PLoS ONE: Fælles enkelt nukleotid polymorfier i gener relateret til Immune Funktion og risikoen for papillære kræft i skjoldbruskkirtlen

Abstrakte

Akkumulerende tyder på, at ændringer i immunforsvaret kan være vigtig i ætiologien af ​​papillær kræft i skjoldbruskkirtlen (PTC). For at identificere genetiske markører i immun-relaterede veje, vi evaluerede 3985 tag enkelt nukleotid polymorfier (SNP) i 230 kandidat gen regioner (vedhæftning-ekstravasation migrering, arachidonsyre stofskifte /eicosanoid signalering, supplerer og koagulering kaskade, cytokin signalering, medfødte patogen detektion og antimikrobielle midler, leukocyt signalering, TNF /NF-kB pathway eller andre) i en case-kontrol undersøgelse af 344 PTC tilfælde og 452 kontroller. Vi brugte logistiske regressionsmodeller til at estimere odds ratio (OR) og beregne en frihedsgrad

P

værdier af lineær trend (

P

SNP-trend

) for sammenhængen mellem genotype ( fælles homozygot, heterozygot, variant homozygote) og risiko for PTC. For at korrigere for multiple sammenligninger, vi anvendt den falske opdagelse sats metode (FDR). Gene områdespecifikke og sti-niveau foreninger (

P

omegn og

P

Pathway

) blev vurderet ved at kombinere individuel

P

SNP-trend

værdier ved hjælp af adaptive rang afkortede produkt metode. To SNP’er (rs6115, rs6112) i

SERPINA5

gen var signifikant forbundet med risiko for PTC (

P

SNP-FDR /P

SNP-trend =

0.02 /6 × 10

-6 og

P

SNP-FDR /P

SNP-trend =

0,04 /2 × 10

-5, henholdsvis). Disse foreninger var uafhængige af en historie af autoimmun thyroiditis (OR = 6,4; 95% konfidensinterval: 3,0-13,4). På det gen regionsniveau,

SERPINA5

blev suggestively forbundet med risiko for PTC (

P

Region-FDR /P

Region =

0,07 /0,0003). Samlet set supplerer og koagulationskaskaden sti var den mest betydningsfulde vej (

P

Pathway

= 0,02) i forbindelse med PTC risiko skyldes i høj grad den stærke effekt af

SERPINA5

. Vores resultater kræver replikation, men tyder på, at

SERPINA5

gen, der koder for protein C inhibitor involveret i mange biologiske processer, herunder inflammation, kan være en ny modtagelighed locus for PTC

Henvisning:. Brenner AV, Neta G, Sturgis EM, Pfeiffer RM, Hutchinson A, Yeager M, et al. (2013) Fælles enkelt-nukleotid polymorfier i gener relateret til Immune Funktion og risikoen for papillære kræft i skjoldbruskkirtlen. PLoS ONE 8 (3): e57243. doi: 10,1371 /journal.pone.0057243

Redaktør: Xiao-Ping Miao, Huazhong Universitet for Videnskab og Teknologi, Kina

Modtaget: August 7, 2012; Accepteret: 18 januar 2013; Udgivet: Marts 8, 2013