PLoS ONE: associering mellem RASSF1A Promotor Methylering og prostatakræft: en systematisk gennemgang og Meta-Analysis

Abstrakt

Prostatakræft (PCA) er fortsat som en af ​​de mest almindelige årsag til kræft dødsfald blandt mænd i OS. Det specifikke antigen (PSA) screening udbredte prostata er begrænset af lav specificitet. Den diagnostiske værdi af andre biomarkører såsom RAS forening domænenavn familie protein 1 A (RASSF1A) promoter methylering i prostatakræft og forholdet mellem RASSF1A methylering og patologiske funktioner eller tumor stadie stadig at blive etableret. Derfor blev en meta-analyse af offentliggjorte undersøgelser udført for at forstå sammenhængen mellem RASSF1A methylering og prostatacancer. I alt blev 16 undersøgelser med 1431 tilfælde og 565 kontroller samlet med en tilfældig effekt model i denne undersøgelse. Den odds ratio (OR) for RASSF1A methylering i PCa tilfælde sammenlignet med kontrolgruppen, var 14,73 med 95% CI = 7,58-28,61. Stratificeret analyser konsekvent viste en lignende risiko på tværs af forskellige prøvetyper, og afsløring methylering metoder. Desuden blev RASSF1A methylering forbundet med høj Gleason score OR = 2,35, 95% CI: 1,56-3,53. Endvidere den poolede specificitet for alle inkluderede studier var 0,87 (95% CI: 0,72-0,94), og den poolede følsomhed var 0,76 (95% CI: 0,55-0,89). Specificiteten i hver undergruppe stratificeret efter prøvetype forblev over 0,84 og følsomheden også forblev over 0,60. Disse resultater antydede, at RASSF1A promotor methylering ville være en potentiel biomarkør i PCa diagnose og terapi

Henvisning:. Pan J, Chen J, Zhang B, Chen X, Huang B, Zhuang J, et al. (2013) associering mellem RASSF1A Promotor Methylering og prostatakræft: en systematisk gennemgang og meta-analyse. PLoS ONE 8 (9): e75283. doi: 10,1371 /journal.pone.0075283

Redaktør: Ken Mills, Dronningens University Belfast, Storbritannien

Modtaget: Maj 20, 2013; Accepteret: 14. august 2013; Udgivet: 20 September, 2013

Copyright: © 2013 Pan et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Dette arbejde blev støttet af tilskud fra China National Natural Science Foundation (81272809); Støttet af Videnskab og Teknologi Planlægning Projekt Guangdong (2011B050400021) og Guangdong Key Laboratory of Urology, Den første tilknyttet Hospital i Guangzhou Medical University (2010A060801016). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Prostatakræft forbliver som en af ​​de mest almindelige årsag til kræft dødsfald blandt mænd i USA, med en anslået 29,720 dødsfald forventede i 2013 [1,2]. Prostatacancer er helbredes, hvis de opdages tidligt ved digital rektal undersøgelse og prostataspecifikt antigen (PSA) i serum [3]. Med en følsomhed på 80%, PSA screening øger tidlig diagnosticering af prostatacancer, men PSA screening har kun 20% specificitet, som kan føre til unødvendige biopsier og overbehandling [4]. Derfor diagnosticering og behandling er forvirret af manglen på kræft-specifikke diagnostiske teknikker, der skal anvendes under tidlige stadier af sygdommen. Novel tilgange til den endelige detektion og kontrol af denne kræft er et presserende behov for.

Molekylære undersøgelser har afsløret vigtige begivenheder i prostatakræft udvikling og progression og fremkomsten af ​​nye biomarkører kan forbedre diagnoser af prostatacancer [5]. Aberrant DNA methylering af genpromotorer er karakteristisk for cancerceller, og flere gener er epigenetisk ændres i en cancer-specifik måde. GSTP1 genpromotor methylering er almindeligt præget af flere uafhængige grupper og findes at være have diagnostisk værdi i prostatacancer [6,7]. Til dato er mere end hundrede gener rapporteret som methylering mål i prostatakræft, som kan udgøre en lovende metode til overvågning af forekomst og progression af kræft [7-9]. For nylig har næste generation sekventering baserede undersøgelser også identificeret yderligere kandidatgener [10]. Det kromosomale region 3p21 er underlagt hyppige tab (heterozygot og homozygot) i flere forskellige tumortyper, RAS association domæne familie protein 1 A (RASSF1A) gen lokaliseret i denne region, er en formodet tumorsuppressor som deler høj sekvenshomologi med en kendt mus protein (Nore1) [11,12]. Undersøgelser tyder rollen for RASSF1 som effektor der udbreder de apoptotiske virkninger af RAS ved binding RAS i en guanosintriphosphat afhængig måde [13]. Hypermethylering af CpG-øer i RASSF1A promotorområdet er den største årsag til tab af ekspression [14]. I mange faste tumorer, har methylering af RASSF1A blevet identificeret og dens frekvens varierer mellem 30% og 50% [12]. Derfor RASSF1A methylering påvirker dens tumorsuppressor rolle og er forbundet med ugunstig prognose [15,16].

På trods af en række individuelle undersøgelser udført i patienter med prostatacancer, den diagnostiske værdi af RASSF1A methylering status i prostatakræft og forholdet mellem RASSF1A methylering og patologiske funktioner eller tumor stadie stadig kontroversielt. Derfor er formålet med denne undersøgelse var at foretage en meta-analyse af den prognostiske værdi af RASSF1A methylering status i prostatakræft, og forholdet mellem RASSF1A methylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA-niveau. Vi vurderede også følsomheden og specificiteten af ​​RASSF1A methylering i kropsvæsker og væv på opdagelse prostatakræft.

Materialer og Metoder

Undersøgelse Valg

Tidligere publicerede artikler, der studerede RASSF1 promotor DNA methylering i prostatakræft blev identificeret via en elektronisk søgning af PubMed med følgende nøgleord; Prostatakræft, PCa, RAS forening domænenavn familie protein1A, og RASSF1A. Yderligere undersøgelser blev fundet via referencelister for de identificerede artikler. Kun undersøgelser offentliggjort som fuldtekstartikler på engelsk blev inkluderet i denne undersøgelse. Den sidste hentning blev gennemført i marts 2013.

inklusion og eksklusion kriterier

Der blev udvalgt til analyse, hvis de opfyldte følgende kriterier (1): Måling af DNA methylering i en af ​​følgende prøver : blod, plasma, serum, urin eller prostata væv; (2) de emner i alle Undersøgelsen omfattede af patienter med prostatacancer og ikke-kræft kontroller; (3) Data blev inkluderet i analysen, hvis den fulde ordlyd af artiklen var på engelsk. Eksklusionskriterier var: (1) RASSF1A methylering kun udføres i de cellelinier; (2) ingen rå data tilgængelige eller kan ikke hente nogen rådata; (3) anmeldelse papirer.

Dataindsamling

For hver undersøgelse, to uafhængige efterforskere udvundet følgende oplysninger som omfatter forfatterens efternavn, udgivelsesår, land, race, type af sager og kontroller. Desuden blev også indsamlet oplysninger om type assay fremgangsmåde (såsom PCR), kræft klassificering kliniske stadium, PSA, Gleason score, primere beliggenhed, CpG placering og primere sekvens. Detaljer er opsummeret i tabel 1, tabel S2 og tabel S3. Før vi gennemførte sensitivitet og specificitet analyser blev methylering data case og kontrol tabuleret. Blandt de inkluderede studier blev to kategorier tildelt som kontroller: normale kontroller og patienter, der havde negative biopsier, men havde andre sygdomme, herunder benign prostatahyperplasi (BPH). Kun biopsi bekræftede PCa og høj kvalitet prostata-intra-epiteliale neoplasi (HGPIN) blev behandlet som sager. Derfor de sande positive (TP) prøver var begrænset til dem, der havde methylering i indekset tilfælde, mens den falske negative (FN) blev angivet at have nogen methylering blandt case prøver. De samme definitioner blev givet for falsk positiv (FP) og sand negativ (TN) i kontroller (tabel S1).

Forfatter

Land

År

Sample

Metoder

Case

Kontrol

Case Met

Case Umet

Kontrol Met

Kontrol Umet

1.Hoque et alUSA2005UrineQMSPPCaBPH /OCD eller Normal

# 38 (73,1%) 1410 (11,0%) 812. Roupret et alFrance2007UrineQMSPPCaNormal

# 74 (77,9%) 213 (7,9%) 353.Bastian et alPortugal2008SerumMSPPCaNormal

# 3 (1,4%) 2070 (0) 354.Roupret et alUK2008BloodQMSPPCaBPH41 (97,6%) 15 (22,7%) 175 .Maruyama et alUSA2002TissueMSPPCaBPH /Normal * (7) 54 (53,5%) 475 (15,6%) 276.Kang et alKorea2004TissueMSPPCa /HGPINNormal

# 40 (78,4%) 110 (0) 207.Jeronimo et alPortugal2004TissueQMSPPCa /HGPINBPH117 (99,2% ) 128 (93,3%) 28.Yegnasubramanian et alUSA2004TissueQMSPPCaNormal * (12) 70 (95,9%) 30 (0) 259.Singal et alUSA2004TissueMSPPCaBPH40 (49,4%) 418 (19,0%) 3410.Woodson et alUSA2004TissueQMSPPCa /HGPINNormal * (11) 23 (67,6%) 110 (0) 1111.Florl et alGermany2004TissueMSPPCaNormal

# 88 (77,9%) 2519 (52,8%) 1712.Bastian et alGermany2005TissueQMSPPCaBPH36 (67,9%) 174 (28,6%) 1013.Cho et alKorea2007TissueMSPPCaBPH155 (86,6%) 247 (23,3%) 2314.Kawamoto et alJapan2007TissueMSPPCaBPH97 (74,0%) 3412 (18,5%) 5315.Syeed et alIndia2010TissueMSPPCaBPH17 (34,0%) 337 (15,6%) 3816.Vasiljevic et Aluk /China2011TissuePYROPCaBPH44 (91,7%) 42 (6,9%) 27Table 1. Karakteristik af undersøgelser indgår i metaanalysen

BPH, godartet prostatahyperplasi.; MSP, Methlation-specifik PCR; QMSP, kvantitativ real tid Methylering Specifik PCR; PYRO, Pyrosekventering; Met, methylering; Umet, ingen methylering; PCa, prostatakræft; HGPIN, High Grade Postatic intraepitelialneoplasi, OCD, andre kræft sygdom; * Tal i parentes under kontrol kolonne angiver matchede normale væv; # Indikerer normalt prostatavæv fra mænd uden tegn på prostatacancer. CSV Hent CSV

Meta-analyse og statistiske analyser.

Odds ratio (OR) med den tilsvarende 95% CI blev anvendt til at undersøge forskellene i frekvensen af ​​RASSF1A methylering mellem prostatakræft tilfælde og kontrol. Tilsvarende associationen mellem RASSF1A methylering og prostatacancer patologisk stadium, Gleason score, og PSA niveauer blev også undersøgt. For at vurdere heterogenitet på tværs af undersøgelserne blev en statistisk test for heterogenitet udført. Hvis undersøgelserne viste sig at være homogen med P 0,05 for Q-statistikken blev resuméet af OR beregnes efter en fast-effekter model, ellers blev en random-effects model er valgt. Desuden blev stratificerede analyser også udføres af prøver og metoder, blev meta-regression anvendt til at undersøge heterogeniteten kilde, og en følsomhedsanalyse, hvorved en enkelt undersøgelse i meta-analyse blev slettet hver gang for at bestemme indflydelsen af ​​den enkelte datasæt til den samlede poolet OR, blev udført for at vurdere stabiliteten. Potentialet publikationsbias blev undersøgt visuelt af en tragt plot af log [OR] mod dets standardafvigelse (SE), og graden af ​​asymmetri blev testet af Egger test. Endelig blev en trim-and-fill-metoden brugt til at tegne stabil konklusion. Denne meta-analyse blev udført ved hjælp af softwaren STATA 11.0. Alle p-værdier var baseret på tosidede tests og p 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant

Følsomhed og specificitet blev analyseret ved hjælp af tilfældige-effects modeller, og i denne analyse, både væske- og væv undergrupper blev behandlet.. Vi udnyttede resuméet modtager opererer karakteristik (S-ROC) kurve, at vurdere, om variation i tærsklen definition af et positivt resultat produceret en sammenhæng mellem sensitivitet og specificitet værdier på tværs undersøgelser. Estimering af den lineære regression af log-odds ratio fra hver undersøgelse om summen af ​​logits af de sande-positive og falsk-positive rater aktiveret S-ROC beregninger. Når regression mellem disse mængder var null, var en uafhængig analyse af samlet sensitivitet og specificitet ved hjælp af standardmetoder til binære data vedtaget. Under disse omstændigheder blev data analyseret på log-odds skala (fx til særlige, effekten størrelse anvendte var log (Spec /(1-Spec)). Alle analyser blev foretaget i STATA 11.0.

Resultater

Undersøgelse egenskaber

i alt 16 støtteberettigede undersøgelser med 1431 tilfælde og 565 kontroller blev inkluderet i pooled analyser baseret på vores inklusionskriterier [15-30]. Kendetegnene for disse studier er opsummeret i tabel 1. af de 16 studier, 12 studier anvendte vævsprøver og 4, kendetegnet kropsvæsker såsom blod, urin blandt andre. de methylerede RASSF1A niveauer blev overvåget ved anvendelse af enten methylering specifikke PCR (MSP), kvantitativ methylering specifik PCR (QMSP) eller pyrosekventering. Alle sager var fra biopsi bekræftede PCa eller HGPIN, mens kontrol var begrænset til enten BPH, raske eller dem, der havde kræft i (blære karcinom) med en sund prostata. prøverne fra 11 studier var primært fra emner af kaukasisk race, mens fire undersøgelser karakteriseret prøver fra asiatiske befolkning, en undersøgelse omfattede emner fra flere racer fra forskellige verdensdele. Prostatakræft blev bekræftet patologisk i alle undersøgelser.

Association mellem RASSF1A promotor methylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA-niveauer i PCa tilfælde

Under tilfældige effekter model, den poolede OR af RASSF1A methylering i prostata kræfttilfælde, sammenlignet med kontrolgruppen ikke-kræft, var 14,73 med 95% CI = 7,58-28,61 (tabel 2). I den stratificerede analyse af prøven, var signifikant øget risiko forbundet med RASSF1A methylering i begge væskeprøver (OR = 26,27, 95% CI = 7.79-88.61) og væv (OR = 12,28, 95% CI = 5,86-25,76). Som stratificeret analyse ved metoden, blev også fundet signifikant øget risiko i MSP (OR 6,75, 95% CI = 3,42-13,22) og QMSP (OR = 31,50, 95% CI = 10,95-90,62) (figur 1A). Vi har udført en analyse af forholdet mellem den patologiske stadium, Gleason score, og PSA-niveauer blandt PCA sager og RASSF1A methylering. Syv studier [17,19,21-23,25,26] havde tilstrækkelige oplysninger til at udføre denne analyse (tabel S2), fandt vi ingen signifikant sammenhæng mellem grupper med de relevante modeller undtagen for Gleason score (OR = 2,35, 95% CI: 1,56-3,53, jeg

2 = 32,3%). Detaljer er vist i tabel 3.

Variable

p

en

OR (95% CIS)

Heterogenitet Test (I

2, p-værdi)

RASSF1ATotal1614.73 (7,58-28,61) 75,5%, 0.000Sample TypeFluid426.27 (7,79-88,61) 56,6%, 0.075Tissue1212.28 (5,86-25,76) 75,5%, 0.000MethodQMSP731.50 (10,95-90,62) 61,8%, 0.015MSP86.75 ( 3,42-13,22) 67,9%, 0.003Pyrosequencing1148.50 (25,45 til 866,36) NATable 2. lagdeling analyser af RASSF1A methylering og prostatakræft risiko

MSP, methylering-specifik PCR.; QMSP, Kvantitativ realtid Methylering Specifik PCR; OR, Odds Ratio, CI, konfidensinterval;

En række undersøgelser; NA, Ikke relevant. CSV Hent CSV

(A) Forest plot af 16 studier viste, at RASSF1A methylering var forbundet med PCa risiko som stratificeret analyse af metoder. (B) Forest plot efter følsomhedsanalyse fjernelse 6 studier viste den samme risiko uden heterogenitet (p = 0,089). Den diamant symbol repræsenterer det samlede skøn fra meta-analyse og dens CI (konfidensinterval), mens dens centrum er placeret på værdien for den samlede effekt estimat. Diamond bredde viser bredden af ​​den samlede CI.

Clinicopathology

Kategori

ELLER (95% CIS)

Heterogenitet test (I

2, P-værdi)

Offentliggørelse skævhed test (P-værdi)

Gleason scoreGS≥72.35 (1,56-3,53) 32,3%, 0.1820.40GS 7PSA levelsPSA 4 2,19 (0.27-17.76) 67,4%, 0.0460.04PSA≤4Pathological stageⅢ ⅳ2.01 ( 0.77-5.23) 68,4%, 0.0070.73Ⅰ ⅱTable 3. associering mellem RASSF1A promotor methylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA-niveauer i PCA sager

OR, Odds ratio.; CI, konfidensinterval; PSA, prostataspecifikt antigen; GS Gleason Score. CSV Hent CSV

Resultaterne af meta-regression viste, at udviklingen i yderste periferi korreleret med afsløring methylering metoder, som tegnede sig for en del af heterogenitet (koefficient = -1,69, p = 0,024, justeret R

2 = 47,41% ), Men andre faktorer som prøvetyper (p = 0,525), udgivelsesår (p = 0,608), og oprindelsen af ​​patienterne (p = 0,847) kunne ikke forklare heterogenitet. Vi udførte også følsomhedsanalyser at bestemme virkningerne af at udelade en enkelt undersøgelse af den samlede effekt, hvor seks uafhængige undersøgelser viste sig at indføre nogle kilde af heterogenitet. Derfor når vi udelukkede de seks undersøgelser, der ville sandsynligvis indføre høj heterogenitet skyldes forskellige typer af sager og kontroller, vi observeret et fald i heterogenitet (p = 0,089) med stabil konklusion (OR = 14,45, 95% CI = 8,35-25,01) ( . figur 1B)

Vi har ikke observere nogen publikationsbias (Egger test, p = 0,066), og yderligere bekræftet denne observation ved at gennemføre en trim-and-fill-metoden. Meta-analyse med eller uden trim-and-fill-metoden ikke drage forskellige konklusioner, hvilket indikerer, at vores resultater var statistisk robust. Den Egger test foreslog fravær af publikationsbias (P . 0 05). I studier af association mellem RASSF1A methylering og patologisk stadium eller Gleason score (tabel 3)

specificitet og følsomhed RASSF1A promotor methylering ved hjælp af forskellige typer af prøver

den samlede specificitet for alle inkluderede studier var 0,87 (95% CI: 0,72-0,94), og den poolede følsomhed var 0,76 (95% CI: 0,55-0,89). For den traditionelle biomarkør, følsomheden af ​​PSA varierede, men specificiteten var generelt lav ved ca. 20%, hvilket antydede, at RASSF1A methylering testen har en meget højere specificitet end PSA-testen. P-værdi for heterogenitet var 0,001, hvilket indikerer en betydelig heterogenitet. Der var ingen tegn på offentliggørelse bias (p = 0,13). Desuden har vi klassificeret alle prøver i to grupper efter prøvetype (væske /væv). Blandt de fluide studier (urin /blod /plasma), den poolede følsomhed og specificitet var 0,60 (95% CI: 0,08-0,96) og 0,93 (95% CI: 0,75 til 0,98), hhv. For undersøgelserne væv, den poolede sensitivitet og specificitet var 0,79 (95% CI: 0,64 til 0,89) og 0,84 (95% CI: 0,63-0,94), henholdsvis og S-ROC-kurve er vist i figur 2.

SENS: følsomhed, SPEC: specificitet, AUC:. areal under kurven

diskussion

resultatet af vores meta-analyse viste, at RASSF1A methylering i prostatakræft var signifikant associeret med kræftrisiko ved kontrol i urin, blod eller vævsprøver. Det blev også forbundet med øget risiko for højt Gleason score. Den poolede specificitet (0,87) af RASSF1A var meget højere end specificiteten af ​​PSA (20%). Desuden specificitet i hvert undergruppe stratificeret efter prøvetype forblev over 0,84, og følsomheden af ​​RASSF1A også fortsat højt over 0,60. Disse resultater antydede, at RASSF1A promotor methylering ville være en værdifuld biomarkør til diagnosticering PCa.

DNA methylering er en fælles mekanisme til inaktivering tumorsuppressorgener i kræft [10]. Overvågning afvigende methyleringsmønstre har hjulpet i påvisning af tumorceller i kliniske prøver såsom væv biopsier eller kropsvæsker. RASSF1A er et formodet tumorsuppressorgen og spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​forskellige typer humane tumorer. Tidligere rapporter viste, at den genetiske variation af RASSF1A påvirker prostatakræft modtagelighed og hyppigheden af ​​RASSF1A methylering viste sig at være signifikant højere i patienternes gruppen sammenlignet med kontrol [13]. For yderligere at bekræfte status methylering RASSF1A promotor i PCa patientens diagnose, vi foretaget en meta-analyse af 16 undersøgelser med 1431 tilfælde og 565 kontroller til at udlede en mere præcis vurdering af foreningen. Vores resultater antydede, at RASSF1A methylering er en potentiel risikofaktor for PCa som påvist både i kropsvæske og væv. Hyppigheden af ​​RASSF1A methylering i PCA tilfælde var 14,73 gange højere end hos kontrolpersoner. Hertil kommer, på grund af forskelle mellem cases og kontroller mellem studier, vi udførte følsomhedsanalyser og fjernet udvalgte undersøgelser for at gøre data mere homogen og observerede ingen større ændringer i vores konklusion. Vigtigere, hyppig methylering af RASSF1A genet viste signifikante associationer med Gleason score, selv om det ikke korrelerer med patologiske stadium eller PSA niveauer i denne undersøgelse.

Som tidligere vist, havde PSA-testen varierende følsomhed og dårlig specificitet (ca. 20%) [1]. Tests, der giver højere specificitet i stedet følsomhed og supplerer PSA-test er det nuværende krav. Lovende, viser vores resultater, at RASSF1A methylering test har et potentiale til at supplere PSA screening grund af sin høje specificitet. Her mener vi en sekventiel testning model vil være mere nyttigt, hvor PSA test vil i første omgang bruges til at identificere patienter med forhøjede PSA niveauer, efterfulgt af methylering test RASSF1A at øge ægte positivitet. Patienter med negativ RASSF1A test kan placeres på vågent venter, mens personer med positive resultater kan anbefales til biopsier. Således sekventiel testning vil i høj grad reducere de unødvendige biopsi anbefalinger udelukkende baseret på PSA-test.

Den foreliggende undersøgelse har flere begrænsninger. For det første heterogenitet i de metoder, der anvendes som MSP, Q-MSP og pyrosekventering at overvåge gen promoter methylering. Baseret på undersøgelser, vil det være nyttigt, hvis en konsensus kunne ankom til en standard test. Sekventeringsteknikker baserede teknikker anses generelt for at have overlegen ydeevne i forhold til metoder, der beskæftiger PCR alene. Den hastigt fart i at bruge næste generation sekventering (NGS) analyser for at overvåge genomiske og epigenomic ændringer vil helt sikkert indvarsle i fremskridt på dette område [31]. Man kan forudse udviklingen af ​​omfattende diagnostiske tests, der samtidig vil måle udskrift udtryk og DNA methylering ændringer i et panel af biomarkører i over at identificere genetiske afvigelser såsom genfusioner og kopi nummer variationer for hver patient [32]. Den aktuelle undersøgelse sammen med andre hjælper med udvaelgelse biomarkører for stort potentiale, der vil blive lagt særlig vægt mens analysere NGS resultater, der normalt producerer en lang liste af methylerede regioner. Dernæst de forskellige prøvetyper anvendes i disse undersøgelser, som omfatter plasma, serum, urin, helblod og væv er en potentiel kilde til heterogenitet. Også her udvikling af højtydende robuste analyser med høj følsomhed og specificitet kan bidrage til at overvinde dette i den nærmeste fremtid.

Konklusion

Denne meta-analyse har vist, at RASSF1A methylering i prostatacancer var forbundet med kræftrisiko på tværs af forskellige studiepopulationer. RASSF1A er en lovende biomarkør til screening og identifikation af PCa især når de kombineres med PSA-test for at nedbringe antallet af unødvendige biopsier. Fremtidige studier med større prøve kohorte og nye assays baseret på næste generation sekventering tilgange vil hjælpe med yderligere at styrke vores observationer.

Støtte oplysninger

tabel S1.

Karakteristik af undersøgelser indgår i metaanalysen.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s001

(XLSX)

tabel S2.

Detaljer undersøgelser indgår i metaanalysen: associering mellem RASSF1A promotor methylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA niveauer.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s002

(XLSX)

tabel S3.

Sammenfatning af primersekvenser, der anvendes i methylering undersøgelse af RASSF1A.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s003

(XLSX)

Tak

Vi vil gerne takke Dr. Srinivasan Yegnasubramanian (Johns Hopkins University) for at tilbyde den rådata og Dr. Saravana Mohan Dhanasekaran (University of Michigan) til diskussion og manuskriptet forberedelse.