PLoS ONE: programmeret celledød-1 Polymorfier sænke kræftrisikoen: En metaanalyse Inddragelse Tolv Case-Control Studies

Abstrakt

Programmeret celledød-1 (

PD-1

) spiller en vigtig inhibitorisk rolle i anti-tumor-responser, så det betragtes som en kraftig kandidat gen for persons genetiske modtagelighed for cancer. For nylig har nogle epidemiologiske studier evalueret sammenhængen mellem

PD-1

polymorfier og kræftrisiko. Men resultaterne af undersøgelserne er modstridende. Derfor udførtes en meta-analyse. Vi identificerede alle undersøgelser rapporterer forholdet mellem

PD-1

polymorfier og kræft ved elektronisk søger. Ifølge inklusionskriterierne og vurderingen af Newcastle-Ottawa Scale (NOS) kvalitet, blev der kun undersøgelser af høj kvalitet medfølger. I alt tolv relevante undersøgelser med 5,206 tilfælde og 5.174 kontrolpersoner blev rekrutteret. For

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi, signifikant nedsat kræftrisiko blev opnået blandt den samlede befolkning, asiater undergruppe og populationsbaseret undergruppe både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller. Desuden blev et lignende resultat også fundet i T mod C-allel for den samlede befolkning. Der var imidlertid ingen signifikante sammenhænge mellem enten

PD-1

9 Hotel (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 polymorfier og kræft risici i alle genetiske modeller og alleler . For

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi, vi fandt forskellige kræft modtagelighed mellem GA vs. GG og AA vs AG + GG genetiske modeller, og ingen associationer mellem AA vs. GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G allel og kræftrisiko. Generelt vores resultater først viste, at

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi er associeret en stærkt nedsat risiko for kræft. er behov for yderligere epidemiologiske undersøgelser for at bekræfte vores resultater

Henvisning:. Dong W, Gong M, Shi Z, Xiao J, Zhang J, Peng J (2016) programmeret celledød-1 Polymorfier sænke kræftrisikoen: A Meta-analyse Inddragelse Tolv Case-Control Studies. PLoS ONE 11 (3): e0152448. doi: 10,1371 /journal.pone.0152448

Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, UNITED STATES

Modtaget: Januar 16, 2016 Accepteret: 14. marts 2016 Udgivet: Marts 31, 2016

Copyright: © 2016 Dong et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Data Tilgængelighed:. Alle relevante data er inden for de papir og støtte Information filer

finansiering:.. forfatterne har ingen støtte eller finansiering til at rapportere

konkurrerende interesser:. forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Indledning

Programmeret celledød-1 (

PD-1

), et medlem af CD28 /B7 superfamilie af costimulerende molekyler, udtrykkes på aktiverede CD4 + og CD8 + T-celler, naturlige killer T (NKT) celler, B-celler, aktiverede monocytter og nogle dendritiske celle (DC) [1]. Det humane gen, der koder

PD-1

er placeret på kromosom 2q37.3, som koder for en 50-55 kD type I transmembrane glycoprotein protein [2, 3].

PD-1

er bestod af en immunoglobulin-lignende ekstracellulære domæne, og et cytoplasmatisk domæne indeholdende et immunoreceptor tyrosin-baserede inhibitoriske motiv (ITIM) og immunoreceptor tyrosin-baserede switch motiv (ITSM) [4].

PD-1

er blevet godt karakteriseret som en negativ regulator af T-celler, og når reagerer med sine to ligander PD-L1 (B7-H1) og PD-L2 (B7-DC), det kan kraftigt inhibere både proliferation og cytokinproduktion af CD4 og CD8 T-lymfocytter [5, 6]. PD-L1 er blevet rapporteret at blive udtrykt på en række tumorvæv eller cellelinier, herunder brystcancer, cervikal cancer, gastrisk karcinom, esophageal cancer og laryngocarcinoma [7-11]. Desuden

PD-1

er vigtigere involveret i reguleringen af regulatoriske T-celler (Treg) funktion i kræftpatienter. For nylig har nogle undersøgelser viste en direkte forbindelse mellem

PD-1

blokade og nedregulering af intracellulær foxp3 udtryk ved treg at rette immun flugt i forskellige typer af tumorer [12-14]. Baseret på den hæmmende rolle

PD-1

i anti-tumor responser, betragtede vi det

PD-1

gen (Gene bank ID: 5133) som en stærk kandidat til arveanlæg af enkeltpersoner til cancere. Tidligere, de fleste undersøgelser forsket om sammenhængen mellem

PD-1

polymorfier og flere autoimmune sygdomme, herunder type 1-diabetes (T1D), ankyloserende spondylitis (AS), SLE og leddegigt (RA) [15-18 ]. I de senere år har nogle undersøgelser blevet ændret fokus på den rolle,

PD-1

polymorfier i forskellige typer af kræftpatienter. Til dato, flere enkelt nukleotid polymorfier (SNP) er blevet rapporteret for

PD-1

modtagelighed for kræft i litteratur, såsom

PD-1

5 fotos ( rs2227981),

PD-1

9 Hotel (rs2227982),

PD-1

rs7421861 og

PD-1

(rs11568821) et al. Men sammenhængen mellem den

PD-1

polymorfier og kræftrisiko er inkonsekvent. For at afklare dette spørgsmål, vi foretaget en meta-analyse fra alle støtteberettigede studier, for at vurdere sammenslutning af

PD-1

polymorfi med kræftrisiko.

Materialer og metoder

Primær søgestrategi og Inklusionskriterier

Vi identificerede alle undersøgelser rapporterer forholdet mellem

PD-1

polymorfier og kræft offentliggjort før december 22, 2015 ved elektronisk søger. Databaserne omfatter Pubmed, EMBASE, database Cochrane Library, Google Scholar, China National Knowledge Infrastructure (CNKI) og Wan Fang. De søgestrategier var baseret på kombinationer af følgende nøgleord: ( ” Programmeret død-1 “eller ”

PD-1

“), og ( ” kræft “eller ” karcinom”), og ( ‘ “gen” eller ” allel “eller ” genotype” eller ” mutation “eller ” variant” eller ” variation “eller ” polymorfi”), uden nogen begrænsning på sprog. De referencelister af anmeldelser og hentede artikler blev også undersøges manuelt for yderligere artikler. Vi har ikke tilmelde abstracts eller upublicerede studier. For integration, skal undersøgelserne har opfyldt følgende kriterier: (1) studerede på mennesker; (2) klart mål i forholdet mellem

PD-1

polymorfier og kræft; (3) case-kontrol undersøgelse, uanset stikprøve størrelse, ved hjælp af et hospital-baseret eller en population-baserede design; (4) tilstrækkelig offentliggjorte data om størrelsen af stikprøven, odds ratio (OR), og deres konfidensintervaller 95% (CIS).

Data Extraction

Data blev omhyggeligt og uafhængigt udvundet fra alle støtteberettigede publikationer fra tre af forfatterne (Wenjing Dong, Zhirong Shi og Jianjun Xiao). Enhver uenighed blev løst ved diskussion blandt forfatterne. Alle kvalificerede data blev angivet i tabel 1: efternavn første forfatter, dato for offentliggørelse, kvalitet scoringer, etnicitet, kilder til kontrol, antallet af sager og kontroller og P-værdi af Hardy-Weinberg ligevægt (

HWE

). Forskellige etniske grupper blev kategoriseret som asiatiske og kaukasiske. Undersøgelse designs blev stratificeret til populationsbaserede studier og hospitals-baserede undersøgelser.

Kvalitetsvurdering

Tre forfattere (Wenjing Dong, Zhirong Shi og Jianjun Xiao) vurderede kvaliteten studiet uafhængigt hjælp Newcastle-Ottawa Scale, som er en stjerne rating system [19]. Ni stjerner er defineret som den fulde score, og 5 til 9 stjerner er normalt anses for at være en høj metodologisk kvalitet, mens 0 til 4 stjerner anses for at være en dårlig kvalitet [20]. Kvaliteten af alle tilmeldte undersøgelser blev vist i tabel 2. Uoverensstemmelser om NOS score af studierne blev løst ved diskussion mellem forfatterne og vores metaanalyse kun indskrevet studier af høj kvalitet.

Statistisk analyse

Rå yderste periferi med tilsvarende 95% CIs blev brugt til at estimere styrken af sammenhængen mellem

PD-1

polymorfier og kræftrisiko. Betydningen af den poolede OR blev bestemt af

test og

P Hotel (to-halet) 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant. Hardy-Weinberg ligevægt (

HWE

) i kontrollerne blev beregnet ved chi-square test og

0,05 betød en afvigelse fra

HWE

. Mellem-studie heterogenitet blev beregnet af

jeg

test. Hvis heterogenitet var statistisk signifikant (

jeg

50%) [21], en tilfældig effekt model (DerSimonian og Laird metode) [22] blev anvendt; ellers blev en fixed effect model (Mantel-Haenszel-metode) [23] anvendes. Undergruppe analyser blev udført af etnicitet og kontrol- kilder. Tragten plot og Egger test blev begge anvendt til at undersøge publikationsbias. Ved fortolkning af Egger test, blev statistisk signifikans defineret som

0,05 [24] .Den statistisk analyse blev udført med STATA statistisk software (version 12.0, Stata Corporation, College Station, TX, USA).

Resultater

Undersøgelse egenskaber

Fem hundrede og tres-otte undersøgelser blev hentet efter søgning og screening baseret på vores litteratursøgning strategi. Der var 18 studier tilbage, når de irrelevante studier blev ekskluderet. Ud af disse havde 14 studier analyseret sammenhængen mellem

PD-1

polymorfier og kræft. Efter ekstraktion af data, blev en artikel [25] udelukkes på grund af uden kontrolgruppe, mens en anden [26] blev udelukket som diskuteret om de svangerskabsuge trofoblastiske neoplasmer, som indeholder både benigne og maligne tumorer. Derfor fik vi 12 relevante undersøgelser, der undersøgte sammenhængen mellem de

PD-1

polymorfier og kræftrisiko (Fig 1) [27-38]. Alle af dem blev evalueret ved Newcastle-Ottawa Scale og mødte den høje kvalitet (tabel 2). Samlet set metaanalysen omfattede 5,206 kræftpatienter og 5.174 kontroller fra 12 artikler. De oplysninger fra alle berettigede artikler blev opsummeret i tabel 1. Alle artikler, vi inkluderet var case-control studier. Blandt dem, der brystkræft, mavekræft, kolorektal cancer og lungekræft undersøgt af to artikler, henholdsvis. Resten fire undersøgelser er kolon, esophageal, livmoderhalskræft og leverkræft undersøgelse, hhv. Ud af de 12 studier, 7 undersøgelser fokuseret på

PD-1

5 fotos (rs2227981), mens

PD-1

(rs2227982),

PD-1

rs7421861 og

PD-1

3 fotos (rs11568821) blev alle behandlet i 4 studier, hhv. Blandt de 12 undersøgelser, der indgår i metaanalysen, var der 11 studier af asiater og en undersøgelse af kaukasiske. Ifølge styrekilden, kun 4 var hospitals-baserede undersøgelser, resten 8 var populationsbaserede undersøgelser.

PD-1

5 fotos ( rs2227981)

data fra syv undersøgelser, som herunder 3.395 sager og 2.912 kontroller forsket om

PD-1

5 fotos (rs2227981) blev samlet sammen. Seks af undersøgelserne var populationsbaseret og kun én undersøgelse blev sygehus-baseret. Ifølge etnicitet blev seks artikler forsket om asiater og en undersøgelse var om kaukasiere. Vi har udført analyser for alle genetiske modeller og allel i den samlede gruppe, asiater undergruppe og populationsbaseret undergruppe. Samlet set vi opnåede signifikant nedsat kræftrisiko både i TT vs. CC (OR = 0,72, 95% CIs: 0,62-0,85, P = 0,000,

jeg

= 14,0 %), TT vs. CT + CC (OR = 0,75, 95% CIs: 0,65-0,87, P = 0,000,

jeg

= 0,0%) genetiske modeller og T vs C (OR = 0,88, 95% CIs: 0,78-0,99, P = 0,04,

jeg

= 53,6%) allel. Der blev imidlertid ikke dramatiske foreninger findes i de andre genetiske modeller (TT + CT vs. CC: OR = 0,91, 95% CIs: 0,75-1,10, P = 0,343,

jeg

= 65,6%; TC vs. CC: OR = 0,97, 95% CIs: 0,78-1,19, P = 0,759,

jeg

= 68,2%) ( fig 2). Når stratificeret efter etnicitet, blev lignende resultater opnået i asiater undergruppe. Kræft risici blev bemærkelsesværdigt reduceret i TT vs. CC (OR = 0,75, 95% CIs: 0,61-0,92, P = 0,006,

jeg

= 24,1%) og TT vs CT + CC (OR = 0,75, 95% CIs: 0,62 til 092, P = 0,005,

jeg

= 10,8%) genetiske modeller. Der var ingen signifikante foreninger i TT + CT vs. CC (OR = 0,94, 95% initiativerne: 0,74-1,20 P = 0,625,

jeg

= 69,9%), TC vs. CC (OR = 0,99, 95% CIs: 0,76-1,30, P = 0,959,

jeg

= 72,4%) og T vs C (OR = 0,90, 95% CIs: 0,77-1,05, P = 0,190,

jeg

= 59,1%) (fig 3). Når betragtes kilden til kontrolgrupperne, vi gennemførte analyse i befolkningen-baserede undergruppe. Også, nedsat kræftrisiko blev fundet i TT vs. CC (OR = 0,71, 95% CIs: 0,61-0,84, P = 0,000,

jeg

= 7,5%) , TT vs. CT + CC (OR = 0,74, 95% CIs: 0,64-0,86, P = 0,000,

jeg

= 1,9%) og T vs. C (OR = 0,84, 95% CIs: 0,78-0,91, P = 0,000,

jeg

= 26,5%). Men stadig vi havde observeret nogen væsentlige foreninger i TT + CT vs. CC (OR = 0,85, 95% CIs: 0,72-1,00, P = 0,054,

jeg

= 52,0%) og TC vs. CC (OR = 0,91, 95% CIs: 0.75-1.10, P = 0,335,

jeg

= 61,5%) (figur 4 ).

de pladser og vandrette linjer svarer til undersøgelsens specifikke yderste periferi og 95% kreditinstitutter. De områder af firkanterne afspejler undersøgelsens specifikke vægte (som var den inverse af variansen). Diamanterne repræsenterer de samlede yderste periferi og 95% kreditinstitutter.

torve og vandrette linjer svarer til undersøgelsens specifikke yderste periferi og 95% kreditinstitutter. De områder af firkanterne afspejler undersøgelsens specifikke vægte (som var den inverse af variansen). Diamanterne repræsenterer de samlede yderste periferi og 95% kreditinstitutter.

PD-1

9 Hotel (rs2227982) og

PD-1

rs7421861

PD-1

9 Hotel (rs2227982) og

PD-1

rs7421861 polymorfier blev begge diskuteret i fire undersøgelser, som bl.a. 1961 og 1.975 sager, og 2.390 og 2.403 kontroller hhv. Samlet set var der ingen signifikante sammenhænge mellem enten

PD-1

9 Hotel (rs2227982) (figur 5), eller

PD-1

rs7421861 (Fig 6) og kræft i alle genetiske modeller og allel (

PD-1

:. TT vs. CC: OR = 1,10, 95% CIs: 0,84-1,45, P = 0,487,

= 52,4%; TT vs. CT + CC: OR = 1,04, 95% CIs: 0,89-1,21, P = 0,609,

jeg

= 15,5%; TT + CT vs. CC: OR = 1,06, 95% CIs: 0,93-1,22, P = 0,399,

jeg

= 41,6%; TC vs. CC: OR = 1,04, 95% CIs: 0,90-1,20, P = 0,595,

jeg

= 25,8%; T vs. C: OR = 1,04, 95% CIs: 0,95-1,14, P = 0,393,

jeg

= 41,5%;

PD-1

rs7421861: CC vs TT: OR = 0,86, 95% CIs: 0,61-1,23, P = 0,419,

jeg

= 0,0%; CC vs. CT + TT: OR = 0,84, 95% CIs: 0,59-1,19, P = 0,331,

jeg

= 0,0%; CC + CT vs TT: OR = 1,10, 95% CIS : 0,97-1,24, P = 0,137,

jeg

= 0,0%; CT vs TT: OR = 1,13, 95% CIs: 0,99-1,28, P = 0,072 ,

jeg

= 0,0%; C vs T: OR = 1,06, 95% CIs: 0,95-1,18, P = 0,322,

jeg

= 0,0%). Alle undersøgelser om disse to polymorfier gennemføres i asiater. Når vedrørende kontrol kilder, er der to hospitals-baserede og to populationsbaserede artikler studerede om

PD-1

9 Hotel (rs2227982) polymorfi, mens tre hospital-baseret og én populationsbaseret artikel studerede om

PD-1

rs7421861 polymorfi.

PD-1

3 fotos (rs11568821)

Der er fire studier indeholder 1.280 sager og 1.236 kontroller diskuteret denne polymorfi. Alle disse undersøgelser er populationsbaseret og udføres i asiater. Samlet set en signifikant nedsat risiko for kræft blev fundet i AG vs. GG genetiske model (OR = 0,79, 95% CIs: 0,65-0,96, P = 0,021,

jeg

= 0,0%). Interessant nok blev en øget kræftrisiko fundet i AA vs AG + GG genetiske model (OR = 2,25, 95% CIs: 1.30-3.87, P = 0,004,

jeg

= 48,5%). Desuden var der ingen associationer mellem kræftrisiko og AA vs. GG (OR = 1,72, 95% CIs: 0.50-5.94, P = 0,394,

jeg

= 59,4%), AA + AG (OR = 0,92, 95% CIs: 0,63-1,32, P = 0,638,

jeg

= 68,4%) vs. GG eller A vs G (OR = 1,02, 95% CIs: 0,64-1,62, P = 0,945,

jeg

= 85,5%) (fig 7)

Offentliggørelse skævhed

Vi udførte både tragt plots og Egger s test for alle genetiske modeller og allel at vurdere publikationsbias. Vores resultater viste alle tragten parceller var symmetrisk fordeling, der foreslog manglende offentliggørelse bias (S1-S6 fig). Også resultaterne blev støttet af Egger tests (S1 tabel).

Diskussion

Det er kendt for os, at

PD-1

er en immun gen med potente hæmmende virkning på immunceller. Som en vigtig gen for det “fine drejning” af T-lymfocytaktivering og proliferation kan påvirke patientens antitumorimmunitet,

PD-1

fortjenester flere undersøgelser. Mange undersøgelser har rapporteret, at overekspression af

PD-1

er associeret med dårlig prognose i flere tumorer, som herunder bryst-, livmoderhals-, gastrisk, esophageal cancere og ikke-småcellet lungekræft (NSCLC) [7-10 , 39].

PD-1

udtrykkes på tumorspecifikke T-celler, når samvirker med PD-Ls, udtrykt på tumor og immunceller, ekstensivt kunne begrænser vært antitumorimmunitet og skaber antitumor undertrykkende miljø [40, 41]. Derfor er det blevet overvejet at blokade af

PD-1

-PDLs interaktion som en immunterapi procedure at erobre immun-suppression er forbundet med kræft tilstand [41]. For nylig havde nogle undersøgelser undersøgt forholdet mellem

PD-1

polymorfier og forskellige kræftformer, herunder bryst-, mave-, tyktarms-, lunge- og leverkræft, et al. Men resultaterne er kontroversielle. Så vi udførte denne meta-analyse for at diskutere sammenhængen mellem

PD-1

polymorfier og kræftrisiko.

Tidligere Mamat U et al. foretaget en meta-analyse [42] drøftede sammenhængen mellem

PD-1

(rs2227981) polymorfi og kræftrisiko. Deres resultater viste ingen sammenhæng mellem

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi og total kræftrisiko, men afslørede en øget fordøjelsessystemet tumor risiko. Vi fandt imidlertid, at de fejlagtigt medtaget en undersøgelse forsket om

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi og tyktarmskræft risiko [43] i deres meta-analyse. Derfor kan det i væsentlig grad påvirke deres samlede resultater og fordøjelsessystem tumor subgruppe resultater. Derudover har de kun indskrevet seks undersøgelser, som bl.a. en forkert og drøftede kræftrisiko med én polymorfi. Derimod vores meta-analyse omfattede 12 relevante offentliggjorte undersøgelser og drøftede kræftrisiko med fire polymorfier. Desuden er vores meta-analyse omfattede højere antal tilfælde og kontrol end den forudgående ene. Desuden har vi evalueret kvaliteten af undersøgelser af Newcastle-Ottawa Scale og alle de undersøgelser, vi inkluderet var opfyldt høj kvalitet, mens den tidligere metaanalyse ikke foretage nogen vurdering undersøgelse kvalitet. Så vores meta-analyse foretaget en mere overbevisende og detaljeret evaluering end den forudgående undersøgelse gjorde. Alle de egenskaber og resultater af denne undersøgelse for

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi i forhold til den tidligere metaanalyse blev sammenfattet i tabel 3.

i de senere år har anvendelsen af hele genomet forbindelsesundersøgelse (GWAS) i mange typer af sygdomme eksploderede og masser af det GWASs om risikoen for kræft blev offentliggjort. Men der er ingen GWAS fokuseret på de

PD-1

polymorfier og kræftrisiko. Derfor er vores forskning primært bekymret på case-kontrol-studier. I denne undersøgelse, forening mellem

PD-1

5 fotos (rs2227981),

PD-1

9 Hotel (rs2227982),

PD-1

rs7421861 eller

PD-1

3 fotos (rs11568821) og kræft risiko blev undersøgt i alle genetiske modeller og allel, og alle resultater blev sammenfattet i tabel 4 . Vedrørende

PD-1

viste vores resultater en signifikant nedsat kræftrisiko både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller for den samlede befolkning, asiater og befolkning -baserede kontroller, også betydelig nedsat kræftrisiko blev fundet i T vs C allel for den samlede befolkning.

PD-1

5 fotos placeret i exon 5, er et synonym polymorfisme, der ikke ændrer endelige aminosyresekvens af proteinet. Således disse betydelige sammenhænge mellem

PD-1

5 fotos og kræft sandsynligvis kan være

PD-1

variation bindingsuligevægt med andre

PD-1

gen-polymorfier, der kan føre til at ændre

PD-1

udtryk niveau [44]. For nylig, Zhang Hua et al. [29] rapporterede, at frekvenserne af CC genotype og C-allel var højere i brystkræftpatienter end dem i kontrolpersoner i kinesiske befolkning, og CC genotype og C-allel kan spille en potentiel risiko rolle i brystkræft. Konsekvent, vores resultater viste, at i

PD-1

, TT genotype kan reducere kræft risiko.

Vi undersøgte også den

PD -1

9 Hotel (rs2227982) og

PD-1

rs7421861 polymorfier. Det er blevet identificeret som

PD-1

, ligger i exon 5, er en ikke-synonym SNP af

PD-1

, hvilket resulterer aminosyren substitution fra valin til alanin under proteinsyntese, hvilket formentlig føre til forskellige strukturer og forskellige funktioner

PD-1

. Som for

PD-1

rs7421861, er det beliggende i intron 1, hvor en række regulatoriske elementer og splejsning betjeningselementer findes [45, 46]. Derfor, på grund af afbrydelse af splejsningsstedet eller ændring af mRNA sekundær struktur,

PD-1

rs7421861 kan fremkalde afvigende splejsning, og yderligere resultat i translationel forebyggelse [47-49]. Vi undlod imidlertid at finde sammenhængen mellem kræftrisiko og

PD-1

9 Hotel (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 i alle genetiske modeller og alleler . Den begrænsede stikprøve kan være en vigtig årsag til resultaterne, og vi bør behandle resultaterne med forsigtighed. Yderligere undersøgelser er også behov for at bestemme funktionen af disse to polymorfier.

Derudover har vi drøftede

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi i vores meta -analyse.

PD-1

polymorfi var en guanin (G) til adenin (A) enkelt (SNP) ved nukleotid 7146 i

PD-1

intron 4. en region i

PD-1

intron 4 blev beskrevet som en enhancer-lignende struktur, som indeholder bindingssteder for flere transkriptionsfaktorer [50]. Eksisterende undersøgelse har vist, at

PD-1

polymorfi i denne region kan påvirke bindingen af runt-relaterede transskription faktor 1 (RUNX1) og ændre den transkriptionelle regulering og effektivitet af

PD-1

gen [51]. Desuden forskning viste, at tilstedeværelsen af en allel af

PD-1

polymorfi forstyrret bindingssted for RUNX1 transkriptionsfaktorer og resulterede nedskrivning af

PD-1

inhiberende virkning og højere lymfocyt aktivitet [50]. Derfor er en allel af

PD-1

polymorfi kan have øget tumor immunitet kapacitet og faldt modtagelighed kræftformer. Konsekvent, vores resultater af

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi viste en nedsat risiko for kræft i GA vs. GG, men en øget risiko for kræft blev fundet i AA vs AG + GG. Desuden blev der ikke dramatiske associationer fundet mellem AA vs GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G-allel og kræftrisiko. Men stor skala og mere strenge analytiske undersøgelser vil blive krævet, at bekræfte sammenhængen mellem

PD-1

polymorfi og kræftrisiko.

Der er nogle begrænsninger bør blive behandlet i denne meta-analyse. Først og fremmest det begrænsede antal deltagere for

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi kan føre til utilstrækkelig statistisk styrke til at udforske den virkelige forening. For det andet heterogeniteter var betydeligt i nogle genetiske modeller og alleler for

PD-1

5 fotos (rs2227981) og

PD-1

(rs11568821) polymorfier. Når vi udførte undergruppe analyser lagdelt ved etnicitet og kontrol kilde blev heterogene i nogle undergrupper nedsat eller fjernet, mens i nogle undergrupper stadig eksisterede. For det tredje mangler af de oprindelige data begrænsede vores yderligere evaluering af potentielle gen-gen, gen-miljø, eller endda forskellige polymorfisme loci af det samme gen, som alle kan påvirke kræftrisikoen.

Sammenfattende vores meta analyse foreslog, at

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi er forbundet med væsentligt reduceret kræftrisiko både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller, uanset for den samlede befolkning, asiater undergruppe eller populationsbaseret undergruppe, også nedsat kræftrisiko blev fundet i T vs C allel for den samlede befolkning. Ingen foreninger blev fundet mellem kræftrisiko og

PD-1

9 Hotel (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 i alle genetiske modeller og allel. Hertil kommer, for

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi, fandt vi forskellige kræft modtagelighed mellem GA vs. GG og AA vs AG + GG genetiske modeller, og ingen associationer mellem AA vs GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G-allel og kræftrisiko. Men vores resultater først afsløret, en signifikant nedsat risiko mellem

PD-1

polymorfier og kræft, selv om dataene kan være begrænset. Derfor stor skala, veldesignede epidemiologiske studier vil være forpligtet til at bekræfte vores resultater i fremtiden.

Støtte Information

S1 Fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi og kræftrisiko for overordnede befolkningsgrupper (A til TT vs. CC;. B for TT vs. CT + CC ; C TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s001

(TIF)

S2 fig. . Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi og kræftrisiko for asiater undergruppe (A til TT vs. CC;. B for TT vs. CT + CC ; C TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s002

(TIF)

S3 fig. . Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

5 fotos (rs2227981) polymorfi og kræftrisiko for populationsbaseret undergruppe (A til TT vs. CC;. B for TT vs. CT + CC, C TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi:. 10,1371 /journal.pone.0152448.s003

(TIF)

S4 fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

9 Hotel (rs2227982) polymorfi og kræftrisiko for overordnede befolkningsgrupper (A til TT vs. CC;. B for TT vs. CT + CC ; C TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s004

(TIF)

S5 fig. . Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

rs7421861 polymorfi og kræftrisiko for overordnede befolkningsgrupper (A til CC vs TT, B for CC vs. CT + TT; C CC + CT vs. TT; D for CT vs TT og E for C vs. T)

doi:. 10,1371 /journal.pone.0152448.s005

(TIF)

S6 fig. Tragt plot til offentliggørelse partiskhed af

PD-1

3 fotos (rs11568821) polymorfi og kræftrisiko for overordnede populationer (A for AA vs GG;. B for AA vs AG + GG ; C i AA + AG vs. GG; D for AG vs. GG og E for A vs G)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s006

(TIF)

S1 Meta. -analyse på Genetic Association Studies Form.

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s007

(DOCX)

S1 Table. Resumé af Egger test

-værdi

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s008

(DOCX)

Kronisk sygdom

PLoS ONE: programmeret celledød-1 Polymorfier sænke kræftrisikoen: En metaanalyse Inddragelse Tolv Case-Control Studies

Be the first to comment

Leave a Reply Annuller svar