PLoS ONE: Nogle Novel Insights på HPV16 Relaterede Livmoderhalskræft Patogenese baseret på analyser af LCR Methylering, Viral Load, E7 og E2 /E4 Expressions

Abstrakt

Denne undersøgelse blev gennemført for at dechifrere de indbyrdes afhængige roller (i) methylering i E2 bindingssted I og II (E2BS-I /II) og replikation oprindelse (nt 7862) i det lange kontrol region (LCR), (ii) ekspression af viralt onkogen

E7

, (iii) ekspression af transkriptet (

E7-E1∧E4)

der koder E2-repressorproteinet og (iv) virusmængde , i human papillomavirus 16 (HPV 16) relaterede livmoderhalskræft (CaCx) patogenese. Resultaterne viste overrepræsentation (p 0,001) af methylering ved nukleotid 58 i E2BS-I blandt

E2

-intact CaCx sager sammenlignet med

E2

-disrupted sager. Bisulfit sekventering af LCR afslørede overrepræsentation af methylering ved nukleotid 58 eller andre CpG’er i E2BS-I blandt

E2

-intact sager end

E2

-disrupted sager og manglende methylering ved replikation oprindelse /II, i tilfælde af begge. Den virale udskrift (

E7-E1∧E4

), der producerer repressor E2 blev analyseret ved APOT (opformering af papillomavirus onkogene afskrift) -coupled-kvantitativ-RT-PCR (af

E7

E4

gener) til at skelne episomal (ren eller samtidig med integreret) fra rent integrerede virale genomer baseret på forholdet,

E7

C

T /

E4

C

T. Relativ kvantificering baseret på komparative C

T (theshold cyklus) metode afslørede 75,087 folder højere

E7

mRNA-ekspression i episomale sager løbet rent integrerede sager. Viral load og

E2

gen kopiantal var negativt korreleret med

E7

C

T (p = 0,007) og

E2

C

T (p 0,0001), henholdsvis hver normaliseret med

ACTB

C

T, blandt kun episomale sager.

k

-means clustering analyse overvejer

E7

C

T fra APOT-koblede-kvantitativ-RT-PCR analyse, sammenholdt med viral belastning, afslørede enorme heterogenitet blandt HPV16 positive CaCx tilfælde portrættere integreret virale genomer. Resultaterne tilvejebringe nye indsigter i HPV16 relaterede CaCx patogenese og fremhæve, at CaCx sager, som skjuler episomale HPV16 genomer med intakt

E2

sandsynligvis vil være forskellig biologisk, fra de rent integrerede virale genomer i form af værtsgener og /eller involverede veje i cervikal carcinogenese

Henvisning:. Das Ghosh D, Bhattacharjee B, Sen S, Premi L, Mukhopadhyay i, Chowdhury RR, et al. (2012) Nogle Novel Insights på HPV16 Relaterede Livmoderhalskræft Patogenese baseret på analyser af LCR Methylering, Viral Load, E7 og E2 /E4 Expressions. PLoS ONE 7 (9): e44678. doi: 10,1371 /journal.pone.0044678

Redaktør: Giuseppe Viglietto, University Magna Graecia, Italien

Modtaget: Juni 22, 2012; Accepteret: August 7, 2012; Udgivet: 6. september, 2012