PLoS ONE: Styrbarhed i Cancer Metabolic Networks Ifølge Drug Targets som driverindstillinger Nodes

Abstrakte

Netværk er ansat til at repræsentere mange ikke-lineære komplekse systemer i den virkelige verden. De topologiske aspekter og relationer mellem struktur og funktion af biologiske netværk er ofte blevet undersøgt i de seneste årtier. Imidlertid dynamiske og kontrolfunktioner i komplekse netværk er ikke blevet udbredt forsket i sammenligning med topologiske netværksfunktioner. I denne undersøgelse, vi udforske forholdet mellem netværket styrbarhed, topologiske parametre, og netværk medicin (metaboliske lægemiddelkandidater). I betragtning af den antagelse, at mål for godkendte anticancer metaboliske stoffer er driver knudepunkter (som styrer kræft metaboliske netværk), har vi anvendt topologiske analyse genome-skala metaboliske modeller af 15 normale og tilsvarende kræft celletyper. Resultaterne viser, at ud over de primære netværksparametre, kan mere komplekse netværk parametre såsom motiver og klynger også være passende til styring af systemer, der leverer styrbarheden forholdet mellem topologiske parametre og drug targets. Derfor denne undersøgelse afslører mulighederne for efter et sæt driver knudepunkter i netværket klynger i stedet for at betragte dem individuelt efter deres centralities. Dette resultat antyder overvejer distribuerede kontrolsystemer i stedet for nodal kontrol for kræft metaboliske netværk, der fører til en ny strategi inden for netværket medicin

Henvisning:. Asgari Y, Salehzadeh-Yazdi A, Schreiber F, Masoudi-Nejad A (2013) Styrbarhed i Cancer Metabolic Networks Ifølge Drug Targets som driverindstillinger Nodes. PLoS ONE 8 (11): e79397. doi: 10,1371 /journal.pone.0079397

Redaktør: Peter Csermely, Semmelweis University, Ungarn

Modtaget: August 7, 2013; Accepteret: September 30, 2013; Udgivet: November 25, 2013