PLoS ONE: associering mellem DAPK1 Promotor Methylering og livmoderhalskræft: En Meta-Analysis

Abstrakt

Baggrund

Død-associeret protein kinase1 (

DAPK1

) er en vigtig tumorsuppressorgen. DNA methylering kan inaktivere gener, der ofte er blevet observeret i carcinogenese af livmoderhalskræft. I løbet af de sidste mange årtier har mange undersøgelser udforsket sammenhængen mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft. Imidlertid blev mange undersøgelser begrænset af den lille prøver størrelse og resultaterne var inkonsekvent blandt dem. Således har vi foretaget en meta-analyse for at vurdere sammenhængen mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft.

Metoder

Vi systematisk søgte støtteberettigede studier i PubMed, Web of Videnskab, EMBASE og CNKI databaser. Brug meta-regression, undergruppe analyse og følsomhedsanalyse, vi udforskede de potentielle kilder til heterogenitet. Den odds ratio (OR) og 95% konfidensinterval (95% CI) blev beregnet ved metaanalyse i R.

Resultater

I alt 15 studier 2001-2012, bestående af 818 tumorvæv prøver og 671 normale væv prøver blev analyseret i denne meta-analyse. Hyppigheden af ​​

DAPK1

promotor methylering varierede fra 30,0% til 78,6% (median, 59,3%) i livmoderhalskræft væv og 0,0% til 46,7% (median, 7,8%) i normal cervikal væv. Den poolede OR var 19,66 (95% CI = 8,72-44,31) med den tilfældige effekter model, og heterogenitet blev fundet gennem følsomhedsanalysen.

I

2

= 60% (

P

= 0,002) faldt til

I

2

= 29,2% (

P

= 0,144), når en heterogen undersøgelse blev udelukket, og den poolede OR steg til 21,80 (95% CI = 13,44-35,36) med den faste model effekter.

Konklusion

resultatet foreslog en stærk association mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft. Denne undersøgelse viste også, at

DAPK1

promoter methylering kan være en biomarkør i cervikal carcinogenese, der kan tjene som en tidlig indikation af livmoderhalskræft

Henvisning:. Xiong J, Li Y, Huang K, Lu M, Shi H, Ma L, et al. (2014) associering mellem

DAPK1

Arrangøren Methylering og livmoderhalskræft: en meta-analyse. PLoS ONE 9 (9): e107272. doi: 10,1371 /journal.pone.0107272

Redaktør: Xuefeng Liu, Georgetown University, USA

Modtaget: Marts 17, 2014 Accepteret: August 13, 2014; Udgivet den 30. september, 2014

Copyright: © 2014 Xiong et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Dette arbejde blev støttet af National Natural Science Foundation of China (nr 81.071.663). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Livmoderhalskræft er den tredje mest almindelige kræftform, efter brystkræft og tarmkræft, blandt kvinder over hele verden, med 529,500 estimerede nye tilfælde og 275.000 dødsfald i 2008 i henhold til Ferlay et al. [1]. Udviklingen af ​​invasiv livmoderhalskræft er en gradvis proces, der forekommer over en lang periode, fra cervikal intraepithelial neoplastiske (CIN) læsioner til livmoderhalskræft. Således er det kritisk vigtigt at detektere præcancerøse læsioner at forhindre udviklingen af ​​livmoderhalskræft. Selvom infektion med human papillomavirus (HPV) er en accepteret stor risikofaktor for livmoderhalskræft [2], kun en lille del af HPV inficerede patienter udvikler invasiv livmoderhalskræft [3]. Andre risikofaktorer kan også bidrage til tilblivelsen af ​​denne cancer type.

Hypermethylering af promotorområder tumorsuppressorgener kan forårsage gen inaktivering, hvilket er vigtigt i patogenesen af ​​cancere, og forekommer normalt i de tidlige stadier for udvikling af cancer i forskellige typer af kræft, herunder livmoderhalskræft [4], [5]. DNA rmethylation er en tidlig begivenhed i carcinogenese, og er ofte relateret til en transkriptionel blok og tabet af en relevant protein [6]. Fordi

DAPK1

er en vigtig tumorsuppressorgen, der er blevet undersøgt grundigt, vi foretaget en meta-analyse for at vurdere sammenhængen mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft.

Materialer og metoder

kriterier

Undersøgelse søgning og udvælgelse

Vi systematisk anmeldt undersøgelser af

DAPK1

promotor methylering i livmoderhalskræft, og forsøgte at finde de støtteberettigede studier inden PubMed, EMBASE , Web of Science og CNKI, ved hjælp af forskellige kombinationer af mesh (meSH) og ikke-meSH termer. Nøgleordene var “livmoderhalskræft”, “

DAPK1

“, og “methylering”, mens søgestrategien blev udført i PubMed med “uterine cervikale neoplasmer” (mesh), “

DAPK1

” og “methylering”. Undersøgelsen blev gennemført indtil November 1, 2013 uden sprog begrænsning

De undersøgelser til optagelse i denne meta-analyse skulle opfylde følgende standarder:. (I) undersøgelser vurderede sammenslutning af

DAPK1

methylering og livmoderhalskræft, (ii) de undersøgelser, detaljerede oplysninger om hyppigheden af ​​

DAPK1

methylering for både kræft gruppe og den normale kontrolgruppe, (iii) metoder til påvisning af

DAPK1

methylering var begrænset til methylering-specifikke polymerasekædereaktion (MSP) og real-time kvantitativ polymerasekædereaktion (QMSP)

der blev udelukket baseret på følgende kriterier:. (i) de undersøgelser gjorde ikke har en normal gruppe (kontrolgruppen), (ii) de rå data kunne ikke isoleres fra de undersøgelser, hvor kræften gruppen (sag gruppe) også indeholdt personer med forskellige former for forstadier til kræft såsom atypisk skælceller af ubestemt betydning ( ASCUS), Low-grade Pladecellekræft intraepitelial Læsioner (LSIL), og High-grade Pladecellekræft intraepitelial Læsioner (HSIL), (iii) en case-kontrol undersøgelse ikke har hyppigheden af ​​

DAPK1

methylering.

data Extraction

To forfattere uafhængigt gennemførte udtræk af data fra de udvalgte studier. Den ekstraherede oplysninger indeholdt følgende: første forfatters navn, udgivelsesår, patienternes etniske grupper, de metoder, der anvendes til måling af

DAPK1

methylering, vævet kilden til kontrolgruppen, den gennemsnitlige alder af sagen gruppen , og antallet af deltagere i sagen og kontrolgrupper. Alle oplysninger blev bekræftet ved tre anmeldere.

For at vurdere kvaliteten af ​​undersøgelserne, The Newcastle-Ottawa skala (NOS) (https://www.ohri.ca/programs/clinical_epidemiology/oxford.asp) blev gennemført til vurdering af observationsstudier kvalitet. NOS er en kvalitetsvurdering værktøj, som ofte bruges til ikke-randomiseret studier, specifikt case-kontrol- og kohorteundersøgelser indgår i systematiske. Det er også blevet meget udbredt i systematiske reviews af ikke-randomiseret studier af The Cochrane Collaboration

Der er højst ni ‘stjerner’ for hvert punkt:. Fire stjerner til udvælgelsen af ​​de studiegrupper, to stjerner til sammenlignelighed af grupperne, og tre stjerner til konstatering af udfaldet af interesse. Evalueringen blev udført uafhængigt af to anmeldere. Undersøgelser med kvalitetsresultater større end eller lig med 6 blev inkluderet.

Statistisk analyse

De yderste periferi og 95% CIs blev beregnet til at vurdere sammenhængen mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft risiko.

x

2-baserede Cochran Q statistik test og

jeg

2 statistik blev brugt til at teste heterogenitet blandt de inkluderede studier [7]. Signifikant heterogenitet blev bekræftet, hvis

P

0,05;

jeg

2 50% blev også anset for at demonstrere betydelig heterogenitet [8]. Derefter blev en tilfældig effekt model (DerSimonian-Laird estimator), der anvendes til at beregne de samlede yderste periferi; ellers blev en fast-effekter model (Mantel-Haenszel metoden) anvendt [9]. En meta-regression (begrænset maksimal-estimatoren metode) blev anvendt til at undersøge kilden til heterogenitet. Endvidere blev en undergruppe analyse udført for at vurdere kilden til heterogenitet, og t

2 blev brugt til at afgøre, hvor meget heterogenitet kunne forklares ved undergruppe forskelle. En følsomhedsanalyse blev brugt til at finde relativt dårlig kvalitet studier ved udeladelse af en enkelt undersøgelse på et tidspunkt, og for at se, om en bestemt undladelse kan påvirke den samlede ELLER værdi. Tragten plots [10] og Egger s test blev brugt til at evaluere publikationsbias. Den fejlsikker tal var også en indikator for at vurdere publikationsbias. En asymmetrisk plot foreslået en mulig publikationsbias og

P Drømmeholdet værdi af Egger test mindre end 0,05 blev anset for at være repræsentative for en statistisk signifikant publikationsbias [10].

Alle statistiske analyser blev beregnet med Meta pakke (version 2.5-1) i R (version 3.0.1, https://www.r-project.org/).

Resultater

Søgeresultater og studere Kendetegn

i alt 15 studier, der er indarbejdet 1489 patienter blev inkluderet i denne meta-analyse (fig 1). I alt blev 110 undersøgelser oprindeligt fundet efter en søgning af de ovennævnte databaser, men 34 studier blev udelukket på grund af overlapning. Ved at screene titler og abstracts af remaining76 undersøgelser blev yderligere 45 undersøgelser udelukket (8 møde papirer, 1 anmeldelse, en patent papir, 1 cellelinjer, 3 studier med terapi, og 31 irrelevante artikler). Elleve studier uden kontrolgruppe og 5 studier, der omfattede forstadier væv såsom ASCUS, LSIL og HSIL i sagen gruppen, hvilket betød, at de rå data for de kræftpatienter ikke kunne isoleres, blev udelukket under processen med fuld tekst gennemgang. Endelig blev 15 studier inkluderet i denne meta-analyse [3], [11] – [24]. Antallet af sager varierede fra 22 til 350 blandt de studier med deltagere fra Asien (8 studier), Nordafrika (1 studie), Europa og Nordamerika (7 studier). For de 15 studier, 5 studier anvendes real-time kvantitativ polymerasekædereaktion (QMSP) og de øvrige 10 undersøgelser anvendes methyleringsspecifik polymerasekædereaktion (MSP) for at detektere

DAPK1

methylering i behandlingsgruppen og i kontrolgruppe (tabel 1).

Kvalitetsvurdering

resultatet af NOS viste, at den laveste score var seks og højeste score var 9 med en median score på 7,2. De fleste undersøgelser brugte raske frivillige fra hospitalet som kontroller med undtagelse af Feng et al. [12] og Sun et al. [21]. Undersøgelsen af ​​Leung et al. [17] var den eneste, hvor kontrol væv blev afledt fra tilstødende normale væv (tabel 2).

Meta-regression og undergruppeanalyser

x

2

baseret Cochran Q statistik test og

jeg

2 statistik fundet betydelig heterogenitet blandt de 15 studier (

I

2

= 60,0%,

P

= 0,002). Der blev observeret en stærk sammenhæng mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft med en samlet OR af = 19,66 (95% CI = 8,72-44,31) baseret på tilfældige effekter model (fig. 2). For dette resultat, forsøgte vi at finde den mulige kilde til heterogenitet. Baseret på tidligere studier og vores nuværende viden, vi først brugt en multipel regressionsmodel med fem variabler baseret på udgivelsesår, etnicitet, metode, kilde til kontrol, og tilfælde stikprøvestørrelse. Case grupper, hvis stikprøve var mindre end 60, blev klassificeret som gruppe A, mens de andre grupper blev klassificeret som gruppe B. Gennem regressionsmodellen, fandt vi ikke en betydelig heterogenitet for de fem variabler, der er anført ovenfor (tabel 3). Vi derefter foretaget en undergruppe analyse for yderligere at vurdere kilden til heterogenitet.

Vi udførte en undergruppe analyse ifølge etnicitet, metode, og sagen stikprøvestørrelsen. Den OR var 18,22 hos kaukasiere (95% CI = 3,35-99,03, tilfældige effekter model) og 17,88 (95% CI = 10,29-31,07; faste effekter model) i ikke-kaukasiere,

jeg

2

værdi blev opnået separat og blev bestemt til at være 75,9% og 42,6% i forhold til hele studiegruppen (

i

2

= 60%). Med denne metode, den yderste periferi af de undersøgelser, der brugte MSP var 19.10 (95% CI = 11,11-32,84; faste effekter model) og 15,30 (95% CI = 2,34-99,66, tilfældige effekter model). Tilsvarende OR i gruppe A var 25,80 (95% CI = 12.56-53.02, faste effekter model), mens OR i gruppe B var 13,55 (95% CI = 3,93-46,73, tilfældige effekter model). (Tabel 4)

følsomhedsanalyse og undergruppeanalyser

resultatet af følsomhedsanalysen viste, at OR værdi varierede fra 13,97 (95% CI = 8,94-21,83) til 21.80 (95% CI = 13.44- 35.36) med en samlet OR af = 15,32 (95% CI = 9,97-23,66) med den faste effekter model (fig. 3). Efter udeladelsen af ​​den heterogene undersøgelse (Yang et al., 2010), den poolede ELLER ændret sig dramatisk sammenlignet med, når andre undersøgelser blev fjernet. Derudover indledende heterogenitet (

I

2

= 60,0%,

P

= 0,002) faldt til

I

2

= 29,2% (

P

= 0,144) med en samlet OR af = 21,80 (95% CI = 13,44-35,36;. faste effekter model), når den heterogene undersøgelse blev fjernet (Yang et al, 2010) (figur 4).. Når vi gjort en yderligere analyse baseret på etnicitet, metode, og sagen stikprøvestørrelse, viste resultaterne, at heterogenitet i kaukasiere, QMSP metode og større stikprøve forsvandt, da data fra den heterogene undersøgelse blev fjernet (Yang et al., 2010) (tabel 5). Vejviser

offentliggørelse skævhed

Funnel plots og Egger test blev udført for at vurdere publikationsbias af litteraturen. Formen af ​​tragten plottet i figur 5 viser en mulig asymmetri, men Egger test resulterede i

P

= 0,551, hvilket indikerer, at offentliggørelse partiskhed var meget lav; ingen signifikant skævhed blev fundet blandt de inkluderede studier. Den fejlsikker tal (Z = 61,12, NFS

0,05 = 1374,98, NFS

0,01 = 674,13) også anført, at graden af ​​publikationsbias var meget lille.

Diskussion

død-associeret protein kinase1 (

DAPK1

) kunne mægle celledød via IFN-gamma og kan føre til tumor patogenese og metastase når inaktiveret [25]. For nylig har mange undersøgelser vist, at DNA-methylering ændringer er involveret i cancer initiering og progression, og som kunne anvendes til at forudsige diagnose og prognose af humane sygdomme og maligniteter [26], [27]. Tabet af

DAPK1

ekspression, primært ved hypermethylering af dets promotorregion, forbedrer metastatiske potentiale af cancerceller og har vist sig at forekomme i en række forskellige cancere, herunder cancer i livmoderhalsen [14], [ ,,,0],24]. Selvom HPV-infektion er en af ​​de vigtigste risikofaktorer, at flertallet af patienter med HPV-infektion ikke udvikle livmoderhalskræft. HPV-infektion alene er utilstrækkelig for malign transformation af cervikale celler, som tyder potentielle roller andre genetiske og epigenetiske begivenheder i cervikal carcinogenese [11].

resultatet af den poolede OR var 19,66 (95% CI = 8.72- 44.31) med den tilfældige effekter model (figur 1), som viste, at

DAPK1

promotor methylering er forbundet med livmoderhalskræft og derfor, at det kan spille en vigtig rolle i patogenesen af ​​livmoderhalskræft. Dette resultat var i overensstemmelse med resultaterne af tidligere undersøgelser [11], [20]. Imidlertid blev signifikant heterogenitet observeret i disse 15 studier, og årsagen til heterogenitet kunne ikke forklares ved begyndelsen. At udforske den mulige kilde til heterogenitet, vi implementeret en meta-regression og undergruppe analyse. Resultaterne viste nogle heterogenitet i kaukasere, den QMSP fremgangsmåde og i et større prøvestørrelse gennem undergruppe analyse (tabel 4); så har vi gennemført en følsomhedsanalyse for at finde kilden til heterogenitet. Undersøgelsen af ​​Yang et al. (2010) synes at være den heterogene undersøgelse, der påvirkede metaanalyse, som

I

2

= 60% (

P

= 0,002) blev reduceret til

I

2

= 29,2% (

P

= 0,144), når denne undersøgelse blev udeladt (fig 4). Desuden yderligere statistisk analyse bekræftede heterogenitet studiet af Yang et al. (2010), og ingen signifikant heterogenitet af de resterende 14 studier (tabel 5).

Når det heterogene undersøgelse blev udeladt, blev samlet ELLER værdi steget fra 15,32 til 21,80 (den faste effekter model), der foreslog en stærkere sammenhæng mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft. Den heterogenitet præsenteret i QMSP blev reduceret fra

I

2

= 78,8% til

I

2

= 0,0%, hvilket indikerede, at metoden til QMSP er bedre end MSP. Denne konklusion var i overensstemmelse med den undersøgelse, som Eads et al. [28]. Den heterogenitet i kaukasiere også faldet fra

I

2

= 75,9% til

I

2

= 0,0%, som kunne have været forårsaget af to væsentlige årsager. Først påvisning af

DAPK1

promotor methylering i kaukasiere ved QMSP metode udelukkede den undersøgelse, som Flatley et al .. Den anden grund kan være, at heterogeniteten i kaukasiere er relativt lille. Offentliggørelse skævhed blev evalueret gennem Funnel plots og Egger test, og Egger test viste

P

= 0,551, hvilket indikerede, at der ikke var nogen signifikant publikationsbias. Den fejlsikker antal yderligere bekræftet, at tendensen for publikationsbias var meget lille.

Denne meta-analyse havde nogle begrænsninger. Den første begrænsning var, at nogle undersøgelser ikke give detaljerede oplysninger om alder af personer i de tilfælde grupper og kontrolgrupper. Den anden begrænsning i denne meta-analyse var, at nogle undersøgelser ikke afsløre fase af livmoderhalskræft eller subtype, som måske også være kilder til heterogenitet. Betragtning af det lille antal artikler, der er beskrevet stadiet og typen af ​​livmoderhalskræft, magt var for lille til at gøre en undergruppe for dem. Andre forstyrrende variabler som metode, etnicitet, stikprøvestørrelse, og kilden til kontrol kan også forekomme. Offentliggørelse skævhed var den tredje begrænsning. Nogle ikke-offentliggjorte og negative undersøgelser kan bidrage til en vis skævhed, selvom ingen signifikant publikationsbias blev påvist i overensstemmelse med Egger test.

Som konklusion blev der observeret en stærk sammenhæng mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft, og derfor

DAPK1

promoter methylering kan være værdifulde som biomarkør. Overvejer at kvaliteten og mængden af ​​de reviewed artikler var begrænset, bør større og veldesignede undersøgelser anvendes i fremtiden for yderligere bekræftelse af sammenhængen mellem

DAPK1

promotor methylering og livmoderhalskræft.

Støtte oplysninger

Tjekliste S1.

PRISMA Tjekliste

doi:. 10,1371 /journal.pone.0107272.s001

(DOC)

Tak

Vi vil gerne takke Shen Wei, Wang Man, Xiaofang Du og Deng Song for deres nyttige assistance.