PLoS ONE: En Multi-Cancer Mesenchymale Transition Gene Expression Signature er forbundet med længere tid til tilbagefald hos glioblastoma

Abstrakt

En scene-associeret genekspression underskrift koordineret udtrykte gener, herunder transskription faktor Slug (SNAI2) og andre epitel-mesenkymale overgang (EMT) markører er fundet til stede i prøver fra offentligt tilgængelige gen udtryk datasæt på flere typer kræft, herunder nonepithelial kræftformer. Ekspressionsniveauerne af de co-udtrykte gener varierer på en kontinuerlig og koordinere måde tværs prøverne, der spænder fra fravær af ekspression af stærk co-ekspression af alle generne. Disse data antyder, at tumorceller kan passere gennem en EMT-lignende proces med mesenkymale overgang i varierende grad. Her viser vi, at i glioblastoma multiforme (GBM), er denne signatur er forbundet med tid til tilbagefald efter initial behandling. Ved at analysere data fra The Cancer Genome Atlas (TCGA), fandt vi, at GBM patienter, der responderede på behandlingen og havde lang tid at tilbagefald haft lave niveauer af signaturen i deres tumor prøver (

P

= 3 × 10

-7). Vi fandt også, at signaturen er stærkt korreleret i gliomer med det formodede stamcellemarkør CD44, og er stærkt beriget blandt de differentielt udtrykte gener i glioblastomer vs. lavere kvalitet gliomer. Vores resultater tyder på, at lange forsinkelse, før tumor tilbagefald er forbundet med fravær af mesenkymale overgang signatur, øge muligheden at hæmme denne overgang kan forbedre holdbarheden af ​​behandlingen i gliom patienter

Henvisning:. Cheng WY, Kandel JJ, Yamashiro DJ, Canoll P, Anastassiou D (2012) En Multi-Cancer Mesenchymale Transition Gene Expression Signature er forbundet med længere tid til tilbagefald hos glioblastoma. PLoS ONE 7 (4): e34705. doi: 10,1371 /journal.pone.0034705

Redaktør: Jeffrey K. Harrison, University of Florida, USA

Modtaget: December 2, 2011; Accepteret: 6 Marts 2012; Udgivet: April 6, 2012