Abstrakte
Kræft udvikler sig gennem en flertrins proces, hvor normale celler videre til maligne tumorer via udviklingen af deres genomer som følge af købet af mutationer i kræft driver gener. Antal, identitet og virkningsmekanisme af cancer driver gener, og hvordan de bidrager til tumor udvikling er stort set ukendt. Denne undersøgelse implementerede musebrysttumorvirus (MMTV) som en insertional mutagen at finde både fører generne og de netværk, hvor de fungerer. Brug dyb indsættelse websted sekventering identificerede vi omkring 31000 retrovirale integration sites i 604 MMTV-inducerede brysttumorer fra mus med mælkekirtler-specifik sletning af
Trp53
,
PTEN
heterozygote knockout-mus, eller vildtype stammer . Vi identificerede 18 kendte fælles integration sites (CISS) og 12 hidtil ukendte CISS mærkning nye kandidat cancer gener. Medlemmer af
Wnt
,
Fgf
,
FGFR
,
RSPO
og
PDGFR
gen familier blev almindeligt muteret i et gensidigt eksklusiv mode. Rækkefølgen data, vi genereret gav også oplysninger om klonalitet af indrykninger i de enkelte tumorer, giver os mulighed for at udvikle en datastyret model af MMTV-induceret tumor udvikling. Insertionsmutationer nær
Wnt
FGF
gener markerer tidligste “initierende” begivenheder i MMTV induceret tumorigenese, mens
FGFR
gener er målrettet senere under tumorprogression. Vores data viser, at insertionsmutagenese kan bruges til at opdage de mutationsmønstre netværk, timingen af mutationer, og de gener, der initierer og køre tumor evolution
Henvisning:. Klijn C, Koudijs MJ, Kool J, ti Hoeve J , Boer M, de Moes J, et al. (2013) Analyse af Tumor heterogenitet og Cancer Gene Networks Brug Deep Sekventering af MMTV-inducerede muse mammatumorer. PLoS ONE 8 (5): E62113. doi: 10,1371 /journal.pone.0062113
Redaktør: Robert Oshima, Sanford Burnham Medical Research Institute, USA
Modtaget: 9. februar 2013; Accepteret: 25 februar 2013; Udgivet: May 14, 2013
Leave a Reply
Du skal være logget ind for at skrive en kommentar.