PLoS ONE: Dynamic Network of Transskription og Pathway Crosstalk at afsløre molekylære mekanisme af MGD-behandlede human Lung Cancer Cells

Abstrakt

Nyere forskning har afsløret forskellige molekylære markører i lungekræft. Men de organisatoriske principper deres genetiske regulatoriske netværk stadig venter undersøgelse. Her udførte vi Network Komponentanalyse (NCA) og Pathway Crosstalk Analyse (PCA) til at konstruere en regulerende netværk i human lungecancer (A549) celler, som blev behandlet med 50 uM motexafin gadolinium (MGD), en metal kation indeholdende kemoterapeutiske lægemiddel til 4 , 12 og 24 timer. Vi identificerede en række centrale TF’er, kendt målgener for disse TF’er og signalveje, der er involveret i regulatoriske netværk. Vores arbejde viste, at formodede interaktioner mellem disse TF’er (såsom ESR1 /Sp1, E2F1 /Sp1, c-myc-ESR, Smad3 /c-myc, og NFKB1 /RELA), mellem TF’er og deres mål gener (såsom BMP41 /EST1 , TSC2 /Myc, APE1 /Sp1 /p53, RARA /HOXA1, og SP1 /USF2), og mellem signalveje (såsom PPAR signalvejen og Adipocytokines signalvejen). Disse resultater vil give indsigt i de lovgivningsmæssige mekanisme MGD-behandlede humane lunge kræftceller

Henvisning:. Shao L, Wang L, Wei Z, Xiong Y, Wang Y, Tang K, et al. (2012) Dynamic Network of Transskription og Pathway Crosstalk at afsløre molekylære mekanisme af MGD-behandlede human Lung Cancer Cells. PLoS ONE 7 (5): e31984. doi: 10,1371 /journal.pone.0031984

Redaktør: Yidong Bai, University of Texas Health Science Center på San Antonio, USA

Modtaget: September 18, 2011; Accepteret: 16 Jan 2012; Udgivet: 31 maj, 2012