PLoS ONE: Meta-analyse af genekspression Underskrifter Definition epitel til Mesenchymale Overgang under Cancer Progression

Abstrakt

epitelial til mesenkymale overgang (EMT) repræsenterer en afgørende hændelse under kræft progression og formidling. EMT er omdannelsen af ​​carcinomceller fra en epitelial til en mesenchymal fænotype, som associerer med en højere cellemotilitet samt forbedret kemoresistens og cancer stemness. Især EMT er blevet mere og mere anerkendt som en tidlig tilfælde af metastaser. Talrige genekspressionsstudier (GES) er blevet udført for at opnå transkriptom signaturer og markørgener til at forstå de regulatoriske mekanismer bag EMT. Alligevel er udført nogen meta-analyse overvejer de mange GES af EMT til omfattende uddybe de centrale gener i denne proces. Her rapporterer vi meta-analyse af 18 uafhængige og offentliggjort GES af EMT som fokuserede på forskellige celletyper og behandlingsmodaliteter. Beregningsanalyse afslørede gruppering af GES efter typen af ​​behandling frem for celletype. GES af EMT induceret via transformerende vækstfaktor-β og tumornekrosefaktor-α behandling kun givet ensartet defineret klynger mens GES af modeller med alternative EMT induktion grupperet i en mere kompleks måde. Desuden har vi identificeret de op- og nedreguleret gener, der blev delt mellem de mange GES. Denne kerne gen liste omfatter velkendt EMT markører samt hidtil ukendte gener hidtil ikke er beskrevet i denne proces. Endvidere flere gener af EMT-kerne-genet liste signifikant korreleret med nedsat patologisk komplet respons hos brystkræftpatienter. Afslutningsvis denne meta-analyse giver en omfattende undersøgelse af tilgængelige EMT udtryk signaturer og viser grundlæggende indsigt i de mekanismer, der regulerer carcinom progression

Henvisning:. Gröger CJ, Grubinger M, Waldhör T, Vierlinger K, Mikulits W (2012) meta-analyse af genekspression Underskrifter Definition epitel til Mesenchymale Overgang under Cancer Progression. PLoS ONE 7 (12): e51136. doi: 10,1371 /journal.pone.0051136

Redaktør: Olivier de Wever, Ghent Universitet, Belgien

Modtaget: Juni 28, 2012; Accepteret: 29 Okt 2012; Udgivet: December 10, 2012