PLoS ONE: Microarray Profilering af mononukleære celler fra perifert blod Identificerer Nye kandidatgener Relateret til Chemoradiation respons i Rektal kræft

Abstrakt

Præoperativ chemoradiation forbedrer onkologiske udfald i lokalt avanceret endetarmskræft betydeligt. Men der er ingen effektiv metode til at forudsige tumor respons på chemoradiation hos disse patienter. Perifere mononukleære blodceller er opstået for nylig som patologiske markører for cancer og andre sygdomme, der gør det muligt deres anvendelse som terapi prædiktorer. Desuden vigtigheden af ​​immunresponset i radiosensivity af faste organer førte os til den hypotese, at microarray genekspression profilering af perifere mononukleære blodceller kunne identificere patienter med respons på chemoradiation i rektal cancer. Femogtredive 35 patienter med lokalt fremskreden rektal cancer blev rekrutteret i første omgang at udføre undersøgelsen. Perifere blodprøver blev indhentet før neaodjuvant behandling. RNA blev ekstraheret og oprenset for at opnå cDNA og cRNA til hybridisering af mikroarrays inkluderet i Human WG CodeLink bioarrays. Kvantitativ realtids-PCR blev anvendt til at validere microarray eksperimentdata. Resultaterne blev korreleret med patologisk respons, efter Mandard’s kriterier og endelige UICC Stage (patienter med tumorregression klasse 1-2 og downstaging bliver defineret som respondenter og patienter med grad 3-5 og ingen downstaging som ikke-respondenter). Tyve syv ud af 35 patienter blev endeligt inkluderet i undersøgelsen. Vi udførte en multipel t-test under anvendelse Betydning Analyse af Microarrays, at finde de gener, der afviger betydeligt i ekspression mellem respondere (n = 11) og non-respondere (n = 16) til CRT. De forskelligt udtrykte gener var: BC 035.656,1, CIR, PRDM2, CAPG, Falz, HLA-DPB2, NUPL2, og ZFP36. Målingen af ​​Falz (p = 0,029) genekspressionsniveau bestemt ved QRT-PCR, viste statistisk signifikante forskelle mellem de to grupper. Genekspression profilering afslører nye gener i prøver af mononukleære celler, der kunne forudsige respondenter og ikke-respondenter til chemoradiation i patienter med lokalt fremskreden endetarmskræft perifert blod. Desuden er vores undersøgelse tilføjede yderligere bevis på betydningen af ​​mononukleære celler ‘medieret respons i neoadjuverende behandling af endetarmskræft

Henvisning:. Palma P, Cuadros M, Conde-Muiño R, Olmedo C, Cano C, Segura -Jiménez I, et al. (2013) Microarray Profilering af mononukleære celler fra perifert blod Identificerer Nye kandidatgener Relateret til Chemoradiation respons i endetarmskræft. PLoS ONE 8 (9): e74034. doi: 10,1371 /journal.pone.0074034

Redaktør: Roberto Amendola, ENEA, Italien

Modtaget: 15. december, 2012; Accepteret: August 1, 2013; Udgivet: September 5, 2013