Internet-baseret Grid Computing

Et åbent brev til medlemmer af D’Wild West (A Webstedet Fights Team) blev sendt i oktober 2000, hvilket er under. Efter syv år UD gitteret udført sine mål og forbliver tavs som fredag ​​27. april 2007.

Forskningen centreret om proteiner, der blev blevet bestemt til at være en mulig mål for kræftbehandling. Gennem en proces kaldet “virtuel screening”, særlige analyse software identificerede molekyler, interageret med disse proteiner, og bestemmes, hvilke af de molekylære kandidater havde en høj sandsynlighed for at blive udviklet til et lægemiddel. Processen svarer til at finde den rigtige nøgle til at åbne en særlig lås -. Ved at se på millioner og atter millioner af molekylære nøgler

Deltagere i Cancer Research Project blev sendt en ligand bibliotek over internettet. Deres PC analyseret molekylerne ved hjælp af en docking software kaldet LigandFit af Accelrys. Den LigandFit software analyseret de molekylære data ved anvendelse af en tredimensionel model for at forsøge at interagere med et proteinbindende sted. Når en ligand forankret succes med et protein, blev det resulterende interaktion scorede og det samspil, der genererede den højeste score blev registreret og arkiveret til yderligere vurdering.

Vi har brug for et bedre svar. Over fem årtiers kræftforskning indsats i lægemiddelforskning og udvikling har givet mere end 40 lægemidler til behandling af kræft. Disse anti-cancer medicin udvider livet for mange mennesker med kræft, men ofte med store omkostninger. Bivirkningerne almindeligvis er forbundet med kræftbehandling ofte kan synes så slemt som selve sygdommen. Bivirkninger kan være så alvorlige, at de begrænser doseringerne patienterne kan modtage. Og halvdelen af ​​alle kræftpatienter ikke reagerer på de behandlinger øjeblikket tilgængelig

På trods af disse mangler, disse behandlinger er stadig ret dyrt -. En betydelig mængde penge er brugt på at behandle kræft. Behandling af kræft tegner sig for over 6% af alle udgifter til lægebehandling. National Institutes of Health estimat kræft er ansvarlig for milliarder $ 37 for direkte medicinske omkostninger, og $ 11 milliarder i tabt produktivitet på grund af sygdom. Opdagelsen af ​​nye lægemidler repræsenterer det bedste håb for at bekæmpe både de stigende medicinske omkostninger og lidelser forbundet med de nuværende behandlinger mod kræft

Der kan næppe være en svøbe mere værd kampene -. Den høje dødelighed, de lidelser opleves af patienterne, og de høje omkostninger ved behandling gør bekæmpe denne sygdom en forskningsprioritet.

Selv med omfattende pre-screening, den skåret ned antal molekyler til anmeldelse til dette projekt anslås på over to hundrede millioner til hvert protein – en skræmmende tal. Analyse denne mængde noget kræver en enorm regnekraft. Og når tallene er dette store, selv supercomputere er begrænset. En super computer har et højdepunkt kapacitet. Det vil sige, hvis en arbejdsbyrde er tre gange kapaciteten af ​​computeren, de job skal i “kø” og angreb efter hinanden. Et projekt som dette kan tage så meget tid, at en forsker ikke engang ville gå i gang med det – han eller hun ville ikke se det endelige resultat i deres levetid. Men med distribueret databehandling, tusinder eller endda millioner af individuelle computere kan hver arbejde på forskellige molekyler samtidig, og tid til at resultaterne kan betydeligt mindre.

Diana Campbells Letter

Jeg har haft Stage IV brystkræft (metastaser til knoglerne) siden september 2000, og blev først diagnosticeret som Stage IIIB i januar, 1992. Det seneste årti har været en rutsjebanetur, og hvis du, et familiemedlem eller en ven har kræft, så ved du hvad jeg taler om.

jeg begyndte at forske trin IV brystkræft i sommeren 1999, da en X-ray i løbet af en helbredsundersøgelse viste en mistænkelig splint på en back ribben. Mange måneder senere, denne splint var en kæmpe svulst, men det havde tidligere biopsi negativ. Jeg havde en følelse af noget ikke var rigtigt, så jeg begyndte at forske. Jeg fandt der ikke var så meget info om Stage IV, som der var på forebyggelse og brystkræft bevidsthed samt tidlig fase, primær diagnostik og behandling.

Så jeg oprettet denne hjemmeside og den tilhørende Survivor webring, e-mail lister , forskningsprojekt og butikker. Mit mål var at give de oplysninger her, at vi alle ønsker at vide på dette tidspunkt – for det meste forbundet med, hvad vi kan gøre for at forlænge vores liv. Jeg er i færd med at opdatere og tilføje, men jeg håber, at denne hjemmeside vil være til nogen hjælp for dig. Venligst slutte sig til UD gitteret også som dette projekt vil bidrage til at fremskynde kræftforskning og eventuelt hjælpe mig og andre for meget kort tid, da vi klare stadie IV brystkræft.

Diana Campbell

Diana døde den 19 februar 2003

Inden for en måned for at deltage Dianas hold i december 2000 fandt jeg, at kræft var optjent sig i min frailer menneskelige krop også.

Den første hold, som Diana dannede begyndte at svinde som kræft tog sit grimme vejafgift. Wishing altid huske min kære ven og yde et bidrag, mine ressourcer overført til AS! hold-CureNow. SOM! er nu udforske danner et andet hold med bredere appel ud over den meget lille awards samfund og vil gøre en beslutning i den nærmeste fremtid. Jeg vil helt sikkert deltage og et nyt hold grafisk med et link vil blive opdateret i dette rum.

For at holde mindet om Diana i live er der nu forskellige Internet-baserede grid computing skemaer til rådighed, takket være det pionerarbejde Oxford University og United Devices.

The World Community Grid software bruger den ledige tid af Internet-tilsluttede computere og anvender denne computerkraft mod fremme af menneskeheden.

agenten fungerer som en pauseskærm , kun bruger en computers ressourcer, når det ellers ville være inaktiv og opgive de ressourcer, tilbage til brugerne, når de begynder at bruge computerne igen. Agenten kan også køres som et program, altid kører i baggrunden, medmindre det specifikt deaktiveret /pause.

Mens mange offentlige computing net såsom SETI @ home in eller Folding @ home

er helliget til et enkelt projekt, World Community Grid tilbyder flere humanitære projekter under én paraply. Projekterne er godkendt af et advisory board, med medlemmer fra de fleste af de store forskningsinstitutioner og universiteter, samt FN og WHO.

Inden nettet, brugere kan tilslutte hold, der er blevet skabt af organisationer, grupper eller enkeltpersoner. Teams giver mulighed for en øget følelse af fælles identitet og forsøg på at inspirere konkurrenceevnen.

World Community Grid adskiller sig også fra andre grid-projekter ved at tilbyde støtte til mere end én netinfrastruktur. Open source BOINC klient er tilgængelig til Linux, Windows og Mac; den proprietære Grid MP fra United Devices Inc. er kun tilgængelig for Windows.

Historie

De Forenede Devices Kopper Research Grid-projektet blev sponsoreret af IBM og andre Research Deltagere at fremskynde opdagelsen af ​​en kopper helbrede. Den Kopper undersøgelsen anvendte beregningsmæssige kemi på en massiv distribueret computing gitter til at analysere kandidater til en medicinsk terapi til at bekæmpe koppevirus.

Projektet tillod forskerne at screene 35 millioner potentielle lægemiddelkandidater molekyler mod flere kopper proteiner til at identificere gode kandidater til at udvikle sig til kopper behandlinger. I de første 72 timer, blev 100.000 resultater returneret og 44 stærke behandling kandidater blev identificeret ved afslutningen af ​​projektet.

På baggrund af succesen med Kopper undersøgelsen, IBM annoncerede den 16. november 2004 oprettelsen af ​​verden Community Grid med det mål at skabe en teknisk miljø, hvor andre humanitære forskning kunne behandles.

World Community Grid første omgang kun understøttet Windows, ved hjælp af den proprietære grid teknologi fra United Devices hvilke beføjelser grid.org projekter. Stærk efterspørgsel efter Linux support førte til open source BOINC gitter teknologi, som driver Seti @ home in og Climateprediction (blandt andre) er tilføjet. Mac OS X understøttelse er nu også inkluderet.

Som i marts 24, 2007 World Community Grid havde næsten 272.000 medlemmer med mere end 550.000 registrerede arbejdsstationer. Det havde en samlet proces køretid svarer til omkring 82 tusind år, og omkring 80 millioner resultater er blevet sendt. The World Community Grid opdaterer disse statistikker flere gange om dagen, hvilket gør oplysningerne tilgængelige via en dedikeret side statistik.