PLoS ONE: En fælles SMAD7 Variant er forbundet med risiko for kolorektal cancer: Beviser fra en case-kontrol undersøgelse og en meta-analyse

Abstrakt

Baggrund

En fælles genetisk variant, rs4939827, ligger i

SMAD7

, blev identificeret ved to nylige genom-dækkende sammenslutning (GWA) undersøgelser til at være stærkt forbundet med risiko for kolorektal cancer (CRC). Men følgende replikation undersøgelser givet modstridende resultater.

Metode og Resultater

Vi har udført en case-kontrol undersøgelse af 641 tilfælde og 1037 kontroller i en kinesisk befolkning og derefter foretaget en meta-analyse, integrere vores og publicerede data for 34313 sager og 33251 kontroller, at afklare forholdet mellem rs4939827 og CRC risiko. I vores case-kontrol undersøgelse, blev den dominerende model betydelig forbundet med øget CRC risiko [Odds Ratio (OR) = 1,46; 95% konfidensinterval (95% CI), 1,19-1,80]. Følgende metaanalyse yderligere bekræftet dette signifikant sammenhæng for alle genetiske modeller, men med betydelig mellem-studie heterogenitet (alle

P

for heterogenitet 0,1). Ved stratificeret analyse afslørede vi, at etnicitet, prøve størrelse, og tumor sites kunne udgøre kilden til heterogenitet. Den kumulative analyse foreslog, at indlysende tendens til signifikant sammenhæng blev set med at tilføje undersøgelse prøver over tid; mens viste følsom analyse resultater før og efter fjernelse af hver undersøgelse var ens, hvilket indikerer den meget stabilitet af de nuværende resultater.

Konklusion

Resultater fra vores case-kontrol undersøgelse og metaanalysen kollektivt bekræftede signifikant association af varianten rs4939827 med øget risiko for kolorektal cancer. Ikke desto mindre bør pålægges bøde-kortlægning af modtagelighed loci defineret ved rs4939287 at afsløre kausal variant

Henvisning:. Song Q, Zhu B, Hu W, Cheng L, Gong H, Xu B, et al. (2012) En fælles SMAD7 Variant er forbundet med risiko for kolorektal cancer: Beviser fra en case-kontrol undersøgelse og en meta-analyse. PLoS ONE 7 (3): e33318. doi: 10,1371 /journal.pone.0033318

Redaktør: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare, Italien

Modtaget: Januar 2, 2012; Accepteret: 9. februar 2012; Udgivet MT: 21. marts, 2012