PLoS ONE: En hoved- og halscancer tumorrespons-specifikt gen signatur for cisplatin, 5-fluorouracil Induktion Kemoterapi Fails med Lagt Taxaner

Abstrakt

Baggrund

Det er en stor klinisk udfordring at forudsige, hvilke patienter, med fremskreden hoved og hals pladecellekræft, vil ikke udvise en reduktion i tumorstørrelse efter induktion kemoterapi i for at undgå toksiske virkninger af ineffektiv kemoterapi og forsinkelser for at anlægge andre behandlingsmuligheder. Endvidere er det af interesse at vide, i hvilket omfang et gen signatur, som identificerer patienter med tumorer, som ikke vil reagere på en bestemt induktion kemoterapi, gælder, når yderligere kemoterapeutiske stoffer føjes til regime.

Metode /vigtigste resultater

for at identificere gener, der forudsiger tumor resistens over for induktion med cisplatin /5-fluorouracil (PF) eller PF og et taxan, vi analyserede patient tumor biopsier med hele genomet microarrays og kvantitativ revers transkriptase-PCR (TLDA) kort. En orlov én ud krydsvalidering procedure tillod evaluering af forudsigelsen værktøj. En ti-gen microarray signatur korrekt klassificeret 12/13 responders og 7/10 ikke-respondenter til PF (92% specificitet, 82,6% træfsikkerhed). TLDA analyse (med samme klassificeringen) af patienterne korrekt klassificeret 12/12 responders og 8/10 ikke-respondere (100% specificitet, 90,9% træfsikkerhed). Endvidere TLDA analyse korrekt forudsagde respons af 5 nye patienter og overordnede, 12/12 responders og 13/15 non-respondere (100% specificitet, 92,6% træfsikkerhed). Proteinprodukterne af generne, der udgør signaturen fysisk associerer med 27 andre proteiner, der er involveret i regulering af genekspression, som udgør en interaktion netværk. I modsætning hertil TLDA-baserede forudsigelse (med det samme gen underskrift) af svar på induktion med PF og enten af ​​to taxaner var fattige (0% specificitet, 25% nøjagtighed og 33,3% specificitet, 25% nøjagtighed).

konklusioner /betydning

vellykket overførsel af microarray-baserede gen signatur til en uafhængig, PCR-baseret teknologi antyder, at TLDA-baserede signaturer kunne være en nyttig hospital-baseret teknologi til bestemmelse af terapeutiske muligheder. Selvom yderst specifik for tumor reaktioner på PF induktion, genet signatur er mislykket, når taxaner tilsættes. Resultaterne illustrerer subtilitet i at udvikle “personlig medicin”

Henvisning:. Tomkiewicz C, Hans S, Mucchielli MH, Agier N, Delacroix H, Marisa L, et al. (2012) En hoved- og halscancer tumorrespons-specifikt gen signatur for cisplatin, 5-fluorouracil Induktion Kemoterapi Fails med Lagt Taxaner. PLoS ONE 7 (10): e47170. doi: 10,1371 /journal.pone.0047170

Redaktør: Andrew Yeudall, Virginia Commonwealth University, USA

Modtaget: 12. maj 2012; Accepteret: 10. september 2012; Udgivet: 9. oktober, 2012