PLoS ONE: Betydelig rolle østrogen og progesteron receptor Sequence Varianter i galdeblære Cancer Disposition: En Multi-Analytisk strategi

Abstrakt

Baggrund

Carcinoma af galdeblære (GBC) er en aggressiv malignitet. Den højere forekomst af galdeblæren kræft hos kvinder er delvist tilskrives hormonale faktorer. den nuværende undersøgelse blev derfor designet til at udforske den rolle genetiske varianter i østrogen (

ESR1, ESR2

) og progesteron (

PGR

) receptorer i giver risiko for galdeblæren kræft.

Materialer og metoder

Den nuværende case-kontrol undersøgelse rekrutteret i alt 860 emner, herunder 410 GBC patienter, 230 galdesten patienter og 220 kontroller. Vi undersøgte sammenslutninger af 6 udvalgte polymorfier i tre gener:

ESR1

(rs2234693, rs9340799, rs1801132),

ESR2

(rs1271572, rs1256049) og

PGR

(rs1042838) med GBC risiko. Genotypebestemmelse for alle polymorfier blev udført ved anvendelse af PCR-RFLP. Multifaktor reduktion og klassificering dimensionalitet og regression træ tilgange blev kombineret med logistisk regression til at opdage høj-ordens-gen-gen interaktioner i hormonal vej.

Resultater

Ved sammenligning genotypen frekvens fordeling i galdesten og GBC patienter med den for raske personer, homozygot variant genotyper af

ESR1

-397TT (rs2234693) polymorfi viste signifikant risiko for at udvikle galdesten [odds ratio: OR = 2,9] og GBC [OR = 1,8] hhv. Detaljerede haplotyper analyse foreslog, at

ESR1

T

rs2234693G

rs9340799C

rs1801132 har signifikant sammenhæng i giver risiko for både galdesten [OR = 2,2] og GBC [OR = 3,0]. Men variant-holdige genotyper (DI + II) af

PGR

(rs1042838) viste, lav risiko i både GBC [OR = 0,4] og galdesten patienter [OR = 0,4] .På udfører MDR-analyse,

ESR1

IVS1-397C T,

ESR1

IVS1-351A G, og

ESR2

-789 A C gav den højeste test nøjagtighed 0,634. Disse resultater blev yderligere understøttet af CART analyse, som viste, at personer med de kombinerede genotyper af

ESR1

-397 CT eller TT,

ESR1

-351 AG eller GG og

ESR2

-789 AA havde den højeste risiko for GBC [OR = 3,9].

Konklusion

Brug multi-analytiske tilgange, viste vores undersøgelse vigtige rolle

ESR1

IVS1- 397C T,

ESR1

IVS1-351A G, og

ESR2

-789 A . C-varianter i GBC modtagelighed og risikoen synes at være medieret gennem galdesten afhængige vej

Henvisning: Srivastava A, Sharma KL, Srivastava N, Misra S, Mittal B (2012) Betydelig rolle østrogen og progesteron receptor Sequence Varianter i galdeblære Cancer Disposition: En Multi-Analytisk strategien. PLoS ONE 7 (7): e40162. doi: 10,1371 /journal.pone.0040162

Redaktør: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, USA

Modtaget: Marts 1, 2012; Accepteret: Juni 2, 2012; Udgivet: 10. juli 2012