Bakterielle Epigenomics, det er bare time

Med de anvendelser af multi-omics tilgange til at undersøge epigenome, den? Eld af epigenetik er klar til at ændre sig. Vi fokuserer på integrationen af ​​omik tilgange, som anvendes til DNA modi? Kation for high-throughput nærmer

Den bakterielle epigenome er en dynamisk funktion, der ændrer sig i løbet af vækst som reaktion på eksterne stimuli, og derved lette tilpasning til varierende miljømæssige betingelser. Mange teknikker er blevet udviklet til at kvantificere methylering, antallet af ed nukleotider modi?, Og forbedre påvisningen opløsning. Bisul? Te sekventering var den? Rst metode anvendes til bestemmelse DNA methylering via sekventering. NGS har banet vejen for en lang række store sekventering indsats, hvilket vil øge opdagelsen af ​​methylering tæthed, placering og katalytiske enzymer.

Den eksplosive produktion af epigenomes i de kommende år forudsiger behovet for nye beregningsværktøjer og platforme til at køre store dataanalyse for genom og epigenetisk annotation. Databaser til high-throughput analyse af de fysiske og funktionelle protein-protein-interaktioner omfatter STRING, som forudsiger protein-protein-interaktion net til et enkelt genom er meget nødvendige. De fremtidige udfordringer er spændende og? Fyldt med mange muligheder for at gøre nye opdagelser, som de? Ne Epigenomics i rollen som den bakterielle livscyklus i en tid med multi-omics integration.

De forløbere for celler begår til deres skæbne i en trin-for-trin differentiering proces, som drives af et væld af input og er ledsaget af epigenetiske foranstaltninger til styrkelse beslutningerne forpligtelsesbevillinger. Forberedelsen til seksuel reproduktion er en tre-trins proces, der består af sletning af somatiske underskrifter i kønsceller forstadier via en omfattende omprogrammering proces, etablering af sex-specifikke og kønsceller-specifikke epigenetiske signaturer og transskription profiler og endelig, den post-befrugtning fjernelse af disse underskrifter til at udløse embryonale udviklingsmæssige program og begyndelsen på et nyt liv cyklus.

DNA methylering er almindelig i eukaryoter lige fra svampe til hvirveldyr, selv om dens betydning og funktion i disse organismer varierer meget. Den fremherskende placering af 5mC i den symmetriske CpG sammenhæng førte til den tidlige forslag af DNA methylering arv gennem semi-konservativ DNA-replikation,

5-hydroxymethylcytosine (5hmC) og den nylige opdagelse af 10-11 translokation (Tet) familie af dioxygenases foreslå nye muligheder for aktiv DNA demethylering.

det er nu klart, at passiv DNA demethylering er den mest sparsommelige mekanisme af både PGC’er og præimplantations embryoner og er sandsynligvis tilstrækkelig til dette formål.

Epigenetisk omprogrammering adskiller sig på detaljer blandt pattedyrarter, tyder på, at demethylering-methylering i embryonet er nye mekanismer.