Abstrakt
Nylige undersøgelser har knyttet udtryk for lektinlignende ox-LDL-receptor 1 (
OLR1
) til tumorigenese. Vi analyserede microarray data fra
Olr1
knockout (KO) og vildtype (WT) mus for gener involveret i cellulær transformation og evalueret effekter af
OLR1
overekspression i normale mammaepitelceller (MCF10A ) og brystkræftceller (HCC1143) i form af genekspression, migration, adhæsion og transendotelial migration. Twenty-seks ud af 238 gener blev inhiberet i væv fra OLR1 KO-mus; det store flertal af OLR1 følsomme gener indeholdt NF-KB-bindingssteder i deres promotorer. Yderligere undersøgelser afslørede bred hæmning af NF-kB målgener uden for omdannelsen-associerede genpulje, med berigelse temaer til forsvar respons, immunrespons, apoptose, spredning og sårheling. Transkriptom af
Olr1
KO mus afslørede også hæmning af
de novo
lipogenese, hastighedsbegrænsende enzymer fedtsyre syntase (
Fasn
), stearoyl-CoA desaturase (
SCD1
) og ELOVL familiemedlem 6 (
Elovl6
), samt lipolytisk phospholipase A2 gruppe IVB (
Pla2g4b
). I undersøgelser, der sammenligner MCF10A og HCC1143, sidstnævnte viste 60% højere
OLR1
udtryk. Tvungen overekspression af
OLR1
resulterede i opregulering af NF-KB (p65) og dens target pro-onkogener involveret i inhibering af apoptose (
BCL2
,
BCL2A1
,
TNFAIP3
) og regulering af cellecyklus (
CCND2
) i begge cellelinier. Basal udtryk for
FASN
,
SCD1
PLA2G4B
, samt lipogenese transkriptionsfaktorer
PPARa
,
SREBF2
CREM
, var højere i HCC1143 celler. Overekspression af
OLR1
i HCC1143 celler forbedret også celle migration, uden at det påvirker deres tilslutning til TNF-aktiverede endotel eller transendothelial migration. På den anden side,
OLR1
neutraliserende antistof hæmmede både adhæsion og transmigration af ubehandlede HCC1143 celler. Vi konkluderer, at
OLR1
kan virke som et onkogen ved aktivering af NF-kB målgener ansvarlige for formering, migrering og hæmning af apoptose og
de novo
lipogenese gener.
citation: Khaidakov M, Mitra S, Kang BY, Wang X, Kadlubar S, Novelli G, et al. (2011) oxideret LDL receptor 1 (
OLR1
) som en mulig forbindelse mellem fedme, dyslipidæmi og kræft. PLoS ONE 6 (5): e20277. doi: 10,1371 /journal.pone.0020277
Redaktør: Carlo Gaetano, Istituto Dermopatico dell’Immacolata, Italien
Modtaget: December 20, 2010; Accepteret: April 28, 2011; Udgivet: May 26, 2011
Copyright: © 2011 Khaidakov et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres
Finansiering:. Forfatterne har ingen støtte eller finansiering til at rapportere
konkurrerende interesser:.. forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser
Introduktion
OLR1
, et lectin -lignende scavenger receptor, er stærkt bevaret hos pattedyr [1], og den er i stand til at genkende flere ligander, herunder proteindelen af oxideret-LDL (ox-LDL), fremskreden glycosylering slutprodukter, grampositive og gramnegative bakterier og apoptotiske celler [2].
OLR1
primært udtrykkes i vaskulære celler og vaskulatur-rige organer [3], og dets aktivering af en lang række af stimuli, der indikerer dyslipidæmi, inflammation og skader initierer flere signaleringskaskader herunder MAPK’er, andre proteinkinaser samt som transkriptionsfaktorer NF-KB og AP-1 [4], [5].
Overekspression af
OLR1
er blevet vist i cellulære bestanddele i atherosklerotiske læsioner [6]. Sletning af
Olr1
i
LDLr
knockout (KO) mus resulterer i meget mindre aterosklerotiske læsioner forbundet med en drastisk reduktion af inflammation i aortavæggen [7].
Olr1
ophævelsen dæmper også angiotensin II-induceret hypertension [8]. Ligeledes ophævelsen af
Olr1
reducerer omfanget af iskæmi /reperfusion skade [9].
En association mellem fedme og aterosklerotiske sygdomstilstande hos mennesker er veletableret [10], [11]. Foreninger med fedme er blevet fundet for forskellige kræftformer, herunder bryst- og prostata neoplasmer [12], [13], hvilket tyder på en mekanistisk overlap i Patobiologi af atherogenese og tumorigenese. For nylig,
Olr1
, der virker gennem NF-KB-medieret inflammatorisk signalering, var stærkt impliceret i carcinogenese [14].
Fokus i denne undersøgelse var at yderligere at belyse rolle
OLR1
som et onkogen baseret på den forudsætning, at som en sensor af dyslipidæmi og et molekyle involveret i NF-kB-aktivering,
OLR1
kan være en sammenhæng mellem dyslipidæmi og kræft. Den første del af undersøgelsen var baseret på microarray analyse af vildtype (WT) og
olr1
KO mus. Den anden del definerer forholdet mellem
olr1
og apoptose og lipogenese gener i brystkræft cellelinje HCC1143 og migration og adhæsion af disse celler.
Resultater
Sammenligning af
OLR1
KO og transformation transcriptomes
de vigtigste resultater fra analysen af microarray data fra hjerter vildtype (WT) og
Olr1
KO fra vores gruppe er blevet rapporteret andetsteds [15]. En yderligere analyse mod overlappende sæt af gener (n = 238) fundet at være opreguleret under transformation af to isogene celletyper [14] viste, at 26 gener fra denne liste blev hæmmet i
Olr1
KO transkriptom ved på mindst 20% (tabel 1). Blandt disse var forskellige komponenter i immunrespons (
Isg20
,
C1s
,
S1R
,
Ifrd1
) og en række af transkriptionsfaktorer, herunder vel- kendte onkogener (
JunB
,
Rel
,
Irf2
,
Crem
). Promotor analyse af resulterende sæt af gener [16] identificerede deres berigelse for NF-KB-bindingssteder (p 0,03), som var placeret inden for 500 nukleotider proksimalt for transkriptionelle starte sites i alle undtagen en (
C1s
)
Olr1
følsomme gener (n = 25, fig. 1).
et diagram, der afbilder et sæt af overlappende gener mellem transformation og
Olr1
KO transcriptomes. Fra sættet af 238 gener opregulerede under transformation blev fundet 26 gener, der skal inhiberes i
Olr1
KO-mus. Langt størstedelen af disse gener gennemføres NF-KB sites i deres proksimale promotorsekvenser. I alt blev fundet 86 NF-KB målgener skal inhiberes i
Olr1
KO-mus med berigelse for regulering af apoptose (p = 0,0002), proliferation (p = 0,00003), sårheling (p = 0,0002) , forsvar respons (p = 0,0011), immunrespons (p = 0,0003) og celle migration (p = 0,0009).
OLR1
sletning resulterer i en bred hæmning af NF-KB målgener
Yderligere søgen efter NF-KB regulerede gener ved hjælp af en liste udarbejdet af tilgængelige webbaserede databaser og litteraturen viste, at hæmning af p65 subunit observeret i
Olr1
KO transkriptom blev suppleret med opregulering af hæmmende
Ikbα
underenhed (1,36 gange, p = 0,002, tabel 1) og ledsaget af betydelig nedregulering af flere (n = 61) NF-KB-target gener (tabel 2). Den kombinerede sæt
Olr1
følsomme NF-KB målgener viste berigelse for regulering af apoptose (p = 0,0002), proliferation (p = 0,00003), sårheling (p = 0,0002), forsvar respons (p = 0,0011 ), immunrespons (p = 0,0003) og cellevandring (p = 0,0009) (figur 1). Blandt de der er involveret i apoptose gener (n = 11) og celleproliferation (n = 12), 6 og 5, henholdsvis var negative regulatorer (David Bioinformatik Database, 17).
OLR1
sletning undertrykker lipogenese gener
resultaterne microarray blev valideret for udvalgte gener ved hjælp af kvantitativ real-time PCR. For de fleste af de testede gener, de transkriptionelle skift i
Olr1
KO observeret i mikroarrays blev bekræftet (figur 2A). Desuden
Olr1
deletion resulterede i inhibering af nøgleenzymer for lipogenese (figur 2B), herunder ATP-citrat-lyase (
Acly
), acetyl-coenzym A-carboxylase alpha (
Acaca
), fedtsyre syntase (
Fasn
), stearoyl-CoA desaturase 1 (
SCD1
) og ELOVL familiemedlem 6 (
Elovl6
). Det er af interesse, at ingen af de
Olr1
-følsom Lipidmetabolisme gener foretaget NF-KB bindingssteder i deres initiativtagere. Dette tyder på, at virkningerne af
Olr1
på lipogenese kan være uafhængig af sin NF-KB-signalering arm. På den anden side, flere lipid metabolisme transkriptionsfaktorer, herunder sterol regulatorisk element bindende faktor 2 (
Srebf2
), cAMP responsivt element modulator (
Crem
), peroxisomproliferatoraktiveret receptorer alfa og gamma (
PPARa
Pparg
), samt CCAAT /forstærker bindende protein (C /EBP) beta, viste sig at være nedreguleret i
Olr1
KO-mus (figur 2B ).
A. qPCR validering af udvalgte gener fra overlappende sæt (fra tabel 1); B. Angivelse af lipogenese gener og transkriptionsfaktorer i
olr1
KO mus. Hvide søjler – microarray data; sorte bjælker – qPCR data. Alle P-værdier. 0,05
Virkninger af
OLR1
overekspression i normale epitel og cancerceller
Transfektion af MCF10A og HCC1143 celler med
OLR1
ekspressionsvektor resulterede i 5 til 8 gange forøgelse af
OLR1
udtryk, der falder inden for området OLR1 opregulering. I epiteliale celler udsat for ox-LDL [18]. Dette førte til beskedne opregulering af
RELA
(p65) og betydelige stigninger i RNA besked til
BCL2, BCL2A1, TNFAIP3 og CCND2
(figur 3B). Sammenlignet med MCF10A celler, de viste HCC1143 celler øget basale niveauer af
OLR1 Hotel (59%, p 0,05),
FASN Hotel (24%, p 0,03),
SCD1
(21%, p 0,01) og
PLA2G4B Hotel (153%, p 0,01) (figur 3C). Svaret fra lipogenese gener til
OLR1
transfektion varierede i disse cellelinjer (figur 3D). I MCF10A celler, overekspression af
OLR1
væsentligt stimuleret transskription af
SCD1 Hotel (37%, p 0,02),
ELOVL6 Hotel (38%, p 0,05) og
PLA2G4B Hotel (153%, p 0,02) samtidig med opregulering af
CREM
, mens der i HCC1143 celler
CREM
transskription faldt og
SCD1
PLA2G4B
blev inhiberet sammenlignet med kontrolkulturer transficeret med tom vektor.
Disse celler blev transficeret med enten tom vektor eller
OLR1
cDNA (Origene, Rockville, MD) under anvendelse af lipofectamin 2000 (Invitrogen). Transfektionseffektivitet (70-80%) blev vurderet ved anvendelse af GFP-vektoren. RNA blev ekstraheret 48 timer efter transfektion, omdannet til cDNA og ekspressionen af gener blev bestemt ved kvantitativ PCR. A. Effektivitet af transfektion (celler transficeret med GFP-vektoren). B. Kvantitativ PCR plot. Bemærk forbedring af OLR1 udtryk i både kontrol og OLR1-transfekterede kulturer i respons på ox-LDL. C. Ekspression af gener involveret i apoptose og proliferation. For at stimulere
OLR1
tilhørende signalering kræver OLR1-ligand-interaktion,
OLR1
transfekterede celler blev behandlet med 40 pg /ml ox-LDL i 24 timer; grafer repræsenterer sammenligning med ubehandlede kontrolceller transficeret med tom vektor; D. Basal udtryk for
OLR1
,
PLA2G4B
lipogenese gener i normale humane mammae epitelceller (MCF10A) og brystkræftceller (HCC1143); E. Angivelse af
OLR1
,
PLA2G4B
lipogenese gener i MCF10A og HCC1143 celler transficeret med OLR1 behandlet i overensstemmelse med den ovenfor beskrevne protokol. F. Ekspression af lipogenese transkriptionsfaktorer i MCF10A og HCC1143 celler transficeret med OLR1 og behandlet ifølge protokollen beskrevet ovenfor. Alle forsøg blev udført i triplikater. (*) P 0,05 sammenlignet med respektive kontrol; (†) – p. 0,05 sammenlignet med MCF10A
Over-ekspressionen af
OLR1
letter sårheling, men har ingen effekt på vedhæftning
Det har været rapporterede, at hæmning af
OLR1
bruge siRNA’er resulterede i reduktion af tumorvækst
in vivo
og kræft celle migration
in vitro
[14]. For at vurdere virkningerne af
OLR1
opregulering, transficerede vi HCC1143 celler med enten tomme plasmid eller
OLR1
ekspressionsvektor og testet migration i en sårhelende assay (figur 4A). Over-ekspressionen af
OLR1
blev bekræftet ved hjælp af qPCR. Celler med opreguleret
OLR1
bro sårene meget hurtigere end kontrolkulturer (p 0,001). I modsætning hertil vedhæftning og transendotelial migrering af
OLR1
transfekterede kræftceller adskilte sig ikke fra kontrolværdier (ikke vist).
A. Sårheling assay. Øverste panel – repræsentative billeder af sårheling assay udføres ved hjælp af HCC1143 celler transficeret med enten tomme plasmid eller
OLR1
cDNA vektor; Nedre panel – graf, der viser afstanden mellem kanterne af såret efter 36 timers inkubation. (*) – P 0,01; B. Adhæsion assay. Øvre XLRF repræsentative billeder af vedhængende ikke-transficerede HCC1143 celler fyldt med CellTracker Red CMTX (Invitrogen, Carlbad, CA) og anvendes til ikke-aktiverede eller aktiverede (50 ug /ml oxLDL, 4 timer) sammenflydende HUVEC’er transficeret med OLR1 Silencer eller krypteret siRNA. Nedre panel – graf, der viser antallet af adhærente celler midlede fra flere synsfelter i tredobbelte kulturer. (*) – P 0,05 sammenlignet med ikke-aktiverede kontrol ( “scrRNA”); (†) – p 0,05 sammenlignet med krypterede RNA; C. Kolorimetrisk transendothelial migration assay. Øverste panel – kontrol af sammenløbet af HUVEC’er på membranerne ved farvning af celler med CellTracker Red CMTX. Lavere panel – absorbansværdier af pletten udvundet fra cellerne migreret gennem TNF-aktiverede endotel monolag i tilstedeværelse af
OLR1
neutraliserende antistof eller humant IgG (Control)
Men basal vedhæftning. og transendotelial migrering af ikke-transficerede HCC1143 celler var signifikant svækket, da OLR1 blev hæmmet eller neutraliseret i endotelceller ved hjælp siRNA eller forbehandling celler med
OLR1
neutraliserende antistof (figur 4BC).
diskussion
Denne undersøgelse tyder på flere potentielle forbindelser mellem
OLR1
og modtagelighed for kræft. Først databasen mikroarray i mus med
Olr1
ophævelsen udviste en markant reduktion i ekspression af NF-kB target gener involveret i cellulær transformation [14], samt gener relateret til lipogenese. For det andet, over-ekspression af
OLR1
i en human cancercellelinie viste signifikant opregulering af adskillige gener med onkogene egenskaber og en betydelig stigning i cellemigrering.
Vores microarray analyse viste, at det store flertal af gener rapporteret at være opreguleret under celletransformation (men inhiberet i
Olr1
KO-mus), der bæres NF-kB-bindingssteder i deres promotorer (tabel 1). Desuden er en betydelig del af NF-kB målgener uden for omdannelsen-relaterede pool, især dem der er involveret i regulering af apoptose, proliferation og migration, blev også nedreguleret i
Olr1
KO transkriptom (tabel 2 ). I mus
Olr1
KO microarray, både B-celle leukæmi /lymfom 2 relateret protein A1 (
Bcl2a1
) og
Bcl2
var transkriptionelt hæmmet.
Bcl2a1
er en opstrøms negativ regulator af mitochondriocentric tilstand af apoptose
via
forebyggelse af cytochrom c-frigivelse i cytoplasmaet, som er nødvendig for indledningen af apoptotiske kaskade. Det er blevet rapporteret, at en øget syntese af
BCL2A1
BCL-XL
er den underliggende årsag til omkring 1000 gange større modstand af delmængder af kronisk lymfatisk leukæmi celler [19]. TNFa-induceret protein 3 (
TNFAIP3
) er en central regulator af inflammation og immunitet involveret i udviklingen af forskellige autoimmune sygdomme og det desensibiliserer også celler fra TNFa-induceret cytotoksicitet og blev vist at være anti-apoptotisk i bryst- cancer MCF7S1 celler [20]. Hæmning af
TNFAIP3
kompromiser vækst og overlevelse af glioblastom stamceller
via
hæmning af cellecyklusprogression og NF-KB-aktivitet, og øger overlevelsen af mus med glioblastome xenografter [21].
Vi observerede en betydelig reduktion af
Ccnd2
besked i
Olr1
KO mus og dens multi-fold opregulering i
OLR1
transgene HCC1143 celler. Cyclin D2 er en særdeles konserveret regulator af cyclinafhængige kinaser 4 og 6 ansvarlig for af G1 /S transition. Dette gen epigenetisk tavs i de fleste brystcancere [22]. Dens overekspression i LNCaP celler resulterer i en hindring for spredning og øget apoptose [23]. Desuden
Olr1
sletning syntes at kompromittere hele teknologiske kæden af
de novo
lipogenese, herunder syntese af mættede C16 og C18-fedtsyrer (
Fasn
og
Elovl6
), og deres omdannelse til MUFA’er (
SCD1
). Mange kræftformer, herunder dem, der involverer prostata og bryst [24], [25], næsten udelukkende på
de novo
syntese uanset ernæringsmæssige tilgængelighed. Kontakten til
de novo
lipogenese opstår tidligt og er en forudsætning for effektiv transformation. Nye effekter af
OLR1
på lipidmetabolisme kunne tegne sig for meget af sin rapporterede pro-onkogen aktivitet. For eksempel
ekspressionsniveauet af
FASN positivt korrelerer med dårlig kræft prognose [26], dens genomiske forstærkning er en fælles begivenhed i nogle kræftformer [27], og dets overekspression fremmer transformation af epitelceller [28 ]. Ligeledes overekspression af
SCD1
er blevet observeret i flere typer af kræft, herunder brystkræft [29]; dens opregulering er associeret med transformation og dens knock-down resulterer i nedsat celleproliferation, et tab af forankringsuafhængig vækst og forringet apoptose [30]. Det er at bemærke, at i forhold til MCF10A celler, overekspression af
OLR1
i HCC1143 celler ikke fremkalde den forventede aktivering af lipogenese gener. Dette kan forklares ved maksimalt øget basal ekspression af disse gener i HCC1143 celler ved baseline (figur 3D).
Da de fleste af de gener opreguleret i
OLR1
-TG HCC1143 celler er funktionelt pleiotropisk, vi evaluerede den kumulative resultat af deres opregulering på sårheling, adhæsion og transendotelial assays migration (figur 4). Især blev migreringen af celler ses at næsten dobbelt kontrolværdien i celler med overekspression af
OLR1
, hvilket kraftigt antyder en rolle for dette molekyle i vækst brystkræft. På den anden side, havde præsentation af
OLR1
på overfladen af cancerceller synes ikke at være afgørende for adhæsion til aktiverede endotelceller eller til transendotelmigrering migration. Niveauet af
OLR1
i endotelceller, synes imidlertid at være vigtig, da tilsætning af neutralisere
OLR1
antistof til mediet eller hæmning af OLR1 transskription væsentligt forringet vedhæftning og transendotelial migration i ikke- transficerede cancerceller. Dette er tegn på
OLR1
som en mulig mekanisme for kræft celle-endotel-interaktioner, som tumorceller er karakteriseret ved overflod af
OLR1
ligand phophatidylserine på de cellulære membraner [31].
sammenfattende vores data fra flere tilgange i transgene mus og humane normale epitelceller og kræft cellelinjer tyder på, at
OLR1
har flere pro-onkogene handlinger baseret på: a) aktivering af NF-KB signalvej resulterer i hæmning af apoptose og stimulering af spredning; b) aktivering af de novo lipogenese, og c) mere effektiv adhæsion og transendothelial migrering grund opregulering af
OLR1
i endotel. Vi mener, at disse data tyder på, at
OLR1
kan fungere som bindeled mellem fedme og modtagelighed for brystkræft.
Materialer og metoder
Dyr
C57BL /6-mus blev opnået fra Jackson Laboratories. De homozygote
Olr1
KO mus blev udviklet på C57BL /6 baggrund som tidligere [17] beskrevet.
Olr1
KO mus viste totalt fravær af
Olr1
som bestemt ved RT-PCR og immunfarvning, og bindingen af oxLDL til det vaskulære intima var helt fraværende i disse dyr. Alle dyr modtog human måde i overensstemmelse med Public Health Service Politik om Humane Pleje og anvendelse af forsøgsdyr udgivet af National Institutes of Health. De nuværende undersøgelser blev godkendt af UAMS Animal Care og brug Udvalg godkendelsesnummer 2484, dateret november 2007.
microarray analyse
Totalt RNA af hjerte blev ekstraheret fra WT mus og
Olr1
KO-mus. Microarray analyse blev udført af Affymetrix Mouse Genome GenChip 430 2.0 genekspression array (Affymetrix Inc. Santa Clara, CA) og analyseret ved hjælp af Affymetrix Microarray Analyse Suite (MAS) 5,0 for at vurdere kvaliteten af RNA og hybridisering. En log bund 2 transformation blev anvendt på data, før de arrays blev normaliseret. Alle værdier fra hvert array blev normaliseret til den 75. percentil værdien af array, som vilkårligt blev fastsat til intensitet minimum 100. For genekspression annotation, EASE (som beskrevet i https://apps1.niaid.nih.gov/David) analyse blev udført på væsentlige gener identificeret af én prøve
t
-test. Desuden blev Gene Ontology (GO) vilkår https://www.geneontology.org) for biologiske processer og cellulære komponent identificeres som foreslået af GO Consortium. Alle microarray data MIAME kompatibel og at den rå data er blevet deponeret i en MIAME kompatibel database (ArrayExpress) som angivet på MGED Society hjemmeside https://www.mged.org/Workgroups/MIAME/miame.html (tiltrædelse nummer E -MTAB-473).
reagenser og cellelinier
Alle reagenser, medmindre andet er angivet, blev indkøbt fra Sigma (St. Louis, MO). Human brystcancer cellelinje HCC1143 var en venlig gave fra Dr. A. Basnakian (University of Arkansas for Medical Sciences, Little Rock AR). Pattedyrekspressionsvektor (pCMV5-XL5) med human
OLR1
cDNA blev opnået fra Origene (Rockville, MD). Lyddæmper Vælg Valideret siRNA til OLR1 (s9843) blev købt fra Invitrogen (Carlsbad, CA). Celler blev dyrket under anvendelse af standard RPMI 1640 vækstmedium suppleret med føtalt bovint serum (10%) og ampicillin /streptomycin. Høj TBAR ox-LDL (90 nmol MDA /mg protein) blev indkøbt fra Biomedical Technologies Inc. (Stoughton, MA). Humant IgG blev købt fra Abcam (Cambridge, MA).
Real-Time kvantitativ PCR
Celler blev transficeret med enten tomme vektor eller
OLR1
ekspressionsvektor. Effektiviteten af transfektion blev bekræftet i parallelle forsøg med GFP bærer plasmid. En del af de transficerede kulturer (alle i triplikater) blev behandlet med oxLDL (40 ug /ml) i 24 timer før høst og RNA-ekstraktion. RT qPCR blev udført under anvendelse af Applied Biosystems 7900 real-time PCR-system. qPCR specifikke primere blev designet ved hjælp af Probe-Finder (https://www.roche-appliedscience.com) web-baseret software. Alle qPCR reaktioner blev udført i et slutvolumen på 15 pi indeholdende 1 × af SYBR Green PCR Master Mix (Applied Biosystems, Carlsbad, CA), 300 nM af hver genspecifikke primere, 100 ng cDNA, i sterilt deioniseret vand. Standarden cykling tilstand var 50 ° C i 2 minutter, 90 ° C i 10 minutter, efterfulgt af 40 cykler ved 95 ° C i 15 s og 62 ° C i 1 min. Resultaterne blev analyseret under anvendelse af SDS 2.3 relative kvantificering Manager-software. De sammenlignende tærskelværdier cyklusser værdier blev normaliseret til GAPDH referencenumre gener. qPCR blev udført tredobbelt for at sikre kvantitativ nøjagtighed. Salg
transfektionsprotokol
Celler blev transficeret med enten tom vektor eller
OLR1
cDNA-konstruktioner (Origene, Rockville, MD) under anvendelse af lipofectamin 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA) i overensstemmelse med producentens instruktioner med mindre modifikationer. I indledende eksperimenter, vi bestemt, at højere transfektionseffektivitet opnås ved at anvende en 2:01 forhold af DNA til Lipofectamine i forhold til den planlagte fusion af DNA anbefales i den generelle protokol. Ved anvendelse af disse betingelser, vi rutinemæssigt observeret 70-80% transfektionseffektivitet.
Leave a Reply
Du skal være logget ind for at skrive en kommentar.