PLoS ONE: polymorfier og en haplotype i Heparanase Gene Foreninger med Progression og prognosen for mavekræft i en nordlige kinesiske befolkning

Abstrakt

Baggrund

Menneskelig heparanase spiller en vigtig rolle i udviklingen af ​​kræft og enkelt nukleotid polymorfier (SNPs) i heparanase genet (HPSE) har vist sig at være korreleret med mavekræft. Den foreliggende undersøgelse undersøgte sammenhængen mellem individuelle SNPs eller haplotyper i HPSE og modtagelighed, klinisk-patologiske parametre og prognosen for mavekræft i et stort udsnit af Han befolkning i det nordlige Kina.

Metode /vigtigste resultater

Genomisk DNA blev ekstraheret fra formalinfikserede, paraffinindlejrede normale gastriske vævsprøver fra 404 patienter og fra blod fra 404 raske kontrolpersoner. Seks SNP’er blev genotypebestemt ved matrix-assisteret laser desorption /ionisering time-of-flight massespektrometri. En chi-square (χ2) test og ubetinget logistisk regression blev anvendt til at analysere risikoen for gastrisk cancer; en log-rank test og Cox proportional hazard model blev anvendt til opnåelse overlevelse analyse og en Kaplan-Meier-metoden blev anvendt til at kortlægge overlevelseskurver. De gennemsnitlige genotypebestemmelsesmetoder succesrater var mere end 99% i begge grupper. Haplotype CA i blokken bestående af rs11099592 og rs4693608 havde en større fordeling i gruppen af ​​BORRMANN typer 3 og 4 (P = 0,037), gruppen af ​​et større antal lymfeknudemetastaser (N3 vs n0 gruppe, P = 0,046), og desuden var korreleret til dårlig overlevelse (CG vs CA: HR = 0,645, 95% CI: 0,421-0,989, P = 0,044). Desuden genotyper rs4693608 AA og rs4364254 TT blev forbundet med dårlig overlevelse (P = 0,030, HR = 1,527, 95% CI: 1,042-2,238 for rs4693608 AA; P = 0,013, HR = 1,546, 95% CI: 1,096-2,181 for rs4364254 TT). Der var ingen sammenhænge mellem de enkelte SNPs eller haplotyper og mavekræft risiko.

Konklusioner /Betydning

Der blev fundet en funktionel haplotype i HPSE, som omfattede de vigtige SNP rs4693608. SNPs i HPSE spille en vigtig rolle i mavekræft progression og overlevelse, og måske kan være en molekylær markør for prognose og behandling værdier

Henvisning:. Li AL, Song YX, Wang ZN, Gao P, Miao Y, Zhu JL, et al. (2012) polymorfier og en haplotype i Heparanase Gene Foreninger med Progression og prognosen for mavekræft i en nordlige kinesiske befolkning. PLoS ONE 7 (1): e30277. doi: 10,1371 /journal.pone.0030277

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan

Modtaget: 13. oktober 2011; Accepteret: 12. december, 2011; Udgivet: januar 20, 2012