PLoS ONE: 92-Gene Molekylær Profilering i Identifikation af Cancer Oprindelse: En retrospektiv undersøgelse i kinesisk Befolkning og ydeevne indenfor forskellige undergrupper

Abstrakt

Baggrund

Efter kræftdiagnose, terapi for patienten er i høj grad afhængig af tumor oprindelse, især når en metastatisk tumor bliver behandlet. sager som atypisk metastase, dårligt differentierede tumorer eller endda et begrænset antal tumorceller, kan imidlertid føre til udfordringer med at identificere oprindelsen. Desuden vil ca. 3% til 5% af de samlede patienter med solide tumorer ikke at have deres tumoroprindelse identificeret i deres levetid. Den Theros CancerTYPE ID® er designet til at identificere tumor oprindelse med en objektiv, hurtig og standardiseret procedure.

Metode og vigtigste resultater

Dette er et blindet retrospektiv undersøgelse for at evaluere resultaterne af Theros CancerTYPE ID® i en kinesisk befolkning. I alt blev 184 formalin-fikseret paraffinindlejrede (FFPE) prøver af 23 tumor oprindelse indsamlet fra vævsbank af Fudan University i Shanghai Cancer Center (FDUSCC). En standard tumorcelle berigelse fremgangsmåde blev anvendt, og de forudsigelsesresultater blev sammenlignet med henvisning diagnose, hvilket blev bekræftet af to erfarne patologer ved FDUSCC. Alle de 184 prøver blev analyseret med succes, og ingen tumor prøver blev udelukket på grund af prøven kvalitetsproblemer. I alt blev 151 prøver korrekt forudsagt. Aftalen lå 82,1%. En Pearson Chi-square test viser, at der ikke er nogen forskel mellem denne undersøgelse og den tidligere evaluering test udført af bioTheranostics Inc. Ingen statistisk signifikant fald blev observeret i enten metastase gruppe eller tumorer med høje kvaliteter.

Konklusioner

En tilsvarende resultat med tidligere arbejde blev opnået. Konkret prøver med en høj sandsynlighed score ( 0,85) har en stor chance (aftale rate = 95%) for at være korrekt forudsagt. Ingen ydeevne forskel blev observeret mellem primære og metastatiske prøver, og ingen forskel blev observeret blandt tre tumor kvaliteter. Brugen af ​​laser capture mikro-dissektion (LCM) gør Theros CancerTYPE ID® tilgængelig for næsten alle kræftpatienter med forskellige tumor status

Henvisning:. Wu F, Huang D, Wang L, Xu Q, Liu F, Ye X, et al. (2012) 92-Gene Molekylær Profilering i Identifikation af Cancer Oprindelse: En retrospektiv undersøgelse i kinesisk Befolkning og ydeevne indenfor forskellige undergrupper. PLoS ONE 7 (6): e39320. doi: 10,1371 /journal.pone.0039320

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan

Modtaget: Januar 17, 2012; Accepteret: 23. maj 2012; Udgivet: 22 juni, 2012