PLoS ONE: Replication og Fin Kortlægning for Sammenslutningen af ​​C2orf43, FOXP4, GPRC6A og RFX6 Gener med prostatakræft i den kinesiske Befolkning

Abstrakt

Baggrund

Prostatakræft er den hyppigste årsag til mandlig død over hele verden. En nylig genom-dækkende forening undersøgelse (GWAS) identificerede fem nye modtagelighed loci for prostatakræft i den japanske befolkning. Denne undersøgelse er at kopiere og fine kort potentialet sammenslutning af disse fem loci med prostatakræft i den kinesiske Han-befolkning.

Metoder

I fase I af undersøgelsen, vi testede fem enkelt nukleotid (SNP’er), som viste den stærkeste association bevismateriale i den oprindelige GWAS på japansk. Undersøgelsen prøven består af 1.169 kinesiske Hans omfattende 483 patienter og 686 raske kontrolpersoner. Så i fase II, flankerende SNP’er af succes replikerede SNPs i fase I blev genotype og testet for association med prostatacancer til fine kort disse signifikant sammenhæng signaler.

Resultater

Vi held gentaget foreningen af

rs13385191 Hotel (placeret i

C2orf43

gen,

P

= 8,60 × 10

-5),

rs12653946 Hotel (

P

= 1,33 × 10

-6),

rs1983891 Hotel (

FOXP4

,

P

= 6,22 × 10

-5), og

rs339331 Hotel (

GPRC6A /RFX6

,

P

= 1,42 × 10

-5) med prostatakræft. Den mest markante odds ratio (OR) blev registreret som 1,41 (95% konfidensinterval 1,18-1,68) for

rs12653946

.

Rs9600079

viste ikke signifikant sammenhæng (

P

= 8,07 × 10

-2) med prostatakræft i denne undersøgelse. Fase II studiet raffineret disse foreningens signaler, og identificeret flere SNPs viser mere signifikant sammenhæng med prostatakræft end selve SNPs testet i fase I.

Konklusioner

Vores resultater giver yderligere støtte til sammenslutning af

C2orf43

,

FOXP4

,

GPRC6A

RFX6

gener med prostatakræft i østlige asiatiske befolkninger. Denne undersøgelse karakteriseret også romanen loci rapporteret i den oprindelige GWAS med flere detaljer. Yderligere arbejde er stadig forpligtet til at bestemme de funktionelle variationer og endelig klarlægge de underliggende biologiske mekanismer

Henvisning:. Lang Q-Z, Du Y-F, Ding X-Y, Li X, Song W-B, Yang Y, et al. (2012) Replication og Fin Kortlægning for Sammenslutningen af ​​

C2orf43

,

FOXP4

,

GPRC6A

RFX6

Gener med prostatakræft i den kinesiske Befolkning . PLoS ONE 7 (5): e37866. doi: 10,1371 /journal.pone.0037866

Redaktør: Karl X. Chai, University of Central Florida, USA

Modtaget: Januar 4, 2012; Accepteret: April 26, 2012; Udgivet: 25. maj 2012