PLoS ONE: Genome Wide Lille RNA sekventering og Gene Expression Analysis afslører en microRNA Profil af Cancer følsomhed i ATM-Mangelfuld Menneskelig mammaepitelceller

Abstrakt

Mangler i ATM-genet er den underliggende årsag til ataksi telangiectasia, et syndrom karakteriseret ved neurologisk, motor og immunologiske defekter, og en disposition til kræft. MikroRNA’er (miRNA) er nyttige redskaber til kræft profilering og forudsigelse af terapeutiske reaktioner på kliniske regimer. Vi undersøgte virkningerne af ATM-mangel på miRNA ekspression og associeret genekspression i normale humane mammae epitelceller (HME-CCS). Vi identificerede 81 betydeligt differentielt udtrykte miRNA i ATM-mangel HME-CCs hjælp små RNA-sekventering. Mange af disse er blevet impliceret i tumorigenese og proliferation og omfatter nedreguleres tumor suppressor miRNA, såsom HSA-MIR-29c og HSA-MIR-16, såvel som overudtrykte pro-onkogene miRNA, såsom HSA-miR- 93 og HSA-miR-221. MiRNA ændringer blev integreret med genom genekspressionsprofiler at undersøge mulige miRNA targets. Predicted mRNA-mål af miRNA signifikant reguleret efter ATM depletering omfattede mange gener associeret med dannelse og fremadskriden cancer, såsom SOCS1 og proto-onkogenet MAF. Mens en række miRNA er blevet rapporteret som ændret i kræftceller, der er lidt forståelse for, hvordan disse små RNA kan køre kræft dannelse eller hvordan de kan anvendes som biomarkører for kræft modtagelighed. Denne undersøgelse giver foreløbige data for at definere miRNA profiler, som kan anvendes som prognostiske eller prædiktive biomarkører for brystkræft. Vores integrerede analyse af miRNA og mRNA-ekspression giver os mulighed for at få en bedre forståelse af den involveret i brystkræft disposition signalering og foreslår en mekanisme til brystkræft-tilbøjelige fænotype set i ATM-mangel patienter

Henvisning:. Hesse JE, Liu L, Innes CL, Cui Y, Palii SS, Paules RS (2013) genom-Wide Small RNA sekventering og Gene Expression Analysis afslører en microRNA Profil af Cancer følsomhed i ATM-mangelfuld Menneskelig mammaepitelceller. PLoS ONE 8 (5): e64779. doi: 10,1371 /journal.pone.0064779

Redaktør: Jin Q. Cheng, H. Lee Moffitt Cancer Center Research Institute, USA

Modtaget: 12. december, 2012; Accepteret: 17. april, 2013; Udgivet: 31 maj, 2013