PLoS ONE: mRNA-Seq af Single prostatakræft Cirkulerende tumorceller afslører sammenfatning af genekspression og Pathways Fundet i prostatakræft

Abstrakte

Cirkulerende tumorceller (CTC) mægle metastatisk spredning af mange solide tumorer og tælling af CTCs er i øjeblikket bruges som prognostisk indikator for overlevelse i metastatiske patienter med prostatacancer. Nogle tyder på, at det er muligt at udlede yderligere oplysninger om tumorer fra udtryk analyse af CTCs, men de tekniske problemer med at isolere og analysere individuelle CTCs har begrænset fremskridt på dette område. For at vurdere evnen af ​​en ny generation af MagSweeper at isolere intakte CTCs til nedstrøms analyse, udførte vi mRNA-Seq på enkelt CTCs isoleret fra blodet hos patienter med metastatisk prostatakræft og på enkelt prostatacancer LNCaP-celler tilsat i blodet af raske donorer. Vi fandt, at MagSweeper effektivt isoleret CTCs med et capture effektivitet, som matchede den CellSearch platform. Men i modsætning CellSearch, den MagSweeper letter, isolering af individuelle levende CTCs uden kontaminerende leukocytter. Vigtigere, viste mRNA-Seq analyse, at MagSweeper isolation processen ikke har en mærkbar indflydelse på transskriptionsprofilen af ​​enkelte LNCaPs isoleret fra spidse humant blod, hvilket antyder, at eventuelle forstyrrelser forårsaget af MagSweeper processen på den transkriptionelle underskrift af isolerede celler er beskedne. Selvom RNA fra patientens CTCs viste tegn på betydelig nedbrydning, i overensstemmelse med rapporter om korte halveringstider og apoptose blandt CTCs, transkriptionelle underskrifter prostata væv og for kræft var let opdages med enkelt CTC mRNA-Seq. Disse resultater viser, at MagSweeper giver adgang til intakte CTCs og at disse CTCs potentielt kan levere klinisk relevant information

Henvisning:. Cann GM, Gulzar ZG, Cooper S, Li R, Luo S, Tat M, et al . (2012) mRNA-Seq af Single prostatakræft Cirkulerende tumorceller afslører sammenfatning af genekspression og Pathways Fundet i prostatakræft. PLoS ONE 7 (11): e49144. doi: 10,1371 /journal.pone.0049144

Redaktør: Natasha Kyprianou, University of Kentucky College of Medicine, USA

Modtaget: Indtil 30. juni, 2012; Accepteret: 4 Oktober 2012; Udgivet: November 7, 2012