CRC.

Sammenfattende vi undersøgte forholdet mellem CRC modtagelighed og miRNA maskiner genet

drosha

rs10719,

DICER1

rs3742330,

RAN

rs14035, og

XPO5

rs11077 polymorfier. Til dato har få studier undersøgt sammenhængen mellem polymorfier i

RAN

gen og CRC risiko og der var ingen associationer mellem

Ran

gen polymorfier og CRC risiko [24-26]. Selvom vores resultater giver de første beviser for en signifikant sammenhæng mellem

RAN

polymorfier og CRC i koreanske patienter, vil vores resultater drage fordel af yderligere data vedrørende polymorfi effekt på mRNA-stabilitet, bindende effektivitet og selektivitet. Derfor er vores studie, mens roman i sine resultater, kræver validering af funktionelle studier, der undersøger polymorfi effekt på miRNA maskiner og nedstrøms cellulære aktiviteter.

Støtte Information

S1 fil. Tabel A i S1 File.

MiRNA biogenese gen genotypefrekvenser og CRC patient overlevelse. Tabel B i S1 File. Kombinationen af ​​miRNA biogenese gener polymorfier baseret på MDR og CRC patienter. Tabel C i S1 File. Kombinationen af ​​de polymorfier af microRNA maskiner gener i CRC patienter og kontroller: mand undergruppe. Tabel D i S1 File. Kombinationen af ​​de polymorfier af microRNA maskiner gener i CRC patienter og kontroller: pige undergruppe. Tabel E i S1 File. Kombinationen af ​​de polymorfier af microRNA maskiner gener mellem undergruppen for tarmkræft og kontrolpersoner. Tabel F i S1 File. Genotypefrekvenser af miRNA biogenese gen polymorfier og CRC patienter overlevelse i TNM stadie I + II. Tabel G i S1 File. Genotypefrekvenser af miRNA biogenese gener polymorfier og CRC patienter overlevelse i TNM stadie III + IV. Tabel H i ​​S1 File. Allel kombinationer af miRNA behandling gener i CRC patienter og kontroller ved hjælp af reduktion multifactor dimensionalitet. Tabel I i S1 Filer. Allel kombination af miRNA biogenese gener polymorfier baseret på flere faktorer reduktion dimensionalitet og CRC patienter overlevelse

doi:. 10,1371 /journal.pone.0131125.s001

(DOCX)