Abstrakt
HOX udskrift antisense intergeniske RNA (
hotair
) er en lang ikke-kodende RNA (lncRNA), der fungerer som et onkogent molekyle i forskellige cancerceller. Genetiske varianter af
hotair
kan påvirke aktiviteten af visse regulatoriske faktorer og yderligere at regulere den afvigende ekspression af
hotair
, som kan være underliggende mekanismer, der påvirker tumor modtagelighed og prognose. For nylig er der blevet udført en række undersøgelser for at undersøge den mulige forbindelse mellem polymorfier i
hotair
og kræftrisiko; dog har resultaterne været overbevisende. Derfor har vi foretaget en meta-analyse til at estimere sammenhængen mellem
hotair
polymorfier (rs920778, rs4759314 og rs1899663) og kræftrisiko. Otte studier omfatter 7.151 sager og 8.740 kontrolpersoner blev inkluderet i vores undersøgelse. Samlet set ingen signifikante associationer mellem
hotair
polymorfier (rs920778, rs4759314 og rs1899663) og kræftrisiko blev observeret. Men i yderligere lagdelte analyser, varianten T allel af rs920778 udviste et signifikant øget risiko for at udvikle fordøjelsessystemet kræftformer (dominerende model: OR = 1,44; 95% CI = 1,31-1,59). Disse resultater forudsat beviser for, at
hotair
rs920778 kan ændre modtagelighed for visse typer kræft. Yderligere undersøgelser, hvori der indgår personer med anden etnisk baggrund kombineret med re-sekventering af det markerede område og funktionelle evalueringer berettiget
Henvisning:. Tian T, Li C, Xiao J, Shen Y, Lu Y, Jiang L, et al. (2016) Kvantitativ Vurdering af polymorfier i
hotair
lncRNA og Cancer Risk: En metaanalyse af 8 case-control studier. PLoS ONE 11 (3): e0152296. doi: 10,1371 /journal.pone.0152296
Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, UNITED STATES
Modtaget: 8. december 2015; Accepteret: 12 mar 2016; Udgivet: 24 marts 2016
Copyright: © 2016 Tian et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres
Data Tilgængelighed:. Alle relevante data er inden for papir og dens Støtte Information filer
Finansiering:. Dette arbejde blev finansieret af National Natural Science Foundation of China (81502876), Natural Science Research af Jiangsu højere uddannelsesinstitutioner (15KJB330006), Science og Teknologi Program for Nantong (MS22015088) og ph.d. Scientific Research Foundation of Nantong University (14R16). De finansieringskilder havde nogen rolle at spille i undersøgelsen design, indsamling og fortolkning af dataene, udarbejdelse af rapporten, eller beslutning om at indsende dette papir til offentliggørelse
Konkurrerende interesser:. Forfatterne har erklæret, at der ikke eksisterer konkurrerende interesser.
Introduktion
kræft er den hyppigste årsag til dødsfald på verdensplan. Ifølge WHO skønner, at der var 14,1 millioner nye kræfttilfælde i 2012, og over 20 millioner nye kræfttilfælde forventes årligt allerede i 2025, hvilket indikerer en stadig stigende global kræft byrde [1]. Generelt er cancere betragtes som multifaktorielle sygdomme, og forekomsten af kræft er relateret til miljømæssige, genetiske og livsstilsfaktorer. Blandt disse faktorer, genetiske faktorer er af særlig interesse, især fordi de seneste genom-dækkende forening undersøgelser (GWAS) og næste-generations sekventering (NGS) i høj grad har udvidet vores forståelse af de genetiske variationer, der giver risiko for kræft.
lange ikke-kodende RNA’er (lncRNAs) er en type ikke-kodende RNA (ncRNA), der indeholder mere end 200 nukleotider og ikke koder proteiner, men har afgørende roller i talrige biologiske funktioner. Nylige rapporter antyder, at afvigende ekspression af lncRNAs kunne spille en vigtig rolle i udviklingen og progressionen af tumorer [2,3,4], som sandsynligvis medieres gennem ændringer på kromatin, transkriptionelle eller post-transkriptionelle niveauer, der påvirker målgenekspression [5] . Derudover har GWASs succes identificeret flere lncRNA polymorfier, der er forbundet med risikoen for at udvikle forskellige typer af kræft. Men ligner den anden rapporterede GWAS, har de fleste af lncRNA SNPs, som er blevet identificeret af GWAS blevet kortlagt til intergeniske regioner eller introns, der ikke koder for proteiner, og de potentielle funktioner af disse SNPs i patogenesen af kræft forbliver udefineret. På grund af de strenge kriterier for GWASs screening, nogle formodede kausale lncRNAs og varianter, der er forbundet med carcinogenese kan have været stort set ignoreret. Således kan en yderligere indsats rettet mod kandidat lncRNAs der fungerer i udviklingen af cancer være hensigtsmæssigt at afdække en del af den manglende arvelighed. En sådan lncRNA er HOX udskrift antisense intergeniske RNA (
hotair
), hvis funktion er blevet påvist at være tæt forbundet med udviklingen og progressionen af visse kræftformer [6,7,8].
til dato, forholdet mellem afvigende ekspression af
hotair
og kræft prognose er blevet udforsket af mange forskere. Desuden har meta-analyser vist, at afvigende ekspression af
hotair
kan tjene som en indikator, der forudsiger dårlige prognoser både i kræft generelt [9], særlig kræftformer (f.eks fordøjelsessystemet kræft og østrogen afhængige maligne tumorer) [10,11,12]. Derudover en meta-analyse udført af Cai et al. afslørede, at overekspression af
hotair
er signifikant associeret med lymfeknude metastaser hos kræftpatienter, der kan påvirke kræft prognoser [13] yderligere.
I 2015 Bayram S et al. viste, at rs920778 SNP af
hotair
er signifikant associeret med avanceret TNM stadie, fjernmetastaser og dårlig histologisk klasse i brystkræftpatienter, hvilket indikerer, at denne polymorfi kan være forbundet med brystkræft prognose [14]. Ligeledes er det blevet rapporteret, at en anden SNP i
hotair
(rs12826786) er forbundet med de klinisk-patologiske træk er involveret i gastrisk Cardia adenocarcinom progression [15]. Derudover relationer
hotair
polymorfier (herunder rs4759314 og rs920778) med ekspression af
hotair
og forskellige kræftrisiko er observeret [15,16,17,18]. Desuden Zhang et al. rapporterede, at SNP rs920778 i
hotair
kan ændre aktiviteten af en roman intronisk
hotair
forstærker [17]. Det er således biologisk tænkeligt, at de genetiske varianter af
hotair
kan påvirke aktiviteterne i visse regulatoriske faktorer og yderligere at regulere den afvigende ekspression af
hotair
, hvilket kan være en af de underliggende mekanismer, der påvirke tumor modtagelighed og prognose. Som forventet, forholdet
hotair
af polymorfier med følsomheder til kræft har tiltrukket megen interesse [14,15,16,17,18,19,20,21]. Men resultaterne af de undersøgelser, der har udforsket denne forening er ikke fyldestgørende. For eksempel, en tidligere undersøgelse rapport, som rs920778 variant genotype øger risikoen for mavekræft i kinesiske folk [16]; Men blandt tyrkiske folk, den samme variant udviste ingen signifikant sammenhæng, og de effektværdier var endda i den modsatte retning i forhold til de tidligere undersøgelser af kinesiske befolkning [19]. Derfor er baseret på alle de aktuelt publicerede data, vi udførte en meta-analyse til mere præcist karakterisere sammenslutninger af
hotair
polymorfier (rs920778, rs4759314 og rs1899663) med kræftrisiko.
Materialer og metoder
Identifikation og berettigelse af de relevante undersøgelser
En omfattende litteratursøgning af PubMed og Embase op til 30 november, 2015 blev udført ved hjælp af følgende nøgleord: ( “
hotair
“eller” HOX udskrift antisense intergeniske RNA “) og (” kræft “,” carcinoma “,” tumor “,” tumor “, eller” neoplasma “), og (” polymorfi “,” variation “,” variant “, eller” mutation “). Henvisningerne i hentede artikler blev også revideret for eventuel optagelse. Kun publikationer skrevet på engelsk med tilgængelige fuldtekstartikler blev inkluderet i denne meta-analyse. Undersøgelser blev inkluderet, hvis de opfyldte følgende kriterier: (1) case-kontrol undersøgelser fokuserede på forholdet mellem
hotair
polymorfier og enhver form for kræft, (2) mere end to artikler til hver undersøgte
hotair
polymorfi, (3) foreliggende oplysninger om genotypen hyppigheden af hver omfattede
hotair
SNP (dvs. rs920778, rs4759314 eller rs1899663), og (4), offentliggjort som en fuld papir på engelsk. De vigtigste årsager til udelukkelse af undersøgelser var følgende: (1) ikke fokuseret på kræftrisiko, (2) ikke studere
hotair
SNP’er (rs920778, rs4759314 eller rs1899663), (3) ikke rapporterer de relevante genotype frekvens data, (4) ikke er offentliggjort på engelsk, og (5) ikke-humane forskning. I sidste ende blev i alt 8 artikler herunder 7.151 sager og 8.740 kontroller inkluderet i denne meta-analyse (figur 1).
Dataudtræk
To efterforskere (TT og LJ) uafhængigt udpakkede data og nåede enighed om alle de elementer. søgtes Følgende oplysninger fra hver artikel: det første forfatterens navn, udgivelsesår, oprindelsesland, etnicitet, type kræft, antal sager og kontroller, genotype platform og genotype SNPs. Vi kategoriseret de forskellige etniske grupper som kaukasiere og asiater.
Statistisk analyse
Risikoen for kræft forbundet med hver
hotair
polymorfi blev estimeret for hver undersøgelse ved hjælp af odds ratio (OR ) og dens 95% konfidensinterval (95% CI). Den mellem-studiet heterogenitet blev undersøgt med en chi-square-baserede
Q
statistik test, og
P
≤ 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant. Vi samles resultaterne ved hjælp fast-effekt modeller, når heterogenitet mellem studier var fraværende. Ellers blev en random-effects model er valgt. Efterfølgende vi vurderet risikoen for den heterozygote og variant homozygote genotyper i forhold til vildtype homozygot genotype og derefter evaluerede risikoen for den kombinerede heterozygot og variant homozygote genotyper i forhold til vildtype homozygot genotype, mens antage de dominerende effekter af varianten allel. For rs920778 udførte vi også en lagdeling analyser baseret på etnicitet (opdelt i kaukasiere og asiater) og kræftformer. Funnel plots og Begg test blev anvendt til at evaluere publikationsbias. Alle analyser blev udført ved hjælp af Stata-version 12.0 software (Stata Corporation, College Station, TX, USA).
Functional annotation baseret på offentligt tilgængelige databaser
SNPs i høj LD (
r
2 ≥ 0,80) med markør SNP rs920778 blev identificeret i overensstemmelse med SNAP 2.2 (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php/). Expression kvantitativ egenskab loci (eQTL) analyse blev udført på grundlag af databasen Genotype-Tissue Expression projekt (GTEx) (https://www.gtexportal.org/home/). De påvirkninger af SNPs på miRNA-binding blev forudsagt med en online-tjeneste (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/). Derudover blev andre funktionelle annotation resultater stammer fra KODE database (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/).
Resultater
Karakteristik af de offentliggjorte undersøgelser
Efter anvendelse af de strenge kriterier screening, blev 8 artikler, der omfattede i alt 7.151 sager og 8.740 kontroller huser mavekræft, brystkræft, tarmkræft og øsofageale planocellulært karcinom (ESCCs) i sidste ende indgår i den aktuelle kvantitativ analyse. De generelle karakteristika ved de inkluderede studier er anført i tabel 1, og de udelukkede studier er anført i S1 tabel. Blandt de inkluderede studier blev seks studier gennemført i asiater (kinesisk) populationer, og to undersøgelser blev udført i kaukasisk (tyrkisk) populationer. Publikationen år af de inkluderede studier var mellem 2014 og 2015, og den række af prøvestørrelserne var 245 til 4248. I alt fire artikler rapporterede virkningerne af
hotair
polymorfier i mavekræft, to i brystkræft, en i spiserøret planocellulært karcinom (ESCC), og en i kolorektal cancer. Blandt de undersøgelser, der udforskede forholdet af
hotair
SNPs med kræftrisiko, fem fokuseret på rs920778 SNP, seks på rs4759314 SNP og tre på rs1899663 SNP. Genotypebestemmelse blev udført ved hjælp af TaqMan i 4 studier, PCR-RFLP i 3 studier og CRS-RFLP i en undersøgelse. Fordelingerne af genotyper og alleler af
hotair
polymorfier (rs920778, rs4759314 og rs1899663) i de enkelte studier er opført i S2-S4 Tables.
vurderinger Kvalitet af den medfølgende undersøgelser
den metodiske kvalitet i hver omfattede undersøgelse blev evalueret ved brug af kvalitetsvurdering skala Newcastle-Ottawa (NOS). Ved hjælp af denne metode blev hver undersøgelse bedømt på standard kriterier og efterfølgende kategoriseret baseret på tre faktorer: udvælgelse, sammenlignelighed, og eksponering. Resumé scores fra 0 til 9 point blev beregnet, og højere score indikerer lavere risiko for bias (S5 tabel).
Kvantitativ syntese
Evalueringerne af sammenslutninger af rs920778 med kræftrisiko præsenteres i tabel 2. Generelt T allel variant udviste ingen signifikant sammenhæng med risiko kræft i nogen af de testede modeller (CT versus CC: OR = 1,11; 95% CI = 0,86-1,44;
P
= 0,014 for heterogenitet test,
jeg
2
= 67,8%; TT versus CC: OR = 1,55; 95% CI = 0,84-2,85;
P
= 0,000 for heterogenitet test,
jeg
2
= 85,8%; dominerende model: OR = 1,20; 95% CI = 0,92-1,57,
P
= 0,005 for heterogenitet test,
jeg
2
= 73,2%, figur 2)
Vi næste evaluerede effekten af rs920778. polymorfi på kræftrisiko blandt undergrupperne (tabel 2). I et stratificerede analyser, blev der observeret en signifikant øget risiko for kræft blandt asiater (kinesisk, dominerende model: OR = 1,46; 95% CI = 1,32-1,61;
P
= 0,953 for heterogenitet test,
I
2
= 0,0%). I modsætning hertil et væsentligt reduceret blev observeret kræftrisiko blandt kaukasere (tyrkisk; dominerende model: OR = 0,65; 95% CI = 0,42-1,00;
P
= 0,080 for heterogenitet test,
I
2
= 67,4%). Desuden, fordi de fleste (60%, 3/5) af de inkluderede studier i vores meta-analyse involveret fordøjelsessystemet kræftformer (gastrisk kræft og ESCC), vi så foretaget en særskilt analyse for fordøjelsessystemet kræftformer. Interessant, rs920778 varianten udviste en signifikant sammenhæng med en øget risiko for fordøjelsesforstyrrelser kræftformer (dominerende model: OR = 1,44; 95% CI = 1,31-1,59;
P
= 0,339 for heterogenitet test,
I
2
= 7,6%;. tabel 2)
evalueringerne af sammenhængen mellem de 2 andre SNPs (rs4759314 og rs1899663) og kræftrisiko præsenteres i fig 3 og 4. Samlet set G variant allel af rs4759314 udviste ingen signifikant sammenhæng med kræftrisiko (dominerende model: OR = 1,05; 95% CI = 0,86-1,27,
P
= 0,024 for heterogenitet test,
jeg
2
= 61,5%). T-variant allel af rs1899663 også udviste ingen signifikant sammenhæng med kræftrisiko (dominerende model: OR = 0,77; 95% CI = 0,51-1,15,
P
= 0,000 for heterogenitet test,
I
2
= 89,3%).
Test af heterogenitet
for rs920778 blev signifikant heterogenitet observeret efter dataene blev samlet ( dominerende model:
P
for heterogenitet = 0,005,
jeg
2
= 73,2%). (Tabel 2) Når de emner blev stratificeret baseret på etnicitet, heterogeniteten naturligvis forsvandt i asiaterne (dominerende model:
P
for heterogenitet = 0,953,
jeg
2
= 0,0%); dog heterogenitet var stadig til stede blandt kaukasiere (dominerende model:
P
for heterogenitet = 0.080,
jeg
2
= 67,4%), som kunne have været på grund af den genetiske heterogenitet mellem de forskellige inkluderet etniske grupper. Derudover er der i lagdelte analyser baseret på kræfttyper, heterogenitet blev signifikant reduceret for fordøjelsessystemet kræftformer (dominerende model:
P
for heterogenitet = 0,339,
jeg
2
= 7,6%).
Følsomhedsanalyse
for at teste stabiliteten af rs920778 resultater, vi udførte følsomhedsanalyser ved sekventielt at fjerne hvert støtteberettiget undersøgelse (S6 tabel). Undersøgelsen fra Bayram et al. der fokuserede på brystkræft var den største bidragyder af heterogenitet i den dominerende model (
jeg
2
= 73,2%,
P
for heterogenitet = 0,005). Efter fjernelse af denne undersøgelse blev den heterogenitet signifikant reduceret (
jeg
2
= 0,0%,
P
for heterogenitet = 0,536). Som forventet blev lignende resultater observeret i de andre genetiske modeller (dvs. CT versus CC og TT versus CC) og oplyste, at den undersøgelse, som Bayram et al. der fokuserede på brystkræft markant ændret den poolede OR.
Offentliggørelse skævhed
Vi brugte funnel plots og Begg test til at vurdere potentielle offentliggørelse bias i den undersøgte litteratur. Som illustreret i S1-S3 figurerne, formerne af tragten parceller var symmetrisk, og en Begg test gav yderligere statistisk bevis for fravær af publikationsbias (
P
= 0,14 for rs920778,
P
= 0,85 for rs4759314, og
P
= 0,60 for rs1899663).
diskussion
for nylig, et stigende antal undersøgelser har undersøgt sammenslutninger af forskellige
hotair Salg ekspressionsniveauerne med kræft overlevelse, men færre undersøgelser har fokuseret særlig opmærksomhed på relationerne mellem
hotair
polymorfier med kræft modtagelighed og overlevelse. Ikke desto mindre er de relationer
hotair
polymorfier med kræft følsomheder har tiltrukket stor interesse; Men resultaterne er kontroversielle. I den foreliggende undersøgelse, vi foretaget en meta-analyse ved at samle 8 studier med summen af 7.151 sager og 8.740 kontroller og viste, at T allel af rs920778 var forbundet med en signifikant øget risiko for fordøjelsesforstyrrelser kræftformer. Men rs4759314 og rs1899663 variant alleler udstillet ingen signifikante associationer til kræftrisiko.
rs920778 SNP på 12q13.13 ligger i intron 2 af
hotair
. Baseret på offentlige datasæt og værktøjer (se metoder S7 Table), udførte vi yderligere funktionelle anmærkninger af markør SNP rs920778 og SNPs, der er i stærk LD med rs920778 (
r
2 0,8). Blandt de 11 SNPs, der blev anset for at være i stærk LD med rs920778 betydelige genotype-specifikke effekter af 5 SNP’er (dvs. rs10783618, rs11170775, rs4759059, rs4237809 og rs2366150) på mRNA ekspressionen af
hotair
blev observeret (eQTL analyse). Efterfølgende vi undersøgt de mulige mekanismer, hvorved disse SNPs modulerer ekspressionen af
hotair
. Ifølge chip-Seq data fra KODE database (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/), blev i alt 10 SNPs beliggende motiver, som kan påvirke de bindende aktiviteter talrige transkriptionsfaktorer, herunder EZH2, CTBP2 , CHD1, ZNF143, SUZ12, TCF7L2, CTCF, RAD21, og YY1. Transkriptionsfaktorerne nævnt ovenfor, kan være tæt forbundet med forekomsten og progression af mange typer af tumorer hos mennesker. For eksempel forstærker af Zeste homolog 2 (EZH2) er overudtrykt i flere humane tumorer og tegner sig for den aggressivitet og ugunstige prognoser af forskellige tumorer [22,23]. Endvidere undertrykker af Zeste-12-protein (SUZ12) er af stor betydning i tumorigenese af adskillige humane cancere [24,25] og er involveret i udviklingen af ikke-småcellet lungekræft via sin rolle i at fremme celleproliferation og metastase [26]. Derudover, som forudsagt af en miRNA-bindende analyse websted (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/), kan rs7958904 SNP påvirker bindingsaktiviteten af HSA-MIR-615. Denne miRNA er en nyligt identificeret tumor suppressor, der kan regulere proliferation, migration, invasion, og apoptose af forskellige typer af cancerceller [27,28]. Således er disse funktionelle anmærkninger tyder på, at de ovennævnte SNPs (herunder markør SNP rs920778 og mærkede SNP’er) separat eller i fællesskab kunne påvirke de afvigende aktiviteter visse transkriptionsfaktorer eller miRNA og yderligere påvirke forekomst og progression af visse tumorer gennem forskellige mekanismer . Men eksperimentelle beviser validere denne hypotese er begrænset, og der er behov for fremtidige funktionelle undersøgelser for at klarlægge de mulige mekanismer.
I denne meta-analyse, har vi ikke identificere en signifikant sammenhæng af rs920778 SNP med kræftrisiko. Men ifølge analyserne stratificeret af befolkningen etnicitet, den rs920778 SNP var signifikant associeret med en øget risiko for kræft i asiater (kinesisk). Derimod fandt vi, at rs920778 polymorfi udstillet den modsatte sammenhæng med risikoen for kræft hos kaukasiere (tyrkisk). De mulige årsager til de forskellige resultater mellem asiater og kaukasere er som følger. For det første kan forskellen have medført forskelle i de genetiske baggrunde af de undersøgte populationer. For eksempel, baseret på HapMap data (International HapMap Project), de allelfrekvenserne af rs920778 SNP er forskellige mellem asiatiske og kaukasiske befolkninger. For det andet kan forskellen skylder udnyttelsen af forskellige genotypebestemmelsesmetoder, som omfattede PCR-RFLP, CRS-RFLP, TaqMan Real-Time PCR, osv tredje, sammenlignet med asiatiske befolkninger, kan prøven størrelser af den hvide befolkning ikke have været tilstrækkeligt stort til at nå frem til en overbevisende konklusion vedrørende foreningen af rs920778 SNP med kræftrisiko. Derudover kan de forskellige typer af kræft er involveret, og tilfældige fejl også være mulige årsager til forskellene i resultaterne mellem asiater og kaukasere.
I 2014 Deng et al. foretaget en meta-analyse, der viste, at
hotair
overflod kunne tjene som en ny prædiktiv faktor for fattige kræft prognoser [9]. Resultaterne af denne undersøgelse og vores resultater både viste signifikante sammenhænge mellem
hotair
og kræft. Resultaterne af vores undersøgelse dokumenteret, at
hotair
polymorfier kan ændre kræft modtagelighed. Desværre, i deres meta-analyse af den prognostiske værdi af
hotair
i kræft, Deng et al. ikke udforske sammenslutninger af
hotair
polymorfier med kræft prognoser, og den relevante forskning i
hotair
polymorfier og kræft prognoser er begrænset. , Baseret på både resultater og funktionelle annotation resultater, vi spekulere Men at
hotair
polymorfier kan regulere ekspressionen af
hotair
og yderligere påvirke udviklingen af kræft og progression via visse understregning mekanismer, som kan åbne nye muligheder for forebyggelse og behandling af kræft.
styrken af denne meta-analyse er, at vi systemisk revideret forholdet mellem
hotair
polymorfier og tumor modtagelighed for første gang, og vi identificeret forskellige sammenslutninger af den rs920778 SNP med kræftrisiko i forskellige etniske befolkningsgrupper. Derudover veldesignede funktionelle anmærkninger, som yderligere verificerede vores resultater er en anden styrke med denne undersøgelse. Der er dog også nogle begrænsninger, der skal løses. Først blev betydelig heterogenitet mellem studier observeret. Blandt de 8 publicerede studier indgår i vores meta-analyse, nogle af undersøgelserne var befolkning-baseret, mens andre var hospital-baseret. For det andet, vi ikke søge kinesiske databaser, som vil resultere i publikation bias. For det tredje, i nogle af undersøgelserne, detaljerede oplysninger (f.eks alder, køn, rygning status, og alkoholforbrug) blev ikke givet, som begrænsede yderligere lagdeling analyser. Desuden, hvis vi havde været i stand til at erhverve mere detaljerede oplysninger, vi ville have opnået mere præcise skøn ved at justere for andre potentielle kovariater. Endelig til denne undersøgelse, vi samlet kun 8 rapporter. Hovedparten af patienterne var asiater, og antallet af kaukasiske personer inkluderet i denne undersøgelse var relativt lille. Således er velgennemførte store prøve studierne for at yderligere at udforske kræft risici forbundet med
hotair
SNPs, især i kaukasiere.
Konklusioner
Denne meta-analyse, dokumentation for, at
hotair
rs920778 kan ændre modtagelighed for visse typer kræft. Yderligere undersøgelser, hvori der indgår personer med anden etnisk baggrund kombineret med re-sekventering af det markerede område og funktionelle evalueringer berettiget.
Støtte Information
S1 Fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af
hotair
rs920778 polymorfi og kræftrisiko under dominerende model (Tragt plot med pseudo 95% konfidensgrænser blev brugt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s001
(TIF)
S2 fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af
hotair
rs4759314 polymorfi og kræftrisiko under dominerende model (Tragt plot med pseudo 95% konfidensgrænser blev brugt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s002
(TIF)
S3 fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af
hotair
rs1899663 polymorfi og kræftrisiko under dominerende model (Tragt plot med pseudo 95% konfidensgrænser blev brugt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s003
(TIF)
S1 Table. Liste over udelukkede artikler og deres grunde til udelukkelse
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s004
(DOCX)
S2 Table. Udlodning af genotyperne og alleler af
hotair
rs920778 polymorfi
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s005
(DOCX)
S3 Table. Udlodning af genotyperne og alleler af
hotair
rs4759314 polymorfi
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s006
(DOCX)
S4 Table. Udlodning af genotyperne og alleler af
hotair
rs1899663 polymorfi
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s007
(DOCX)
S5 Table. Newcastle-Ottawa kvalitetsvurdering skala for hver omfattede undersøgelse
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s008
(DOCX)
S6 Table. Følsomhedsanalyse af rs920778 i dominerende model
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s009
(DOCX)
S7 Table. Funktionel anmærkning for markør SNP rs920778 og SNPs i stærk bindingsuligevægt med markøren SNP
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s010
(DOCX)
Leave a Reply
Du skal være logget ind for at skrive en kommentar.