PLoS ONE: En sammenlignende undersøgelse af Gene-Expression Data basalcellekræft og melanom afslører ny viden om de to Kræft

abstrakt

En sammenlignende analyse af genom-skala transkriptom data fra to typer hudkræft, melanom og basalcellekræft i sammenligning med andre typer kræft, blev gennemført med henblik på at identificere de vigtigste regulatoriske faktorer, der enten forårsage eller bidrage til aggressivitet melanom, mens basalcellekarcinom forbliver generelt en mild sygdom. Flere kræftrelaterede veje såsom celleproliferation, apoptose, angiogenese, celle invasion og metastase, betragtes, men vores fokus er på energiomsætningen, celle invasion og metastase veje. Vores resultater omfatter følgende. (A) Begge typer hudkræft bruge både glykolyse og øget oxidativ fosforylering (elektronoverførsel kæde) for deres energiforsyning. (B) Advanced melanom viser væsentlig opregulering af centrale gener involveret i fedtsyrestofskiftet (β-oxidation) og oxidativ phosphorylering, med aerobe stofskifte er langt mere effektive end anaerob glycolyse, en kilde til energetikken nødvendige for at støtte en hurtig vækst af denne cancer. (C) Selv fremskreden melanom ligner pancreascancer i form af aktivitetsniveauet for gener involveret i fremme celleinvasion og metastase, er den vigtigste metastatisk form af basalcellekarcinom væsentligt reduceret i denne aktivitet, delvis forklare, hvorfor denne cancertype har været betragtes som langt mindre aggressiv. Vores metode til at bruge sammenlignende analyser af transkriptom data fra flere forskellige typer kræft fokuserer på specifikke veje giver en ny og meget effektiv tilgang til kræft studier generelt

Henvisning:. Xu K, Mao X, Mehta M, Cui J, Zhang C, Xu Y (2012) En sammenlignende undersøgelse af Gene-Expression data basalcellekræft og melanom afslører ny viden om de to kræftformer. PLoS ONE 7 (1): e30750. doi: 10,1371 /journal.pone.0030750

Redaktør: Raya Khanin, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, USA

Modtaget: Juli 2, 2011; Accepteret: December 23, 2011; Udgivet: 25 januar, 2012