PLoS ONE: MALDI Imaging massespektrometri for in situ proteomiske analyse af præneoplastiske Læsioner i kræft i bugspytkirtlen

Abstrakt

identifikation af nye biomarkører for præneoplastiske læsioner i bugspytkirtlen (PanINs, IPMNs) og tidlig pancreas duktalt adenokarcinom (PDAC) er afgørende på grund af de sygdomme, høje dødelighed på sene afsløring. For at løse denne opgave anvendte vi hidtil ukendt teknik til matrix-assisteret laser desorption /ionisering (MALDI) afbildning massespektrometri (IMS) på gensplejsede musemodeller (GEM) af pancreascancer. Various GEM blev analyseret med MALDI IMS at undersøge peptid /protein-ekspression mønster af forstadielæsioner i sammenligning med normal pancreas og PDAC med cellulær opløsning. Statistisk analyse afslørede flere diskriminerende

m /z

-species mellem normal og sygt væv. Intraepitelialneoplasi (Panin) og intraduktal papillære mucinøs neoplasme (IPMN) kunne skelnes fra normal pancreas væv og PDAC med 26 betydelig

m /z

-species. Blandt disse

m /z

-species identificerede vi Albumin og thymosin-beta 4 ved væskekromatografi og tandem-massespektrometri (LC-MS /MS), som blev yderligere valideret ved immunhistokemi, western blot, kvantitativ RT- PCR og ELISA i både murine og humane væv. Thymosin-beta 4 blev fundet signifikant forøget i sera fra mus med Panin læsioner. Opreguleres Panin udtryk for Albumin blev ledsaget af forøget ekspression af lever-begrænsede gener tyder på en hepatisk transdifferentiering program af præneoplastiske celler. Som konklusion viser vi, at GEM af endogent PDAC er et egnet modelsystem for MALDI-IMS og efterfølgende LC-MS /MS-analyse, der giver

in situ

analyse af små forstadielæsioner og identifikation af differentielt udtrykte peptider og proteiner.

Henvisning: Grüner BM, Hahne H, Mazur PK, Trajkovic-Arsic M, Maier S, Esposito I, et al. (2012) MALDI Imaging massespektrometri for

In Situ

proteomiske Analyse af præneoplastiske læsioner i kræft i bugspytkirtlen. PLoS ONE 7 (6): e39424. doi: 10,1371 /journal.pone.0039424

Redaktør: Frank T. Kolligs, universitetet i München, Tyskland

Modtaget: Januar 15, 2012; Accepteret: 20 maj 2012; Udgivet: 26 juni, 2012