PLoS ONE: polymorfier i NFKB1 og TLR4 og Interaktion med Diætmad og livsstilsfaktorer i relation til kolorektal cancer i en dansk Prospective Case-Kohorte

Abstrakt

Vedligeholdelse af en balance mellem kommensale bakterier og slimhindeimmunsystemet er afgørende, og tarm dysbiosis kan være en central begivenhed i patogenesen for kolorektal cancer (CRC). Den toll-like receptor 4 (TLR4) er en vigtig mønster-genkendelse receptor der regulerer inflammation og barrierefunktion i tarmen ved en mekanisme, der involverer aktivering af den nukleare faktor-KB (NF-KB) transskriptionsfaktoren. Kosten og livsstilsfaktorer kan påvirke disse funktioner. Vi brugte derfor en dansk prospektiv case-kohorte studie af 1010 CRC sager og 1829 tilfældigt udvalgte deltagere fra den danske Kost, Kræft og Helbred kohorte til at undersøge tre polymorfier i

NFKB1

og

TLR4

deres mulige interaktioner med kost og livsstilsfaktorer i relation til risikoen for CRC. Homozygot transport af varianten allel af

TLR4

/rs5030728 polymorfi var forbundet med øget risiko for CRC (incidensrate ratio (IRR) = 1,30; 95% konfidensinterval (CI): 1,05-1,60; P = 0,02 (gen-dosis model); IRR = 1,24; 95% CI: 1,01-1,51; P = 0,04 (recessiv model)). Del-bærere af

NFKB1

/rs28362491 polymorfi havde en 17% (95% CI: 1,03-1,34; P = 0,02) øget risiko for CRC forhold til homozygote bærere af ins-allel. Men ingen af ​​disse risikofaktorer skøn modstod justering for multiple sammenligninger. Vi fandt ingen stærke gen-miljø interaktioner mellem den undersøgte polymorfi og kost og livsstilsfaktorer i relation til CRC risiko

Citation:. Kopp TI, Andersen V, Tjønneland A, Vogel U (2015) polymorfier i

NFKB1

TLR4

og Interaktion med Diætmad og livsstilsfaktorer i relation til kolorektal cancer i en dansk Prospective Case-Kohorte. PLoS ONE 10 (2): e0116394. doi: 10,1371 /journal.pone.0116394

Academic Redaktør: Jeffrey S. Chang, National Health Research Institutes, TAIWAN

Modtaget: August 21, 2014 Accepteret: 9. december 2014 Publiceret: 23 feb 2015

Copyright: © 2015 Kopp et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Data Tilgængelighed: Alle relevante data er inden for papir og dens støtte Information filer

Finansiering:. projektet blev støttet af et ph.d.-stipendium fra forskningsrådene i programmet »en integreret tilgang til risk-benefit vurdering af humane sundhedsmæssige virkninger af fødevarer og fødevarekontaminanter ‘(Forskeruddannelse 2009-10), og ved en Mobility ph.d.-stipendium (09-06 7572) fra dansk Frie Forskningsråd (www.ufm.dk) og som en del af projektet: “Oksekød versus svinekød forbrug i ætiologi kræft i tyktarmen og endetarmen: undersøgelser udført inden for det Kost, Kræft og Helbred kohorte “også fra dansk Frie Forskningsråd; Medical Sciences (Grant nr. 09-073.597) (www.ufm.dk). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:. Forfatterne har læst tidsskriftets politik og har følgende konkurrerende interesser: VA modtager kompensation som konsulent for Merck Co., Inc. (MSD) og Janssen. Dette ændrer ikke forfatternes overholdelse PLoS ONE politikker på datadeling og materialer.

Introduktion

Kolorektal cancer (CRC) er den tredje mest almindelige kræftform hos mænd og den anden hos kvinder verdensplan [1]. Arvelige faktorer skønnes at bidrage til kun 35% af risikoen [2], understrege betydningen af ​​miljømæssige faktorer i ætiologien af ​​CRC. Faktisk har kosten og livsstilsfaktorer været intensivt undersøgt for deres rolle i kolorektal carcinogenese; og alkohol, rygning, fedme og høj kød indtag er nu etableret risikofaktorer for CRC [3-5]. Indtagelse af rødt og forarbejdet kød har potentiale til at inducere cancer ved kemiske carcinogener dannes under tilberedning af kød ved høje temperaturer [6], produktion af toksiske fermenteringsbetingelser forbindelser [7-9] eller ved at inducere inflammation skyldes ændringer i bakteriel sammensætning [10] . Omvendt fiber, frugt og grøntsager giver kortkædede fedtsyrer (SCFA’er) til tyktarmsepitelet ved fermentering af ikke-absorberet kostfibre og stivelse [11-15]. Den SCFA butyrat er vigtig for colon integritet [14], hæmmer væksten af ​​kræftceller

in vitro

[16,17], og har anti-inflammatoriske egenskaber hovedsagelig ved hæmning af nuklear faktor-KB (NF-KB) aktivering [18]. Salg

Toll-lignende receptorer (TLR) er vigtige mønstergenkendelse receptorer, der regulerer inflammation og barrierefunktion i tarmen og dermed bevare en balance mellem kommensale bakterier og det mucosale immunsystem [19,20] . Receptoren for gramnegativ bakteriel lipopolysaccharid (LPS), TLR4, regulerer celleproliferation som respons på celleskade gennem induktion af cyclooxygenase 2-ekspression [21] i en kaskade, der involverer aktivering af NF-KB og epidermal vækstfaktor [22] tyder på, at TLR4 er et vigtigt element i overgangen fra betændelse til neoplasi [19]. Faktisk har forøget ekspression af TLR4 været knyttet til udviklingen af ​​inflammation-associerede neoplasi [23-26]. Derudover har vi tidligere fundet bevis for, at betændelse kan bidrage til CRC carcinogenese. Således genetisk bestemt høj IL-1 og COX-2-niveauer var associeret med øget risiko for CRC [27].

Dysbiosis i tarmen kan være en vigtig begivenhed i patogenesen af ​​både inflammatoriske tarmsygdomme (IBD) og CRC. Brug funktionelle enkelt nukleotid polymorfier (SNP) og deres interaktion med kost og livsstil kan afsløre vigtige veje for kolorektal carcinogenese [28]. Da

TLR

polymorfier har været forbundet med IBD [29], vi havde til formål at undersøge en mulig gensidig mekanisme for IBD og CRC.

Vi har tidligere vist, at transporten af ​​varianten del-allel de funktionelle ins /del

NFKB1

/rs28362491 polymorfi er forbundet med øget risiko for CRC og interageret med kød indtag i en delmængde af den aktuelle studiegruppen [30] i overensstemmelse med resultaterne fra to andre undersøgelser også rapportering øget risiko af CRC blandt variant bærere af polymorfi blandt en malaysisk [31] og en svenske befolkning [32], men ikke en kinesisk studiegruppe [32]. En funktionel SNP i

TLR4

(rs4986790) er blevet grundigt undersøgt og har været forbundet med neoplastisk progression

in vitro

[33], aggressiv human tyktarmskræft [33], IBD [34-37 ] og CRC [38-40]. Men andre var ikke i stand til at finde en sammenhæng mellem CRC og SNP [41-43]. I en canadisk undersøgelse [44], blev indtagelse af kosten mættede fedtsyrer omvendt relateret til blod for høj densitet lipoprotein kolesterol hos personer homozygote for

TLR4

/rs5030728 G-allel.

TLR4

/rs5030728 kan derfor interagere med kosten komponenter i tarmen.

Derfor forventede vi, at inflammation er en vigtig faktor i kolorektal carcinogenese og dermed undersøgt, om kost og livsstilsfaktorer (ikke- steroide anti-inflammatoriske lægemidler (NSAID) og rygning) ændre CRC risiko ved at ændre immunresponset mucosal i tarmen via interaktion med TLR4 og NF-KB. Vi evaluerede derfor tre polymorfier i

NFKB1

og

TLR4

og deres mulige samspil med kost og livsstilsfaktorer i et prospektivt kohorte af 1010 CRC sager og 1829 tilfældigt udvalgte deltagere fra den danske Kost, Kræft og Health Study.

Materiale og metoder

Studerede emner

kost, Kræft og Helbred undersøgelse er en igangværende dansk kohorteundersøgelse designet til at undersøge forholdet mellem kost, livsstil og kræftrisiko [45]. Den kohorte består af 57,053 personer, rekrutteret fra december 1993 og maj 1997. Alle emner blev født i Danmark, og de personer, var 50 til 64 år og havde ingen tidligere kræft ved undersøgelsens start. Blodprøver og spørgeskemadata om kost og livsstil blev indsamlet ved undersøgelsens start.

Opfølgning og endpoints

Opfølgning var baseret på populationsbaserede kræftregistre. Mellem 1994 og 31 december 2009, blev 1010 CRC tilfælde diagnosticeret. En sub-kohorte af 1829 personer blev tilfældigt udvalgt inden kohorten. 28 personer var begge sager og sub-kohorte på grund af den anvendte undersøgelse design [46]. 245 med manglende genotypedata og 16 med manglende data om risikofaktorer blev udelukket. Alle oplysninger om genotyper og kost og livsstilsfaktorer var tilgængelig for 915 CRC tilfælde og 1719 sub-kohorte medlemmer.

Diætmad og livsstil spørgeskema

Oplysninger om kost, livsstil, vægt, højde, medicinsk behandling , miljøeksponeringer og andre socioøkonomiske faktorer blev indsamlet ved indskrivning ved hjælp af spørgeskemaer og interviews, og er blevet beskrevet i detaljer andetsteds [27,47-49]. Kort sagt, maden-frekvens spørgeskema, blev kost forbrug vurderet i 12 kategorier af foruddefinerede svar, ranking fra “aldrig” til “otte gange eller mere om dagen«. Det daglige indtag blev derefter beregnet ved FoodCalc [45]. Rygning status blev klassificeret som aldrig, tidligere eller nuværende. Personer rygning mindst en cigaret dagligt i løbet af sidste år blev klassificeret som rygere. NSAID brug ( “Aspirin”, “Paracetamol”, “Ibuprofen”, eller “Andre smertestillende midler) blev vurderet som ≥ 2 piller om måneden i løbet af et år ved baseline.

Genotypning

Buffy coat præparater blev opbevaret ved minus 150 ° C indtil anvendelse. DNA blev ekstraheret som beskrevet [50]. DNA blev genotype af LGC KBioscience (LGC KBioscience, Hoddesdon, Det Forenede Kongerige) ved PCR-baserede KASP genotypebestemmelsesassay (Fejl! Hyperlink henvisning ikke gyldig. Www.lgcgenomics.com/).

NFKB1

/rs28362491 blev analyseret og rapporteret for en delmængde af den aktuelle studiegruppen [30]. To af polymorfier (

NFKB1

/rs28362491 og

TLR4

/rs4986790) blev valgt på grundlag af kendte funktionalitet og deres tilknytning til CRC [30-33] og IBD [34-37] fra en litteratursøgning.

TLR4

/rs5030728 polymorfi, på den anden side, har ingen kendt funktionalitet. Men

TLR4

/rs4986790 er tæt forbundet med

TLR4

/rs5030728 (D ‘: 1,0; r

2: 0,017) ved hjælp Haploview version 4.2 (Broad Institute of MIT og Harvard, Cambridge) [51] med HapMap3 Genome Browser release # 2 (fase 3) [52]; og da

TLR4

/rs5030728 har en højere mindre allel frekvens i kaukasiere end

TLR4

/rs4986790 (0,305 vs. 0,035), denne polymorfi er mere egnet til gen-miljø interaktion analyser. For at bekræfte reproducerbarhed blev genotype gentaget for 10% af prøverne giver 100% identitet.

Statistisk analyse

Afvigelse fra Hardy-Weinberg ligevægt blev vurderet ved hjælp af en Chi-square test.

incidensrate ratio (IRR) og 95% konfidensinterval (CI) blev beregnet i henhold til principperne for analyse af case-kohortestudier bruger en un-vægtet tilgang [46]. Alder blev anvendt som tidsskala i Cox regressionsmodeller. Test og konfidensintervaller var baseret på Wald s forsøg med det robuste estimat af variansen-kovarians matrix til regressionsparametrene i Cox regressionsmodeller [53], som tidligere beskrevet [27,46,48,54-61].

Alle modeller blev justeret for baseline værdier af risikofaktorer for kolorektal cancer såsom body mass index (BMI) (kg /m

2, kontinuerlig), brug af hormonpræparater (HRT) (aldrig /fortid /strøm, blandt kvinder), indtagelse af kostfibre (g /dag, kontinuerlig), og rødt kød og forarbejdet kød (g /dag, kontinuerlig) og i tillæg til mistanke risikofaktorer såsom NSAID brug (ja /nej) og rygning status (aldrig /fortid /strøm). Korn, fiber, frugt og grøntsager blev også indgået lineært. Alle analyser blev stratificeret efter køn, således at de grundlæggende (underliggende) farer var kønsspecifik. For alle polymorfier blev IRR beregnet separat for heterozygote og homozygote variant allel luftfartsselskaber. For

TLR4

/rs4986790 og

NFKB1

/rs28362491, variant allel luftfartsselskaber blev efterfølgende grupperet til interaktion analyser, da der ikke recessive effekter blev observeret.

TLR4 /

rs5030728 blev udledt i både et gen-dosis og en recessiv tilstand i de efterfølgende analyser.

Desuden vurderede vi ugentlig brug af NSAID baseret på resultaterne af en undersøgelse af kolorektal cancer inden for Kost, Kræft og Helbred kohorte [62] rapporterer, at langvarig konsekvent brug af aspirin eller ikke-Aspirin NSAID synes nødvendig for at opnå en beskyttende virkning. Men der var ingen forskel i risikoestimater mellem månedligt eller ugentligt brug dermed at opretholde den statistiske styrke i lag; vi brugte månedlige NSAID brug i analyserne.

Sandsynligheden kvotientkriteriet blev brugt til interaktion analyser mellem de undersøgte polymorfier og indtag af rødt og forarbejdet kød, kostfibre, korn, fisk, frugt, grøntsager, alkoholindtagelse, rygning status og NSAID brug. I samspil analyser hvor kostfaktorer blev opført som kategoriske variabler, tertil beskæringspunkter var baseret på den empiriske fordeling mellem mandlige og kvindelige tilfælde hhv. De mulige interaktioner blev undersøgt ved anvendelse af likelihood ratio test.

Alle analyser blev udført ved anvendelse af SAS-version 9.3 (SAS Institute Inc., Cary, NC). En p 0,05 blev anset for at være betydelig. Desuden, for at teste for flere sammenligninger blev Bonferroni korrektion anvendes.

Etik erklæring

Alle deltagere gav verbale og skriftligt informeret samtykke. Den Kost, Kræft og Helbred undersøgelse blev godkendt af det nationale udvalg for Health Research Ethics (tidsskrift nr. (KF) 01-345 /93) og den danske Datatilsynet.

Resultater

Baseline karakteristika af undersøgelsen er gengivet i tabel 1. Blandt sub-kohorte medlemmer genotypen fordelingen af ​​SNPs ikke afvige fra Hardy-Weinberg ligevægt (resultater ikke vist).

Foreninger mellem polymorfier og CRC

Homozygote variant bærere af

TLR4

/rs5030728 polymorfi var på 1,30 gange (95% CI: 1,05-1,60) øget risiko for CRC i et gen-dosis model og på 1,24 fold (95% CI: 1,01-1,51) øget risiko for CRC sammenlignet med vildtype og heterozygote bærere i en recessiv model (tabel 2). Desuden bærere af

NFKB1

del-allel havde en 17% (95% CI: 1,03-1,34) øget risiko for CRC forhold til homozygote bærere af ins-allel (Tabel 2). Disse risikofaktorer skøn imidlertid ikke, nå statistisk signifikans efter Bonferroni korrektion. Der var ingen interaktion mellem de to risikofaktorer genotyper

TLR4

/rs5030728 og

NFKB1

/rs28362491 men på den anden side var der ingen additiv virkning af at være homozygot bærer af både variant alleler (S1 Table ).

Gene-miljø analyser

Vi fandt ingen interaktion mellem nogen af ​​de kostfaktorer og de undersøgte polymorfier i forhold til risikoen for CRC i de lineære analyser (S2 tabel). I tertil analyser, der var svag vekselvirkning mellem

TLR4

/rs5030728 og indtag af grøntsager (Gene-dosis model: P-værdi for interaktion (P

int) = 0,05; Recessive model: P

int = 0,03) (tabel 3). Desuden er en borderline statistisk signifikant interaktion mellem kød indtag og

NFKB1

/rs28362491 polymorfi (P

int = 0,06) blev fundet (tabel 3). For ins-bærere, risikoestimater var sammenlignelige på tværs tertiles af kød indtag. Omvendt blandt del-bærere, indtagelse af kød i den anden (IRR = 1,46; 95% CI: 1,17-1,83) og tredje tertil (IRR = 1,24; 95% CI: 0,99-1,56) var forbundet med risiko for CRC, hvorimod del-allel bærere var ikke i fare i den første tertil med lavt indtag af kød (IRR = 0,98; 95% CI: 0,78-1,23). Med hensyn til alkohol, variant bærere af

NFKB1

/rs28362491 og homozygote A-allel bærere af

TLR4

/rs5030728 var forbundet med CRC risiko i forhold til de homozygote vildtype luftfartsselskaber blandt deltagere med et lavt indtagelse af alkohol. Desuden er der for variant bærere af alle tre polymorfier, et lavt indtag (første tertil) af alkohol var forbundet med den højeste CRC risiko sammenlignet med moderat (anden tertil) indtag-der var forbundet med den laveste risiko-og højt indtag af alkohol (tredje tertil ) (tabel 3).

Der var ingen interaktion mellem NSAID brug eller rygning status og de undersøgte genotyper (S3 og S4 Tables). Blandt ikke-rygere (S4 tabel), dog

TLR4

/rs5030728 polymorfi demonstreret gen-dosis effekt, der er sammenlignelig med resultaterne ses blandt deltagerne med lavt indtag af alkohol (Tabel 3). I en model, hvor risikoen for CRC blev udledt pr 25 g indtag af kød per dag opdelt ved brug af NSAID, er risikoen for CRC med kød indtag steg på en dosisafhængig måde blandt variante allel bærere af

TLR4

/rs5030728 i mangel af NSAID brug, men ikke blandt NSAID-brugere (S5 tabel). Således blev kød indtag ikke forbundet med risiko blandt homozygote bærere af vildtype allelen, hvorimod kød indtag var forbundet med en 4% øget risiko pr 25 g kød /dag (95% CI: 1,00-1,09) blandt heterozygoter og 11% øget risiko blandt homozygot variant allel luftfartsselskaber (95% CI: 1,02-1,22). Men der var ingen statistisk signifikante interaktioner (S5 tabel).

Diskussion

I den foreliggende undersøgelse, fandt vi, at homozygot variant transport af

TLR4

/rs5030728 og variant transport af

NFKB1

/rs28362491 polymorfi var forbundet med øget risiko for CRC, men ikke efter korrektion for multiple test. Vi fandt kun svage vekselvirkninger med et par kostfaktorer og derfor vi ikke var i stand til at gengive tidligere fundet samspil mellem

NFKB1

/rs28362491 polymorfi og kød indtag. Den manglende sammenhæng mellem

TLR4

/rs4986790 og CRC fundet i nærværende undersøgelse kunne muligvis være på grund af den meget lave variant allel frekvens i den danske befolkning. Kun én person var homozygot variant allel luftfartsselskab. Vi kan derfor ikke udelukke, at den funktionelle effekt af denne SNP påvirker kolorektal carcinogenese.

NFKB1

/rs28362491 polymorfi er temmelig konsekvent været forbundet med CRC risiko [30-32], og til en vis grad også IBD [29,63,64]. Som tidligere beskrevet [65,66],

NFKB1

koder for p50 /P105 underenheder af transskriptionsfaktoren NF-KB. NF-KB består af homo- eller heterodimerer af et antal forskellige underenheder p65, p50, p105, C-rel og relB [67,68], og kombinationen bestemmer målgenet specificitet. Som p65 /p50-heterodimer, komplekset er pro-inflammatorisk [68], hvorimod p50-homodimeren har anti-inflammatoriske egenskaber [65,67,69,70]. Den relative overflod af P50 /p65 heterodimerer og P50-homodimerer vil derfor bestemme størrelsen af ​​betændelse ved at afbalancere den pro-inflammatoriske og anti-inflammatorisk respons [67].

NFKB1

/rs28362491 polymorfi genererer en sletning af fire nukleotider i promotorområdet forårsager sænkede transskription niveauer og dermed delvis udtømning af p50 [63]. Efter aftale med dette, blev det konstateret, at mRNA niveauerne af

NFKB1

var lavere i kolon biopsier af sundt væv fra homozygote del-bærere i forhold til heterozygoter [71]. Dette ugunst det antiinflammatoriske respons siden dannelsen af ​​pro-inflammatoriske p65 /p50 heterodimer afhænger af koncentrationen af ​​p50, mens dannelsen af ​​det antiinflammatoriske p50-homodimer afhænger af koncentrationen af ​​p50 kvadreret [65].

TLR4

/rs5030728 polymorfi er endnu ikke knyttet til CRC [20], og dets funktion er ukendt [72].

TLR4

/rs4986790, der har været forbundet med IBD og CRC, er tæt forbundet med

TLR4

/rs5030728. Det er derfor ikke klart, hvilken af ​​de to polymorfier er det biologisk relevante. Men vores resultater viser, at transport af

TLR4

/rs4986790 var ikke forbundet med risiko for CRC, hvorimod transport af

TLR4

/rs5030728 var forbundet med risiko. Dette tyder på, at risikoen følger af

TLR4

/rs5030728 vogn blev ikke forårsaget af kobling med

TLR4

/rs4986790. Interessant variant transport af

TLR4-service /rs5030728 A-allelen er blevet forbundet med fordelagtige respons på anti-TNF-behandling blandt patienter med IBD [73], hvilket indebærer, at disse patienter kan have en højere baseline aktivitet eller ekspression af TLR4.

de to

TLR4

SNP er til stede på flere almindeligt anvendte GWAS arrays (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php) mens ins /del

NFKB1

/rs28362491 polymorfi ikke overvåges kobling i GWAS [65]. Ingen af ​​de to TLR4 SNPs var forbundet med CRC i GWAS. vores primære fokus var imidlertid at søge efter gen-miljø interaktioner, i stedet for at identificere loci med stærke associationer til CRC. Gene-miljø interaktioner sjældent vurderet i GWAS.

Vi fandt ingen stærke indikationer af gen–miljø interaktioner. For variant bærere af

NFKB1

/rs28362491 og homozygote A-allel bærere af

TLR4

/rs5030728, risiko for CRC blandt forbrugerne lave kød blev lavere i forhold til mellem- og høj kød forbrugere, der havde risiko estimater mellem 1,24 og 1,70 indikerer en stærkere rolle af kød i kolorektal carcinogenese blandt personer med genetisk bestemt høje inflammatorisk respons. Alternativt kød indtagelse covaries med andre livsstilsfaktorer som

per se

fremkalde en inflammatorisk reaktion, at vi ikke har været i stand til at justere for.

fundet interaktion med grøntsager og

TLR4

/rs5030728 i den foreliggende undersøgelse er ikke direkte fortolkelige og kan skyldes små grupper i tertiles. Men syntes grøntsager til lidt øge risikoen for CRC i nærværende undersøgelse, som bør behandles i andre prospektive studier.

Vi havde begrænset statistisk styrke til at påvise gen-miljø interaktioner. Men den prospektive undersøgelse design anvendes i denne undersøgelse er velegnet til gen-miljø interaktion analyser skyldes indsamling af kosten og livsstilsfaktorer før diagnose, eliminerer risikoen for recall bias. Ændring i kosten og livsstil vaner under follow-up er dog muligt, men forventes ikke at resultere i differentiel misklassifikation mellem sager og sammenligningsgruppen. Desuden er den foreliggende undersøgelse gruppen er homogen bestående af danskere og to af de undersøgte polymorfier har høje allel-frekvenser. Brug af nuværende studiegruppe, har vi tidligere fundet gen-miljø interaktioner mellem kost og

IL10

rs3024505 (P

int, kød = 0,04, fisk = 0,007, fibre = 0,0008, grøntsager = 0,0005),

IL1B

C-3737T (P

int; NSAID brug = 0,040),

PTGS2

G-765c (P

int, kød = 0,006, fiber = 0,0003, frugt 0,004) og

PTGS2

T8473C (P

int, frugt = 0,03) og

PTGS2

A-1195G (P

int, fiber 0,020 og nuværende rygning = 0,046) [27] . Vi justeret risiko estimater for mistanke risikofaktorer og omhyggeligt udvalgt de polymorfier baseret på funktion og /eller tidligere resultater på association med kostfaktorer, CRC eller IBD. Men ingen af ​​analyserne modstod justering for multiple test. Således kan vi ikke udelukke, at vores resultater skyldes chance, og de bør derfor ikke betragtes som signifikante sammenhænge.

Som konklusion, denne undersøgelse var ikke i stand til at påvise sammenhænge mellem de undersøgte polymorfier i de inflammatoriske mediator generne

NFKB1

og

TLR4

som ingen af ​​de fundne associationer modstod justering for multiple sammenligninger. Vi fandt ingen stærke gen-miljø interaktioner mellem de undersøgte polymorfier og kost og livsstilsfaktorer i relation til CRC risiko.

Støtte Information

S1 Table. IRR for CRC i forhold til kombinationer af

NFKB1

/rs2836249 og

TLR4

/rs5030728 genotyper

doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s001

(DOCX)

S2 tabel. Samspil mellem kostfaktorer og de undersøgte polymorfier i forhold til CRC risiko

doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s002

(DOCX)

S3 Table. Samspil mellem NSAID brug og de undersøgte polymorfier i forhold til CRC risiko

doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s003

(DOCX)

S4 Table. Interaktion mellem rygning status og de undersøgte polymorfier i forhold til risikoen for CRC

doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s004

(DOCX)

S5 Table. Samspil mellem NSAID brug og de undersøgte polymorfier pr 25 g rødt og forarbejdet kød indtag per dag i forhold til CRC risiko

doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s005

(DOCX)

tak

Vi takker Nick Martinussen og Katja Boll til teknisk bistand med data, der forvalter; og Jane Christensen for statistisk rådgivning. Projektet blev støttet af et ph.d.-stipendium fra forskningsrådene i programmet »En integreret tilgang til risk-benefit vurdering af humane sundhedsmæssige virkninger af fødevarer og forurenende stoffer« (Forskeruddannelse 2009-10), og ved en Mobility ph.d.-stipendium (09 -06 7572) fra dansk Frie Forskningsråd (www.ufm.dk) og som en del af projektet: “Oksekød versus svinekød forbrug i ætiologien af ​​kræft i tyktarm og endetarm: undersøgelser udført inden for det Kost, kræft og helbred kohorte “også fra dansk Frie Forskningsråd; Medical Sciences (Grant nr. 09-073.597) (www.ufm.dk). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet.