Af Jennifer Bails
TRIBUNE-REVISION
Torsdag 29 september, 2005
Sundhed embedsmænd reagerede hurtigere på hepatitis A udbrud i Beaver County for to år siden, fordi genetiske test, der anvendes i løbet af udbruddet givet resultater inden for et par dage, ifølge en ny statslige og føderale rapport.
en teknik kaldet viral sekventering aktiveret den amerikanske Food and Drug Administration til at iværksætte en øjeblikkelig undersøgelse for at se, om grønne løg importeret fra Mexico forårsagede udbruddet, der syg 660 mennesker og dræbte fire, ifølge en analyse, der offentliggøres i oktober 15 udgave af The Journal of Infectious Diseases, men nu tilgængelige online.
Uden denne molekylære beviser, FDA kunne ikke ‘ t er begyndt at spore kilden til medicinske detektiver færdig interviewe hepatitis a patienter om deres symptomer og hvilke fødevarer, de spiste og hvor, sagde Dr. Anthony Fiore, en medicinsk epidemiolog ved det amerikanske Centers for Disease Control og Forebyggelse i Atlanta.
“i dette tilfælde, var vi i stand til at gøre en formodet sammenhæng mellem de grønne løg fra avlere i det nordlige Mexico inden for et par dage fra begyndelsen af udbruddet blot baseret på viral sekventering alene,” sagde Fiore. “Som et resultat, kan FDA få deres tilbagesporingstællingen undersøgelse startede tidligere, hvilket førte dem til at sætte en forsendelse forbud mod produkter vokset med fire gårde.”
At succes kan føre til mere udbredt anvendelse af viral sekventering at spore sygdomsudbrud , sagde Fiore. Lignende metoder, som allerede anvendes rutinemæssigt til genetisk sammenligning af bakterier forbundet med E. coli og salmonella forgiftning.
Viral sekventering bestemmer den nøjagtige rækkefølge af de kemiske enheder, der udgør den genetiske kode af et virus. Med hepatitis A, den genetiske kode består af enheder kaldet RNA, der er opbygget svarende til DNA. Nogle dele af RNA-sekvensen variere lidt fra stamme til stamme. Forskere sammenligne variationer til at fortælle, hvor tæt en virusstamme er relateret til en anden.
Technology er opstået kun inden for det sidste årti at sekventere RNA hurtigt nok til at blive brugt i løbet af en hepatitis A udbrud i stedet for bagefter, sagde Fiore.
I de seneste fem år, forskerne også lært at udtrække virus prøver er egnede til sekventering fra blodserum, sagde han. Tidligere blev afføringsprøver krævede, hvilket var langsommere.
“Teknologien har avancerede nok, at nu kan vi få resultater fra viral sekventering på mindre end to dage,” Fiore sagde.
I september 2003, Tennessee, North Carolina og Georgien indberettet 422 tilfælde af fødevarebårne hepatitis A virus infektion Centers for Disease Control og Forebyggelse. Gennem patient interviews og viral sekventering, CDC embedsmænd bestemmes disse sager var knyttet til forbrug af forurenede grønne løg, eventuelt importeret fra Mexico.
De blev indpakning op undersøgelsen i begyndelsen af oktober som lånere af Chi-Chi restaurant i Beaver County Mall ubevidst spiste forurenet grønne løg.
Mens epidemiologer begyndte interviewe patienter i Beaver County område, CDC forskere begyndte sekventering virusstammer isoleret fra deres blod.
Mens interviewene var i gang, opdagede forskerne RNA-sekvensen af hepatitis en stamme i Pennsylvania patienter afveg ved blot én kemisk enhed fra virus i Georgia og North Carolina udbrud. Og det afveg med en enkelt enhed fra Tennessee virus.
“Det alene ikke bevise det måtte være relateret til den samme kilde, men det var godt foreløbige beviser, at jump-startede hele processen hurtigere,” Fiore sagde.
Jennifer Bails kan kontaktes på [email protected] eller (412) 320-7991.
Leave a Reply
Du skal være logget ind for at skrive en kommentar.