PLoS ONE: Angiogen mRNA og microRNA Gene Expression Signature Forudsiger et Novel Undertype af serøs kræft i æggestokkene

Abstrakt

Kræft i æggestokkene er den femte hyppigste årsag til kræft dødsfald for kvinder i USA og den syvende mest dødelige på verdensplan. Selvom kræft i æggestokkene er bemærkelsesværdig for sin oprindelige følsomhed over for platin-baserede terapier, at langt størstedelen af ​​patienterne i sidste ende udvikle tilbagevendende kræft og bukke under for stigende platinresistent sygdom. Moderne, målrettede kræftlægemidler gribe ind i cellesignalering, og påpege de vigtigste sygdomsmekanismer og veje vil i høj grad fremme vores behandling evner. For at belyse den molekylære mangfoldighed af ovariecancer vi udførte omfattende transkriptionel profilering på 129 fremskredent stadium, høj kvalitet serøse æggestokkene kræftformer. Vi implementerede en, re-sampling baseret version af ISIS klasse opdagelse algoritme (rISIS: robust ISIS) og anvendt det til det samlede sæt af kræft i æggestokkene transkriptionelle profiler. rISIS identificeret en ikke tidligere beskrevet patient lagdeling, yderligere understøttet af mikro-RNA-ekspression profiler, og gensæt berigelse analyse fundet stærk biologisk støtte til stratificering af ekstracellulær matrix, celleadhæsion og angiogenese gener. Den tilsvarende “angiogenese signatur” blev valideret i ti offentliggjorte uafhængige ovariecancer genekspression datasæt og signifikant associeret med samlede overlevelse. De undertyper vi har defineret, er af potentiel translationel interesse, da de kan være relevante for at identificere patienter, der kan drage fordel af tilsætning af anti-angiogene behandlinger, der nu testes i kliniske forsøg

Henvisning:. Bentink S, Haibe -Kains B, Risch T, Fan JB, Hirsch MS, Holton K, et al. (2012) angiogen mRNA og microRNA Gene Expression Signature Forudsiger et Novel Undertype af serøs kræft i æggestokkene. PLoS ONE 7 (2): e30269. doi: 10,1371 /journal.pone.0030269

Redaktør: Chad Creighton, Baylor College of Medicine, USA

Modtaget: 19 oktober, 2011; Accepteret: 12. december, 2011; Publiceret: 13. februar 2012