PLoS ONE: Sammenligning af Prognostiske genomiske Prædiktorer i kolorektal cancer

Abstrakt

Baggrund

Selv om flere prognostiske genomiske prædiktorer er blevet identificeret fra uafhængige undersøgelser, er det fortsat uklart, om disse prædiktorer er faktisk samstemmende med hensyn til deres forudsigelser for de enkelte patienter og hvilke prædiktor udfører bedst. Vi sammenlignede fem prognostiske genomiske prædiktorer, den V7RHS, den ColoGuideEx, den Meta163, den OncoDX, og MDA114, i form af at forudsige sygdomsfri overlevelse i to uafhængige grupper af patienter med tarmkræft.

Study Design

Brug originale klassificering algoritmer, vi testede forudsigelser af fem genomiske prædiktorer for sygdomsfri overlevelse i to kohorter af patienter med kolorektal cancer (n = 229 og n = 168) og evalueret konkordans af prædiktorer forudsige resultater til individuel patienter.

Resultater

Vi fandt, at kun to prædiktorer, OncoDX og MDA114, viste robust ydeevne identificere patienter med dårlig prognose i 2 uafhængige kohorter. Disse to prædiktorer havde også beskeden, men signifikant overensstemmelse mellem forventede resultat (r 0,3,

P

0,001 i begge kohorter)

Konklusioner

Yderligere validering af udviklede genomisk. prædiktorer er nødvendig. Trods det begrænsede antal gener deles af OncoDX og MDA114, individuel-patient udfald forudsagt af disse to prædiktorer var væsentligt overensstemmende

Henvisning:. Park YY, Lee SS, Lim JY, Kim SC, Kim SB, Sohn BH et al. (2013) Sammenligning af Prognostiske genomiske Prædiktorer i kolorektal cancer. PLoS ONE 8 (4): e60778. doi: 10,1371 /journal.pone.0060778

Redaktør: Patrick Tan, Duke-National University of Singapore Graduate Medical School, Singapore

Modtaget: 25 oktober, 2012; Accepteret: 2. marts, 2013; Udgivet 23. april, 2013