PLoS ONE: SLCO1B1 og SLC19A1 genvarianter og irinotecan-induceret hurtig reaktion og overlevelse: en prospektiv multicenter Farmakogenetik Undersøgelse af metastatisk colorectal Cancer

Abstrakt

Baggrund

Hurtig reaktion på kemoterapi i metastatisk kolorektal cancer (mCRC) patienter (respons inden for 12 uger af kemoterapi) kan øge risikoen for fuldstændig resektion og forbedret overlevelse. Få molekylære markører forudser irinotecan-induceret hurtig reaktion og overlevelse. Single-polymorfier (SNP’er) i opløst stof carrier gener er rapporteret at korrelere med de variable farmakokinetik irinotecan og folat hos kræftpatienter. Denne undersøgelse har til formål at evaluere den prædiktive rolle 3 SNPs i FRK patienter behandlet med irinotecan og fluoropyrimidinbaseret regimer.

Materialer og metoder

Tre SNPs blev udvalgt og genotype i 137 FRK patienter fra et kinesisk prospektivt multicenter studie (NCT01282658). Det chi i anden-test, univariate og multivariable logistisk regressionsmodel, og Receiver Operating karakteristisk analyse blev anvendt til at evaluere korrelationer mellem de genotyper og hurtig reaktion. Kaplan-Meier overlevelsesanalyse og Cox proportional hazard modeller blev anvendt til at vurdere sammenhængen mellem genotyper og overlevelse resultater. Benjamini og Hochberg Falsk Discovery Rate korrektion blev anvendt i flere test

Resultater

Genotype GA /AA af SNP rs2306283 af genet

SLCO1B1

og genotype GG af SNP rs1051266 af gen

SLC19A1

var forbundet med en højere hurtig responsrate (odds ratio [OR] = 3,583 og 3,521, 95% CI = 1,301-9,871 og 1,271-9,804,

s

= 0,011 og p = 0,013, henholdsvis). Svarprocenten var 70% hos patienter med begge genotyper, mod kun 19,7% i de resterende patienter (OR = 9,489, 95% CI = 2,191 til 41,093, Fishers eksakte test

s

= 0,002). Deres betydninger blev alle opretholdt, selv efter flere test (alle

s

c

0,05). Den rs2306283 GA /AA genotypen var også en uafhængig prognostisk faktor på længere progressionsfri overlevelse (PFS) (hazard ratio = 0,402, 95% CI = 0,171-0,945,

s

= 0,037). Ingen af ​​SNPs forudsagde samlede overlevelse.

Konklusioner

Polymorphisms af opløste transportvirksomheders kan være nyttige til at forudsige hurtig reaktion på irinotecan plus fluoropyrimidin og PFS i mCRC patienter.

Trial Registry

ClinicalTrials.gov NCT01282658

https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT01282658

Henvisning: Huang L, Zhang T, Xie C, Liao X, Yu Q, Feng J et al. (2013) SLCO1B1 og SLC19A1 genvarianter og irinotecan-induceret hurtig reaktion og Survival: en prospektiv multicenter Farmakogenetik Undersøgelse af metastatisk kolorektal cancer. PLoS ONE 8 (10): e77223. doi: 10,1371 /journal.pone.0077223

Redaktør: Robert Lafrenie, Sudbury Regional Hospital, Canada

Modtaget: Marts 9, 2013; Accepteret: August 29, 2013; Udgivet: 15 oktober 2013

Copyright: © 2013 Huang et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Dette arbejde blev støttet af The National Natural Science Funds nr 81071832 og nr 81272492. de finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:. det forfattere har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser.

Introduktion

Kolorektal cancer (CRC) er en af ​​de førende årsager til kræft dødsfald i USA og Kina [1,2]. Komplet resektion af alle kendte involverede steder i udvalgte metastatisk kolorektal cancer (mCRC) patienter forbedrer deres overlevelse betydeligt [3]. irinotecan plus fluorpyrimidin (± leucovorin) er en af ​​de vigtigste regimer til mCRC behandling og kan bidrage til at konvertere en inoperabel patient til en resektabel status [4]. Men kun 30-50% af patienterne reagerer på første-line irinotecan plus fluoropyrimidin kemoterapi [5,6]. Til dato, er konvertering og neoadjuverende behandling normalt begrænset til 2 til 3 måneder. Respons inden for 12 uger til kemoterapi i høj grad forbedrer muligheden for fuldstændig resektion og længere overlevelse for FRK patienter. Derfor er det af stor betydning at identificere patienter, som vil reagere på den relevante kemoterapi inden for 12 uger.

Nogle germlinie polymorfier af enzymer af 5-fluoruracil (5-FU) og irinotecan er blevet beskrevet at korrelere med graden af ​​toksicitet hos CRC patienter. Men kliniske data ikke entydigt støtte deres indflydelse på kræft respons indtil nu. Kun begrænsede data til rådighed til at forudsige hurtig reaktion til at guide behandling valg [4,7-13] ..

solut luftfartsselskaber tegner sig for variable farmakokinetik irinotecan og folat i kræftpatienter. F.eks solut bærer organisk aniontransporter familiemedlem 1B1 (

SLCO1B1

) er en stor tilstrømning transportør udtrykt på den basolaterale membran af humane hepatocytter, der medierer 7-ethyl-10-hydroxy-camptothecin (SN38, den aktive metabolit af irinotecan) disposition [14]. En

SLCO1B1

enkeltnukleotidpolymorfi (SNP), rs4149056 (521T C), har vist sig at være forbundet med en højere arealet under koncentrations-tids-kurven af ​​SN38 (AUC

SN38) og grad ≥ 3 neutropeni i lunge cancerpatienter behandlet med irinotecan og cisplatin [15-17]. Men beviser for en sammenhæng mellem

SLCO1B1

SNPs og irinotecan-relaterede tumor respons og overlevelse i FRK patienter er stadig uklart.

Den menneskelige solut luftfartsselskab familie 19, member1 (

SLC19A1

) genet koder reduceret folat carrier protein 1 (RFC1), der medierer intracellulær optagelse af folate- [18,19]. Tidligere undersøgelser identificeret at human coloncancer cellelinier opbevares ved høj folat medium viste en lavere følsomhed over for fluoruracil (5-FU) alene eller 5-FU plus leucovorin (en aktiv form af folat) end de samme cellelinier holdt i lav-folat medium [20]. Imidlertid har der været få undersøgelser, der fokuserer på forholdet af

SLC19A1

gen varianter med variation mellem patienter i kombinerede irinotecan og fluoropyrimidinbaserede regimer (FOLFIRI [irinotecan plus 5-FU og leucovorin] /mCapeIRI [irinotecan plus capecitabin] ).

der er ingen tvivl om, at ikke-genetiske kovarianteffekter kontroller er meget vigtige for forståelsen af ​​bidrag af genetisk variation i farmakogenetiske undersøgelser. Her gennemførte vi et prospektivt multicenter studie i FRK patienter til at undersøge, om SNPs i opløste carrier gener var forbundet med hurtig tumor respons på FOLFIRI /mCapeIRI og forbedret overlevelse.

n

%

No. af patients137 100 Age, yearsMedian (interval) 53 (18-75) SexMale 87 63,5 Kvindelige 50 36,5 KPS 60% 16 11,7 70% 44 32,1 ≥80% 77 56.2 SmokerNo 84 61,3 Ja 53 38,7 Kemoterapi regimenFOLFIRI 104 75,9 mCapeIRI33 24,1 Primær tumorColon 73 53.3 endetarm 64 46,7 Tabel 1. Patientrettigheder egenskaber.

KPS, Karnofsky indeks af performance status; FOLFIRI, irinotecan plus 5-FU og leucovorin; mCapeIRI, irinotecan plus capecitabin. CSV Hent CSV

Materialer og metoder

Patient berettigelse og studiedesign

Denne undersøgelse blev godkendt af den etiske komité for Huazhong Universitet for Videnskab og Teknologi den 12. november 2010 og registreret på http: //www.clinicaltrials.gov med referencenummer NCT01282658. Seks kræftcentre i Hubei-provinsen var involveret (tabel S1 i File S2). Undersøgelsen blev koordineret og sponsoreret af Onkologisk Afdeling, Tongji Hospital, Tongji Medical College, Huazhong Universitet for Videnskab og Teknologi, Wuhan, Kina. Alle deltagende institutioner godkendt forsøgsprotokollen. Skriftligt informeret samtykke blev opnået fra hver patient før rekruttering. Perifere blodprøver blev opnået fra patienter, der har accepteret at give blod.

Vi vælger type I fejl α = 0,05, 1-β = 0,8, to-sidet test, forudsat målet SNP allel frekvens i populationen var omkring 20%, behandlingseffekt var omkring 30%, OR ≥ 3,5, den beregnede prøver størrelse var 86 af Quanto (Version 1.2.4)

kriterier inkluderet histologisk bekræftet inoperabel metastatisk adenokarcinom i colorectum.; alder mellem 18 og 75 år; målbar sygdom, defineret i henhold til de svar evalueringskriterier i solide kræftsvulster version 1.1 (RECIST1.1) [21]; ingen tidligere irinotecan eksponering; ingen forventede forløb stråleterapi under første linje kemoterapi; Karnofsky indeks af performance status ≥ 60 eller Eastern Cooperative Oncology Group Statusskalaen ≤ 2; patienter ikke gravide eller ammende; patienter frivilligt underskrevet informeret samtykke; total bilirubin ≤ 1,5 gange den øvre normalgrænse (ULN); aspartataminotransferase og alaninaminotransferase ≤ 2,5 gange ULN (≤ 5 gange ULN hvis levermetastaser stede); kreatininclearance 50 ml /min eller serumkreatinin ≤ 1,5 gange ULN.

De primære mål var at vurdere sammenhængen mellem genetiske varianter og den hurtige responsrate (RRR) i kinesisk FRK patienter. Hurtig reaktion blev defineret som mindst et fald på 30% i summen af ​​den længste diameter af target-læsioner på de første 12 uger af kemoterapi. Sekundære mål omfattede forholdet mellem genvarianter og progressionsfri overlevelse (PFS), irinotecan-relaterede tid til behandlingssvigt (IR-TTF), og samlet overlevelse (OS). PFS var defineret som tidsrummet mellem den første dag i irinotecan behandling og sygdomsprogression (PD) eller død uanset årsag, alt efter hvad skete første. IR-TTF blev beregnet fra starten af ​​irinotecan behandling til den er afbrudt af årsager, herunder PD, utålelig toksicitet, eller død. OS blev beregnet som tiden fra irinotecan behandlingsstart indtil død uanset årsag eller datoen for sidste opfølgning [22].

SNPs

Gene

Allelic ændre

Funktion

AA forandring

Ring sats

n Hotel (%)

HWE

s

MAF

genotype frekvens,

n Hotel (%)

wt/wt

wt/var

var/var

rs1051266

SLC19A1

A GMH27R201(99.0)0.30 0,4857 (28,4) 93 (46,2) 51 (25,4) 97 (99,0) 0,66 0.4418(18.6)50(51.5)29(29.9)rs2306283

SLCO1B1

A GMN130D200(98.5)0.930.2412(6.0)73(36.5)115(57.5)97(99.0) 0.360.223(3.1)36(37.1)58(59.8)rs4149056

SLCO1B1

T CMV174A203(100.0)0.800.13153(75.4)46(22.7)4(1.9)98(100.0) 0,81 0,1374 (75,5) 22 (22,4) 2 (2,1) Tabel 2. SNP’er oplysninger og genotypiske frekvenser i 203 gastrointestinal cancer og 98 FRK patienter

SNPs, Single-nukleotid polymorfier.; AA, aminosyre; mCRC, metastatisk colorectal cancer; HWE, Hardy-Weinberg ligevægt; MAF, mindre allel frekvens; wt, vild-type; Var, variant; M, missense. CSV Hent CSV

Protokollen for dette forsøg og støtte TREND tjekliste er tilgængelige som underbyggende oplysninger; se protokollen S1 og Tjekliste S1.

Effekt og toksicitet vurdering

Patienter opholdt sig i hospital for 3-dages kemoterapi. Effekten blev vurderet med en konsekvent imaging teknik (magnetisk resonans eller CT-scanning) hver 6. uge af RECIST 1.1. Toksicitet oplysninger blev indsamlet af ansigt-til-ansigt spørgeskemaer og blev gradueret ved hjælp af National Cancer Institute Common Toxicity Criteria af bivirkninger version 4.0 ved hver cyklus. En enkelt cyklus af kemoterapi blev anset nok til at evaluere toksiciteten; ellers ville mindst tre cykler (6 uger) af kemoterapi være behov i svaret vurderingen analyse. Tidligere evaluering respons blev kun tilladt, når patienter havde alvorlige symptomer indikerer progression. Blodtal og biokemiske analyser blev udført inden for 72 timer efter begyndelsen af ​​hver cyklus og 7-10 dage efter hver cyklus. Evalueringer blev udført blindet til de genetiske resultater og blev vurderet uafhængigt af to læger. En tredje læge løst uoverensstemmelser. De kliniske data blev overvåget af undersøgelsen sponsor

Behandling

De patienter, der accepterede FOLFIRI modtaget, som anbefalet af retningslinjerne i National Comprehensive Cancer Network, irinotecan (Camptosar,. Pfizer, Sydney, Australien) 180 mg /m

2 intravenøs (IV) infusion over 30-90 minutter, dag 1; leucovorin 400 mg /m

2 intravenøs infusion til at matche varigheden af ​​irinotecan infusion, dag 1; 5-FU 400 mg /m

2 IV bolus, dag 1; derefter 1200 mg /m

2 /dag × 2 dage (i alt 2400 mg /m

2 mere end 46-48 timer) kontinuerlig infusion; dette blev gentaget hver 14. dag. Patienter, der faldt kontinuerlig infusion blev senere ændret til en mCapeIRI [23] regime (irinotecan 125 mg /m

2, dag 1 og 8; capecitabin 825-1000 mg /m

2, to gange dagligt på dag 1-14 ; gentag hver 21. dag). Vi ændrede standard irinotecan plus capecitabin (CapeIRI [24] eller XELIRI [25]) regime på grund af vores erfaring i toksicitet kontrol. Alle patienter accepterede 5-hydroxytryptamin-receptor-antagonist (5 mg en gang dagligt) 30-60 minutter før irinotecan. Kriterierne for reduktion irinotecandosis er givet i tabel S2 i File S2. Den kemoterapi fortsatte indtil sygdommen skred frem eller utålelige toksiciteter kom ud eller patienter bedt om at trak på grund af en eller anden grund.

Genotypning

Vi søgte National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP database (dbSNP, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/) og relateret litteratur til identificere funktionelle SNPs fra

SLCO1B1

og

SLC19A1

gener. Kriterierne for SNP udvælgelse var som følger :. (1) Med en mindre allel frekvens på mere end 0,15 i asiatiske befolkning, (2) Genotype opkald på ≥ 95%, (3) missense SNP. Tre SNP’er (

SLCO1B1

rs2306283 og rs4149056, og

SLC19A1

rs1051266) blev udvalgt til genotypning. Genomisk DNA blev ekstraheret fra perifert blod under anvendelse af en FUJI fuldblod DNA kit (Fujifilm Corporation, Tokyo, Japan). Primere blev designet af genotypning Værktøj og MassARRAY Assay Design software (version 3.0, Sequenom Inc., San Diego, Californien). SNPs blev genotypebestemt hjælp af Sequenom MassARRAY IPLEX platform. Data blev behandlet og analyseret af Sequenom MassArray Typer 4.0 software. Detaljer om PCR-reaktioner og primersekvenser er tilgængelige i File S1 og tabel S3 i File S2 hhv. Fem procent af prøverne blev tilfældigt udvalgt og genotype ved direkte sekventering, med deraf konkordans på 100%. Ring frekvenstærskel blev fastsat til mindst 95% for hver SNP. Hardy-Weinberg ligevægt (HWE) blev testet gennem χ

2 test og

s

0.05 angivet afvigelse fra ligevægt.

Statistisk analyse

Hver variant blev evalueret for association med hvert endpoint. Korrelationer mellem RRR og genotyper blev testet under anvendelse af Pearson chi-square test. Den multivariable logistiske regressionsmodel (Enter) blev anvendt til at justere for potentielle kovariater (køn og rygning status som dikotome variable, alder, areal og performance status som kontinuerte variable, rs1051266, rs2306283 og rs4149056 genotyper som dikotome variabler). Rygning betydeligt sænkede eksponeringen for irinotecan, hvilket indikerer en potentiel risiko for behandlingssvigt i en case-kontrol undersøgelse [26]; derfor, vi tegnede sig for rygning status i den multivariate analyse. Odds ratio (OR) og deres 95% konfidensinterval (CI) blev beregnet som estimater for korrelationerne. Receiver opererer karakteristiske (ROC) kurver blev genereret for at sammenligne modellerne med og uden positive respons prædiktorer. Kaplan-Meier-analyse og log-rank test blev udført for at estimere fordelingen af ​​PFS, IR-TTF og OS og sammenligne forskelle mellem overlevelseskurver. For at vurdere forholdet mellem genotyper og PFS, IR-TTF og OS, blev multivariat Cox regression (Enter) udført, justering for potentielle forstyrrende kovariater. Hazard ratio (HR) og deres 95% CI blev beregnet som estimater for korrelationerne. En værdi på

s

0,05 blev betragtet som statistisk signifikant i en to-halet test. Korrigeret P-værdi (

s

c

) blev opnået ved Benjamini og Hochberg Falsk Discovery Rate korrektion i flere test. Haploview software (version 4.2) blev anvendt til at beregne Bindingsuligevægt (LD) mellem polymorfismer og udføre analysen af ​​udledte haplotyper. Statistisk analyse blev udført under anvendelse af SPSS 16.0 statistisk software (SPSS Inc., Chicago, IL).

Resultater

Patient karakteristika og behandlingsresultat

Patienternes egenskaber er vist i tabel 1. Fra november 2010 til Juni 2012, blev 139 patienter inkluderet. To patienter viste sig at være støtteberettigede i henhold til evalueringen overvågningsudvalget, og blev udelukket fra den endelige analyse.

Flowdiagram blev vist i figur 1. evaluering Reaktion var tilgængelig for 120 patienter. Sytten patienter kunne ikke vurderes for respons på grund af: tidlig ophør af kemoterapi (færre end tre cyklusser) på grund af ulidelig toksicitet (

n

= 5), eller til ikke-medicinske årsager (

n

= 6); stadig under observation for respons (

n

= 4); eller andre anti-cancer terapi forstyrre vurderingen effekt (

n

= 2).

RRR og toksiciteter er vist i tabel S4 og S5 i File S2. Blandt de 120 patienter, der blev anset for egnet til respons evaluering, 33 patienter (27,5%) opnåede en hurtig reaktion, af dem, 13 patienter (39,4%) svarede inden for de første 6 uger af kemoterapi, og 20 patienter (60,6%) svarede inden 12 uger efter påbegyndelsen af ​​kemoterapi (tabel S4 i File S2). Halvfems otte patienter forudsat blodprøver og blev genotypebestemt, og svaret var vurderbare i 88,8% (

n

= 87). Ingen forskel for RRR blev fundet mellem genotypede og ikke-genotypede patienter (26,4% vs. 30,3%, p = 0,672; Pearson chi-squared test)

Tredive-tre patienter (24,1%) accepterede mCapeIRI regime. . RRR (27,6% vs. 27,5%,

s

= 0,990; Pearson chi-squared test) og overlevelse (figur S1 i File S3) viste ingen forskelle mellem mCapeIRI og FOLFIRI grupper. Så vi ikke udføre undergruppe analyse i henhold til forskellige kemoterapi.

N

Patienter med RRR n (%)

OR (95%CI)

p

P

c

rs2306283

aGG518(15.7)GA/AA3514(40.0)3.583(1.301-9.871)0.0110.022rs1051266

aGG 2411 (45,8) 3,521 (1.271-9.804) GA /AA 6212 (19,4) 0.0130.017rs4149056

BTT 6718 (26,9) CT /CC 205 (25,0) 0,907 (0.288-2.858) 0.8680.868rs2306283 (GA /AA) + rs1051266 (GG) 10 7 (70,0) 9,489 (2.191-41.093) others7615 (19,7) 0,002

※ 0.008Table 3. RRR i patienter i henhold til genotyper (Pearson chi-squared test).

RRR, hurtig svarprocent; OR, odds ratio; CI, konfidensinterval;

※ Fishers eksakte test, N Antal vurderbare patienter;

s

c

, P-værdi korrigeres ved Benjamini og Hochberg Falsk Discovery Rate korrektion. en genetisk model er REC.b genetisk model er DOM. CSV Hent CSV

SNPs information, genotypiske og haplotypiske frekvenser og LD analyse

Ud over vores multicenter kohorte, vi genotype SNPs i 203 kinesiske mave kræftpatienter (98 FRK patienter og 105 gastric cancerpatienter) . Genotypefrekvenserne er rapporteret i tabel 2. Den mindre allel frekvens (MAF) for hver SNP var sammenlignelig med tidligere rapporterede data i NCBI-databasen, undtagen rs2306283, for hvilke MAF var lavere i vores befolkning [27,28] end tidligere rapporteret. Alle varianter var i HWE (

s

0,05).

OCF (andre kliniske faktorer) omfatter sex, overfladeareal, performance status og rygning status. Agene omfatter alder, rs2306283 og rs1051266. SE, standardafvigelse.

Ingen kobling blev observeret blandt disse tre varianter (figur S2 i File S3). Haplotypiske frekvenser af

SLCO1B1

* 1B, * 1A og * 15 blev vist i tabel S6 i File S2.

Variate

RRR (N = 85)

OR

95% CI

P

rs2306283GA /AA vs GG4.0701.155-14.3470.029rs1051266GG vs. GA /AA4.3951.282-15.0640.019rs4149056CT /CC vs. TT2.0820.502-8.6430.313sex0.8610.141-5.2430.871age1.0721.013-1.1350.017SA3.5380.027-458.5590.611PS1.0140.945-1.0870.701SS0.5080.119-2.1680.360Table 4. Multivariat logistisk regressionsanalyse (Enter) af RRR

RRR, hurtig svarprocent.; N, antal vurderbare patienter; OR, odds ratio, CI, konfidensinterval; SA, overfladeareal; PS, performance status; SS, rygning status. CSV Hent CSV

Sammenhæng mellem genotyper og svar

Det komplette sæt af associationer mellem hver SNP og RRR er vist i tabel 3. Både rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) var signifikant associeret med højere RRR ved chi-squared test (tabel 3) og univariat logistisk regressionsanalyse (tabel S7 i File S2). Som det fremgår af tabel 3, var RRR 40% (14 ud af 35 patienter) i rs2306283 (GA /AA) gruppen sammenlignet med 15,7% (8 af 51 patienter) i rs2306283 (GG) gruppe,

s

= 0,011 . I rs1051266 (GG) gruppe, var RRR 45,8% (11 ud af 24 patienter) sammenlignet med 19,4% (12 af 62 patienter) i rs1051266 (GA /AA) gruppe,

s

= 0,013. Patienter med rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) viste en mere signifikant forskel i RRR (70% vs. 19,7%, OR = 9,489,

s

= 0,002). Forskelle var stadig signifikant, selv efter korrektion af Benjamini og Hochberg Falsk Discovery Rate korrektion (

s

c

0,05) og justering for potentielle kliniske (køn, alder, areal, performance status, og rygning status) og genetiske (rs4149056) kovariater i multivariabel logistisk regressionsanalyse (tabel 4). Ud over genetiske faktorer, alder var den eneste kliniske faktor i forbindelse med RRR. At vurdere bidraget af de genetiske faktorer forudsigelse af RRR, ROC analyse blev udført ved hjælp af andre kliniske faktorer (OCF), alder alene og alder + rs2306283 + rs1051266 (AGene) hhv. AGene gav den højeste AUC værdi (0,776,

s

0,001) og den bedste følsomhed (figur 2), hvilket viser, at gen-faktorer kan forbedre prædiktiv nøjagtighed RRR.

Sammenhæng mellem genotyper og overlevelse

Ved medianen opfølgning på 270 dage (interval 36-594 dage), var 69 patienter døde, 3 patienter kom ikke til deres opfølgning udnævnelse, og 125 patienter havde trukket sig ud af undersøgelsen (53 erfarne PD, 15 lidt utålelig grad ≥ 3 toksicitet [1 patient trak på grund af hurtig PD og utålelige toksiciteter], 41 patienter uden PD valgte at opgive anti-cancer terapi, 15 ikke- PD patienter accepteret kirurgi eller transkateter arteriel chemoembolization terapi, og 2 patienter gennemført 12 cyklusser af kemoterapi uden progression). I vores undersøgelse, den mediane OS var 343 dage. For at udelukke, at forskellene i PFS og IR-TTF var på grund af ikke-kemoterapi faktorer, PFS og IR-TTF evaluering udelukkede de patienter med ingen medicinske grunde til tilbagetrækning og ikke-PD patienter, der har accepteret en anden end anti-cancer terapi kemoterapi. Således blev 41 og 54 patienter genotype og analyserbare for PFS og IR-TTF hhv. Af hvem, 1 patienter ikke skal genotypebestemmes for rs1051266. I Kaplan-Meier analyse, patienter med rs2306283 (GA /AA) havde signifikant længere progressionsfri overlevelse (n = 41, median 124 vs. 104 dage, log rank

s

= 0,014) og IR-TTF (n = 54 , median 96 vs. 86 dage, log rank

s

= 0,046) sammenlignet med dem med genotype GG. Lignende resultater af univariate Cox regressionsanalyse af PFS, IR-TTF og OS er vist i tabel S8 i File S2. I multivariat cox regressionsanalyse, rs2306283 (GA /AA) igen vist sig at være en uafhængig prognostisk faktor PFS (n = 40, HR = 0,402, 95% CI = 0,171-0,945,

s

= 0,037), men miste sin betydning i udviser en længere IR-TTF (n = 53,

s

= 0,076; tabel 5). Ingen association blev observeret mellem rs1051266 eller rs4149056 og PFS eller IR-TTF. Ingen af ​​SNPs var en signifikant prædiktor for OS (n = 96,

s Restaurant 0,05; tabel 5). Alle overlevelseskurverne for rs2306283, rs1051266 og rs4149056 er vist i figur 3.

Variate

PFS (N = 40)

IR-TTF (N = 53)

OS (N = 96 )

HR(95%CI)

P

HR(95%CI)

p

HR(95%CI)

p

rs2306283GA/AA vs GG0.402 (0.171-0.945) 0.0370.543 (0.277-1.066) 0.0760.966 (0.536-1.741) 0.909rs1051266GG vs. GA /AA1.329 (0.542-3.260) 0.5340.714 (0.358-1.423) 0,3391. 321 (0,688-2,538) 0.403rs4149056CT /CC vs. TT1.197(0.527-2.718)0.6671.042(0.531-2.043)0.9050.688(0.341-1.390)0.297sex0.724(0.234-2.238)0.5740.941(0.350-2.534)0.9050.893(0.363-2.201)0.806age0.997(0.964-1.030)0.8521.008(0.981-1.035)0.5880.969(0.946-0.992)0.008SA0.827(0.018-39.075)0.9231.298(0.058-29.145)0.8700.266(0.023-3.113)0.292PS1.007(0.961-1.055)0.7711.006(0.969-1.045)0.7570.971(0.936-1.009)0.130SS0.934(0.339-2.575)0.8951.079(0.475-2.452)0.8562.201(1.053-4.602)0.036Table 5. Multivariat Cox regressionsanalyse (Enter) af PFS, IR-TTF og OS

PFS, progressionsfri overlevelse,. IR-TTF, irinotecan-relaterede tid til behandlingssvigt, OS, samlet overlevelse, N, Antal vurderbare patienter; HR, hazard ratio, CI, konfidensinterval SA, areal, PS, performance status,. SS, rygning status CSV Hent CSV

diskussion

Vi fandt, at en fælles

SLC19A1

SNP, rs1051266 (GG), der var til stede i 29,9% af vores kohorte, var forbundet med en højere FOLFIRI /mCapeIRI hurtig svarprocent. Så vidt vi ved, er dette den første prospektive undersøgelse for at evaluere effekten af ​​

SLC19A1

varianter på FOLFIRI /mCapeIRI farmakodynamik i mCRC patienter. den SLC19A1 transporteren er primært lokaliseret i den apikale børste grænserne membran af jejunum og colon og betragtes som den dominerende rute folat optagelse i pattedyrceller [19] . Leucovorin (en aktiveret form af folat) kan bidrage 5-FU til at inhibere thymidylatsynthase (TS) ved at danne et ternært kompleks med TS-FdUMP. Derfor har leucovorin-5-FU kombinationer vist en bedre terapeutisk indeks end 5-FU alene i fremskreden kolorektal cancer [29-32]. Lave folatniveauer kan øge evnen til leucovorin til dannelse af komplekset [20]. Backus et al (2000) rapporterede, at fire uafhængige coloncancer-cellelinjer dyrket i lav folat medium viste en højere følsomhed over for enten 5-FU alene eller kombinationen med leucovorin [20]. Tidligere data har påvist, at individer med genotype rs1051266 (GG) havde lavere plasma folat-niveauer [18]. Den højere RRR på rs1051266 (GG) patienter i vores undersøgelse kan delvis forklares med lavere plasma folat og øget TS hæmning, men denne forklaring skal bekræftes i yderligere undersøgelser.

SLCO1B1 medierer den hepatiske tilstrømning af SN38 fra blodet. Det andet vigtige fund er, at rs2306283 (GA /AA) af

SLCO1B1

er forbundet med højere RRR, længere PFS og IR-TTF i mCRC patienter behandlet med FOLFIRI /mCapeIRI regimer, mens rs4149056 (CT /CC) mislykkedes at forudsige RRR eller overlevelse. Imidlertid har tidligere undersøgelser vist, at rs2306283 (A G) kan have ringe indflydelse på SLCO1B1 aktivitet [33,34], og ingen statistisk signifikans blev rapporteret mellem rs2306283 og AUC

SN38 eller tumor respons i 81 lungekræftpatienter [35 ], mens C-allel af rs4149056 fører til nedsat membran udtryk for SLCO1B1, nedsat transport aktivitet, reduceret drug clearance [36-39] og en højere plasma AUC

SN38 i lungekræftpatienter [35]. En nylig genom-dækkende sammenslutning undersøgelse blandt 699 børn med akut lymfoblastisk leukæmi viste, at rs2306283 var forbundet med øget methotrexat (MTX, også substrater af SLCO1B1) opstod efter regulering for rs4149056 [37]. Interessant, vores resultater støttede, at rs2306283 (GA /AA) blev uafhængigt forbundet med højere RRR, længere PFS og IR-TTF efter justering for rs4149056. Disse resultater viser, at in vitro eller lille, retrospektiv, single-institution undersøgelser har normalt for mange komplekse kovarianter at give afgørende resultater. Anden etnisk baggrund, forskellige sygdomme, forskellige regimer og forskellige irinotecan doser kan føre til kontroversielle resultater. Fornyet associationer mellem rs2306283 (GA /AA) og behandlingsresultater efter justering for rs4149056 i prospektive undersøgelser er værd at forfølge i yderligere undersøgelser.

Vi fandt også, at 70% af patienterne med både rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) opnåede hurtig reaktion, meget højere end andre patienter, som blev genotype. Til dato er der ingen funktionelle data om virkningerne af kombineret

SLCO1B1

SLC19A1

genvarianter i forudsige respons på FOLFIRI /mCapeIRI. Forskellene i RRR (70% vs. 19,7%), hvis de er valideret, vil give værdifulde oplysninger om den kliniske beslutningsproces. Den intelligente funktion rs2306283 (GA /AA) kombineret med rs1051266 (GG), kan hjælpe lægerne finde ud af en undergruppe af patienter, der nyder godt af konvertering /neoadjuverende kemoterapi før operation. Men på grund af den lille prøvestørrelse, vores resultater har brug for validering i større serier.

Ingen af ​​de 3 SNPs blev fundet at være associeret med OS i vores undersøgelse, selv om flere SNP’er forudsagt en bedre respons. Dette kan skyldes forskellige efterfølgende behandlinger, der kan fremkalde remission hos patienter resistente over for first-line kemoterapi. I vores undersøgelse, svarprocenten er lavere, og overlevelsestiden er kortere end i tidligere kliniske forsøg [6,24]. Dette kan være fordi vi er gået glip af de patienter, der ville have reageret senest 12 ugers kemoterapi, fordi patienter med stabil sygdom fik en lavere median antal kemoterapi cyklusser (median antal, 4; interval, 2-12). Desuden frafaldet før PD var høj (34,2%) som følge socioøkonomiske årsager. Hvad mere er, kun 5 patienter (4,2%) accepterede resektion af levermetastaser. Disse grunde kan forklare, hvorfor god respons ikke var relateret til længere OS i vores undersøgelse.

Som konklusion, at resultaterne af denne multi-center prospektivt studie tyder på, at rs2306283 (GA /AA) af

SLCO1B1

i kombination med rs1051266 (GG) af

SLC19A1

er signifikant associeret med hurtig tumor respons på FOLFIRI /mCapeIRI i kinesisk FRK patienter. Dette kan hjælpe lægerne til at optimere første linje kemoterapi af FRK patienter. Fornyet associationer mellem rs2306283 (GA /AA) og behandlingsresultater er værd at forfølge i fremtiden.

Støtte Information

File S1. Salg Detaljer om PCR-reaktioner.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s001

(DOCX)

File S2.

Tabel S1 til S8.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s002

(DOCX)

File S3.

Figur S1 til S2.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s003

(DOCX)

Tjekliste S1.

TREND Tjekliste.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s004

(PDF)

protokol S1.

Trial-protokollen.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s005

(DOC)

Tak

Vi takker patienterne for venligt at levere biologiske prøver. Vi takker Michael Heuser og Nathan Susnik fra Hannover Medical School, Tyskland for deres hjælp med manuskript skrivning, og CapitalBio (Beijing, Kina) til forsøg og bioinformatik assistance.