PLoS ONE: Genetisk variation i en MicroRNA-502 Minding stedet på SET8 Gene giver Klinisk Resultatet af ikke-småcellet lungekræft i en kinesisk Befolkning

Abstrakt

Baggrund

Genetiske varianter kan påvirke microRNA-target interaktion gennem modulere deres binding affinitet, skabe eller ødelægge miRNA-bindingssteder. SET8, et medlem af SET domæne-holdige methyltransferase, har været impliceret i en række vifte af biologiske processer

Metoder

Brug Taqman assay, vi genotypede en polymorfi rs16917496 T . C inden for miR-502 bindingssted i 3′-utranslaterede region af

SET8

gen i 576 ikke-småcellet lungekræft (NSCLC) patienter. Funktioner af rs16917496 blev undersøgt ved hjælp af luciferaseaktivitet assay og valideret af immunfarvning.

Resultater

Log-rank test og Cox regression viste, at CC-genotypen var forbundet med en længere overlevelse og en reduceret risiko for døden for NSCLC [58.0 vs. 41,0 måneder,

P

= 0,031; hazard ratio = 0,44, 95% fortrolige interval: 0,26-0,74]. Yderligere trinvis regressionsanalyse foreslog rs16917496 var et selvstændigt gunstig faktor for prognose og den beskyttende effekt mere fremtrædende i aldrig rygere, patienter uden diabetes og patienter, som fik kemoterapi. En signifikant interaktion blev observeret mellem rs16917496 og rygning status i forhold til NSCLC overlevelse (

P

0,001). Luciferaseaktivitet assay viste en lavere udtryk niveau for C-allelen i forhold til T-allelen, og miR-502 havde en effekt på graduering af

SET8

gen

in vitro

. CC-genotypen var forbundet med reduceret SET8 proteinekspression baseret på immunfarvning af 192 vævsprøve NSCLC (

P

= 0,007). Lavere niveauer af SET8 var forbundet med en ikke-signifikant længere overlevelse (55,0 vs. 43,1 måneder)

Konklusion

Vores data antydede, at rs16917496 T . C placeret på miR-502 bindingssted bidrager til NSCLC overlevelse ved at ændre SET8 udtryk gennem modulerende miRNA-target interaktion

Henvisning:. Xu J, Yin Z, Gao W, Liu L, Yin Y, Liu P, et al. (2013) genetiske variation i en MicroRNA-502 Minding stedet på

SET8

Gene giver Klinisk Resultatet af ikke-småcellet lungekræft i en kinesisk Befolkning. PLoS ONE 8 (10): e77024. doi: 10,1371 /journal.pone.0077024

Redaktør: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugal

Modtaget: Juli 2, 2013; Accepteret: August 27, 2013; Udgivet: 11 oktober, 2013